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Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo105043 (UGT85A3)
 0.69 0.61 0.54 0.34 0.31 0.23 0.02 0.29 0.39 0.2 0.48 0.39 0.38 0.07 -0.66 0.6 -0.09 -0.55 0.3 -8.51 -3.23 -2.5 0.06 0.2 -1.03 -0.29 -0.41 -0.08 -0.06 -0.03 -0.34 -0.46
Smo109211 (HEN1)
 0.19 0.23 0.2 0.16 0.2 0.09 0.3 0.24 0.43 0.32 0.25 0.23 0.07 0.27 -0.45 0.18 -0.23 -0.55 0.43 -4.81 -1.6 -2.65 0.08 0.16 -0.96 0.3 0.04 0.19 -0.02 0.18 0.11 0.03
0.54 0.27 0.16 0.14 0.26 0.23 0.13 0.35 0.28 0.21 0.14 0.02 0.31 0.36 0.87 0.44 -0.55 -0.73 0.04 -3.8 -0.91 -1.98 -0.45 -0.36 -0.41 -0.19 0.22 0.04 -0.21 -0.12 -0.13 -0.04
0.32 0.27 0.33 0.52 0.49 0.41 0.37 0.32 0.28 0.32 0.18 0.31 0.13 -0.14 -0.02 0.26 -0.25 -0.76 0.2 - -3.21 -7.88 0.31 0.55 -2.95 -0.57 -0.34 -0.48 0.27 0.26 0.3 0.3
1.01 0.45 0.24 -0.06 0.03 0.22 0.02 0.18 0.29 0.33 0.38 0.38 0.21 0.51 0.3 0.35 -0.15 -0.14 0.1 -4.94 -3.23 -6.36 0.32 0.45 -2.08 -0.47 -0.53 -0.1 0.25 0.22 -0.51 -0.49
Smo121171 (KEG)
 0.3 0.32 0.45 0.45 0.37 0.33 0.17 0.17 0.16 0.32 0.3 0.19 0.26 -0.25 -0.55 0.72 0.19 -0.46 0.69 - -7.68 -8.46 0.3 -0.11 -7.96 -0.61 -0.64 -0.64 0.49 0.36 0.46 0.3
0.05 0.26 0.34 0.28 0.22 0.25 0.2 0.26 0.2 0.37 0.3 0.26 0.27 -0.5 -0.49 0.68 -0.09 -0.65 0.77 -3.98 -3.48 -6.26 -0.05 -0.35 -3.32 0.1 -0.26 -0.03 0.48 0.43 0.28 0.44
0.72 0.57 -0.07 0.37 -0.46 0.54 0.07 0.26 -0.14 0.2 0.38 0.48 0.02 1.29 0.66 0.26 -0.5 -1.0 0.25 -4.19 -2.07 -4.53 -0.26 0.17 0.08 0.43 -0.55 0.53 -0.88 -0.61 -1.26 -1.34
0.53 0.23 0.13 0.14 0.32 0.34 0.12 0.22 0.04 0.21 0.06 -0.0 0.09 -0.11 -0.13 0.22 -0.14 -0.21 0.56 -1.99 -1.76 -1.97 0.19 0.24 -0.59 -0.29 -0.02 -0.15 0.13 0.17 0.02 0.19
0.71 0.46 0.31 0.15 0.2 0.12 -0.05 0.05 0.33 0.35 0.42 0.32 0.58 -0.43 -0.95 0.7 -0.22 -0.2 -0.04 -11.32 -5.57 -6.03 0.51 0.73 -4.19 0.35 -0.44 -0.11 -0.01 0.27 -0.27 0.07
Smo147057 (COQ3)
 0.2 -0.02 0.18 0.46 0.53 0.22 0.27 0.47 0.28 0.08 0.2 0.1 0.27 -0.47 -0.24 0.33 -0.06 -0.52 0.55 -4.4 -5.63 -2.63 0.25 0.2 -0.44 -0.44 -0.28 -0.27 0.22 0.15 0.35 0.34
