1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo107453 (LOI1)
 -0.11 -0.42 -0.41 -0.01 0.17 0.49 0.82 0.67 0.75 0.69 0.34 0.33 -0.02 -0.18 1.07 0.14 -0.86 -1.05 -0.27 -2.56 -1.97 -3.09 -0.47 -0.43 0.65 -0.4 -0.37 -0.06 -0.37 -0.4 0.2 0.27
-0.07 0.1 1.06 1.02 1.4 1.21 1.53 1.39 1.48 1.17 0.97 0.15 -0.64 -0.12 1.87 -1.53 -6.56 -7.49 -5.86 - -5.36 -7.82 -7.01 -4.26 -7.29 -0.75 -1.34 -0.78 -5.68 -5.55 -7.71 -6.93
Smo121066 (PAO5)
 -0.05 0.11 0.53 0.4 0.63 0.68 0.95 0.81 0.75 0.79 0.59 0.13 1.42 0.06 1.74 0.38 -0.12 -0.4 -2.53 -1.62 -2.43 -1.64 -2.3 -2.26 -2.28 -1.71 -1.57 -1.45 -1.12 -0.88 -1.5 -1.73
-0.01 -0.12 -0.5 -0.17 0.41 0.62 1.07 0.79 0.66 0.37 0.53 -0.07 -0.96 -1.47 1.32 0.21 -0.17 -0.73 -0.03 -1.94 -3.32 -5.65 -0.32 -0.62 -2.39 -0.89 0.35 0.54 0.32 0.26 -0.13 -0.21
Smo146942 (CKA2)
 -0.75 -0.51 -0.08 0.1 0.12 0.07 0.6 0.91 0.79 0.8 0.77 0.31 -0.3 0.1 0.73 -0.29 -0.56 -0.93 -0.42 -1.5 -1.53 -1.54 -0.27 -0.19 -0.44 0.57 0.18 0.22 -0.43 -0.36 -0.39 -0.18
Smo156840 (CPFTSZ)
 -0.09 0.21 0.32 0.37 0.51 0.81 0.69 0.68 0.45 0.13 0.14 -0.2 -1.79 -1.03 0.63 -1.37 0.09 -0.34 -0.26 -1.95 -3.18 -1.73 -0.14 -0.37 0.01 -0.24 0.86 1.0 0.2 0.21 -1.03 -1.6
Smo161424 (HAG2)
 0.0 -0.03 0.17 0.11 0.22 0.6 0.37 0.57 0.23 0.21 -0.1 -0.17 -0.17 -0.31 0.74 -0.09 -0.46 -0.47 -0.06 -1.41 -1.15 -0.75 -0.38 -0.23 -0.08 0.44 0.74 0.59 -0.49 -0.48 -0.34 -0.44
Smo174931 (RH1)
 -0.35 -0.19 -0.29 0.2 0.48 0.61 0.68 0.84 0.59 0.55 0.18 -0.08 0.13 -0.7 1.15 0.18 -1.01 -1.23 -0.01 -2.91 -1.31 -2.13 -0.47 -0.11 -1.71 0.54 0.8 0.71 -0.54 -0.4 -0.99 -0.91
-0.31 0.04 0.6 0.73 1.04 0.87 0.98 0.9 0.96 0.75 0.44 -0.09 0.31 -0.03 1.9 0.07 -1.95 -0.7 -2.27 -1.93 -4.99 -1.97 -1.78 -0.85 -5.06 -0.02 -0.59 -0.17 -1.78 -1.07 -2.1 -1.73
-0.23 0.04 0.51 0.57 0.95 0.86 1.09 0.44 0.61 0.37 0.34 -0.23 -0.78 -0.51 1.13 -0.69 -0.29 0.14 -1.2 -0.5 -3.6 -0.94 -0.28 0.23 -3.68 -1.27 -0.85 -0.49 -0.26 0.25 -0.51 -0.32
-0.31 0.2 0.59 0.62 0.85 0.9 1.05 0.35 0.59 0.27 0.14 -0.39 -0.67 -0.09 1.79 -0.46 -0.17 0.32 -1.9 -1.1 -3.91 -0.52 -0.86 -0.56 -3.34 -0.78 -0.42 -0.13 -0.52 -0.13 -1.16 -1.33
