Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.51 1.0 0.39 0.31 0.29 0.28 0.3 0.31 0.26 0.2
0.23 1.0 0.07 0.07 0.23 0.08 0.21 0.12 0.14 0.03
Spa_g03178 (REME1)
0.19 1.0 0.34 0.13 0.4 0.18 0.37 0.12 0.35 0.07
0.35 1.0 0.21 0.18 0.33 0.18 0.3 0.25 0.23 0.12
0.32 1.0 0.22 0.13 0.33 0.14 0.33 0.21 0.37 0.18
0.21 1.0 0.36 0.24 0.42 0.3 0.48 0.16 0.4 0.21
0.18 1.0 0.28 0.17 0.42 0.17 0.41 0.16 0.28 0.14
Spa_g04485 (CRR22)
0.16 1.0 0.23 0.13 0.34 0.15 0.37 0.12 0.23 0.14
Spa_g06116 (VAC1)
0.36 1.0 0.47 0.34 0.53 0.38 0.48 0.33 0.46 0.3
0.28 1.0 0.14 0.09 0.15 0.11 0.14 0.03 0.09 0.06
0.3 1.0 0.28 0.15 0.3 0.17 0.35 0.25 0.28 0.17
0.28 1.0 0.21 0.18 0.27 0.24 0.27 0.18 0.18 0.14
0.33 1.0 0.47 0.34 0.5 0.33 0.48 0.27 0.37 0.23
0.42 1.0 0.43 0.42 0.39 0.42 0.44 0.38 0.37 0.26
0.29 1.0 0.29 0.22 0.38 0.24 0.38 0.17 0.24 0.18
0.29 1.0 0.11 0.22 0.35 0.21 0.31 0.11 0.22 0.06
0.26 1.0 0.34 0.24 0.46 0.29 0.5 0.18 0.28 0.26
0.61 1.0 0.37 0.35 0.43 0.38 0.47 0.32 0.44 0.28
Spa_g09058 (APX3)
0.42 1.0 0.3 0.22 0.28 0.17 0.26 0.18 0.3 0.2
Spa_g09078 (APX3)
0.38 1.0 0.37 0.18 0.23 0.17 0.24 0.17 0.25 0.22
Spa_g09562 (DEG8)
0.38 1.0 0.23 0.22 0.3 0.24 0.31 0.24 0.27 0.13
0.15 1.0 0.27 0.14 0.24 0.19 0.24 0.11 0.25 0.14
Spa_g09922 (OTP84)
0.5 1.0 0.38 0.2 0.26 0.23 0.23 0.24 0.17 0.13
Spa_g10206 (CLPP5)
0.68 1.0 0.42 0.37 0.48 0.37 0.46 0.37 0.48 0.29
0.32 1.0 0.19 0.21 0.24 0.24 0.21 0.12 0.18 0.1
0.17 1.0 0.1 0.17 0.24 0.18 0.24 0.08 0.15 0.02
0.4 1.0 0.13 0.22 0.29 0.21 0.3 0.18 0.22 0.08
0.14 1.0 0.06 0.06 0.29 0.05 0.3 0.08 0.31 0.07
0.47 1.0 0.49 0.36 0.49 0.33 0.48 0.35 0.37 0.31
0.39 1.0 0.4 0.28 0.48 0.28 0.48 0.28 0.34 0.29
Spa_g12227 (OTP84)
0.45 1.0 0.45 0.21 0.39 0.21 0.41 0.2 0.35 0.17
0.17 1.0 0.23 0.08 0.23 0.1 0.2 0.1 0.16 0.09
0.26 1.0 0.21 0.16 0.29 0.2 0.31 0.11 0.23 0.14
Spa_g12812 (WTF1)
0.33 1.0 0.21 0.15 0.3 0.17 0.33 0.22 0.19 0.15
0.32 1.0 0.25 0.19 0.32 0.22 0.3 0.29 0.28 0.12
0.54 1.0 0.21 0.07 0.17 0.07 0.17 0.03 0.0 0.0
Spa_g13788 (UGT85A7)
0.14 1.0 0.04 0.12 0.14 0.16 0.12 0.05 0.14 0.01
Spa_g13913 (OTP86)
0.24 1.0 0.25 0.11 0.25 0.12 0.24 0.12 0.13 0.12
0.14 1.0 0.22 0.1 0.15 0.18 0.24 0.09 0.17 0.09
