Heatmap: Cluster_83 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.39 0.37 0.37 0.37 0.48 0.7 0.59 0.63 0.99 1.06 0.86 0.77 -0.1 -1.46 -2.15 -2.16 -0.75 -0.27 -0.69 -0.14 -5.45 -1.64 -2.6 -0.68 -0.63 -0.57
0.97 0.15 -0.12 0.22 0.21 0.15 0.42 0.37 0.1 -0.08 0.1 0.02 0.86 -0.89 -0.4 -0.37 -0.72 0.33 -0.1 -0.63 -4.29 0.18 -0.3 -0.18 -0.02 -0.58
1.38 0.56 -0.03 0.32 0.31 -0.45 0.33 0.57 0.22 0.51 0.72 0.56 1.09 -1.94 -2.15 -0.93 -1.06 -0.67 -1.22 -0.43 -2.54 -0.51 -1.2 -0.57 0.19 -0.48
0.92 0.1 0.09 0.18 0.1 -0.05 0.37 0.6 0.11 0.01 0.03 0.07 1.04 -0.98 -0.89 0.77 -0.7 -0.07 -0.22 -0.3 -2.9 -0.2 -1.04 -1.03 -0.06 -0.23
1.13 0.35 0.25 0.21 -0.6 -0.52 0.22 0.27 0.23 0.19 0.39 0.54 1.31 -0.85 -0.54 -0.69 0.54 0.05 -0.06 -0.24 -5.91 -3.09 -0.6 -0.23 -0.62 -1.15
0.71 0.17 -0.12 0.84 0.84 0.45 0.43 0.38 -0.16 -0.47 -0.56 -0.79 0.26 -0.41 -0.4 -0.05 -0.19 -0.21 -0.15 -0.83 -0.68 -0.59 -0.09 -0.49 0.28 -0.32
-0.06 0.41 0.6 0.63 0.68 0.78 0.57 0.51 0.55 0.64 0.71 0.54 -0.49 -1.69 -1.12 -2.29 -0.35 -0.32 -0.23 0.46 -4.14 -0.97 -1.7 -0.9 -0.44 -0.63
0.43 0.24 0.1 0.43 0.45 -0.06 0.25 0.3 0.42 0.61 0.88 0.87 0.59 -0.84 -1.31 -0.74 -0.52 -0.33 -0.73 -0.32 -2.33 -0.03 -1.03 -0.93 -0.21 -0.4
1.37 0.75 0.08 -0.12 -0.39 -0.69 -0.25 0.27 0.4 0.41 0.64 0.79 1.54 -0.9 -1.0 -1.19 -1.03 -0.48 -0.58 -1.2 -4.38 -1.86 -0.31 -0.4 0.18 -0.58
0.52 0.24 0.02 0.24 -0.01 -0.2 -0.01 0.19 0.22 0.27 0.54 0.66 0.74 -0.12 -0.48 -0.45 -0.66 -0.2 -0.49 -0.48 -4.25 0.06 -0.65 -0.33 0.12 0.24
0.85 0.13 0.26 0.43 0.46 0.5 0.56 0.55 -0.09 -0.45 -0.35 -0.1 1.25 -0.62 -0.64 -0.38 -0.55 -0.17 -0.57 -0.42 -2.76 0.47 -1.51 -0.91 -0.07 -0.63
1.35 0.39 0.31 0.02 0.46 0.17 -0.11 -0.1 0.11 0.2 0.61 1.28 1.81 -1.17 -1.0 -1.27 -1.21 -0.94 -0.73 -0.83 -5.2 -0.3 -2.29 -1.5 -1.07 -1.06
1.17 0.7 0.49 0.37 -0.14 -0.38 0.61 0.17 0.64 0.74 0.49 0.45 1.0 -0.14 -1.51 0.87 -1.59 -1.74 -1.01 -1.17 -3.91 -0.78 -2.27 -2.14 -0.11 -1.18
0.53 0.21 0.22 0.56 0.7 0.66 0.66 0.61 0.6 0.53 0.55 0.66 0.81 -0.61 -1.06 -0.61 -1.05 -0.71 -0.85 -1.05 -3.17 -0.67 -1.69 -0.92 -0.56 -0.99
