Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
Smo114131 (RS27A)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
Smo137147 (NSF)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
Smo402771 (GLIP6)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
Smo403377 (GLP10)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
Smo406278 (PUR4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
Smo429626 (ERF1-2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -
Smo93463 (GLIP1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.