Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo106329	0.39	0.46	0.41	0.4	0.33	0.44	0.43	0.46	0.46	0.54	0.49	0.53	0.69	0.45	0.36	0.74	0.27	0.29	0.61	0.59	0.32	0.25	0.29	0.31	0.78	1.0	0.62	0.63	0.36	0.36	0.32	0.34
Smo113819 (BTI2)	0.63	0.64	0.7	0.66	0.67	0.65	0.61	0.69	0.81	0.81	0.84	0.71	0.63	0.45	0.56	0.64	0.53	0.53	0.57	0.81	0.73	0.76	0.68	0.76	0.88	1.0	0.47	0.52	0.54	0.57	0.54	0.53
Smo120459	0.29	0.51	0.39	0.59	0.74	0.78	0.77	0.8	0.75	0.55	0.44	0.35	0.34	0.45	0.56	0.29	0.26	0.06	0.4	0.6	0.24	0.16	0.29	0.36	0.83	0.91	0.7	1.0	0.3	0.36	0.1	0.07
Smo135849	0.51	0.44	0.56	0.51	0.51	0.49	0.54	0.81	0.83	0.8	0.81	0.62	0.75	0.29	0.21	0.61	0.39	0.21	0.58	0.65	0.34	0.03	0.4	0.34	0.39	1.0	0.77	0.9	0.56	0.61	0.29	0.31
Smo160429	0.32	0.29	0.31	0.31	0.33	0.42	0.44	0.53	0.44	0.46	0.42	0.41	0.24	0.38	0.15	0.32	0.25	0.23	0.32	0.46	1.0	0.19	0.22	0.24	0.69	0.26	0.25	0.24	0.34	0.36	0.56	0.49
Smo165561 (PTR1)	0.24	0.27	0.3	0.27	0.4	0.5	0.53	0.51	0.53	0.53	0.37	0.36	0.24	0.12	0.27	0.32	0.22	0.17	0.48	0.63	0.1	0.05	0.33	0.35	0.7	1.0	0.53	0.63	0.4	0.36	0.16	0.18
Smo227288	0.61	0.61	0.54	0.59	0.66	0.72	0.59	0.66	0.55	0.56	0.54	0.54	0.29	0.43	0.22	0.44	0.49	0.32	0.63	0.66	0.6	0.16	0.46	0.43	0.47	1.0	0.76	0.89	0.46	0.51	0.32	0.38
Smo228673	0.42	0.4	0.51	0.58	0.65	0.68	0.85	0.88	0.72	0.58	0.53	0.47	0.19	0.84	0.44	0.19	0.33	0.15	0.24	0.61	0.45	0.35	0.22	0.16	0.39	0.47	1.0	0.82	0.29	0.27	0.24	0.17
Smo230104 (ARA7)	0.66	0.45	0.39	0.42	0.39	0.39	0.43	0.59	0.65	0.76	0.67	0.75	0.64	0.49	0.5	0.78	0.3	0.35	0.59	0.97	0.43	0.3	0.41	0.51	0.59	1.0	0.61	0.58	0.5	0.45	0.4	0.49
Smo269745 (ASD1)	0.42	0.54	0.61	0.7	0.62	0.61	0.53	0.52	0.48	0.43	0.43	0.41	0.45	0.35	0.84	0.53	0.35	0.31	0.73	0.47	0.67	0.16	0.5	0.49	1.0	0.86	0.83	0.94	0.42	0.43	0.26	0.18
Smo31855	0.25	0.25	0.16	0.34	0.43	0.61	0.67	1.0	0.63	0.37	0.49	0.36	0.46	0.08	0.25	0.66	0.3	0.24	0.29	0.39	0.0	0.0	0.28	0.36	0.39	0.57	0.77	0.77	0.37	0.37	0.23	0.27
Smo34484	0.47	0.4	0.4	0.43	0.37	0.37	0.44	0.48	0.52	0.66	0.47	0.52	0.26	0.16	0.14	0.34	0.19	0.17	0.63	0.44	0.0	0.23	0.25	0.25	0.02	1.0	0.42	0.48	0.33	0.38	0.29	0.44
Smo404532	0.57	0.62	0.56	0.62	0.59	0.65	0.7	0.79	0.83	0.78	0.68	0.59	0.37	0.29	0.35	0.39	0.38	0.21	0.5	0.73	0.61	0.08	0.53	0.57	0.79	0.69	0.96	1.0	0.38	0.41	0.39	0.42