0.05 0.53 0.31 0.75 0.78 0.19 0.46 0.67 0.76 0.06 0.63 0.29 -0.54 -1.32 -1.97 -0.4 -0.53 -0.21 0.02 -0.38 -3.01 -1.27 -0.44 -1.15 0.31 -0.22
0.51 -0.02 0.02 0.67 0.44 0.08 0.26 0.86 0.74 1.27 1.69 1.66 0.94 -5.14 -4.27 -4.14 -3.18 -4.06 -3.86 -2.24 -3.5 -2.51 -0.79 -2.95 0.2 -1.12
1.05 0.17 -0.31 0.73 -0.04 -0.82 -0.12 0.72 0.84 1.45 1.79 1.63 1.24 -5.78 - -3.37 -4.64 -3.73 -4.84 -3.06 -3.65 -1.8 -1.74 -1.76 -0.2 -0.76
0.74 0.08 -0.22 0.36 0.19 -0.31 -0.07 -0.06 0.37 0.43 0.8 0.96 0.66 -0.35 -0.25 -0.59 -1.35 -0.46 -0.8 -1.11 -3.66 -0.7 -0.01 0.0 0.17 0.16
1.6 0.28 -0.37 -0.1 -0.67 -0.5 0.41 0.69 0.37 0.5 0.65 0.91 1.79 -0.84 -1.04 -1.33 -1.51 -0.57 -1.02 -1.35 -3.9 -2.31 -0.62 -1.4 -0.52 -0.31
1.23 0.96 0.16 0.62 0.38 -0.41 0.13 0.28 -0.06 -0.17 0.06 0.32 1.46 -1.59 -1.57 -1.4 -1.52 -0.48 -0.77 -1.1 -2.43 -1.23 -0.64 -0.06 0.46 0.04
0.2 0.02 0.12 0.43 0.49 0.4 0.51 0.58 0.49 0.4 0.49 0.57 0.4 -0.85 -0.78 -0.8 -0.82 -0.49 -0.59 -0.83 -1.62 0.37 -0.6 -0.56 -0.25 -0.32
0.99 0.15 0.08 0.29 0.4 0.31 0.64 0.66 0.22 0.22 0.11 -0.11 0.88 -0.68 -0.47 -0.46 -0.32 -0.03 0.06 -0.22 -3.61 -0.72 -1.58 -1.07 -0.14 -0.78
0.66 0.28 0.4 0.39 -0.11 -0.57 -0.16 0.35 0.18 0.38 0.56 0.56 0.78 -0.48 -0.47 -0.42 -0.7 -0.22 -0.61 -0.46 -2.84 -0.07 -0.97 -0.89 0.52 0.11
0.23 0.31 0.54 0.52 0.49 0.2 0.78 0.73 0.66 0.95 0.84 0.54 0.16 -1.67 -1.81 -2.23 -0.68 -0.55 -0.83 0.13 -5.2 -1.58 -2.13 -0.67 -0.22 0.04
2.32 0.33 -1.67 -1.53 -0.56 0.34 1.04 1.09 0.42 0.14 -0.16 -0.38 1.94 -3.37 -2.5 -3.97 -1.97 -0.22 -0.45 -0.62 -5.42 -6.44 -0.4 -0.14 -1.31 -3.22
0.52 -0.19 -0.05 0.0 -0.05 -0.08 0.25 0.29 0.53 0.67 0.89 1.15 0.7 -0.16 -0.72 -0.54 -0.83 -0.61 -0.61 -0.84 -2.7 -0.5 -0.67 -0.53 -0.26 0.04
0.66 0.56 0.46 0.86 0.66 0.13 0.4 0.72 0.67 0.62 0.42 -0.02 0.41 -1.38 -2.64 -1.74 -1.59 -0.72 -0.79 -0.79 -3.15 -1.18 -0.82 -0.64 0.26 0.54
0.88 0.41 0.16 0.08 0.13 0.2 0.45 0.54 -0.19 -0.06 -0.07 -0.17 0.73 -0.51 -0.23 -0.28 0.18 0.57 0.32 0.25 -2.56 -1.69 -1.21 -0.76 -0.43 -0.79
