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Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.16 -0.47 0.38 0.43 0.61 0.56 0.7 -0.11 0.48 0.6 -0.08 0.22 0.12 0.24 1.0 0.5 -0.31 -0.05 -0.28 -2.72 -3.57 - -0.25 -0.03 -2.26 -0.7 0.46 -0.22 -0.31 -0.2 -0.12 -0.04
0.33 0.27 0.18 0.19 0.25 0.28 0.29 0.16 0.21 0.2 0.04 0.02 0.51 0.66 0.95 0.65 -0.37 -0.33 0.12 -2.06 -2.74 -0.24 0.13 0.23 -2.97 -0.54 -0.6 -0.33 -0.26 -0.07 -0.43 -0.48
-0.28 -0.28 -0.01 0.12 0.24 0.04 0.05 0.21 0.58 0.74 0.49 0.14 1.04 1.32 1.35 0.99 -1.04 -1.59 -1.4 -1.32 -5.21 -3.13 0.47 0.36 -3.11 -0.27 -0.55 -0.46 -1.01 -0.73 -0.77 -0.57
-0.14 -0.32 -0.3 0.03 0.18 0.18 -0.11 0.23 0.45 0.86 0.67 0.29 0.96 1.23 1.02 1.01 -1.22 -1.5 -1.54 -1.14 -1.21 -0.84 0.3 0.51 -1.33 -0.53 -0.74 -0.85 -1.27 -0.81 -0.81 -0.44
Smo110685 (ETR)
 0.71 0.31 0.42 0.27 0.36 0.29 -0.02 0.19 0.19 0.34 0.26 0.06 1.14 0.38 0.85 0.61 -0.99 -1.42 -0.7 -2.54 -1.89 -0.42 -0.15 0.25 -0.36 -0.28 0.03 0.16 -0.91 -0.65 -1.52 -1.15
Smo118155 (GPAT6)
 0.27 0.48 0.31 0.4 0.54 0.27 -0.01 -0.2 0.06 -0.04 0.21 -0.09 0.77 0.43 0.72 0.41 -0.1 -0.9 -0.19 -1.73 -2.29 -0.35 0.5 0.41 -2.03 -0.21 -0.22 0.08 -0.41 -0.33 -0.77 -0.69
0.43 0.47 0.44 0.31 0.43 0.54 0.21 0.11 0.4 0.41 0.23 0.27 0.38 0.07 -2.02 0.72 -0.6 -0.3 0.52 -5.04 -2.03 -3.6 -0.21 -0.18 -1.93 0.1 -0.0 0.32 -0.53 -0.38 0.13 0.27
Smo125835 (XK2)
 0.72 0.56 0.55 0.56 0.57 0.35 0.4 0.52 0.31 0.46 0.44 0.52 0.72 0.76 0.34 0.02 -0.17 -0.86 0.05 -3.89 -3.67 -0.56 -0.11 -0.19 -2.45 -0.64 -0.79 -0.82 -0.29 -0.35 -1.52 -1.39
0.16 0.12 0.05 0.23 0.4 0.36 0.08 0.06 0.08 0.32 0.1 0.01 0.68 -0.2 -0.07 0.86 -0.1 -0.3 0.63 - -3.44 -3.38 0.29 0.4 -2.78 -0.19 0.12 -0.05 0.21 0.25 -0.2 -0.09
0.65 0.42 0.09 -0.02 0.3 0.2 -0.19 0.36 0.29 0.35 0.62 0.44 0.75 0.24 0.3 0.74 -0.89 -0.87 -0.12 -1.49 -1.31 -2.69 0.17 0.67 -0.07 -0.46 -0.83 -0.58 -0.78 -0.65 -0.37 -0.28
Smo128662 (TT7)
 -0.73 -0.53 0.02 -0.4 -1.26 0.0 -0.39 0.06 -0.28 0.16 0.22 0.08 2.16 -1.2 1.83 2.04 -1.49 -0.94 -0.26 -2.75 -4.3 - -0.86 -0.46 -3.16 0.26 -0.47 0.08 -0.76 -1.03 -0.55 -0.06
