Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Spa_g00434 (UGT85A3)
41.97 0.12 7.76 0.04 0.11 0.02 0.12 6.66 0.72 3.28
14.21 0.0 8.83 1.21 0.0 0.79 0.28 10.16 0.74 4.62
Spa_g01142 (HCT)
12.02 0.0 0.53 0.48 0.3 0.72 0.28 2.64 0.24 0.44
Spa_g01441 (B5 #4)
11.48 0.7 9.18 1.58 0.53 0.81 0.61 6.18 3.23 4.02
Spa_g01738 (GT13)
35.23 0.11 1.64 0.27 0.0 0.09 0.04 9.72 1.7 1.72
6.09 0.03 5.23 0.23 0.07 0.24 0.08 3.9 0.45 3.64
38.16 3.66 20.33 1.97 1.48 1.13 2.12 12.04 2.15 3.62
311.1 0.11 98.8 1.37 0.0 1.5 0.59 87.29 8.25 11.43
3.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0
Spa_g02137 (TMK1)
19.91 0.2 3.2 0.85 0.27 1.0 0.23 8.02 1.19 2.94
Spa_g02223 (BGAL1)
12.58 0.12 6.78 1.12 0.26 1.33 0.28 6.11 2.13 2.08
4.15 0.0 2.58 0.05 0.0 0.11 0.0 2.35 0.6 0.19
61.15 0.69 4.99 0.18 0.37 0.35 0.46 14.79 5.34 4.86
Spa_g02575 (BIP1)
193.5 4.83 55.82 16.37 7.88 20.57 6.22 22.29 20.01 32.72
29.69 0.29 4.81 1.56 1.3 1.62 1.46 19.34 4.39 4.48
15.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.04 0.0
303.53 0.31 45.82 1.39 0.05 1.77 0.06 4.19 2.74 0.22
2.71 0.0 0.8 0.05 0.0 0.33 0.0 1.17 0.05 0.92
63.45 0.67 16.05 5.91 0.98 3.71 0.79 15.26 7.59 5.68
20.11 0.06 2.3 0.14 0.0 0.11 0.0 0.7 0.0 0.18
4.73 0.0 1.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0
Spa_g03664 (EXP15)
3.27 0.0 0.12 0.39 0.0 0.04 0.0 0.98 0.09 0.15
26.24 0.0 0.33 0.76 0.0 0.09 0.0 9.04 4.34 3.51
22.96 0.0 4.55 3.4 0.08 3.38 1.09 6.95 0.95 3.8
Spa_g03908 (CYCP4;1)
9.21 0.0 4.24 0.23 0.0 0.0 0.0 3.81 0.21 1.64
5.85 0.0 1.53 0.0 0.49 0.0 0.0 2.28 0.11 0.29
8.5 0.2 0.02 0.05 0.0 0.12 0.02 3.14 1.79 1.63
Spa_g04302 (MYB20)
5.66 0.08 1.39 0.33 0.22 0.34 0.28 3.46 0.75 1.25
4.51 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.65 0.47
46.42 0.15 1.94 0.02 0.02 0.02 0.01 7.09 1.13 1.11
16.57 0.78 4.35 0.16 0.0 0.06 0.06 9.44 4.72 0.17
8.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.61 0.0 0.0
Spa_g06321 (XTH5)
4.97 0.0 2.07 0.11 0.03 0.44 0.01 1.91 0.32 1.78
83.07 1.45 36.38 12.38 0.98 13.3 0.78 28.68 13.45 10.44
Spa_g06424 (KCS9)
67.72 0.0 20.1 7.99 0.17 6.48 0.47 25.87 3.19 19.28
Spa_g06425 (KCS4)
45.44 0.03 13.23 4.67 0.09 3.61 0.23 26.94 2.48 18.73
Spa_g06558 (UTR3)
59.55 9.36 26.44 16.14 10.74 16.48 9.7 16.71 8.79 17.79
27.99 3.97 18.76 6.74 2.11 6.58 2.36 12.93 7.89 8.2