Smo405078	0.44	0.4	0.42	0.68	0.56	0.64	0.46	0.78	0.57	0.65	0.59	0.48	0.2	0.36	0.8	0.26	0.24	0.4	0.17	0.96	0.59	0.36	0.28	0.19	0.73	0.91	0.89	1.0	0.27	0.34	0.1	0.09
Smo405855	0.48	0.33	0.3	0.38	0.39	0.53	0.4	0.47	0.5	0.56	0.38	0.41	0.18	0.4	0.59	0.11	0.08	0.27	0.03	1.0	0.13	0.11	0.05	0.04	0.6	0.52	0.42	0.5	0.03	0.07	0.07	0.03
Smo406243	0.31	0.21	0.17	0.26	0.26	0.34	0.24	0.35	0.38	0.25	0.31	0.3	0.27	0.27	0.31	0.23	0.16	0.04	0.2	0.41	0.22	0.4	0.32	0.26	0.35	0.94	1.0	0.59	0.2	0.21	0.27	0.25
Smo406682	0.21	0.24	0.24	0.36	0.3	0.5	0.5	0.42	0.48	0.37	0.32	0.29	0.11	0.07	0.3	0.18	0.37	0.22	0.47	0.72	0.03	0.01	0.24	0.19	0.72	0.93	0.87	1.0	0.33	0.26	0.14	0.23
Smo407860	0.37	0.35	0.37	0.39	0.34	0.4	0.51	0.58	0.57	0.6	0.54	0.48	0.34	0.24	0.32	0.33	0.23	0.19	0.37	0.72	1.0	0.28	0.24	0.27	0.66	0.74	0.44	0.47	0.27	0.3	0.3	0.32
Smo413432	0.79	0.73	0.77	0.78	0.77	0.79	0.78	0.8	0.82	0.79	0.85	0.72	0.5	0.51	0.5	0.56	0.61	0.64	0.8	1.0	0.65	0.49	0.61	0.67	0.65	0.98	0.84	0.85	0.62	0.65	0.57	0.59
Smo413897	0.25	0.43	0.59	0.75	0.91	1.0	0.8	0.69	0.4	0.35	0.25	0.21	0.38	0.28	0.3	0.42	0.45	0.39	0.49	0.77	0.45	0.38	0.59	0.55	0.86	0.58	0.69	0.73	0.26	0.28	0.34	0.49
Smo417192	0.14	0.19	0.49	0.58	0.56	0.87	0.9	0.7	0.5	0.46	0.32	0.27	0.03	0.1	0.16	0.06	0.32	0.08	0.3	0.5	0.02	0.01	0.47	0.41	1.0	0.26	0.66	0.42	0.15	0.16	0.15	0.18
Smo418432	0.5	0.51	0.55	0.66	0.68	0.6	0.7	0.67	0.7	0.81	0.65	0.56	0.46	0.87	0.87	0.51	0.52	0.42	0.65	0.65	0.55	0.24	0.55	0.62	0.64	0.95	1.0	0.94	0.55	0.52	0.49	0.5
Smo420076	0.44	0.42	0.44	0.39	0.52	0.43	0.55	0.61	0.79	0.71	0.73	0.67	0.1	0.23	0.31	0.14	0.15	0.11	0.12	0.97	0.77	0.95	0.16	0.12	0.35	1.0	0.7	0.61	0.12	0.1	0.17	0.24
Smo420928	0.36	0.25	0.26	0.36	0.28	0.29	0.42	0.39	0.42	0.37	0.44	0.43	0.39	0.28	0.32	0.38	0.29	0.02	0.37	0.39	0.08	0.26	0.38	0.37	0.39	1.0	0.57	0.65	0.31	0.35	0.31	0.22
Smo424556	0.18	0.1	0.05	0.05	0.04	0.19	0.13	0.19	0.27	0.29	0.35	0.27	0.03	0.02	0.03	0.12	0.08	0.06	0.11	0.55	0.24	0.0	0.07	0.14	0.39	1.0	0.38	0.29	0.12	0.11	0.12	0.2
Smo430052	0.5	0.43	0.38	0.42	0.57	0.44	0.51	0.59	0.58	0.65	0.63	0.67	0.2	0.23	0.19	0.23	0.24	0.27	0.28	1.0	0.6	0.14	0.22	0.22	0.76	0.79	0.45	0.46	0.35	0.34	0.3	0.28
