Heatmap: Cluster_126 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g29106 (MUB6)	-2.73	-4.1	3.13	-2.25	-4.31	-2.06	-3.78	-2.58	-2.78	-2.49
Spa_g31201	-2.63	-	3.25	-	-	-	-	-3.75	-2.16	-6.46
Spa_g33914	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-4.85
Spa_g36024 (AL4)	-3.36	-	3.27	-4.77	-	-5.61	-	-3.37	-6.74	-3.01
Spa_g36926	-3.86	-	3.29	-	-	-	-	-	-	-2.75
Spa_g37330 (LUP2)	-5.61	-	3.26	-	-	-	-	-1.36	-8.26	-5.35
Spa_g43034	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43125	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43293	-0.68	-	3.17	-	-	-	-	-2.82	-	-2.3
Spa_g43302	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43330	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43350	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43440	-1.71	-	3.26	-	-	-	-	-2.93	-	-
Spa_g43503	-	-	3.28	-	-	-	-	-2.65	-	-2.77
Spa_g43542	-2.02	-	3.29	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43546	-	-	3.28	-	-4.35	-	-	-2.05	-	-
Spa_g43657 (SYP124)	-2.77	-3.85	3.27	-6.31	-5.52	-	-5.3	-	-	-4.1
Spa_g43678	-7.54	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-5.08
Spa_g43701	-3.2	-	3.27	-8.04	-	-	-	-6.43	-4.87	-2.19
Spa_g43871	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43942	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44010	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44019	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44165	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44309	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.34	-	-
Spa_g44327	-1.55	-	3.22	-	-	-	-	-3.02	-2.34	-4.68
Spa_g44338	-	-	3.25	-	-3.76	-	-	-2.65	-2.14	-
Spa_g44350	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44398	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44452	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44668	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.26	-	-
Spa_g44786	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44819	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44846	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44864	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45118	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.48	-2.67	-
Spa_g45194	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45324 (DSO)	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-3.86
Spa_g45414	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45489	-2.4	-3.34	3.23	-	-3.58	-	-	-2.16	-	-
Spa_g45635	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45994	-	-	3.22	-3.15	-2.94	-	-2.35	-	-2.86	-3.7
Spa_g46013	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46225	-	-	3.32	-	-7.44	-	-	-	-	-6.14
Spa_g46313	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46318	-	-	3.3	-5.53	-7.38	-4.35	-	-5.67	-5.01	-5.74
Spa_g46323 (LUP2)	-	-	3.32	-	-	-	-	-7.25	-7.79	-8.84
Spa_g46341	-2.09	-	3.28	-	-	-	-	-	-4.52	-
Spa_g46393	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-4.6
Spa_g46408	-5.52	-3.6	3.25	-	-3.85	-	-4.04	-3.78	-	-2.24
Spa_g46459	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46492 (CHAL)	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-4.03	-
Spa_g46498	-7.55	-	3.31	-	-	-	-6.07	-	-	-5.02
Spa_g46507	-	-8.42	3.32	-	-	-	-8.45	-8.13	-6.38	-6.15
Spa_g46613	-5.44	-4.02	3.26	-6.33	-4.5	-5.83	-5.07	-4.66	-4.29	-2.99
Spa_g46671 (ASY1)	-8.45	-	3.32	-	-	-	-	-8.95	-8.62	-5.1
Spa_g46676	-2.95	-4.17	3.28	-	-	-	-	-	-3.25	-
Spa_g46856	-4.31	-	3.3	-	-	-	-	-3.99	-	-4.11
Spa_g47030	-2.86	-	3.24	-1.87	-	-	-	-	-2.58	-