Smo150347 (CI51)
 0.7 0.58 0.34 0.32 0.25 0.28 0.35 0.2 0.37 0.32 0.23 0.42 -0.08 0.36 0.03 -0.14 -0.01 0.06 -0.32 -2.29 -1.5 -5.9 -0.19 -0.39 -1.6 -0.07 0.3 0.25 -0.16 -0.06 -0.3 -0.12
Smo159119 (CI76)
 0.89 0.71 0.47 0.4 0.34 0.2 0.04 0.15 0.17 0.24 0.27 0.39 0.08 1.01 0.44 -0.03 -0.33 -0.55 -0.12 -4.01 -2.91 -3.68 -0.41 -0.43 -1.7 -0.19 0.08 0.13 -0.37 -0.27 -0.13 -0.01
0.98 0.49 0.46 0.22 0.35 0.35 0.06 0.34 0.35 0.39 0.38 0.17 0.18 -0.89 -2.29 0.4 -0.39 -0.52 0.52 -2.84 -1.73 -3.01 0.53 0.66 -2.71 -0.15 -0.26 0.0 -0.18 -0.06 -0.3 -0.01
Smo165987 (UGP)
 0.98 0.97 0.57 0.05 -0.32 -0.63 -0.52 -0.16 0.04 0.31 0.48 0.92 -0.78 1.07 0.67 -0.41 -0.35 -0.39 -0.59 -3.12 -2.0 -4.65 -0.13 -0.11 -0.17 0.13 -0.04 -0.02 -0.49 -0.34 0.15 -0.08
1.12 1.09 0.46 0.29 0.04 -0.11 0.38 0.42 0.13 0.24 0.39 0.75 -1.88 1.97 1.17 -0.6 -0.2 -0.65 -0.88 -5.36 -2.0 -4.82 -2.74 -3.04 -2.16 -0.77 0.11 0.47 -0.05 -0.17 -1.89 -3.28
Smo173095 (TMKL1)
 1.22 0.8 0.44 0.3 0.32 0.23 0.05 -0.16 -0.26 -0.04 0.1 0.58 -0.33 1.35 0.79 0.27 -0.69 -0.55 -0.41 -4.35 -2.85 -1.23 -0.05 0.18 -1.47 -0.35 0.19 0.42 -1.01 -0.69 -1.22 -1.35
Smo174640 (PSD)
 0.39 0.5 0.46 0.31 0.36 0.32 0.12 -0.05 -0.04 -0.11 -0.06 -0.08 -0.28 -0.03 0.94 0.01 0.16 -0.28 0.21 -0.43 -0.39 -1.21 -0.03 -0.16 -0.54 -0.53 0.1 0.06 -0.32 -0.21 -0.36 -0.51
Smo175936 (PP2A-2)
 0.62 0.39 0.28 0.2 0.24 0.19 0.11 0.15 -0.0 -0.02 0.1 -0.02 0.22 0.29 0.34 0.48 -0.08 -0.32 0.35 -3.25 -1.62 -3.63 0.0 0.02 -0.18 -0.03 -0.01 -0.07 -0.02 0.02 -0.0 -0.24
0.94 0.52 0.28 0.24 0.29 0.37 -0.03 0.04 0.1 0.29 0.32 0.25 0.18 0.1 0.33 0.17 0.12 0.13 0.33 -5.17 -2.19 -2.88 -0.16 -0.12 -1.74 -0.39 -0.05 -0.13 0.01 0.22 -0.19 -0.35
0.63 0.37 0.19 0.16 -0.14 -0.13 -0.05 -0.14 0.11 0.29 0.23 0.35 0.72 0.78 -0.06 0.75 0.05 -0.78 0.18 -6.02 -5.55 -7.2 0.52 0.49 -3.46 -0.22 -0.07 0.03 0.26 0.26 -0.44 -0.41
Smo23005 (UGT85A7)
