Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g00663 (CDF1)	1.0	0.93	0.49	0.31	0.37	0.33	0.4	0.26	0.26	0.26
Spa_g00951	0.82	1.0	0.82	0.57	0.62	0.58	0.56	0.51	0.59	0.5
Spa_g01000	0.54	1.0	0.39	0.47	0.4	0.58	0.31	0.12	0.19	0.24
Spa_g01184	0.54	1.0	0.52	0.32	0.3	0.35	0.3	0.2	0.29	0.15
Spa_g02248	0.81	1.0	0.27	0.37	0.29	0.37	0.29	0.17	0.14	0.14
Spa_g02828	0.94	1.0	0.45	0.52	0.67	0.56	0.58	0.32	0.48	0.36
Spa_g04160	0.58	1.0	0.27	0.18	0.3	0.2	0.28	0.15	0.24	0.11
Spa_g04186 (RFC3)	0.55	1.0	0.34	0.28	0.29	0.28	0.3	0.19	0.21	0.24
Spa_g04792 (NAP7)	0.85	1.0	0.4	0.4	0.37	0.42	0.33	0.18	0.26	0.25
Spa_g05242 (CRR6)	0.78	1.0	0.5	0.49	0.42	0.47	0.39	0.17	0.3	0.26
Spa_g05377	0.66	1.0	0.71	0.49	0.38	0.54	0.38	0.33	0.3	0.37
Spa_g05399	0.86	1.0	0.33	0.39	0.32	0.35	0.26	0.19	0.17	0.21
Spa_g05435	0.82	1.0	0.65	0.56	0.47	0.58	0.47	0.33	0.38	0.39
Spa_g05866	0.72	1.0	0.34	0.31	0.39	0.29	0.35	0.25	0.27	0.24
Spa_g05931	0.67	1.0	0.54	0.52	0.45	0.57	0.5	0.28	0.42	0.36
Spa_g06264	0.66	1.0	0.53	0.31	0.35	0.33	0.28	0.38	0.39	0.24
Spa_g06455	0.78	1.0	0.62	0.55	0.57	0.57	0.52	0.48	0.53	0.44
Spa_g06499 (emb2004)	0.8	1.0	0.49	0.4	0.51	0.45	0.48	0.18	0.38	0.27
Spa_g06607	0.81	1.0	0.49	0.45	0.5	0.45	0.54	0.21	0.36	0.34
Spa_g06637	0.63	1.0	0.26	0.23	0.27	0.26	0.28	0.18	0.19	0.16
Spa_g06850	0.61	1.0	0.63	0.66	0.55	0.63	0.52	0.42	0.46	0.5
Spa_g06943 (CR88)	0.62	1.0	0.31	0.31	0.32	0.36	0.33	0.18	0.21	0.2
Spa_g07064	0.61	1.0	0.58	0.54	0.43	0.5	0.48	0.22	0.3	0.4
Spa_g07099	0.67	1.0	0.79	0.56	0.47	0.6	0.46	0.39	0.44	0.41
Spa_g07187	0.67	1.0	0.38	0.34	0.38	0.34	0.35	0.18	0.32	0.26
Spa_g07287	1.0	0.92	0.44	0.3	0.25	0.28	0.25	0.11	0.2	0.2
Spa_g07424 (MAR1)	1.0	0.87	0.51	0.32	0.33	0.35	0.32	0.29	0.27	0.31
Spa_g07574	0.54	1.0	0.38	0.29	0.24	0.31	0.23	0.09	0.1	0.11
Spa_g08391	0.99	1.0	0.66	0.46	0.52	0.5	0.47	0.34	0.51	0.36
Spa_g08475	1.0	1.0	0.38	0.41	0.35	0.39	0.32	0.27	0.25	0.25
Spa_g08504	0.61	1.0	0.34	0.31	0.35	0.31	0.33	0.33	0.26	0.2
Spa_g08541	0.88	1.0	0.51	0.48	0.44	0.48	0.41	0.24	0.3	0.33
Spa_g08551	0.69	1.0	0.43	0.14	0.23	0.13	0.15	0.34	0.47	0.01
Spa_g08644	0.57	1.0	0.55	0.49	0.51	0.53	0.48	0.27	0.35	0.44
Spa_g08724 (CLP2)	0.71	1.0	0.48	0.42	0.39	0.43	0.37	0.18	0.21	0.32
Spa_g08879	0.83	1.0	0.54	0.39	0.41	0.34	0.43	0.38	0.44	0.23
Spa_g09328	0.75	1.0	0.49	0.44	0.38	0.44	0.34	0.14	0.25	0.25
Spa_g09366	0.53	1.0	0.37	0.42	0.31	0.43	0.31	0.19	0.21	0.2
Spa_g09383	0.67	1.0	0.63	0.52	0.51	0.55	0.49	0.36	0.44	0.36
Spa_g09433 (CFM2)	0.8	1.0	0.59	0.19	0.31	0.23	0.31	0.42	0.34	0.27