0.26 0.41 0.51 0.24 0.39 0.42 0.05 -0.17 -0.09 -0.0 -0.2 -0.17 0.49 0.66 0.72 0.59 -0.08 0.08 0.33 -2.8 -2.5 -3.7 0.39 0.49 -1.36 -0.55 -0.36 0.02 -0.1 -0.06 -0.77 -0.44
0.06 0.23 0.41 0.33 0.29 0.26 0.21 0.17 0.25 0.2 0.23 -0.12 0.95 0.29 0.12 0.87 -0.14 -0.26 0.09 -8.16 -10.9 - 0.62 0.73 -5.34 -0.16 -0.17 0.09 -0.11 0.04 -0.84 -0.76
Smo134879 (UBC35)
 -0.36 0.04 -0.06 0.05 -0.16 0.0 -0.1 0.25 0.44 0.34 0.11 0.06 0.49 0.75 0.88 0.62 -0.2 -0.09 0.04 -2.33 -0.46 -0.82 0.07 0.17 -0.71 -0.24 -0.45 -0.48 -0.23 -0.19 -0.16 -0.11
-0.12 -0.03 0.21 0.31 0.29 0.1 0.65 0.52 0.64 0.81 0.58 0.4 1.16 0.52 0.7 0.69 -0.81 -1.07 -1.01 -6.06 -6.34 -8.06 -0.09 -0.04 -3.42 0.34 -0.18 -0.31 -0.86 -0.75 -0.32 -0.16
0.29 0.14 0.14 0.1 0.24 0.26 0.28 0.28 0.13 0.3 0.16 0.04 0.47 0.12 -0.3 0.72 -0.14 -0.34 0.49 -8.87 -9.16 -6.16 0.14 0.25 -4.93 0.27 0.13 0.19 0.2 0.3 0.0 0.04
0.17 0.02 0.07 -0.05 -0.23 -0.11 -0.26 -0.08 -0.12 0.11 0.11 0.15 0.7 0.73 0.14 0.45 -0.32 0.16 0.37 -2.5 -0.76 -0.58 0.34 0.49 -0.92 0.03 -0.42 -0.58 -0.19 -0.12 -0.04 0.39
-0.08 0.2 0.22 0.19 0.17 0.19 0.19 0.29 0.35 0.21 0.33 0.07 0.86 0.51 1.14 1.13 -0.29 -0.67 0.02 -1.72 -4.73 -4.27 0.05 0.03 -1.65 0.06 -0.64 -0.23 -0.1 0.14 -1.28 -1.3
Smo150326 (HXK2)
 0.05 0.44 0.43 0.41 0.3 0.22 0.06 -0.07 0.03 0.07 0.02 -0.06 1.39 0.64 0.61 0.96 -0.51 -0.63 -0.19 -1.86 -1.95 -4.02 0.04 0.1 -0.2 -0.13 -0.26 -0.14 -0.55 -0.37 -1.19 -0.99
-0.29 0.53 0.34 0.48 0.23 0.34 0.21 -0.02 0.23 -0.17 -0.39 -0.32 1.43 1.01 1.52 1.17 -1.73 -0.5 -1.16 -0.43 -2.15 -0.91 -0.02 0.88 -0.83 -1.41 -2.11 -2.0 -1.06 -0.5 -1.94 -1.26
0.19 0.21 0.23 0.14 0.15 0.25 0.19 0.22 0.21 0.23 0.21 0.08 -0.1 0.27 0.43 0.27 -0.5 -0.31 0.39 -0.54 -0.61 -0.69 -0.03 0.17 -1.07 -0.01 -0.12 -0.07 -0.11 -0.08 -0.44 -0.43
0.41 0.47 0.5 0.34 0.51 0.34 0.18 0.18 -0.13 0.47 0.1 0.03 0.47 -0.08 -0.14 0.55 -0.04 -0.44 0.56 - - - 0.14 -0.02 - -0.27 0.13 0.37 -0.03 -0.11 0.04 0.17
Smo162543 (RR24)
 0.86 0.59 0.71 0.65 0.77 0.7 0.57 0.04 0.24 0.13 0.41 0.2 0.92 0.5 0.57 1.12 -0.89 -1.01 -0.44 -3.87 -3.71 -6.78 -0.38 -0.18 -1.1 -0.72 -0.56 -0.4 -0.9 -0.55 -1.63 -1.77
