Heatmap: Cluster_106 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
-4.87 -0.93 - - - - - - - 3.24
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g31645 (CYTC-2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g33236 (PHT5)
- - - - - - - - - 3.32
- -4.51 - - -3.45 - -3.81 - - 3.29
Spa_g34060 (PER1)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34198 (SBT4.13)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34538 (SYP122)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g34581 (ARA5)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -2.64 3.3
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g37576 (UBC7)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g37792 (CAM4)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g37822 (HINT4)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - -5.82 -7.34 - -7.68 - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-4.37 - -4.72 -2.76 -4.81 -3.1 -5.45 -2.56 -2.63 3.21
Spa_g39151 (ARA12)
-5.4 -4.14 -5.16 -3.84 -3.36 -3.02 -3.28 -5.31 -4.65 3.24
-2.12 -1.33 -0.98 -2.63 -2.16 -2.97 -1.82 -2.02 -2.47 2.93
Spa_g39206 (ATG8F)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39227 (FATB)
- - - - - - - -3.41 - 3.31
- - -3.56 - -5.9 - -6.91 - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39615 (UGT85A1)
- -5.3 - -1.99 - -2.52 - - - 3.26
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39705 (XCP1)
- - - - - - - - -4.3 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39857 (ARA2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g39959 (RCI2A)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40091 (UGT85A1)
- - -4.21 - - - - - - 3.31
- - - - - - - - - 3.32
- - -2.08 - - - - - - 3.29
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40245 (CAM6)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40559 (NQR)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40735 (HEXO2)
-4.61 - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g40784 (CPK14)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41102 (AAC3)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41208 (NRPA1)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41509 (UBQ11)
- - - - - - - - - 3.32
Spa_g41610 (UGT85A5)
- - - -4.88 - -6.75 - - -5.65 3.31
- - -3.27 -3.68 - -2.35 - -1.49 - 3.21
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - -4.91 3.32
Spa_g42353 (XCP2)
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
- - - - - - - - - 3.32
-3.32 - - - - - - - - 3.31
-6.49 - -1.36 -3.53 -4.65 -6.53 -6.59 -6.79 -4.29 3.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.