Spa_g06672 (HSC70)
171.69 38.23 110.57 48.78 26.47 43.46 27.37 65.91 43.52 42.54
Spa_g06696 (ICE2)
7.84 0.11 4.79 0.66 0.11 0.73 0.14 2.89 1.48 0.61
Spa_g06798 (CHAL)
9.64 0.0 1.23 0.58 0.09 0.5 0.27 2.21 0.29 0.11
Spa_g07085 (XIK)
25.91 0.66 3.31 2.74 0.39 0.98 0.5 11.59 0.99 1.1
8.12 0.1 2.8 0.15 0.13 0.14 0.11 3.39 0.46 2.2
Spa_g07293 (IQD3)
48.4 0.3 15.16 10.16 0.6 7.87 0.5 18.15 4.12 12.67
29.14 0.01 0.22 0.35 0.0 0.09 0.0 14.27 0.82 0.04
Spa_g08040 (HSP70)
583.16 259.76 506.68 288.29 189.8 276.69 192.91 280.85 251.8 263.22
6.17 1.44 3.84 0.89 0.31 0.91 0.32 3.05 1.21 3.06
Spa_g09257 (TTL1)
18.17 0.25 4.75 2.43 0.02 1.72 0.04 7.47 1.54 3.46
Spa_g09520 (DFR)
29.84 3.28 7.03 2.02 1.46 2.26 3.24 4.34 2.03 7.88
Spa_g09857 (SOS5)
25.08 0.01 0.62 0.08 0.0 0.02 0.0 10.96 3.71 0.14
7.02 0.04 0.04 0.45 0.03 0.27 0.05 3.87 0.0 0.0
18.46 1.78 9.66 2.82 1.26 2.75 1.68 7.63 3.4 3.17
Spa_g10637 (SAH7)
97.95 16.02 50.41 23.13 20.91 24.28 18.06 37.46 24.24 6.18
Spa_g11113 (AGAL2)
15.65 0.6 0.72 0.28 0.28 0.37 0.33 8.33 0.99 0.69
Spa_g11168 (P58IPK)
30.72 5.59 16.19 10.7 6.99 10.64 6.87 13.05 11.09 12.68
18.48 1.3 1.85 0.82 0.47 0.66 0.52 5.97 1.46 3.15
Spa_g11468 (PUB14)
3.86 0.19 0.39 0.28 0.02 0.15 0.07 1.52 0.1 0.64
31.0 0.83 3.66 1.46 0.68 1.32 1.49 9.87 2.51 5.64
3.83 0.28 2.17 0.42 0.03 0.39 0.06 1.16 0.82 0.03
5.78 0.0 1.9 0.04 0.02 0.0 0.0 1.15 0.19 1.47
4.71 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.38
Spa_g12193 (BIP1)
301.11 7.08 78.82 26.63 13.68 28.72 9.73 30.98 24.56 52.46
Spa_g12199 (PDI5)
183.28 36.86 100.94 54.79 41.12 58.71 43.93 87.07 58.61 60.86
Spa_g12208 (GPAT5)
6.56 0.0 3.15 0.04 0.0 0.0 0.1 2.11 0.3 0.04
7.16 0.69 4.03 0.18 0.32 0.12 0.53 2.68 0.68 0.86
87.44 3.34 38.97 6.5 0.61 5.64 0.59 28.19 10.16 4.03
7.22 0.0 3.36 0.09 0.02 0.11 0.0 3.07 1.01 0.23
62.41 2.27 21.22 5.01 0.07 2.56 0.68 12.64 3.76 3.14
3695.67 87.5 1847.52 42.46 0.23 34.21 2.37 1226.04 281.92 10.02
Spa_g14807 (HSP70)
955.4 127.13 498.78 250.26 117.51 228.57 135.41 383.57 203.42 226.47
Spa_g15040 (CYCD1;1)
11.63 0.52 3.7 0.24 0.11 0.08 0.14 3.74 0.36 2.81
Spa_g15041 (CYCD1;1)
10.24 0.32 5.64 0.65 0.3 0.6 0.13 4.26 1.05 3.44
9.0 1.07 2.81 1.94 0.6 1.48 0.36 3.76 0.71 2.28
141.57 2.17 15.82 11.88 3.77 16.69 6.17 29.12 23.19 9.87
Spa_g18128 (SHD)