0.05 0.01 -0.12 0.13 0.23 0.19 0.05 0.15 0.18 0.27 0.2 0.01 0.2 0.55 -0.16 0.82 -0.01 -0.04 0.15 -2.05 -0.83 -1.37 0.21 0.27 -1.36 -0.36 0.03 -0.16 0.05 -0.01 0.03 -0.08
0.03 0.23 0.05 0.13 -0.02 0.06 0.12 0.28 0.33 0.32 0.22 0.19 1.45 0.28 0.4 0.97 0.03 -0.94 0.06 -2.89 -3.22 -5.55 -0.18 -0.09 -0.94 0.53 -0.35 -0.13 -0.1 -0.01 -0.89 -0.99
Smo171183 (P44)
 -0.08 -0.1 -0.02 0.14 0.16 0.04 0.19 0.49 0.51 0.56 0.51 0.3 0.33 0.98 0.3 0.63 -0.64 -1.18 -0.57 -1.41 -2.66 -4.2 0.09 0.33 -0.52 0.25 -0.18 -0.26 -0.34 -0.22 -0.13 -0.09
Smo171410 (TPS1)
 -0.33 -0.06 -0.5 -0.16 -0.11 -0.1 -0.37 -0.1 0.05 -0.07 -0.04 -0.24 1.45 1.07 1.37 1.32 -1.29 -1.06 0.88 -2.84 -1.57 -1.03 0.11 0.31 -2.04 0.53 -0.16 -0.18 -1.17 -0.76 -1.57 -0.99
-0.11 0.26 0.08 0.03 0.05 -0.1 -0.19 0.12 -0.09 -0.21 0.03 -0.16 0.79 0.56 1.27 1.08 -0.48 -0.62 0.24 -5.37 -4.64 -0.99 0.06 0.49 -1.42 0.47 0.31 0.27 -0.12 -0.17 -1.03 -1.55
0.08 0.36 0.22 0.28 0.32 0.29 0.06 -0.15 -0.05 -0.01 -0.13 -0.11 0.49 0.93 0.99 0.68 0.05 0.14 0.17 -4.88 -3.39 -4.78 0.69 0.65 -1.96 -1.15 -0.86 -0.7 -0.18 -0.02 -0.21 -0.06
Smo176429 (PLL5)
 0.11 -0.14 0.14 0.08 0.25 0.27 0.24 0.26 0.22 0.33 0.16 0.0 1.43 0.21 0.88 1.02 -0.7 -0.91 -0.06 -3.3 -2.77 -2.79 0.39 0.66 -2.42 -0.36 -0.44 -0.22 -0.25 -0.03 -0.86 -0.95
Smo178381 (ACT7)
 0.11 0.16 0.17 0.1 0.02 0.04 0.16 0.13 0.22 0.24 0.19 0.07 0.72 1.08 0.77 0.71 -0.15 -0.17 -0.16 -2.61 -2.18 -3.51 0.11 0.3 -1.25 -0.54 -0.81 -0.67 -0.19 -0.02 0.11 0.01
0.03 0.07 0.15 0.07 0.23 0.22 0.15 0.17 0.25 -0.02 0.14 -0.17 0.62 0.87 0.81 0.39 0.38 -0.02 0.04 -0.93 -1.78 -0.66 0.0 -0.13 -1.66 -0.78 -0.68 -0.47 0.02 0.06 -0.34 -0.24
0.38 0.29 0.16 0.23 0.29 0.44 0.06 0.24 0.12 0.11 0.14 -0.17 0.26 0.7 0.63 0.83 -0.31 -0.64 0.28 -1.11 -0.58 -1.94 0.01 0.14 -0.96 -0.86 -0.49 -0.21 -0.25 -0.07 -0.3 -0.59
0.13 0.12 0.26 0.18 0.08 0.22 0.19 0.36 0.53 0.59 0.57 0.44 0.59 0.92 0.18 0.44 -0.61 -0.8 -0.52 -4.28 -1.95 -4.49 0.47 0.58 -1.21 -0.12 -0.5 -0.41 -0.43 -0.35 -0.21 -0.33
Smo230667 (CYP703)