Spa_g14020 (VAC1)
0.27 1.0 0.33 0.16 0.4 0.2 0.37 0.18 0.31 0.24
0.24 1.0 0.1 0.18 0.29 0.22 0.2 0.09 0.13 0.01
0.25 1.0 0.25 0.14 0.22 0.12 0.16 0.06 0.09 0.14
Spa_g14318 (CRR2)
0.2 1.0 0.23 0.15 0.37 0.22 0.36 0.06 0.27 0.18
0.16 1.0 0.22 0.13 0.21 0.12 0.2 0.08 0.15 0.06
Spa_g14599 (REME1)
0.31 1.0 0.26 0.15 0.41 0.21 0.34 0.12 0.21 0.15
0.27 1.0 0.26 0.12 0.14 0.12 0.17 0.03 0.1 0.1
Spa_g14608 (VAC1)
0.31 1.0 0.25 0.19 0.38 0.22 0.41 0.17 0.24 0.21
Spa_g14958 (VTE1)
0.15 1.0 0.2 0.19 0.26 0.27 0.22 0.14 0.08 0.05
Spa_g15000 (OTP84)
0.32 1.0 0.34 0.11 0.17 0.14 0.17 0.06 0.15 0.17
0.22 1.0 0.07 0.12 0.28 0.12 0.25 0.1 0.12 0.03
0.27 1.0 0.34 0.18 0.31 0.23 0.29 0.13 0.27 0.13
0.21 1.0 0.29 0.13 0.34 0.14 0.37 0.15 0.26 0.15
0.43 1.0 0.44 0.37 0.43 0.37 0.43 0.22 0.27 0.24
Spa_g15769 (CH1)
0.31 1.0 0.22 0.26 0.31 0.23 0.3 0.17 0.23 0.11
0.24 1.0 0.21 0.11 0.38 0.13 0.36 0.15 0.2 0.13
0.31 1.0 0.14 0.2 0.28 0.2 0.25 0.09 0.12 0.06
0.33 1.0 0.31 0.2 0.37 0.23 0.36 0.14 0.29 0.19
0.37 1.0 0.2 0.04 0.13 0.04 0.16 0.06 0.15 0.02
0.45 1.0 0.36 0.18 0.31 0.19 0.28 0.25 0.28 0.16
0.26 1.0 0.07 0.12 0.32 0.09 0.24 0.05 0.12 0.03
Spa_g17234 (EDD)
0.52 1.0 0.33 0.23 0.38 0.26 0.39 0.27 0.3 0.14
0.16 1.0 0.16 0.03 0.26 0.04 0.25 0.03 0.09 0.06
0.42 1.0 0.3 0.2 0.29 0.22 0.28 0.25 0.28 0.17
0.15 1.0 0.21 0.04 0.21 0.08 0.17 0.07 0.19 0.09
0.23 1.0 0.38 0.17 0.35 0.22 0.4 0.11 0.34 0.1
0.41 1.0 0.24 0.07 0.18 0.06 0.16 0.12 0.18 0.08
0.22 1.0 0.22 0.13 0.36 0.15 0.38 0.12 0.22 0.13
Spa_g20297 (REME1)
0.24 1.0 0.32 0.16 0.38 0.19 0.33 0.22 0.29 0.18
0.41 1.0 0.35 0.2 0.33 0.26 0.35 0.23 0.31 0.2
0.32 1.0 0.27 0.19 0.38 0.21 0.36 0.18 0.3 0.22
0.13 1.0 0.09 0.06 0.2 0.09 0.19 0.08 0.1 0.08
Spa_g22620 (4-Oct)
0.12 1.0 0.08 0.03 0.23 0.06 0.23 0.02 0.1 0.02
0.35 1.0 0.4 0.24 0.41 0.26 0.44 0.3 0.42 0.23
Spa_g22744 (PFC1)
0.32 1.0 0.2 0.19 0.28 0.2 0.27 0.18 0.21 0.1
Spa_g22875 (CLPR4)
0.34 1.0 0.24 0.27 0.29 0.35 0.29 0.18 0.27 0.15
Spa_g23700 (OTP86)
0.35 1.0 0.29 0.15 0.29 0.14 0.28 0.2 0.28 0.14
0.44 1.0 0.39 0.2 0.29 0.21 0.39 0.21 0.32 0.14
0.25 1.0 0.1 0.09 0.27 0.1 0.26 0.07 0.18 0.07