35.99 5.59 15.83 9.0 10.66 12.7 10.03 9.2 10.78 12.07
26.25 0.58 0.15 1.0 0.07 0.94 0.36 0.57 0.0 0.91
50.45 2.37 4.95 8.12 5.39 6.97 6.11 17.51 2.33 12.89
4.22 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0
16.77 0.11 6.79 1.07 1.3 1.09 1.34 7.54 1.01 2.41
6.19 0.0 2.56 0.42 0.0 0.2 0.15 2.61 0.55 0.99
161.93 3.14 64.27 11.58 0.32 8.87 0.83 40.63 10.03 8.14
19.03 0.53 8.48 2.86 2.18 3.13 3.39 4.8 1.4 2.87
Spa_g22441 (GONST3)
42.66 8.26 16.54 7.97 6.92 9.03 7.76 14.64 10.43 15.66
Spa_g23497 (CNX1)
122.71 6.02 46.44 9.45 9.52 8.37 7.59 43.14 25.79 33.41
61.84 4.69 32.86 12.04 8.62 11.59 9.37 14.34 7.54 3.44
Spa_g24022 (HSC70)
75.81 32.35 65.89 26.64 18.71 23.35 21.69 38.36 30.6 29.83
70.82 11.09 40.83 15.46 8.1 15.45 11.24 31.87 17.39 16.76
101.56 2.53 47.27 13.41 1.85 14.26 1.23 34.19 18.35 13.0
1668.36 54.77 136.7 154.02 1.4 17.79 2.52 540.71 193.29 61.89
Spa_g26488 (SHD)
227.37 25.99 93.54 46.67 59.97 65.18 56.9 55.5 62.61 78.94
19.85 0.75 12.37 1.33 0.59 1.2 1.27 12.21 2.01 6.16
258.08 16.31 103.42 24.02 20.51 21.77 17.78 91.61 48.38 89.58
1177.49 0.51 657.34 80.12 1.06 27.84 1.44 384.19 240.25 205.67
3.61 0.47 0.0 0.37 0.0 0.0 0.11 0.16 0.54 0.0
5.75 0.22 0.28 0.65 0.0 0.34 0.11 1.64 0.91 0.12
4.67 0.0 0.0 0.12 0.0 0.32 0.0 1.86 1.17 0.15
23.2 0.13 9.63 0.49 0.04 0.44 0.06 9.08 2.55 1.42
Spa_g29351 (FXG1)
21.39 1.1 1.82 2.29 0.0 2.63 0.0 13.49 3.55 3.71
21.7 0.02 4.92 1.7 0.03 1.07 0.08 5.56 2.22 1.58
19.2 0.37 5.67 0.41 0.11 0.18 0.16 4.51 3.16 2.25
23.96 0.47 5.1 0.64 0.22 0.34 0.49 9.1 2.09 1.27
23.89 0.0 3.99 0.86 0.0 0.7 0.01 10.86 4.67 4.94
13.63 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 1.85 0.0
22.37 0.0 5.8 0.0 0.0 0.0 0.0 1.28 0.24 1.91
11.65 0.1 3.5 2.19 0.0 0.47 0.0 5.93 0.7 2.64
8.8 0.39 1.53 0.48 0.33 0.51 0.4 3.17 1.22 1.3
Spa_g33949 (HSP70)
137.84 68.87 103.68 47.6 33.7 43.16 35.68 75.2 56.77 54.92
4.67 0.0 2.87 0.47 0.38 0.69 0.2 2.71 0.69 2.08
43.91 0.17 7.08 0.15 0.0 0.0 0.0 1.01 0.28 0.86
63.9 6.61 26.38 9.99 4.53 8.54 3.25 23.67 7.13 9.91
10.83 0.0 4.53 1.15 0.11 1.26 0.0 5.0 0.73 1.97
2.38 0.0 1.21 0.3 0.05 0.04 0.08 1.17 0.41 0.89
106.27 0.02 2.65 0.14 0.02 0.05 0.06 4.48 4.18 7.08
29.38 0.0 6.07 0.53 0.0 0.31 0.0 9.02 1.12 3.1
12.45 0.14 4.17 0.0 0.0 0.0 0.0 3.39 0.44 0.36
40.1 0.09 30.63 2.52 0.0 1.42 0.0 23.12 11.24 7.73