 0.44 0.48 0.02 0.16 0.18 -0.04 0.15 0.38 0.37 0.27 0.24 0.41 0.42 0.3 -0.68 0.47 -0.43 -0.47 0.17 -3.33 -2.39 - -0.14 0.53 -0.41 0.51 0.02 0.07 0.32 0.16 -0.52 -1.02
1.2 0.69 0.45 0.03 -0.32 -0.29 -0.2 -0.18 -0.19 0.16 0.48 0.91 0.18 1.32 0.4 1.09 0.06 -0.68 -0.83 -9.51 -6.28 - -0.6 -0.47 -3.48 -0.43 -0.21 0.05 0.18 0.28 -0.31 -1.01
1.64 0.38 0.07 -0.06 0.12 0.16 -0.29 -0.24 0.16 0.06 -0.4 -0.29 0.15 0.41 1.31 0.45 -0.21 -0.39 -0.03 - - -4.06 0.07 0.33 -3.68 -0.5 0.15 0.45 -0.45 -0.08 -0.2 -0.11
Smo266927 (SUT2)
 0.44 0.59 0.2 0.31 0.06 0.0 -0.11 -0.21 0.03 0.08 0.05 0.32 0.24 0.41 0.07 0.67 -0.04 -0.11 0.37 -2.7 -1.89 -3.33 0.34 0.26 -0.81 0.32 -0.45 -0.28 -0.08 -0.01 -0.13 -0.01
0.75 0.55 0.02 -0.05 -0.1 -0.12 -0.25 0.03 0.17 0.15 0.08 0.42 0.06 0.9 0.24 0.53 -0.84 -0.84 -0.05 -1.74 -2.29 -3.4 -0.2 0.1 0.04 0.82 0.28 0.42 -0.27 -0.19 -0.68 -0.5
Smo267830 (GLS2)
 0.55 0.52 0.4 0.49 0.3 0.01 0.23 0.37 0.62 0.63 0.69 0.6 -0.92 -0.63 0.28 -0.66 -0.27 -1.57 -0.02 -3.09 -4.36 -2.65 0.28 0.33 -4.32 0.26 0.25 0.36 -0.26 -0.05 -0.01 -0.02
Smo404660 (RST1)
 0.37 0.34 0.19 0.33 0.17 0.0 0.02 0.23 0.4 0.44 0.52 0.56 -0.17 -0.05 0.6 -0.01 -0.28 -1.09 0.27 -4.28 -1.92 -1.95 -0.14 -0.04 -0.92 0.12 0.08 0.17 -0.04 0.11 -0.0 -0.03
1.1 0.77 0.51 0.43 -0.09 0.36 -0.11 -0.1 0.08 0.01 -0.05 0.34 0.19 0.03 -0.23 0.25 0.02 0.4 0.56 -1.25 -1.17 -4.41 0.34 0.34 -1.89 -1.54 -0.97 -1.29 0.08 0.08 -0.23 0.04
0.55 0.28 0.19 0.24 0.25 0.06 0.14 -0.18 0.2 0.13 0.03 0.03 -0.12 -0.26 -0.15 0.29 0.23 -0.24 0.67 -6.72 -1.92 - 0.13 -0.02 -2.99 -0.15 0.05 0.29 0.23 0.56 0.29 0.59
1.57 0.95 0.87 0.66 0.86 0.72 -0.59 -0.47 -0.72 -0.81 -0.63 -0.24 -0.17 -0.47 0.42 0.11 -0.5 -1.07 -0.38 -8.29 -4.97 -0.96 0.83 0.73 -0.93 -1.0 0.11 0.4 -0.48 -0.09 -0.52 -1.13
1.24 -0.21 -0.96 -1.12 -1.12 -1.32 -1.24 -0.99 -0.66 -0.36 0.22 0.66 0.7 1.12 1.18 0.67 -1.05 -0.99 -0.15 -2.04 -2.81 -1.0 -0.88 -0.56 -0.32 1.84 -0.04 -0.22 -0.11 0.05 0.1 -0.07