-0.31 -0.3 -0.15 -0.03 0.17 0.35 0.6 0.59 0.45 0.56 0.2 0.28 -0.38 -0.64 0.62 -0.4 -0.35 -0.39 -0.04 -0.9 -0.79 -1.36 -0.3 -0.12 0.85 0.02 -0.08 0.13 -0.25 -0.22 -0.3 0.1
0.69 -0.09 0.64 0.66 0.39 1.08 0.82 0.96 1.16 1.13 0.47 0.51 -0.89 0.12 0.96 -0.67 -1.9 -3.7 -0.92 -5.05 - -4.72 -0.93 -0.95 - 0.59 0.11 0.5 -1.42 -1.0 -1.09 -1.35
0.22 0.5 0.87 0.95 1.51 1.54 1.14 1.13 0.92 0.72 0.94 -0.12 -2.91 0.7 2.41 -2.86 -4.23 -5.71 -5.22 -2.05 -7.49 -2.85 -3.92 -3.31 -3.79 -1.58 -1.35 -1.48 -5.67 -4.23 -5.35 -5.33
-0.21 0.12 0.06 0.02 0.27 0.4 0.56 0.62 0.47 0.53 0.29 0.1 -0.12 -0.84 0.7 -0.03 -0.66 -0.53 0.06 -1.51 -1.72 -1.78 -0.48 -0.21 -0.5 0.55 0.66 0.65 -0.48 -0.38 -0.31 -0.41
Smo233298 (ADNT1)
 -0.18 -0.31 -0.14 0.16 0.46 0.35 0.71 0.91 0.86 0.71 0.43 0.21 -0.08 -0.07 1.01 -0.11 -0.62 -0.74 0.15 -1.49 -3.14 -3.48 -0.43 -0.29 -0.39 0.16 -0.08 -0.06 -0.31 -0.24 -0.56 -0.47
-0.99 -1.12 -1.53 -0.58 -0.38 0.87 1.12 0.77 0.86 0.81 0.05 -0.46 -1.5 -1.65 1.42 -1.02 0.38 -0.45 -0.12 - - - -0.17 -0.73 - -0.78 -0.16 0.67 0.62 0.83 0.96 0.67
-0.3 -0.35 -0.1 0.12 0.36 0.49 1.26 0.84 0.6 0.3 0.03 -0.32 -0.51 -0.63 1.12 -0.59 -0.18 -0.72 0.15 - -4.31 - -0.15 -0.42 - -0.29 0.75 0.73 0.17 0.57 0.2 -0.87
-0.09 -0.17 0.04 0.26 0.23 0.37 0.47 0.5 0.48 0.42 0.35 0.08 0.1 -0.53 0.83 0.08 -0.36 -0.36 0.0 -1.67 -0.76 -0.5 -0.06 0.31 -0.5 -0.11 -0.19 -0.53 -0.38 -0.14 -0.35 -0.03
-0.11 -0.27 0.02 0.03 0.31 0.36 0.59 0.35 0.2 0.28 0.33 -0.21 0.24 -0.37 0.91 0.17 -0.04 -0.18 0.14 - - - 0.14 0.32 -3.76 0.32 0.67 0.48 -0.04 0.12 -0.18 -0.14
-0.74 -0.34 -0.01 0.29 0.33 0.24 0.57 0.2 0.32 0.09 -0.01 -0.33 -0.88 0.73 1.58 0.04 0.1 -0.21 -0.13 -0.62 -2.09 -1.02 -0.73 -0.68 -1.82 -0.04 0.11 0.32 -0.21 0.21 -0.2 0.11
-0.3 0.21 0.06 0.35 0.41 0.94 0.91 0.84 0.79 0.71 0.08 0.18 -0.24 -1.12 0.8 -0.44 -0.39 -0.4 0.02 - -6.15 - -0.19 0.03 -1.57 -0.1 0.3 0.57 -0.3 -0.14 -0.66 -0.58
0.05 0.03 0.11 0.28 0.47 0.47 0.37 0.23 0.31 0.39 0.35 0.06 0.06 -0.14 1.39 0.12 -0.38 -0.41 -0.16 -0.82 -0.29 -0.3 -0.26 -0.06 -2.29 -0.26 -0.13 -0.17 -0.62 -0.55 -0.7 -0.54
-0.11 0.63 0.6 0.68 1.0 0.64 0.59 0.16 0.37 0.36 0.55 -0.01 -0.49 -1.35 1.1 -0.42 -0.15 -1.63 0.06 -0.47 -0.93 0.69 -0.21 -0.39 -3.85 0.27 -0.73 -0.36 -1.24 -0.75 -1.07 -1.87