20.96 0.36 2.44 0.77 0.23 0.89 0.35 0.15 0.0 0.1
3.76 0.41 0.79 0.32 0.76 0.29 0.39 2.33 1.27 0.29
5.89 0.0 3.14 0.0 0.0 0.02 0.0 2.3 0.22 0.0
47.04 0.11 6.28 1.23 0.49 0.74 0.14 6.59 4.28 10.68
431.88 0.0 257.03 20.09 0.21 3.93 0.77 104.26 85.64 69.63
34.15 0.0 17.05 1.03 0.27 1.07 0.1 12.36 8.51 4.0
3.79 0.0 2.5 0.07 0.0 0.0 0.0 1.63 0.51 1.17
2.87 0.0 0.8 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.68 0.14 2.56 0.58 0.3 0.86 0.0 3.43 0.14 0.17
244.0 10.62 22.95 32.97 0.48 3.37 0.23 85.97 47.49 3.17
96.14 4.35 5.05 9.95 0.28 1.59 0.29 33.41 6.25 0.08
142.08 0.0 21.92 14.71 0.15 1.65 0.29 26.24 6.72 0.0
Spa_g47063 (VLN4)
24.99 1.33 9.05 4.84 0.65 4.31 0.54 11.13 2.18 2.34
5.1 0.03 2.11 0.06 0.09 0.08 0.09 2.29 0.28 1.47
Spa_g47641 (ALE2)
25.7 1.78 10.01 1.2 0.71 1.38 0.84 7.81 2.75 0.48
10.65 0.1 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 5.04 0.0 0.09
14.92 0.1 1.63 0.3 0.08 0.27 0.11 7.5 2.39 1.51
392.12 109.44 189.0 111.89 107.18 124.72 100.83 112.34 111.53 150.27
Spa_g48417 (FLA10)
7.59 0.07 1.81 0.06 0.21 0.14 0.06 0.88 0.66 0.34
6.12 0.63 1.13 0.87 0.05 0.67 0.06 1.17 0.31 0.0
Spa_g48730 (FLS)
39.71 0.17 26.5 3.5 0.94 2.82 1.22 15.29 5.45 9.94
Spa_g48925 (PIN4)
47.74 0.18 26.83 3.16 0.71 2.61 0.91 14.37 9.66 2.76
10.66 0.0 6.18 0.0 0.0 0.0 0.0 4.22 0.5 1.99
114.37 0.09 0.54 0.33 0.0 0.13 0.08 1.74 0.06 0.31
470.95 0.21 154.0 1.51 0.14 1.32 0.48 169.21 14.77 15.67
Spa_g49584 (BIP)
523.2 83.11 147.44 101.65 93.22 163.04 94.57 92.28 101.93 115.65
Spa_g49816 (GPAT6)
8.29 0.03 3.22 0.37 0.01 0.13 0.03 3.47 0.56 0.09
13.65 0.12 0.9 0.36 0.04 0.45 0.14 3.26 0.43 0.43
6.73 0.0 2.27 1.44 0.32 0.71 0.35 2.48 0.31 2.43
3.9 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.04 0.0
Spa_g50211 (ERD2)
164.31 28.22 103.94 36.41 27.43 31.15 33.14 77.79 45.83 42.98
Spa_g50212 (BIP1)
80.95 2.0 18.71 4.08 4.3 5.95 2.52 6.77 6.74 11.37
2.23 0.0 0.31 0.06 0.0 0.0 0.0 0.6 0.24 0.0
3.23 0.09 0.95 0.12 0.18 0.06 0.03 2.04 0.21 0.75
58.01 5.12 9.56 4.09 5.0 4.43 5.46 5.43 6.78 3.49
5.5 0.28 2.54 1.76 0.3 0.81 0.17 0.88 0.86 0.91
10.85 1.17 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 3.77 0.0 0.1
Spa_g50754 (HTB4)
154.95 26.01 22.53 6.27 14.63 12.5 13.17 41.38 15.02 9.74
2.81 0.0 0.77 0.02 0.0 0.01 0.0 1.67 0.21 0.1
Spa_g50837 (FLA10)