Spa_g47076	-6.35	-	3.3	-8.37	-6.92	-	-5.73	-6.93	-5.19	-4.11
Spa_g47155	-	-	3.32	-	-9.64	-	-11.41	-	-10.29	-6.39
Spa_g47156	-	-	3.32	-	-	-	-8.89	-	-8.21	-5.49
Spa_g47221	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.67	-	-
Spa_g47230	-2.48	-	3.28	-5.3	-5.67	-	-	-	-4.63	-4.46
Spa_g47259	-2.65	-	3.28	-	-	-	-	-	-4.29	-4.09
Spa_g47261	-1.38	-	3.25	-	-	-	-	-	-	-3.11
Spa_g47387	-	-	3.32	-7.49	-	-	-	-	-	-7.16
Spa_g47396	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47398 (TFIIB)	-	-	3.3	-4.12	-5.33	-3.73	-	-	-	-5.91
Spa_g47400 (PLSP1)	-	-	3.23	-2.78	-3.36	-4.55	-4.18	-3.83	-2.31	-5.58
Spa_g47431	-	-2.79	3.18	-	-3.21	-2.01	-2.0	-2.67	-	-
Spa_g47441	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-6.85
Spa_g47442	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-5.59	-5.73
Spa_g47530	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47565 (BEH4)	-6.73	-	3.29	-4.3	-4.23	-3.2	-5.74	-	-	-7.43
Spa_g47661	-3.82	-3.8	3.22	-	-3.06	-	-	-	-	-1.31
Spa_g47791	-	-	3.32	-	-9.96	-	-	-	-	-5.38
Spa_g47873	-	-	3.28	-4.5	-	-	-4.5	-3.67	-5.48	-3.18
Spa_g47881	-4.76	-8.43	3.31	-	-7.9	-	-	-5.2	-7.69	-6.76
Spa_g48096	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48105 (SCZ)	-4.1	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-4.52
Spa_g48199	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.31	-	-4.39
Spa_g48216 (PG2)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-6.86
Spa_g48286	-	-4.51	3.3	-6.16	-6.36	-4.14	-	-	-	-4.79
Spa_g48287	-8.16	-7.03	3.3	-7.28	-7.5	-5.07	-4.68	-5.27	-7.13	-
Spa_g48363	-4.0	-	3.29	-5.17	-	-	-	-	-	-3.14
Spa_g48364	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-6.22
Spa_g48365	-	-	3.32	-6.9	-	-	-	-	-	-
Spa_g48368 (SWEET5)	-6.0	-	3.31	-	-5.24	-	-	-5.21	-	-
Spa_g48458	-	-	3.3	-3.77	-	-4.86	-	-6.36	-	-4.36
Spa_g48543 (ELI3)	-4.06	-6.74	3.28	-7.2	-3.04	-9.11	-3.48	-	-	-6.15
Spa_g48561	-6.2	-7.53	3.25	-4.87	-6.02	-5.83	-5.59	-5.36	-3.77	-1.84
Spa_g48597	-	-3.99	3.31	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48675	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-5.75
Spa_g48744	-2.72	-	3.3	-	-	-	-	-	-5.28	-
Spa_g48781	-	-2.34	3.27	-4.75	-3.27	-5.57	-	-5.8	-	-
Spa_g48821	-	-	3.25	-2.13	-	-1.93	-	-	-	-
Spa_g49029	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-3.04	-
Spa_g49109	-4.02	-4.27	3.29	-	-	-	-	-3.98	-4.33	-
Spa_g49146	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49225	-5.58	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-5.5
Spa_g49257	-3.09	-	3.28	-	-4.92	-	-	-3.51	-	-3.68
Spa_g49264	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49314	-1.19	-	3.17	-	-	-	-	-3.74	-	-1.1
Spa_g49348	-7.33	-8.0	3.28	-4.7	-6.4	-5.8	-5.71	-4.98	-4.12	-3.86
Spa_g49520 (DMC1)	-3.35	-	3.27	-4.58	-	-3.57	-	-6.3	-	-2.97
Spa_g49634	-	-	3.16	-	-	-	-2.54	-1.76	-	-0.72
Spa_g49682	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49692	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49861	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.54	-	-
Spa_g49907 (WES1)	-	-	3.27	-	-	-	-	-1.79	-	-3.56
Spa_g49928 (UNE14)	-	-	3.3	-6.38	-	-	-	-5.46	-	-3.31
Spa_g49978	-2.0	-	3.13	-3.6	-4.99	-1.77	-3.0	-1.89	-5.43	-2.46
Spa_g49981 (DYAD)	-6.02	-6.79	3.26	-7.52	-4.48	-6.39	-4.85	-4.8	-7.36	-2.0
Spa_g50076	-2.12	-	3.28	-	-	-	-	-	-4.07	-
Spa_g50077	-3.69	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g50079	-3.14	-	3.26	-9.14	-9.35	-	-9.12	-5.32	-	-1.88
Spa_g52981	-0.94	-	3.11	-3.15	-5.67	-1.66	-4.64	-	-5.64	-1.68
Spa_g54981	-	-	3.32	-	-7.19	-5.21	-	-	-7.89	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.