-0.19 0.4 1.01 0.65 0.71 0.69 0.33 0.13 0.3 -0.01 -0.02 -0.14 0.07 -1.05 1.16 -0.01 -0.01 -0.6 0.38 -0.33 -1.33 0.05 -0.21 -0.55 -4.06 0.17 0.02 -0.02 -1.08 -0.8 -1.09 -1.69
-0.16 -0.17 0.04 0.34 0.31 0.64 0.66 0.69 0.54 0.38 -0.05 -0.18 0.16 -0.47 1.0 0.1 -0.14 -0.9 0.25 -1.29 - - 0.09 0.34 -1.02 -0.33 0.38 0.07 -0.16 0.24 -0.65 -0.53
-1.59 -0.95 -0.38 -0.06 0.69 0.87 1.03 0.88 0.02 -0.29 -0.9 -1.41 -0.47 -1.66 1.42 -0.53 0.04 0.15 0.13 -3.05 -5.08 -3.84 0.22 0.42 -1.63 -0.35 1.19 1.29 -0.24 0.06 -0.67 -0.61
-0.62 0.04 -0.01 0.08 0.3 0.59 0.81 0.82 0.74 0.43 0.15 -0.09 -0.61 -1.4 1.37 -0.64 -0.64 0.25 0.08 -0.69 - - -0.19 -0.41 -5.25 -0.42 0.75 0.61 -0.17 0.03 -0.62 0.02
-0.5 -0.48 -0.41 -0.07 0.18 0.26 0.59 0.76 0.79 0.71 0.58 0.28 -0.29 -0.88 0.42 -0.47 -0.54 -0.7 -0.07 -1.59 -1.44 -1.5 -0.17 -0.16 -0.28 0.87 0.44 0.31 -0.15 -0.1 -0.37 -0.18
0.15 0.11 0.35 0.42 0.75 0.78 0.68 0.38 0.3 -0.04 0.14 -0.23 -0.36 -0.13 0.66 -0.27 0.06 -0.54 -0.04 -5.33 - -1.77 0.21 0.05 -1.29 -0.34 0.76 0.57 -0.13 0.01 -0.95 -0.74
0.36 -0.31 -0.22 -0.13 -0.01 0.24 0.3 0.65 0.45 0.89 0.74 0.26 -0.17 -0.72 1.17 0.2 0.01 -1.26 0.49 - - -4.25 0.2 0.51 -4.62 -0.62 -0.69 -0.92 0.37 0.28 0.2 0.33
0.01 -0.13 -0.28 0.1 0.03 0.16 0.52 0.83 0.58 0.83 0.31 -0.11 0.34 -0.86 1.08 0.56 -0.35 -0.59 0.34 - - - 0.18 0.49 - -0.1 -0.55 -0.36 -0.19 0.17 0.01 0.43
-0.64 0.26 0.74 0.81 0.88 0.92 0.95 0.27 0.12 0.05 -0.07 -0.44 -1.26 -0.4 1.62 -0.41 0.3 -0.39 -1.1 -1.43 -2.12 -0.52 -0.64 -0.82 -4.52 0.7 0.07 0.43 -0.86 -0.79 -0.97 -1.35
-0.52 -0.23 0.07 0.14 0.61 0.48 0.48 0.58 0.63 0.44 0.18 -0.01 -0.47 -0.95 0.98 -0.35 -0.42 -0.96 -0.04 -0.83 -0.68 -1.99 -0.36 -0.33 -2.43 1.1 0.68 0.91 -0.42 -0.09 -1.55 -1.45
-0.41 -0.3 -0.54 -0.07 0.01 0.43 0.6 0.61 0.6 1.06 0.39 0.44 0.03 -0.17 0.9 0.04 -0.5 -0.89 0.0 -2.74 -1.67 - -0.32 0.04 -1.27 0.17 0.45 0.28 0.09 0.08 -0.53 -0.23
-0.34 -0.34 -0.19 0.27 0.35 0.18 0.65 0.75 0.55 0.57 0.36 -0.11 0.3 -0.21 0.75 0.24 -0.5 -0.76 0.19 -4.82 -3.39 -0.03 -0.15 -0.23 -1.24 0.22 0.45 0.33 -0.37 -0.15 -0.71 -0.39
1.23 0.57 0.94 1.1 0.31 0.96 1.28 1.12 0.54 1.37 1.27 0.89 - -0.08 0.44 - - - - - - - - - - 1.2 -0.23 1.36 - - - -