Smo431879	0.55	0.43	0.52	0.47	0.72	0.7	0.62	0.91	0.73	0.59	0.66	0.57	0.34	0.28	0.34	0.44	0.38	0.22	0.55	0.73	0.56	0.39	0.43	0.43	1.0	0.92	0.82	0.81	0.46	0.48	0.29	0.26
Smo432315	0.3	0.16	0.09	0.18	0.32	0.16	0.4	0.39	0.55	0.55	0.51	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.39	0.05	0.0	0.0	0.65	1.0	0.3	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo438247 (RAD5)	0.45	0.48	0.41	0.44	0.47	0.48	0.46	0.53	0.59	0.65	0.59	0.49	0.32	0.39	0.37	0.39	0.22	0.03	0.36	0.43	0.35	0.28	0.28	0.3	0.58	1.0	0.56	0.6	0.24	0.27	0.22	0.2
Smo439622	0.45	0.52	0.46	0.52	0.37	0.5	0.64	0.75	0.67	0.75	0.72	0.68	0.36	0.23	0.29	0.38	0.31	0.28	0.4	0.6	0.67	0.9	0.38	0.41	1.0	0.69	0.48	0.53	0.44	0.4	0.33	0.36
Smo440808	0.29	0.35	0.41	0.47	0.48	0.59	0.62	0.73	0.67	0.66	0.63	0.49	0.45	0.51	0.62	0.53	0.3	0.18	0.53	0.38	0.48	0.28	0.42	0.42	1.0	0.87	0.62	0.63	0.34	0.35	0.33	0.31
Smo441302 (SIS7)	0.11	0.18	0.16	0.24	0.14	0.13	0.17	0.35	0.33	0.37	0.17	0.16	0.02	0.01	0.0	0.02	0.08	0.07	0.03	0.4	0.0	0.44	0.06	0.04	0.21	1.0	0.29	0.46	0.14	0.05	0.13	0.05
Smo441388	0.25	0.16	0.05	0.19	0.31	0.13	0.2	0.56	0.55	0.61	0.5	0.38	0.09	0.03	0.0	0.08	0.1	0.16	0.69	0.78	0.0	0.0	0.1	0.1	1.0	0.92	0.79	0.69	0.25	0.26	0.21	0.23
Smo441741	0.13	0.07	0.06	0.07	0.08	0.08	0.13	0.24	0.23	0.36	0.32	0.42	0.11	0.05	0.14	0.13	0.05	0.04	0.15	0.44	0.33	0.37	0.06	0.09	0.66	1.0	0.23	0.25	0.1	0.09	0.05	0.04
Smo441817	0.26	0.31	0.31	0.39	0.47	0.46	0.6	0.61	0.61	0.52	0.5	0.41	0.12	0.09	0.14	0.2	0.21	0.05	0.25	0.48	0.52	0.22	0.19	0.21	1.0	0.87	0.45	0.55	0.27	0.24	0.17	0.15
Smo443261	0.23	0.28	0.22	0.29	0.31	0.31	0.36	0.48	0.54	0.55	0.49	0.46	0.31	0.2	0.47	0.28	0.17	0.01	0.3	0.75	0.59	0.84	0.21	0.3	1.0	0.93	0.47	0.36	0.25	0.26	0.22	0.33
Smo446114	0.48	0.49	0.54	0.57	0.63	0.67	0.61	0.56	0.47	0.43	0.47	0.42	0.41	0.43	0.45	0.46	0.39	0.36	0.46	0.71	0.13	0.36	0.46	0.47	0.64	0.7	0.89	1.0	0.35	0.34	0.27	0.28
Smo447286	0.23	0.31	0.33	0.31	0.33	0.37	0.39	0.43	0.38	0.38	0.35	0.3	0.34	0.29	0.31	0.38	0.26	0.27	0.32	0.62	0.4	0.28	0.34	0.37	0.34	1.0	0.76	0.8	0.28	0.31	0.2	0.18
Smo447844	0.63	0.62	0.61	0.68	0.67	0.8	0.75	0.78	0.8	0.78	0.76	0.68	0.64	0.67	0.94	0.71	0.52	0.34	0.51	0.49	0.98	0.48	0.74	0.76	0.86	1.0	0.97	0.88	0.51	0.55	0.48	0.46