 0.16 0.07 0.15 0.21 0.55 0.35 0.04 -0.11 0.2 0.07 0.35 -0.03 1.17 0.94 0.79 1.25 -0.12 -0.6 0.34 -5.62 -3.76 -2.13 -0.59 -0.19 -3.95 0.14 -0.27 -0.23 -0.54 -0.24 -1.1 -0.77
0.26 0.39 0.39 0.46 0.45 0.37 0.23 0.15 0.03 0.11 0.04 -0.02 0.32 -0.39 -1.05 0.55 -0.23 -0.64 0.26 -0.67 -1.26 -1.19 0.05 0.07 -0.69 0.22 0.15 0.01 -0.31 -0.18 -0.01 -0.08
1.01 0.48 0.0 -0.06 0.2 0.01 -0.3 -0.28 0.26 0.17 0.36 0.22 0.71 0.35 0.99 1.09 -1.07 -0.86 0.96 - - -4.69 0.77 1.44 -5.08 -1.12 -1.36 -1.2 -0.9 -0.57 -0.94 -0.86
Smo231507 (IDH1)
 0.27 0.49 0.5 0.45 0.54 0.58 0.17 0.02 -0.04 -0.06 -0.06 -0.16 0.38 0.62 0.48 0.56 -0.32 -0.08 0.3 -2.0 -1.76 -2.36 0.31 0.42 -1.43 0.01 -0.34 -0.05 -0.44 -0.32 -0.94 -0.88
0.25 0.35 0.38 0.04 0.22 0.18 0.17 0.18 0.15 0.16 0.12 -0.03 0.88 0.06 0.01 0.8 0.05 0.01 0.73 -4.38 -5.65 - 0.22 0.12 -4.33 -0.5 -0.31 -0.49 0.3 0.14 0.1 0.05
Smo25619 (5-FCL)
 -0.21 -0.22 -0.14 -0.21 0.25 0.11 -0.26 0.12 0.07 0.09 0.07 -0.35 0.9 0.99 0.9 0.89 -0.56 -0.58 0.14 -2.76 -0.86 -0.34 0.34 0.69 -0.74 0.2 -0.52 -0.75 -0.16 -0.1 -0.88 -0.77
Smo266739 (FMO1)
 0.08 0.32 0.39 0.31 0.39 0.18 0.11 0.18 0.17 0.16 -0.02 0.11 1.15 0.27 0.1 0.72 -0.19 -0.37 0.21 -7.12 -3.58 -3.88 0.03 0.04 -0.42 0.36 0.01 0.23 -0.17 -0.16 -1.02 -0.9
0.29 0.27 0.29 0.23 0.29 0.31 0.03 0.26 0.02 0.17 -0.01 -0.02 0.35 0.35 -0.57 0.61 -0.37 -0.31 0.38 -4.48 -3.72 -4.95 0.11 -0.01 -0.41 0.33 0.37 0.41 -0.04 -0.16 -0.13 0.15
0.42 0.33 0.23 0.22 0.29 0.3 0.14 0.18 0.22 0.32 0.25 0.21 0.25 0.06 0.03 0.36 -0.21 -0.29 0.17 -1.63 -0.65 -0.54 -0.0 0.1 -0.09 -0.55 -0.56 -0.43 -0.04 -0.01 -0.36 -0.37
0.63 0.78 0.07 0.01 0.05 0.31 0.13 0.05 0.38 0.57 0.46 0.8 1.16 0.73 0.41 0.96 -0.85 -1.08 -0.73 -2.17 -0.21 - -0.46 0.01 -1.81 -0.96 -1.23 -0.69 -0.16 -0.01 -0.96 -0.98
0.11 0.22 0.3 0.18 0.41 0.24 0.29 0.16 0.1 0.03 -0.03 -0.3 0.83 1.34 0.92 0.83 0.34 0.19 0.14 - -5.23 - 0.14 0.13 -3.04 -0.97 -1.31 -0.79 0.13 0.3 -0.8 -1.23
0.19 0.55 0.5 0.46 0.47 0.45 0.29 0.24 0.02 0.22 0.24 -0.04 0.79 0.58 0.35 0.74 -0.15 -0.41 0.38 -0.63 -1.07 -4.67 0.21 0.27 -1.62 -1.04 -1.22 -0.39 -0.53 -0.41 -0.88 -1.1