21.91 0.03 1.36 0.0 0.0 0.02 0.04 1.32 0.33 0.01
3.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.35 0.06 0.5 0.1 0.04 0.05 0.03 0.65 0.02 0.56
Spa_g51023 (CHAL)
5.97 0.0 0.24 1.17 0.24 0.53 0.28 2.34 0.42 0.32
Spa_g51064 (RLP57)
2.68 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.03 0.25
6.13 0.11 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
3.47 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
127.85 0.0 38.96 20.15 0.38 21.35 0.89 61.06 8.42 24.9
5.81 0.04 0.03 0.01 0.09 0.04 0.11 0.0 0.01 0.22
Spa_g51415 (EPF1)
15.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
37.24 0.28 0.14 1.96 1.05 1.82 1.29 1.93 0.3 6.19
11.5 0.0 0.01 0.07 0.0 0.19 0.0 4.54 0.0 0.05
13.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.04 0.1
3.49 0.0 0.52 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.07
7.0 0.13 1.93 0.63 0.0 0.49 0.0 0.23 0.04 0.37
6.33 0.0 0.11 0.17 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.36
Spa_g52096 (FATB)
9.21 0.59 6.85 1.47 0.66 0.82 0.31 3.72 1.88 2.29
12.6 0.65 1.01 0.13 0.0 0.16 0.11 6.26 0.8 1.43
3.69 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
2.79 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.42
4.45 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.46 0.84
17.79 0.1 2.49 0.0 0.09 0.29 0.0 6.04 0.67 0.0
Spa_g52525 (DFR)
148.77 0.08 5.71 1.0 0.04 0.22 0.33 0.42 2.23 1.19
23.57 0.0 9.46 0.66 0.0 0.27 0.0 5.14 2.01 0.79
4.06 0.02 1.08 0.17 0.02 0.11 0.23 1.23 0.19 0.2
Spa_g52685 (FMA)
3.06 0.0 0.35 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.26
7.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.38 0.0
17.67 0.29 1.43 1.47 0.0 1.55 0.09 0.0 0.0 0.21
114.43 4.45 4.55 20.19 1.2 7.17 0.42 49.92 10.44 6.54
Spa_g53612 (BIM2)
31.86 1.67 4.35 0.64 0.48 2.32 0.41 6.2 0.46 0.96
18.4 0.35 5.86 2.32 0.0 1.2 0.08 6.9 2.33 4.28
10.46 0.01 5.16 2.11 0.13 1.41 0.24 2.59 0.69 1.22
7.5 0.14 4.61 0.05 0.06 0.28 0.0 4.29 0.69 0.08
Spa_g55275 (HSC70)
114.52 22.77 71.81 28.71 14.0 32.09 17.54 51.07 26.45 28.37
Spa_g55768 (HSC70)
369.38 94.05 270.46 145.93 83.32 152.63 98.26 176.76 127.21 127.02
4.63 0.04 0.8 0.59 0.12 0.68 0.13 1.85 0.75 0.69
Spa_g56867 (ENDO 2)
116.07 0.08 16.13 0.32 1.14 0.64 1.23 9.09 1.18 25.91
14.57 0.06 0.02 0.15 0.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)