Spa_g23977 (CRR22)
0.13 1.0 0.27 0.1 0.4 0.15 0.31 0.06 0.23 0.12
0.19 1.0 0.36 0.22 0.44 0.28 0.46 0.13 0.36 0.2
0.24 1.0 0.23 0.21 0.34 0.21 0.29 0.08 0.17 0.11
0.21 1.0 0.24 0.09 0.33 0.13 0.3 0.14 0.2 0.15
Spa_g25619 (CR88)
0.35 1.0 0.16 0.16 0.23 0.2 0.22 0.2 0.22 0.11
Spa_g25737 (AMT2)
0.02 1.0 0.05 0.05 0.2 0.08 0.08 0.0 0.0 0.03
0.42 1.0 0.5 0.24 0.47 0.28 0.45 0.22 0.34 0.21
Spa_g25939 (OTP86)
0.4 1.0 0.3 0.21 0.23 0.21 0.23 0.13 0.16 0.16
0.24 1.0 0.26 0.18 0.27 0.29 0.31 0.09 0.24 0.12
Spa_g26143 (MEF1)
0.27 1.0 0.43 0.17 0.36 0.2 0.33 0.14 0.25 0.21
0.31 1.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.13 0.04 0.07 0.0
Spa_g26517 (EMB2758)
0.21 1.0 0.23 0.24 0.39 0.28 0.45 0.1 0.23 0.2
0.38 1.0 0.28 0.15 0.32 0.17 0.36 0.32 0.26 0.14
0.48 1.0 0.24 0.06 0.22 0.04 0.24 0.04 0.1 0.15
0.22 1.0 0.27 0.1 0.33 0.08 0.35 0.11 0.23 0.13
Spa_g26827 (CRR22)
0.26 1.0 0.26 0.14 0.37 0.15 0.38 0.11 0.25 0.18
0.22 1.0 0.22 0.18 0.24 0.18 0.23 0.07 0.26 0.17
Spa_g27801 (EMB2758)
0.32 1.0 0.48 0.2 0.44 0.24 0.43 0.2 0.31 0.22
0.26 1.0 0.4 0.12 0.31 0.18 0.31 0.09 0.28 0.1
0.32 1.0 0.34 0.27 0.3 0.29 0.33 0.13 0.17 0.22
0.36 1.0 0.47 0.25 0.46 0.3 0.43 0.25 0.44 0.31
0.31 1.0 0.42 0.19 0.34 0.23 0.37 0.11 0.34 0.16
Spa_g29877 (PSBY)
0.35 1.0 0.07 0.31 0.32 0.31 0.27 0.07 0.19 0.07
0.37 1.0 0.34 0.26 0.35 0.34 0.39 0.14 0.32 0.18
0.46 1.0 0.34 0.15 0.35 0.15 0.31 0.17 0.28 0.14
0.29 1.0 0.33 0.12 0.37 0.15 0.33 0.11 0.31 0.18
0.32 1.0 0.26 0.21 0.38 0.26 0.41 0.16 0.23 0.2
0.26 1.0 0.17 0.17 0.38 0.13 0.33 0.21 0.33 0.19
0.27 1.0 0.33 0.31 0.44 0.36 0.38 0.22 0.32 0.29
0.29 1.0 0.34 0.23 0.49 0.3 0.41 0.11 0.24 0.24
Spa_g38996 (LDA)
0.52 1.0 0.31 0.26 0.43 0.29 0.41 0.32 0.32 0.24
0.41 1.0 0.31 0.35 0.36 0.34 0.35 0.23 0.24 0.21
0.18 1.0 0.17 0.06 0.15 0.06 0.21 0.06 0.15 0.07
0.23 1.0 0.26 0.15 0.35 0.19 0.35 0.1 0.28 0.14
0.24 1.0 0.32 0.18 0.37 0.21 0.34 0.16 0.23 0.16
0.57 1.0 0.49 0.27 0.28 0.36 0.29 0.29 0.19 0.15
0.17 1.0 0.02 0.13 0.37 0.09 0.26 0.03 0.14 0.0
0.27 1.0 0.31 0.21 0.35 0.21 0.36 0.14 0.21 0.14
0.37 1.0 0.25 0.15 0.28 0.17 0.27 0.21 0.23 0.1
0.34 1.0 0.37 0.27 0.31 0.34 0.27 0.13 0.24 0.16