0.87 0.84 0.36 0.15 0.22 -0.28 -0.26 -0.47 -0.13 0.0 0.22 0.49 -0.53 -0.01 1.26 0.01 0.15 -0.28 0.08 -2.35 -0.89 -1.53 -0.12 0.14 -2.4 0.07 0.15 0.58 -0.02 0.12 -1.35 -1.08
Smo443638 (TAF15)
 0.23 0.13 0.13 0.13 0.31 0.25 0.37 0.39 0.32 0.55 0.35 0.19 0.2 -0.26 0.24 0.35 -0.16 -0.54 0.24 -3.68 -1.35 -1.98 0.15 0.09 -1.71 -0.19 -0.44 -0.44 0.03 0.07 0.29 0.4
0.3 0.23 0.24 0.27 0.43 0.53 0.38 0.3 0.38 0.47 0.22 0.29 0.03 0.05 -0.24 0.47 -0.31 -0.93 0.15 -5.7 -1.0 -3.84 0.22 0.55 -1.95 -0.26 -0.4 -0.52 0.1 0.1 0.11 0.12
Smo445125 (REV1)
 0.91 0.51 0.19 0.28 0.24 0.35 0.09 -0.07 -0.03 -0.07 0.04 0.14 0.16 1.32 -0.67 0.36 -0.46 -0.77 0.08 -2.72 -1.17 -2.7 -0.69 -0.62 -0.1 -0.22 0.63 0.84 -0.4 -0.19 -0.75 -0.9
Smo45667 (ZFN1)
 0.78 0.47 0.43 0.19 0.31 0.06 0.1 0.08 0.22 0.28 0.42 0.2 -0.02 -0.07 -0.95 0.55 0.15 -0.0 0.26 -7.29 -5.87 -7.3 0.44 0.44 -10.43 -0.12 -0.28 -0.18 0.36 0.44 0.03 -0.19
Smo68227 (BLH7)
 1.07 0.57 0.56 0.28 0.39 0.27 0.05 0.54 0.48 0.61 0.41 0.24 0.21 -1.0 -2.62 0.43 -0.33 -0.38 0.58 - - -7.52 0.51 0.61 - -0.54 -0.69 -0.56 -0.03 0.09 -0.1 0.18
Smo73365 (BGLU40)
 1.88 1.84 -0.05 0.26 0.39 -0.82 -0.56 -1.29 -0.64 -0.69 -0.11 0.51 -2.19 2.03 1.5 0.18 -0.16 -4.07 -0.61 -4.97 -6.07 -3.91 -0.59 -1.2 -2.2 -0.65 -0.47 -0.18 -0.23 -0.18 -1.29 -1.59
Smo74453 (POB1)
 0.31 0.25 0.09 0.13 0.21 0.25 0.25 0.39 0.33 0.42 0.23 0.24 0.1 0.06 0.03 0.24 -0.31 -0.8 0.27 -2.86 -1.48 -3.36 -0.06 0.03 -0.5 -0.03 -0.15 -0.08 0.03 0.06 0.37 0.33
Smo74687 (MPK16)
 0.97 0.66 0.33 0.2 0.04 -0.05 -0.24 -0.07 -0.09 0.09 0.28 0.72 -0.0 0.54 0.29 0.38 -0.01 -0.52 0.18 -6.11 -6.06 - 0.03 0.16 -2.79 0.3 0.06 0.27 0.24 0.35 -0.53 -0.66
0.99 0.5 -0.05 0.11 -0.08 -0.21 -0.52 -0.7 -0.48 -0.34 -0.06 0.49 0.56 0.66 0.87 0.98 -0.18 -0.7 0.37 -1.36 -3.34 -2.35 -0.34 -0.56 -0.39 0.57 0.28 0.52 -0.18 -0.04 -0.6 -1.49
0.63 0.45 0.31 0.29 0.35 0.39 0.05 0.16 0.07 0.19 0.43 0.24 -0.0 0.04 0.31 0.54 -0.06 -0.2 0.48 -1.98 -1.65 -5.37 0.1 0.23 -1.03 -0.2 -0.78 -0.55 -0.16 0.06 -0.09 -0.18
Smo77337 (ACCD)
