Heatmap: Cluster_175 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.05 0.11 0.14 0.15 0.17 0.15 0.24 1.0 0.65 0.22
0.18 0.14 0.11 0.1 0.18 0.1 0.19 1.0 0.5 0.12
0.0 0.0 0.09 0.05 0.03 0.02 0.07 1.0 0.76 0.11
0.03 0.0 0.05 0.08 0.0 0.03 0.0 1.0 0.63 0.0
Spa_g01868 (HY4)
0.2 0.14 0.15 0.12 0.13 0.14 0.19 1.0 0.51 0.12
0.42 0.42 0.41 0.29 0.37 0.29 0.38 1.0 0.7 0.39
Spa_g02267 (ECT7)
0.18 0.25 0.18 0.23 0.29 0.26 0.31 1.0 0.81 0.23
0.06 0.12 0.1 0.13 0.27 0.16 0.32 1.0 0.63 0.19
0.03 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.44 0.1
0.1 0.17 0.21 0.11 0.17 0.14 0.27 1.0 0.72 0.14
0.0 0.01 0.05 0.01 0.05 0.01 0.04 1.0 0.14 0.17
Spa_g04476 (ECHIA)
0.13 0.28 0.42 0.22 0.32 0.21 0.35 1.0 0.62 0.3
0.13 0.24 0.12 0.05 0.18 0.04 0.17 1.0 0.58 0.09
Spa_g05036 (UGT85A5)
0.25 0.29 0.3 0.37 0.41 0.34 0.41 1.0 0.68 0.31
0.2 0.25 0.23 0.14 0.17 0.16 0.19 1.0 0.32 0.25
0.01 0.02 0.11 0.01 0.03 0.01 0.03 1.0 0.25 0.11
0.08 0.06 0.07 0.07 0.12 0.11 0.11 1.0 0.51 0.01
0.16 0.12 0.2 0.27 0.25 0.25 0.23 1.0 0.6 0.24
0.22 0.34 0.34 0.24 0.38 0.25 0.38 1.0 0.78 0.27
0.03 0.03 0.09 0.06 0.1 0.06 0.14 1.0 0.31 0.16
Spa_g07433 (AFB2)
0.16 0.15 0.27 0.11 0.16 0.12 0.18 1.0 0.45 0.23
0.12 0.17 0.21 0.14 0.21 0.12 0.24 1.0 0.76 0.21
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.34 0.04
Spa_g08479 (SAT-106)
0.04 0.23 0.13 0.07 0.18 0.07 0.2 1.0 0.46 0.24
Spa_g08748 (UBQ11)
0.11 0.18 0.18 0.16 0.19 0.17 0.19 1.0 0.71 0.23
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.63 0.0
0.45 0.5 0.55 0.53 0.57 0.51 0.61 1.0 0.78 0.57
Spa_g10021 (NCBP)
0.36 0.48 0.44 0.39 0.43 0.41 0.46 1.0 0.67 0.43
0.16 0.32 0.37 0.25 0.32 0.21 0.38 1.0 0.55 0.3
Spa_g10373 (SCL14)
0.06 0.03 0.16 0.11 0.16 0.13 0.19 1.0 0.55 0.2
0.19 0.3 0.27 0.22 0.3 0.23 0.36 1.0 0.72 0.28
Spa_g11777 (ANN5)
0.18 0.23 0.22 0.26 0.25 0.27 0.3 1.0 0.8 0.27
0.15 0.12 0.27 0.21 0.36 0.22 0.34 1.0 0.7 0.36
0.34 0.39 0.48 0.41 0.4 0.42 0.42 1.0 0.55 0.36
0.22 0.24 0.29 0.2 0.33 0.22 0.34 1.0 0.72 0.26
Spa_g14313 (GID1C)
0.02 0.1 0.05 0.07 0.08 0.05 0.08 1.0 0.35 0.2
0.31 0.34 0.39 0.32 0.34 0.33 0.4 1.0 0.77 0.3
0.03 0.03 0.11 0.03 0.11 0.04 0.12 1.0 0.23 0.12
0.19 0.14 0.29 0.24 0.24 0.24 0.27 1.0 0.65 0.24
0.07 0.03 0.11 0.08 0.15 0.06 0.15 1.0 0.49 0.14
0.25 0.23 0.29 0.16 0.23 0.21 0.22 1.0 0.59 0.25
0.13 0.17 0.07 0.14 0.24 0.14 0.27 1.0 0.7 0.23
0.35 0.31 0.35 0.32 0.45 0.32 0.45 1.0 0.75 0.39
Spa_g18825 (CSY4)
0.15 0.2 0.28 0.29 0.3 0.26 0.33 1.0 0.81 0.35
Spa_g19185 (EDA5)