0.48 1.0 0.32 0.19 0.19 0.19 0.17 0.22 0.2 0.17
0.2 1.0 0.15 0.07 0.25 0.07 0.22 0.14 0.24 0.06
Spa_g49347 (OTP84)
0.35 1.0 0.33 0.29 0.37 0.3 0.37 0.15 0.23 0.2
0.36 1.0 0.19 0.11 0.18 0.11 0.17 0.13 0.16 0.07
0.28 1.0 0.15 0.1 0.18 0.11 0.15 0.01 0.08 0.07
0.18 1.0 0.29 0.06 0.16 0.04 0.16 0.01 0.15 0.07
0.4 1.0 0.29 0.26 0.34 0.27 0.36 0.23 0.39 0.16
0.5 1.0 0.47 0.18 0.33 0.27 0.36 0.27 0.28 0.18
0.25 1.0 0.25 0.11 0.24 0.12 0.25 0.11 0.24 0.12
0.23 1.0 0.16 0.12 0.35 0.16 0.36 0.15 0.16 0.19
0.26 1.0 0.18 0.08 0.25 0.1 0.24 0.09 0.18 0.1
0.26 1.0 0.32 0.15 0.35 0.16 0.35 0.11 0.27 0.15
0.23 1.0 0.21 0.14 0.39 0.18 0.27 0.05 0.28 0.12
0.18 1.0 0.19 0.16 0.33 0.14 0.31 0.14 0.21 0.18
0.14 1.0 0.07 0.06 0.33 0.04 0.3 0.06 0.22 0.09
0.33 1.0 0.23 0.08 0.24 0.1 0.23 0.05 0.17 0.08
0.24 1.0 0.27 0.17 0.26 0.21 0.23 0.1 0.17 0.09
0.24 1.0 0.26 0.24 0.3 0.24 0.3 0.12 0.19 0.11
0.33 1.0 0.43 0.36 0.4 0.41 0.41 0.18 0.33 0.29
0.35 1.0 0.33 0.32 0.37 0.39 0.37 0.19 0.3 0.18
0.36 1.0 0.36 0.25 0.36 0.32 0.34 0.12 0.32 0.19
0.31 1.0 0.3 0.23 0.26 0.28 0.26 0.08 0.18 0.2
0.25 1.0 0.28 0.2 0.24 0.21 0.3 0.08 0.19 0.09
Spa_g54623 (PDF1A)
0.62 1.0 0.36 0.42 0.49 0.43 0.48 0.4 0.44 0.36
0.18 1.0 0.21 0.21 0.39 0.17 0.38 0.07 0.21 0.15
0.34 1.0 0.2 0.16 0.31 0.16 0.3 0.14 0.22 0.11
0.23 1.0 0.29 0.16 0.33 0.2 0.35 0.08 0.29 0.17
0.34 1.0 0.35 0.26 0.38 0.28 0.42 0.25 0.29 0.21
Spa_g55598 (VAC1)
0.23 1.0 0.18 0.12 0.34 0.15 0.26 0.18 0.17 0.14
0.03 1.0 0.07 0.02 0.19 0.02 0.09 0.0 0.03 0.01
0.24 1.0 0.21 0.16 0.19 0.07 0.19 0.18 0.23 0.19
0.37 1.0 0.14 0.14 0.35 0.15 0.35 0.21 0.36 0.13
0.25 1.0 0.36 0.14 0.42 0.17 0.42 0.13 0.29 0.18
0.26 1.0 0.23 0.22 0.32 0.28 0.25 0.14 0.19 0.11
0.19 1.0 0.15 0.14 0.32 0.11 0.25 0.14 0.3 0.09
0.2 1.0 0.23 0.2 0.37 0.22 0.43 0.09 0.23 0.19
0.36 1.0 0.17 0.18 0.17 0.18 0.17 0.1 0.15 0.1
0.37 1.0 0.44 0.26 0.46 0.31 0.45 0.19 0.36 0.23
0.27 1.0 0.36 0.22 0.25 0.19 0.33 0.13 0.33 0.19
0.31 1.0 0.23 0.16 0.31 0.24 0.29 0.13 0.16 0.11
0.36 1.0 0.18 0.22 0.27 0.22 0.25 0.15 0.23 0.08
0.25 1.0 0.17 0.08 0.22 0.1 0.24 0.03 0.09 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)