-0.06 0.76 -0.67 1.09 1.29 1.0 0.84 0.44 0.84 0.15 -0.18 0.37 2.04 0.96 2.1 -0.12 -2.55 - -4.13 - - - - - -2.12 -0.77 -0.34 -0.36 - - -4.17 -
-0.09 -0.01 -0.03 0.11 0.34 0.22 0.29 0.61 0.55 0.69 0.52 0.45 0.13 -0.46 0.49 0.2 -0.32 -0.41 0.21 -1.18 -1.95 -2.61 -0.33 -0.25 -1.54 0.42 0.03 -0.21 0.04 -0.1 -0.16 -0.07
Smo43289 (CHC1)
 0.19 0.29 0.43 0.29 0.43 0.33 0.32 0.25 0.18 0.15 0.25 -0.04 0.0 -0.06 0.57 0.43 -0.02 -0.09 0.18 -1.01 -2.35 -2.89 0.07 0.11 -3.51 0.0 -0.02 0.35 -0.07 0.18 -0.41 -0.61
-0.5 -0.02 0.18 0.3 0.76 1.07 0.92 0.63 0.25 -0.07 -0.47 -0.63 -1.02 -2.73 1.18 -0.49 0.02 -0.32 0.3 -2.02 -3.1 -1.38 -0.33 -0.4 -1.44 -0.46 1.04 1.22 0.03 0.26 -1.9 -1.92
-0.12 -0.04 -0.07 0.01 0.52 0.27 0.48 0.56 0.44 0.4 0.15 -0.19 0.15 -0.24 1.3 0.26 -0.79 -0.95 0.12 -2.46 -2.07 -3.16 -0.47 -0.18 -1.58 0.52 0.75 0.64 -0.63 -0.33 -0.56 -0.13
-0.43 -0.09 -0.16 0.09 0.16 0.18 0.37 0.63 0.4 0.55 0.43 0.05 -0.01 -0.46 0.81 0.14 -0.43 -0.58 0.09 -1.4 -2.18 -1.46 -0.09 0.1 -1.31 0.74 0.26 0.29 -0.27 -0.09 -0.3 -0.01
Smo445056 (SAR1)
 -0.31 -0.17 -0.1 0.21 0.29 0.21 0.3 0.41 0.45 0.4 0.21 0.03 0.16 -0.0 0.9 0.17 -0.52 -1.14 0.25 -1.41 -1.37 -1.16 -0.37 -0.01 -0.69 0.32 0.62 0.65 -0.36 -0.27 -0.48 -0.51
-0.03 -0.27 -0.21 0.24 0.16 0.6 0.62 0.5 0.45 0.41 0.22 0.04 -0.17 -0.22 1.0 -0.04 -0.19 0.07 -0.1 - -5.83 - 0.07 0.09 -1.96 -0.02 0.67 0.91 -0.13 0.06 -0.7 -0.6
0.13 -0.16 0.2 0.29 0.29 0.6 0.67 0.7 0.6 0.33 0.26 -0.09 -0.14 -0.78 0.49 -0.29 -0.06 -0.33 -0.34 -8.18 - - -0.25 -0.5 -2.81 -0.28 1.04 1.09 -0.15 -0.08 -0.26 0.2
-0.35 -0.01 0.02 0.19 0.45 0.37 0.33 0.4 0.26 0.2 -0.17 -0.21 0.16 -0.25 0.88 0.25 -0.31 -0.92 0.82 -1.43 -0.92 -3.06 -0.0 0.21 -0.13 0.33 -0.03 0.07 0.16 0.25 -1.08 -1.03
Smo78320 (LAG13)
 -0.51 -0.3 0.3 0.44 0.33 0.09 0.51 0.56 0.44 0.62 0.49 0.19 0.64 -0.8 0.48 0.05 -0.18 -0.9 -0.08 -2.13 -0.62 -5.81 -0.37 -0.62 0.52 0.17 0.07 0.15 -0.26 -0.39 -0.49 -0.07
-0.15 -0.01 0.28 0.24 0.41 0.65 0.76 0.68 0.19 0.14 -0.02 -0.29 -0.4 -0.62 1.18 -0.02 -0.06 -0.37 0.44 -3.54 - -2.51 -0.16 -0.21 -1.7 -0.43 0.43 0.89 0.01 -0.08 -0.14 -0.75
Smo81392 (GRP2)