1.09 0.48 0.03 -0.16 -0.13 -0.12 0.35 0.49 0.08 0.41 0.69 0.91 1.05 -3.24 -1.57 -2.53 -0.13 0.44 -0.1 0.49 -4.34 -1.58 -0.76 -0.07 -1.03 -1.16
0.69 0.2 0.12 0.04 -0.09 -0.07 0.28 0.4 0.24 0.2 0.16 0.17 0.76 -0.23 0.22 0.04 -0.11 0.24 -0.03 -0.11 -2.85 -0.38 -0.98 -0.64 -0.53 -0.64
0.61 0.25 0.16 0.36 0.31 0.47 0.59 0.62 0.52 0.27 0.34 0.42 0.71 -0.62 -0.44 -0.5 -0.74 -0.46 -0.57 -0.65 -2.7 -0.5 -0.48 -1.11 -0.37 -0.33
1.42 0.57 0.06 0.1 -0.31 -0.48 -0.11 -0.23 -0.49 -0.64 -0.21 -0.16 1.51 -0.19 -0.46 0.17 -0.17 -0.04 -0.05 -0.02 -4.59 -0.56 -0.5 -0.79 0.47 -0.91
0.97 0.17 -0.09 -0.25 0.01 0.34 0.58 0.52 0.4 0.32 0.06 -0.08 0.85 -0.88 -0.32 -0.84 -0.23 0.25 0.16 -0.07 -4.52 -0.94 -0.22 -0.33 -0.42 -0.72
0.47 -0.39 0.02 0.41 0.48 0.09 0.39 0.31 0.59 0.32 0.89 0.63 -0.27 -1.14 -1.02 -2.21 -1.13 -0.09 -0.94 -1.96 -4.45 0.87 -0.16 -0.24 0.65 -0.01
1.16 1.17 1.31 1.58 1.12 0.22 0.15 0.47 -0.75 -0.63 -0.39 -0.22 1.09 -0.61 -2.7 -0.81 -1.84 -1.94 -1.99 -1.5 -7.51 -2.3 -5.51 -3.21 0.28 0.17
0.76 0.15 0.05 0.29 0.23 0.09 0.15 0.28 0.17 0.34 0.56 0.66 0.84 -0.28 -0.78 -0.72 -0.72 -0.61 -1.17 -0.73 -2.27 -0.24 -0.45 -0.12 0.17 -0.01
0.53 -0.03 -0.22 0.13 0.19 0.4 0.59 0.59 0.11 -0.02 -0.0 -0.1 0.35 -0.52 -0.71 -0.75 -0.36 0.04 0.01 -0.27 -2.77 0.36 0.2 -0.11 0.06 -0.32
1.16 0.39 -0.05 -0.12 0.19 0.1 0.24 0.37 0.31 0.56 0.43 0.4 1.05 -0.88 -1.0 0.29 -0.76 -0.37 -0.71 -0.69 -6.08 -0.66 -1.04 -0.88 0.02 -0.16
0.47 0.06 0.28 0.72 0.76 0.93 0.68 0.77 0.48 0.68 0.49 0.32 -0.1 -2.14 -0.27 -2.72 -0.93 -0.28 -0.46 0.06 -5.64 -1.32 -0.5 -1.3 -0.67 -0.38
0.37 -0.03 0.42 0.81 0.67 0.57 0.9 1.07 0.57 0.59 0.81 0.69 0.23 -2.64 -1.4 -2.59 -0.98 -0.49 -0.99 -0.38 -5.2 -1.62 -0.46 -0.74 -1.03 -0.5
0.08 0.11 0.06 0.27 0.47 0.0 0.18 0.31 0.4 0.45 0.49 0.47 0.08 -0.18 -0.07 -0.28 -0.27 -0.01 -0.13 -0.08 -2.91 -0.26 -0.87 -0.49 -0.28 -0.09
1.08 0.49 0.19 0.53 0.29 -0.02 0.25 0.42 0.52 0.27 0.51 0.33 1.01 -0.85 -0.65 -0.25 -0.58 -0.6 -0.75 -0.45 -2.07 -0.91 -0.73 -1.01 -0.5 -0.8
