1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.05 0.12 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 91.46 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.23 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo117920 (TT7)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 11.36 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0
Smo126308 (RPL10B)
 0.07 0.2 0.1 0.05 0.03 0.04 0.34 0.28 0.05 0.11 0.11 0.03 0.11 0.16 0.18 0.13 0.18 0.11 16.29 0.0 1.36 0.1 0.52 1.01 0.29 0.14 0.08 0.0 0.16 0.35 0.41 0.55
0.32 0.32 0.71 0.62 0.92 1.1 1.14 1.09 0.65 0.99 0.9 0.63 2.35 1.51 7.5 0.79 0.65 0.66 696.98 1.18 0.63 0.15 0.24 0.23 0.12 1.01 2.74 2.64 0.37 0.46 0.29 0.31
0.28 0.23 0.16 0.28 0.57 0.36 0.42 0.29 0.33 0.51 0.36 0.32 0.37 0.27 0.44 0.37 0.24 0.36 22.24 0.0 0.0 0.0 0.88 0.59 0.14 0.18 0.3 0.23 0.09 0.18 0.49 0.75
0.27 0.44 0.31 0.49 0.09 0.48 1.42 1.46 0.39 0.38 0.54 0.27 0.43 0.66 0.79 0.24 0.42 0.22 22.87 0.0 0.0 0.0 0.17 0.24 0.0 0.0 0.27 0.0 0.04 0.25 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.45 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo27935 (R1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
3.98 3.6 3.44 4.31 7.12 7.04 5.65 6.49 4.39 4.54 3.48 3.26 9.41 3.74 7.26 11.77 6.36 7.11 242.52 0.72 1.45 0.81 12.07 12.39 14.98 10.59 8.0 8.75 7.01 8.63 3.71 4.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.13 8.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.13 0.0 0.0 0.0 0.45 0.26 0.33 0.48 0.12 0.25 0.14 0.13 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 22.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.04 0.6 0.39 1.39 0.38 0.5 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.21 0.0 0.0 0.0 0.35 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo402765 (GLIP6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo404034 (TLP-3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo404385 (TLP-3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.19 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.93 0.28 1.8 2.14 0.17 1.3 0.57 0.48 1.7 0.25 3.36 1.16 0.0 3.86 0.0 3.92 0.75 1.15 32.38 0.0 1.21 0.0 0.0 0.86 2.46 0.32 0.0 1.5 0.4 0.66 1.45 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 148.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo407504 (SSP5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.12 2.77 0.99 26.02 7.35 3.67 633.23 1.29 2.62 0.35 0.05 0.9 11.02 0.24 1.97 0.28 4.64 10.58 5.42 17.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 2.63 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.27 0.12 0.63 0.34 0.08 0.49 0.26 0.31 0.45 0.45 0.45 0.27 1.17 1.65 0.21 1.23 0.14 0.13 26.89 0.0 0.0 0.0 0.27 0.64 0.28 0.66 0.39 0.21 0.34 0.25 0.15 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.05 0.23 0.0 0.0 0.43 0.05 0.08 27.29 0.0 0.0 0.0 0.24 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.64 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo417095 (SSP5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.9 0.41 0.34 0.21 0.42 0.24 0.09 0.29 0.34 0.56 0.34 1.33 0.53 0.0 1.32 0.41 0.43 330.51 0.0 0.0 0.0 2.0 0.62 1.44 0.07 0.0 0.25 0.24 0.29 0.21 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.05 0.03 0.0 0.37 0.12 0.2 0.12 0.03 0.0 0.04 0.04 0.0 0.05 0.12 0.29 0.35 31.36 0.0 0.22 1.04 0.38 0.22 1.93 0.16 0.65 0.41 0.31 0.5 0.17 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.73 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.55 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 18.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 1.01 1.96 0.94 0.97 2.48 1.15 1.35 1.23 1.21 1.4 1.54 1.42 0.24 1.58 0.33 0.38 0.92 4652.05 0.09 0.0 2.85 0.45 0.57 3.29 1.76 2.95 2.21 0.66 1.11 0.15 0.56
2.21 0.78 1.19 1.33 0.53 1.1 0.17 0.44 1.47 1.06 0.56 2.01 0.91 0.13 0.09 0.0 0.57 1.06 2865.03 0.0 0.37 0.0 1.11 0.77 0.53 0.15 0.55 0.0 1.45 0.85 0.91 1.13
Smo5960 (AGL17)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.81 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.86 0.21 1.32 0.23 0.06 2.46 0.37 0.04 0.93 0.19 0.49 147.92 0.0 0.0 0.0 1.55 7.49 0.0 0.53 0.3 0.0 0.55 1.18 0.37 1.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.15 0.0 0.1 0.3 0.29 0.14 0.19 0.0 0.02 0.11 0.09 0.15 0.25 0.19 0.2 0.4 0.2 0.05 13.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.17 0.0 0.06 0.25 0.0 0.06 0.0 0.19 0.32
Smo84369 (ATM1)
 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.15 0.0 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.17 0.25 39.59 0.1 0.0 0.25 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 0.15 0.16 0.08 0.15
0.93 0.15 0.17 0.12 0.06 0.57 0.59 0.88 0.71 1.95 1.13 0.3 0.06 0.0 0.1 1.04 0.6 0.68 79.11 0.0 1.94 2.01 0.27 0.21 0.23 0.8 1.11 0.52 0.36 0.38 0.43 0.36
Smo85851 (CAL)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 30.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.98 0.51 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Smo92287 (SWEET5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.21 0.0 0.04 0.0 0.3 0.0 0.0 0.04 59.35 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)