 -0.91 -0.74 -0.44 -0.26 0.56 0.61 0.81 0.75 0.3 -0.02 -0.47 -0.83 -0.22 -1.35 1.75 -0.31 -0.41 0.06 0.39 -3.04 -5.2 -5.26 -0.07 0.47 -2.46 -0.28 0.78 0.47 -0.31 -0.25 0.27 0.44
-0.36 0.33 0.33 0.37 0.63 0.93 0.68 0.26 0.25 0.24 -0.08 -0.37 -0.1 -0.27 0.5 -0.2 -0.19 0.1 -0.5 -1.49 -2.57 -1.88 0.37 0.08 -1.49 -0.55 0.75 0.77 -0.26 0.13 -1.39 -1.09
-0.03 0.15 0.01 0.11 0.38 0.18 0.3 0.42 0.29 0.44 0.07 -0.24 0.22 -0.63 0.52 0.55 -0.15 -0.46 0.49 -2.02 -1.42 -1.97 -0.06 -0.11 -0.28 0.05 -0.11 0.25 0.37 0.38 -0.65 -0.66
Smo83687 (COX15)
 -0.53 -0.2 -0.01 0.43 0.43 0.68 0.74 0.35 0.47 0.19 -0.01 -0.24 -0.56 -0.35 1.22 -0.44 -0.28 0.29 0.27 -0.62 -3.25 0.16 -0.28 -0.23 -0.72 -0.38 0.15 0.25 -0.27 -0.09 -0.92 -0.91
-0.04 0.13 0.26 0.19 0.5 0.87 1.07 0.99 0.99 0.96 0.42 0.38 -0.73 -0.93 1.0 -0.77 -0.8 -2.13 0.27 - - -1.69 -0.41 -0.24 - -0.05 0.15 0.18 -0.36 -0.16 -1.0 -0.55
Smo86162 (CRR2)
 -0.31 0.2 0.38 0.34 0.52 0.69 0.8 0.52 0.45 0.23 -0.05 -0.19 -0.36 -0.5 0.68 -0.59 0.1 -0.16 -0.15 -3.29 -2.3 -3.88 0.17 0.15 -2.12 -0.64 0.69 1.1 -0.0 0.12 -1.02 -1.16
0.21 0.23 0.35 0.21 0.2 0.37 0.3 0.41 0.18 0.17 0.18 0.05 -0.13 0.16 0.68 0.1 -0.34 -0.11 -0.21 -1.94 -2.75 -4.75 0.1 -0.12 -1.8 0.27 0.67 1.0 -0.25 -0.19 -0.64 -0.62
-0.04 -0.08 0.13 0.2 0.56 0.56 0.79 0.55 0.61 0.43 -0.06 0.22 -0.08 -0.83 0.96 -0.19 -0.38 -0.42 0.18 -6.66 -5.32 -2.82 -0.22 -0.33 -3.09 0.1 0.63 0.39 -0.14 -0.07 -0.08 0.06
-0.1 -0.06 0.06 0.2 0.83 0.72 0.9 0.93 0.87 0.57 0.04 -0.04 -0.29 -0.81 1.31 -0.39 -0.39 -0.04 -0.02 -6.86 -4.62 -2.18 0.11 0.1 -2.57 -1.04 0.11 0.43 -0.43 -0.24 -1.28 -0.86
-0.03 0.23 -0.25 0.07 0.06 0.48 0.58 0.55 0.54 0.65 0.22 0.1 0.16 -0.74 0.13 -0.16 -0.44 -0.51 0.1 -2.0 -0.97 -1.39 -0.09 -0.11 0.4 -0.81 0.09 0.3 -0.15 0.02 -0.01 -0.02
-0.16 -0.27 -0.28 -0.04 0.28 0.44 0.71 0.63 0.62 0.52 0.32 0.0 -0.03 -0.6 0.89 0.07 -0.52 -0.89 0.22 -0.37 -2.17 -2.23 -0.36 -0.16 -2.13 0.68 0.4 0.6 -0.17 0.01 -0.94 -0.82
Smo98524 (TAN)
 -0.06 -0.05 -0.04 0.07 0.16 0.21 0.21 0.35 0.36 0.28 0.22 -0.03 0.15 0.15 0.37 0.31 -0.29 -0.63 0.55 -1.04 -0.7 -4.95 0.28 0.25 -0.25 0.32 0.36 0.01 -0.35 -0.28 -0.43 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.