0.75 0.48 0.4 0.23 0.41 0.3 -0.13 -0.11 0.01 -0.11 0.15 0.1 0.4 0.66 0.89 0.81 -0.68 -0.64 0.48 -4.64 -3.34 -0.06 0.42 0.56 -4.99 -0.67 -0.61 -0.7 -0.56 -0.34 -0.66 -0.32
Smo36025 (IBR5)
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Smo403717 (MGP2)
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Smo404439 (NPG1)
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Smo437530 (ARA3)
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Smo438018 (MAG2)
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Smo440891 (CARB)
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Smo441825 (PLD)
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Smo57074 (GIK)
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-0.04 0.08 0.19 0.26 0.39 0.26 0.36 0.1 0.13 0.31 0.04 -0.11 0.55 0.86 1.1 0.47 0.03 0.3 0.19 -6.6 -4.52 -3.02 0.35 0.47 -2.36 -1.1 -0.89 -0.62 -0.08 0.08 -0.42 -0.27
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-0.57 -0.27 -0.29 -0.16 -0.08 -0.06 0.05 0.03 0.1 0.12 0.12 -0.27 0.35 1.4 0.87 1.01 -0.21 0.02 0.21 -2.77 -2.4 -1.42 0.02 0.0 -2.29 -0.86 -0.18 -0.26 -0.05 0.12 0.43 0.47
Smo71342 (AHL22)
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Smo74346 (VEP1)
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Smo77081 (PUB44)
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Smo77558 (BAM1)
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Smo79372 (RBL13)
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Smo79836 (GT18)
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Smo81021 (SD2-5)
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Smo84762 (SCR)
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Smo92814 (NEF1)
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Smo97180 (NHX1)
 0.19 0.17 0.15 0.3 0.14 0.14 -0.0 0.35 -0.0 0.2 0.02 -0.09 0.43 0.53 -0.27 0.69 0.03 -0.18 0.61 -8.48 -1.39 -6.12 0.38 0.31 -1.27 -0.23 -0.01 0.09 0.12 0.15 -0.2 -0.27
0.24 0.13 0.33 0.31 0.16 0.1 -0.24 0.04 0.1 0.27 0.37 -0.25 0.57 0.83 0.83 1.15 -0.14 -0.04 0.29 -7.54 -5.3 -5.41 0.03 -0.2 -5.11 0.03 0.19 0.21 -0.31 -0.1 -0.52 -0.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.