Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
Solyc01g005740.3.1 (Solyc01g005740)
- - - - - - - - - 4.0 2.9 5.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g021695.1.1 (Solyc01g021695)
- - - - - - - - - 4.82 4.01 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g057395.1.1 (Solyc01g057395)
- - - - - - - - 1.52 4.18 4.04 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g066410.1.1 (Solyc01g066410)
- - - - -0.81 0.97 -0.76 1.44 2.02 4.04 3.81 3.65 - -3.51 -5.26 -2.15 -4.74 0.54 1.55 - - - - - - - - - - - - - - -1.95 - - - - - - - - - - - - - - -3.19 - - - -9.72 - - - - -
Solyc01g088330.1.1 (Solyc01g088330)
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g090150.1.1 (Solyc01g090150)
- - - - - - - - - 5.22 3.42 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g108220.3.1 (Solyc01g108220)
- - 1.63 - - - - - - 4.23 4.0 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g011870.2.1 (Solyc02g011870)
- - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.89 3.92 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g021160.2.1 (Solyc02g021160)
- - - - - - - - - 3.19 3.49 5.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g069890.1.1 (Solyc02g069890)
- - - - - - - - - 4.99 3.41 3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g072450.4.1 (Solyc02g072450)
- - - - - - - - - 4.5 4.22 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g084480.3.1 (Solyc02g084480)
- - - - - - - - - 4.51 3.94 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g085300.4.1 (Solyc02g085300)
- - - - - - - - - 4.19 4.56 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g087160.3.1 (Solyc02g087160)
- - - - - - - - - 5.35 2.96 3.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g090060.1.1 (Solyc02g090060)
- - - - - - - - - 4.28 4.26 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g007820.3.1 (Solyc03g007820)
- - 0.77 - - - - - -1.76 4.24 4.28 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g013420.1.1 (Solyc03g013420)
-8.48 -8.04 -4.6 -1.29 1.28 -0.13 -0.96 1.91 1.49 4.01 3.71 3.67 -3.15 -0.07 -0.73 0.1 -4.59 -2.83 - -8.76 -3.62 -3.8 -4.1 -3.48 -3.38 -7.11 -4.4 -3.38 -3.72 -3.22 -3.57 -3.18 -3.0 -5.62 -3.38 -4.41 -5.68 -5.47 -4.42 -4.11 -5.84 -4.53 -4.6 -5.07 -3.74 -9.35 -5.87 -6.79 -2.24 -5.06 -3.4 -5.15 -4.71 -5.88 -3.88 -3.84 -4.75 -3.38
Solyc03g120580.3.1 (Solyc03g120580)
1.51 - 0.06 - - - - - 1.26 4.38 3.91 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g056717.1.1 (Solyc04g056717)
- - - - - - - - - - 5.27 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g064520.4.1 (Solyc04g064520)
- - - - - - - - - 3.65 3.99 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-7.5 -8.14 -6.54 -4.72 0.75 1.06 0.94 1.79 1.61 3.76 3.72 3.93 -9.9 -2.79 -4.1 -1.88 0.62 0.75 -7.36 -6.61 -9.58 - -8.08 -8.22 -9.37 -9.3 -10.57 -9.73 -10.63 -9.61 -11.59 -10.51 -9.33 - -9.34 - -8.01 -8.67 - - - -9.45 - -8.5 -7.97 -3.74 -11.25 -7.58 -7.94 -6.8 -9.11 -9.66 -9.58 -7.47 -7.53 - -9.64 -11.09
Solyc05g015900.4.1 (Solyc05g015900)
- - - - - - - - - 4.23 4.23 4.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g017720.3.1 (Solyc05g017720)
- - - - - - - - - 3.87 3.38 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g050650.2.1 (Solyc05g050650)
- - - - - - - - - - 4.87 4.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g050690.2.1 (Solyc05g050690)
- - - - - - - - - 4.39 4.48 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g055575.1.1 (Solyc05g055575)
- - - - - - - - - 4.12 2.97 5.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g007220.4.1 (Solyc06g007220)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g009080.2.1 (Solyc06g009080)
- - -1.33 - - - - - 0.28 4.21 4.16 4.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g034330.5.1 (Solyc06g034330)
- - - - - - - - - 4.46 4.25 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g035550.3.1 (Solyc06g035550)
- - - - - - - - -0.58 4.23 4.47 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g050460.2.1 (Solyc06g050460)
- - - - - - - - - 5.1 2.89 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g051100.1.1 (Solyc06g051100)
- - - - - - - - - 4.34 4.79 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g053250.2.1 (Solyc06g053250)
- - - - - - - - - 4.5 4.38 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g005490.4.1 (Solyc07g005490)
- 0.05 -0.69 - - - - - -0.46 3.95 4.02 4.46 - - - - - - - 0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g026620.4.1 (Solyc07g026620)
- - - - - - - - - 5.03 4.51 1.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032150.3.1 (Solyc07g032150)
- - - - - - - - - 4.73 4.12 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g040660.4.1 (Solyc07g040660)
- - 0.22 - - - - - 0.95 3.99 4.14 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.28
Solyc07g049650.1.1 (Solyc07g049650)
- - - - - - - - - 4.14 4.14 4.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g052000.1.1 (Solyc07g052000)
- - - - - - - - 0.34 4.32 4.16 4.21 - - - -5.55 - - - - - - - - - - - - -3.32 - - - - - - - - - - - - -6.73 - - - - - - -2.4 - - - -5.04 - - - - -
Solyc08g008640.3.1 (Solyc08g008640)
- - - - - - - - - 2.7 5.07 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g048560.2.1 (Solyc08g048560)
- - - - - - - - - 4.1 4.22 4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g063120.1.1 (Solyc08g063120)
- - - - - - - - - - 4.84 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g066560.3.1 (Solyc08g066560)
- - - - - - - - - 4.11 4.35 4.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g007960.1.1 (Solyc09g007960)
- - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g010580.3.1 (Solyc09g010580)
- - - - - - - - - 4.81 - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g074860.2.1 (Solyc10g074860)
- - - - - - - - - 4.26 4.28 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g076430.1.1 (Solyc10g076430)
- - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g083620.2.1 (Solyc10g083620)
- - - - - - - - - 4.94 1.96 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g084360.1.1 (Solyc10g084360)
- - - - - - - - - - 2.92 5.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g150151.1.1 (Solyc10g150151)
- - - - - - - - 0.41 4.27 4.22 4.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g007150.2.1 (Solyc11g007150)
- - - - - - - - - 4.28 4.17 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -6.7 -3.03 - -0.99 - -2.95 2.0 4.23 4.02 4.13 -4.08 -4.48 -4.4 -5.23 - - - - - - - - - - -6.22 - - - - - - - - - - - -2.33 -3.97 - -7.27 - - -3.28 -2.98 - - -4.52 - - - -6.97 - - - - -
Solyc11g027910.1.1 (Solyc11g027910)
- - - - - - - - - 3.68 4.17 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g050855.1.1 (Solyc11g050855)
- - - - - - - - 1.99 3.92 3.04 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - -
Solyc11g051178.1.1 (Solyc11g051178)
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g150115.1.1 (Solyc11g150115)
- - - - - - - - - 4.08 3.86 4.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g036920.1.1 (Solyc12g036920)
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g038453.1.1 (Solyc12g038453)
- - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g056676.1.1 (Solyc12g056676)
- - - - - - - - - 5.22 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.