Spa_g09710 (ISPF)	0.65	1.0	0.63	0.54	0.52	0.53	0.52	0.24	0.36	0.34
Spa_g09823	0.77	1.0	0.51	0.23	0.4	0.24	0.43	0.25	0.28	0.18
Spa_g09925 (OPT4)	0.55	1.0	0.38	0.06	0.28	0.08	0.23	0.29	0.11	0.16
Spa_g09973 (CLPP4)	0.91	1.0	0.44	0.42	0.47	0.42	0.49	0.25	0.37	0.31
Spa_g10048	0.74	1.0	0.77	0.46	0.47	0.45	0.38	0.47	0.47	0.49
Spa_g10145 (TOC64-III)	0.78	1.0	0.55	0.57	0.6	0.59	0.61	0.31	0.44	0.37
Spa_g10146 (TOC64-III)	0.69	1.0	0.65	0.53	0.49	0.54	0.45	0.31	0.35	0.37
Spa_g10193	0.8	1.0	0.42	0.34	0.36	0.36	0.35	0.22	0.26	0.25
Spa_g10253	0.58	1.0	0.35	0.25	0.35	0.26	0.33	0.2	0.25	0.16
Spa_g10436	0.71	1.0	0.43	0.37	0.37	0.36	0.35	0.3	0.34	0.32
Spa_g10942	0.54	1.0	0.45	0.29	0.33	0.25	0.31	0.21	0.2	0.35
Spa_g11290	0.7	1.0	0.43	0.29	0.25	0.34	0.27	0.13	0.13	0.22
Spa_g11390	0.67	1.0	0.56	0.35	0.43	0.34	0.4	0.23	0.27	0.25
Spa_g12152 (AKR2B)	0.6	1.0	0.4	0.49	0.35	0.5	0.32	0.19	0.31	0.26
Spa_g12293	0.51	1.0	0.48	0.47	0.45	0.49	0.42	0.24	0.26	0.28
Spa_g12356 (ML5)	0.69	1.0	0.72	0.59	0.55	0.68	0.58	0.43	0.47	0.47
Spa_g12379 (GME)	0.66	1.0	0.5	0.3	0.36	0.33	0.35	0.25	0.29	0.24
Spa_g12493	0.67	1.0	0.57	0.2	0.28	0.2	0.32	0.38	0.4	0.22
Spa_g12782	0.91	1.0	0.62	0.43	0.54	0.4	0.45	0.28	0.46	0.38
Spa_g13670 (MRP6)	0.35	1.0	0.46	0.08	0.09	0.09	0.08	0.01	0.02	0.0
Spa_g14437	0.69	1.0	0.37	0.24	0.46	0.3	0.5	0.26	0.31	0.21
Spa_g14457	0.53	1.0	0.68	0.37	0.47	0.41	0.37	0.21	0.29	0.22
Spa_g14798	0.4	1.0	0.31	0.01	0.11	0.04	0.19	0.33	0.39	0.09
Spa_g14937	0.82	1.0	0.52	0.46	0.51	0.5	0.5	0.36	0.33	0.42
Spa_g15201	0.55	1.0	0.46	0.36	0.34	0.4	0.31	0.21	0.28	0.15
Spa_g15202	0.88	1.0	0.79	0.35	0.39	0.33	0.42	0.59	0.38	0.44
Spa_g15263	0.78	1.0	0.48	0.24	0.31	0.27	0.24	0.42	0.26	0.18
Spa_g15266	0.77	1.0	0.47	0.47	0.45	0.43	0.38	0.29	0.36	0.43
Spa_g15384 (NYC1)	0.97	1.0	0.5	0.25	0.48	0.3	0.43	0.5	0.4	0.26
Spa_g15771 (EMB36)	1.0	1.0	0.67	0.53	0.63	0.55	0.64	0.43	0.6	0.43
Spa_g16285	0.77	1.0	0.67	0.53	0.63	0.51	0.62	0.4	0.41	0.44
Spa_g16979	0.62	1.0	0.59	0.59	0.51	0.63	0.49	0.37	0.4	0.45
Spa_g17134 (MIND)	0.57	1.0	0.35	0.27	0.29	0.24	0.29	0.3	0.24	0.15
Spa_g18306	0.73	1.0	0.46	0.45	0.37	0.45	0.36	0.44	0.4	0.3
Spa_g18340 (MEF22)	0.77	1.0	0.68	0.5	0.51	0.45	0.53	0.48	0.53	0.44
Spa_g18391 (IMPL1)	0.82	1.0	0.42	0.41	0.34	0.41	0.35	0.19	0.28	0.26
Spa_g18446 (CRR22)	0.52	1.0	0.39	0.39	0.29	0.39	0.25	0.1	0.19	0.24
Spa_g18488	0.55	1.0	0.21	0.31	0.33	0.33	0.26	0.12	0.12	0.16
Spa_g18741 (CRF3)	0.61	1.0	0.52	0.07	0.15	0.05	0.14	0.04	0.12	0.08
Spa_g18745 (HDA15)	0.76	1.0	0.35	0.28	0.21	0.27	0.21	0.09	0.1	0.12