0.33 0.32 0.26 0.89 0.94 0.12 0.34 0.38 0.34 0.39 0.57 0.55 0.42 0.08 -0.35 -0.1 -0.77 -0.38 -0.36 -0.36 -5.72 -3.4 -2.11 -2.24 -0.21 -0.17
1.18 0.29 -0.01 0.15 0.18 0.14 -0.05 0.23 0.09 0.08 0.37 0.76 1.2 0.04 -1.46 -0.13 -1.23 -0.32 -0.45 -0.56 -2.95 -1.62 0.25 -0.59 -0.47 -0.61
1.04 0.33 0.06 0.4 0.21 -0.18 0.53 0.8 0.68 0.69 0.67 0.33 1.06 -0.97 -1.09 -0.62 -0.61 -0.56 -0.4 -0.56 -5.73 -1.74 -2.74 -1.32 -0.27 -0.24
0.97 0.4 0.64 1.0 0.74 0.17 0.03 -0.49 -0.21 0.05 0.49 0.43 1.1 0.16 -2.48 -0.42 -1.33 -0.87 -1.39 -2.15 -2.96 -0.87 0.49 -0.78 0.07 -0.84
1.12 0.4 0.22 -0.13 -0.45 -0.33 -0.0 0.4 -0.06 0.29 0.73 0.73 1.43 -0.74 -0.59 -0.63 -0.75 -0.39 -0.43 -0.53 -1.87 -2.19 0.09 -0.27 -0.71 -0.52
1.34 0.35 -0.18 -0.04 0.21 0.06 0.37 0.41 0.27 0.26 0.47 0.45 1.31 -1.23 -1.0 -0.81 -0.92 -0.47 -0.35 -0.61 -5.7 -0.41 -1.31 -0.88 0.22 -0.26
0.17 -1.03 -0.91 0.71 0.95 -0.68 -0.22 0.83 1.54 0.69 1.78 0.31 -1.05 -3.1 -1.94 -5.19 -4.08 -2.37 -3.26 -2.97 -2.68 0.54 1.39 -1.16 0.63 -2.05
0.23 0.09 0.18 0.31 0.34 0.43 0.53 0.6 0.57 0.4 0.49 0.6 0.52 -0.39 -0.52 -0.17 -0.74 -0.87 -0.69 -0.71 -1.72 -0.06 -0.97 -0.63 -0.39 -0.42
0.92 0.4 0.28 0.61 0.57 0.38 0.17 0.34 0.24 0.13 0.42 0.54 0.83 -0.86 -0.65 -0.78 -0.79 -0.46 -0.63 -0.46 -3.88 -0.63 -0.85 -0.67 0.07 -0.68
0.3 -0.98 -0.59 1.02 0.7 -0.25 0.48 0.31 0.91 0.81 1.32 0.93 -0.14 -1.76 -2.72 -0.0 -2.72 -1.36 -1.3 -2.53 -1.14 0.42 -0.43 -1.31 0.41 -0.56
1.24 -0.02 -0.43 0.06 0.27 0.38 0.71 0.92 0.48 0.23 0.01 -0.29 1.29 -1.26 -1.41 -1.09 -1.09 -0.25 -0.28 -1.08 -4.3 0.01 -1.32 -0.87 0.58 -0.7
1.9 0.34 -0.36 -0.11 -0.65 -0.84 -0.02 0.22 -0.03 -0.03 0.23 -0.02 1.43 0.07 -1.32 -0.36 -0.72 -0.1 0.31 -0.5 -1.83 -3.54 -0.92 -0.35 -0.66 0.16
0.6 -0.09 -0.02 0.44 0.53 0.47 0.49 0.98 0.74 0.52 0.8 0.03 0.06 -0.69 -0.96 -0.85 -0.58 -1.08 -0.02 -0.72 -3.07 -1.56 -0.55 -1.58 0.56 -0.52
2.17 0.03 -0.74 -5.22 -5.6 -2.81 -0.8 0.4 -0.3 0.13 0.44 1.22 1.88 -3.08 -0.17 -4.36 -0.25 -1.7 -1.54 -1.19 -0.85 -0.21 -0.79 1.09 -0.24 -0.81