Smo448336	0.11	0.14	0.23	0.16	0.21	0.2	0.17	0.16	0.48	0.29	0.22	0.23	0.11	0.02	0.19	0.05	0.15	0.09	0.17	0.52	0.29	0.35	0.12	0.11	0.19	1.0	0.31	0.4	0.16	0.14	0.09	0.14
Smo448891 (RAD5)	0.5	0.46	0.43	0.44	0.44	0.52	0.45	0.53	0.5	0.54	0.61	0.51	0.25	0.35	0.31	0.26	0.17	0.07	0.24	0.48	0.09	0.15	0.2	0.21	0.1	1.0	0.68	0.72	0.16	0.17	0.17	0.15
Smo54681	0.65	0.49	0.52	0.58	0.65	0.64	0.71	0.65	0.81	0.56	0.48	0.57	0.07	0.08	0.27	0.08	0.31	0.08	0.21	1.0	0.54	0.04	0.22	0.2	0.57	0.65	0.81	0.73	0.23	0.21	0.24	0.24
Smo58051	0.27	0.25	0.35	0.37	0.36	0.35	0.42	0.48	0.47	0.5	0.42	0.35	0.25	0.11	0.05	0.23	0.36	0.19	0.26	0.49	1.0	0.11	0.32	0.36	0.83	0.4	0.21	0.25	0.4	0.37	0.25	0.25
Smo74963	0.43	0.31	0.38	0.43	0.63	0.68	0.73	0.86	0.63	0.66	0.51	0.47	0.5	0.32	0.32	0.61	0.4	0.38	0.81	0.65	0.17	0.21	0.63	0.66	0.33	1.0	0.79	0.8	0.6	0.71	0.39	0.41
Smo77699 (NMNAT)	0.32	0.29	0.3	0.28	0.34	0.32	0.31	0.38	0.39	0.51	0.52	0.49	0.5	0.28	0.33	0.56	0.31	0.3	0.49	0.5	0.32	0.27	0.38	0.49	0.61	1.0	0.66	0.69	0.37	0.38	0.4	0.43
Smo83967	0.7	0.72	0.74	0.61	0.63	0.68	0.52	0.48	0.5	0.6	0.53	0.58	0.17	0.31	0.22	0.27	0.63	0.42	0.73	0.38	0.77	0.46	0.34	0.24	0.53	1.0	0.74	0.87	0.66	0.61	0.35	0.4
Smo84592	0.28	0.32	0.43	0.54	0.47	0.65	0.55	0.64	0.54	0.48	0.42	0.34	0.35	0.47	0.33	0.27	0.29	0.43	0.27	0.65	0.67	0.24	0.36	0.38	0.63	0.58	1.0	0.83	0.22	0.24	0.09	0.15
Smo85972	0.39	0.43	0.45	0.54	0.54	0.58	0.5	0.58	0.51	0.52	0.5	0.41	0.44	0.47	0.69	0.56	0.35	0.22	0.44	0.46	0.62	0.35	0.44	0.44	1.0	0.72	0.65	0.76	0.4	0.42	0.23	0.21
Smo90836	0.21	0.25	0.26	0.34	0.29	0.32	0.35	0.41	0.44	0.48	0.43	0.44	0.21	0.13	0.28	0.28	0.17	0.11	0.28	0.47	0.17	0.13	0.2	0.25	0.29	1.0	0.49	0.48	0.21	0.22	0.14	0.13
Smo97439	0.2	0.31	0.23	0.34	0.3	0.43	0.34	0.39	0.35	0.39	0.31	0.33	0.04	0.03	0.01	0.24	0.28	0.08	1.0	0.3	0.12	0.0	0.41	0.28	0.5	0.74	0.49	0.35	0.3	0.24	0.14	0.07
Smo98922	0.4	0.43	0.41	0.56	0.48	0.49	0.38	0.41	0.27	0.2	0.34	0.32	0.19	0.2	0.45	0.52	0.63	0.09	0.44	0.73	0.02	0.09	0.25	0.17	0.35	0.37	0.72	1.0	0.42	0.4	0.18	0.24
Smo99840	0.34	0.36	0.35	0.42	0.4	0.45	0.42	0.44	0.37	0.44	0.43	0.38	0.23	0.3	0.42	0.34	0.37	0.31	0.58	0.39	0.07	0.29	0.37	0.42	0.31	1.0	0.74	0.75	0.31	0.37	0.32	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)