Spa_g18833	0.93	1.0	0.59	0.41	0.44	0.41	0.44	0.51	0.47	0.39
Spa_g18856 (CLPS3)	0.69	1.0	0.65	0.41	0.43	0.38	0.38	0.29	0.37	0.31
Spa_g18962 (MAR1)	0.82	1.0	0.38	0.27	0.3	0.24	0.22	0.23	0.22	0.22
Spa_g19064	0.74	1.0	0.53	0.33	0.38	0.3	0.4	0.53	0.39	0.29
Spa_g19065	0.76	1.0	0.37	0.15	0.24	0.16	0.21	0.29	0.38	0.04
Spa_g20006 (EST3)	0.3	1.0	0.41	0.09	0.14	0.06	0.06	0.01	0.05	0.02
Spa_g20529 (MRP6)	0.29	1.0	0.37	0.11	0.09	0.11	0.05	0.01	0.02	0.03
Spa_g21347	0.78	1.0	0.45	0.2	0.24	0.15	0.26	0.39	0.37	0.01
Spa_g21535	0.55	1.0	0.44	0.05	0.11	0.07	0.21	0.36	0.55	0.08
Spa_g21801	0.59	1.0	0.39	0.1	0.23	0.12	0.35	0.06	0.28	0.07
Spa_g22928 (UBP1B)	0.81	1.0	0.52	0.23	0.29	0.24	0.23	0.36	0.31	0.22
Spa_g24785	0.61	1.0	0.35	0.37	0.31	0.34	0.31	0.25	0.22	0.21
Spa_g24921	0.57	1.0	0.51	0.33	0.48	0.33	0.46	0.22	0.33	0.17
Spa_g25183	0.74	1.0	0.74	0.48	0.46	0.52	0.32	0.28	0.3	0.3
Spa_g25712 (emb1624)	0.71	1.0	0.57	0.48	0.42	0.48	0.4	0.26	0.33	0.31
Spa_g26112	0.56	1.0	0.26	0.22	0.29	0.26	0.27	0.21	0.18	0.17
Spa_g26505 (KCA2)	0.54	1.0	0.53	0.29	0.32	0.32	0.29	0.19	0.23	0.19
Spa_g26711	0.69	1.0	0.43	0.32	0.33	0.27	0.31	0.38	0.37	0.09
Spa_g27697	0.73	1.0	0.5	0.36	0.37	0.3	0.31	0.2	0.14	0.18
Spa_g29357	0.98	1.0	0.51	0.32	0.42	0.34	0.43	0.25	0.34	0.26
Spa_g37332	0.55	1.0	0.58	0.36	0.32	0.41	0.29	0.14	0.23	0.18
Spa_g37505 (CR88)	0.88	1.0	0.3	0.24	0.43	0.32	0.41	0.24	0.25	0.17
Spa_g40494 (crr1)	0.86	1.0	0.33	0.33	0.28	0.42	0.23	0.17	0.19	0.11
Spa_g44644	0.76	1.0	0.71	0.41	0.49	0.45	0.48	0.37	0.35	0.42
Spa_g44822	0.54	1.0	0.52	0.34	0.38	0.35	0.44	0.21	0.28	0.37
Spa_g45071 (MRP6)	0.33	1.0	0.34	0.12	0.13	0.13	0.06	0.01	0.02	0.01
Spa_g46191 (SIGB)	0.86	1.0	0.47	0.3	0.4	0.28	0.37	0.42	0.22	0.17
Spa_g46288	0.6	1.0	0.39	0.25	0.36	0.27	0.38	0.09	0.19	0.27
Spa_g47317	0.6	1.0	0.29	0.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.04	0.06
Spa_g47438	0.61	1.0	0.7	0.42	0.36	0.43	0.31	0.2	0.32	0.2
Spa_g50414	0.86	1.0	0.73	0.49	0.4	0.56	0.35	0.53	0.45	0.52
Spa_g50477	0.66	1.0	0.45	0.33	0.44	0.29	0.36	0.12	0.23	0.2
Spa_g50917 (MAR1)	0.88	1.0	0.49	0.42	0.3	0.43	0.29	0.25	0.25	0.2
Spa_g51921 (MRP8)	0.31	1.0	0.46	0.07	0.16	0.11	0.03	0.0	0.01	0.01
Spa_g53486 (SLO1)	0.62	1.0	0.39	0.46	0.47	0.45	0.42	0.19	0.38	0.33
Spa_g53745	0.45	1.0	0.25	0.12	0.4	0.15	0.25	0.03	0.23	0.12
Spa_g54007	0.69	1.0	0.57	0.26	0.29	0.23	0.26	0.51	0.31	0.24
Spa_g54828	0.7	1.0	0.45	0.31	0.34	0.2	0.29	0.33	0.41	0.1
Spa_g55549	0.64	1.0	0.4	0.24	0.32	0.3	0.43	0.15	0.33	0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)