 0.9 0.66 0.32 0.09 0.13 0.25 -0.13 -0.12 0.15 0.37 0.05 0.31 -0.09 -0.05 -0.17 0.39 0.12 0.49 0.54 -0.69 -1.69 -1.73 0.08 0.47 -2.91 -0.17 -0.86 -1.01 0.13 0.12 -0.5 -0.41
1.15 1.29 0.7 0.46 0.37 -0.14 -0.3 -0.23 0.14 0.1 0.33 0.65 -0.98 0.93 0.87 -0.04 0.03 -0.25 -0.84 -3.47 -1.94 -1.37 -0.07 0.08 -1.34 -0.35 -0.79 -0.65 -0.54 -0.37 -0.55 -0.88
0.35 0.44 0.38 0.3 -0.13 -0.0 0.28 0.16 0.45 0.57 0.36 0.37 0.22 0.2 -0.28 0.49 -0.33 -0.81 -0.04 -10.66 -4.23 -9.3 0.36 0.37 -2.49 0.55 -0.05 0.45 0.35 0.36 -0.75 -0.92
0.58 0.34 0.24 0.26 0.25 0.18 -0.09 0.07 0.17 0.18 0.2 0.25 0.33 0.13 -0.52 0.36 -0.03 -0.45 0.62 -2.37 -2.2 -4.36 0.61 0.11 -0.67 0.04 0.07 0.01 -0.08 0.02 -0.34 -0.24
1.59 0.76 0.28 0.12 0.17 0.2 -0.22 -0.66 -0.28 -0.37 -0.02 0.37 0.35 1.89 -2.51 0.66 -0.4 -0.37 -0.04 -1.76 -0.46 -5.53 -1.13 -0.92 0.03 -1.99 -0.4 0.01 -0.25 -0.05 -0.55 -0.84
0.56 0.43 0.27 0.23 0.17 0.11 0.09 0.15 0.35 0.44 0.37 0.35 0.0 0.23 0.45 0.4 -0.15 -0.55 0.2 -5.2 -3.88 -3.29 -0.03 -0.13 -2.27 0.61 -0.26 -0.27 0.46 0.47 -0.49 -0.56
1.39 1.4 0.62 -0.05 -0.1 -0.65 -0.86 -0.78 -0.63 -0.67 -0.29 0.22 0.2 1.13 0.42 1.52 -1.45 -0.89 0.28 -5.41 -3.29 -4.43 -0.58 0.03 -1.46 0.4 0.61 0.37 -0.83 -0.47 -1.19 -0.88
0.63 0.62 0.43 0.43 0.37 0.12 0.07 0.19 0.29 0.32 0.49 0.66 -0.16 0.36 0.12 -0.23 0.06 -0.73 -0.21 -4.28 -3.64 -4.87 -0.31 -0.34 -1.45 0.14 0.28 0.55 0.03 0.08 -0.16 -0.56
Smo93784 (ATM1)
 0.89 0.64 0.58 0.3 0.49 0.45 0.22 0.01 0.1 0.22 0.61 0.29 -0.14 0.28 0.71 0.61 -0.09 -0.0 0.04 -6.14 -4.1 -2.88 -0.36 -0.38 -4.96 -0.05 -0.05 -0.09 -0.03 -0.04 -0.91 -0.91
1.74 1.21 0.26 -0.11 -0.62 -0.81 -1.33 -0.96 -0.75 -0.28 0.06 1.09 0.96 1.28 0.75 0.91 -0.94 -0.41 0.17 -3.97 -3.5 -5.78 -0.68 -0.2 -0.7 0.0 -0.48 -0.08 -0.5 -0.16 -1.76 -1.71
Smo96881 (LACS9)
 1.34 1.06 -0.16 -0.6 -0.49 -0.78 -0.63 -0.69 -0.55 -0.5 -0.27 0.58 -0.36 0.34 0.51 0.87 -0.88 -0.05 0.81 -1.64 -0.46 -2.64 -0.53 -0.01 -0.26 0.43 0.14 -0.03 -0.2 -0.01 -0.03 -0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.