0.89 0.52 0.31 0.75 0.57 -0.07 0.27 0.38 0.25 0.32 0.48 0.54 1.04 -1.11 -1.23 -1.05 -0.9 -0.43 -0.6 -0.8 -3.0 -0.44 -0.52 -0.5 -0.83 -0.31
0.49 -0.08 0.29 0.81 0.53 0.01 -0.22 -0.05 -0.33 0.04 0.47 0.7 0.91 -0.34 -1.22 0.02 -0.9 -1.32 -1.55 -1.3 -2.35 -1.05 0.13 0.83 0.24 0.05
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2.17 0.5 -0.01 -0.05 0.11 0.5 0.7 0.71 -0.72 -0.92 -1.21 -1.62 1.78 -0.53 -0.52 -0.69 -0.96 -0.22 -0.39 -0.88 -3.96 -0.76 -1.79 -2.15 -0.62 -0.91
0.11 0.34 0.42 0.5 0.58 0.42 0.42 0.39 0.34 0.55 0.54 0.55 0.19 -0.81 -0.88 -0.91 -0.43 -0.36 -0.47 -0.01 -5.76 -0.3 -1.16 -0.48 -0.16 -0.22
0.01 0.22 -0.62 0.8 0.77 -0.49 0.86 0.66 0.61 0.71 1.25 0.79 0.34 -2.73 -1.21 -2.32 -3.32 -0.59 -1.64 -1.88 - 1.31 -1.84 -1.76 0.49 -1.04
0.31 0.39 0.45 0.87 0.62 -0.31 0.23 0.46 -0.19 -0.1 0.55 0.92 1.11 -0.33 -0.95 -0.78 -0.39 -0.82 -0.79 -1.27 -3.41 0.38 -0.97 -1.24 -0.34 -0.51
0.57 0.37 0.31 0.91 0.69 -0.22 0.04 0.36 -0.18 0.2 0.65 0.91 1.15 -0.61 -1.21 -1.04 -0.79 -0.97 -1.04 -1.34 -2.88 -0.02 -0.91 -1.13 0.2 -0.32
1.8 -0.28 -1.15 -0.43 0.23 0.39 0.97 1.17 0.62 0.49 0.17 -0.26 1.6 -1.31 -1.95 -2.08 -1.8 -0.66 -1.27 -2.65 -5.09 0.05 -1.55 -1.42 0.18 -0.79
0.71 0.34 0.38 0.74 0.77 0.57 0.36 0.49 0.18 0.37 0.5 0.44 0.34 -0.87 -0.9 -0.82 -0.97 -0.68 -0.55 -0.59 -4.95 -0.34 -1.49 -1.0 0.18 -0.25
0.78 0.36 0.27 0.17 0.2 0.32 0.42 0.41 0.42 0.55 0.74 0.71 1.04 -0.89 -1.04 -1.05 -0.31 -0.39 -0.99 -0.05 -2.28 -1.54 -1.08 -0.53 -0.83 -0.71
0.59 0.13 0.24 0.57 0.32 0.19 0.47 0.57 0.35 0.36 0.33 0.03 0.38 -0.47 -0.0 -0.47 -0.24 -0.23 -0.31 -0.22 -4.11 -0.04 -1.73 -1.31 -0.22 -0.07
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0.28 0.21 -0.02 0.7 0.46 0.29 0.6 0.66 0.87 0.57 0.77 0.64 0.35 -0.89 -1.0 -0.89 -0.56 -0.63 -0.63 -0.59 -3.45 -0.51 -0.81 -0.67 -0.94 -0.45
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0.81 0.36 -0.0 -0.14 -0.21 -0.07 0.59 0.73 0.21 0.17 0.02 -0.22 0.54 -0.17 -0.46 0.03 0.08 0.49 -0.09 -0.21 -3.15 -0.82 -0.42 -0.4 -0.29 -0.84

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.