0.06 0.28 0.07 0.04 0.07 0.05 0.07 1.0 0.27 0.22
0.22 0.23 0.27 0.26 0.29 0.26 0.33 1.0 0.75 0.33
Spa_g20494 (KUP11)
0.01 0.05 0.1 0.01 0.03 0.01 0.04 1.0 0.29 0.16
Spa_g21189 (UBC34)
0.18 0.22 0.27 0.22 0.32 0.22 0.33 1.0 0.77 0.26
0.13 0.2 0.33 0.2 0.28 0.21 0.36 1.0 0.71 0.23
0.08 0.05 0.07 0.01 0.07 0.02 0.09 1.0 0.23 0.15
Spa_g22043 (PIRL4)
0.13 0.05 0.13 0.04 0.05 0.04 0.04 1.0 0.19 0.16
Spa_g22304 (TLP3)
0.06 0.02 0.08 0.05 0.13 0.04 0.14 1.0 0.43 0.1
Spa_g22325 (BAS1)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.03 1.0 0.29 0.12
0.08 0.03 0.04 0.13 0.19 0.17 0.13 1.0 0.58 0.15
0.01 0.05 0.07 0.13 0.1 0.13 0.12 1.0 0.56 0.11
0.21 0.28 0.21 0.22 0.23 0.21 0.26 1.0 0.66 0.21
0.02 0.02 0.14 0.03 0.1 0.05 0.12 1.0 0.24 0.18
0.19 0.22 0.28 0.18 0.29 0.2 0.31 1.0 0.67 0.26
0.14 0.06 0.18 0.1 0.06 0.08 0.05 1.0 0.33 0.04
Spa_g26520 (GLR3.3)
0.3 0.09 0.16 0.09 0.1 0.1 0.18 1.0 0.5 0.17
0.19 0.29 0.43 0.23 0.24 0.19 0.29 1.0 0.52 0.3
0.03 0.05 0.02 0.02 0.1 0.02 0.07 1.0 0.47 0.03
Spa_g27995 (BAC2)
0.02 0.0 0.05 0.05 0.01 0.04 0.03 1.0 0.49 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.32 0.02
0.09 0.12 0.19 0.13 0.18 0.13 0.23 1.0 0.53 0.21
Spa_g30857 (MBD11)
0.1 0.06 0.28 0.05 0.13 0.05 0.17 1.0 0.35 0.15
Spa_g31000 (VCR)
0.07 0.2 0.28 0.15 0.25 0.17 0.27 1.0 0.41 0.23
0.16 0.18 0.2 0.11 0.19 0.14 0.17 1.0 0.65 0.14
0.04 0.02 0.07 0.02 0.03 0.02 0.05 1.0 0.22 0.04
0.13 0.15 0.1 0.08 0.12 0.06 0.11 1.0 0.58 0.21
Spa_g37155 (NAC057)
0.16 0.22 0.22 0.12 0.2 0.12 0.21 1.0 0.56 0.13
0.4 0.33 0.48 0.39 0.45 0.4 0.41 1.0 0.56 0.4
Spa_g39610 (SR1)
0.2 0.31 0.28 0.16 0.23 0.16 0.25 1.0 0.6 0.26
0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.2 0.13
0.21 0.25 0.23 0.21 0.22 0.16 0.21 1.0 0.6 0.35
Spa_g47083 (HAP5A)
0.13 0.06 0.07 0.18 0.14 0.18 0.18 1.0 0.49 0.19
0.23 0.27 0.33 0.33 0.34 0.31 0.34 1.0 0.76 0.32
Spa_g49535 (MBD2)
0.28 0.29 0.39 0.36 0.34 0.31 0.37 1.0 0.62 0.29
0.31 0.36 0.41 0.37 0.45 0.34 0.46 1.0 0.56 0.43
Spa_g50725 (PIRL4)
0.07 0.21 0.14 0.12 0.18 0.11 0.23 1.0 0.63 0.2
0.28 0.34 0.37 0.33 0.47 0.32 0.52 1.0 0.66 0.43
0.12 0.14 0.08 0.05 0.07 0.02 0.1 1.0 0.47 0.13
0.06 0.02 0.16 0.1 0.06 0.14 0.2 1.0 0.69 0.06
0.12 0.12 0.25 0.16 0.23 0.17 0.24 1.0 0.7 0.18
Spa_g53872 (UBQ11)
0.1 0.16 0.17 0.17 0.17 0.17 0.19 1.0 0.63 0.22
Spa_g55167 (SCL30A)
0.17 0.11 0.27 0.13 0.09 0.14 0.07 1.0 0.33 0.13
Spa_g57014 (DRH1)
0.16 0.26 0.28 0.2 0.32 0.21 0.37 1.0 0.86 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)