1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.38 0.43 0.48 0.59 0.68 0.73 0.69 0.64 0.52 0.47 0.45 0.38 0.22 0.34 0.52 0.3 0.38 0.24 0.36 0.03 0.06 0.03 0.36 0.34 0.13 0.47 0.91 1.0 0.34 0.36 0.29 0.26
0.45 0.39 0.39 0.42 0.51 0.59 0.64 0.75 0.55 0.51 0.46 0.42 0.15 0.12 0.3 0.18 0.3 0.2 0.4 0.05 0.05 0.04 0.3 0.28 0.37 0.59 0.98 1.0 0.39 0.39 0.25 0.23
Smo117257 (SPPL1)
 0.5 0.41 0.52 0.49 0.52 0.52 0.59 0.54 0.5 0.47 0.5 0.41 0.24 0.19 0.23 0.3 0.59 0.51 0.5 0.08 0.29 0.0 0.45 0.34 0.37 0.43 0.74 1.0 0.64 0.65 0.43 0.34
0.17 0.15 0.18 0.2 0.24 0.3 0.46 0.5 0.47 0.51 0.43 0.35 0.04 0.06 0.14 0.06 0.15 0.12 0.11 0.0 0.0 0.06 0.11 0.08 0.04 0.44 1.0 0.95 0.21 0.21 0.18 0.22
0.47 0.5 0.46 0.55 0.61 0.59 0.72 0.69 0.7 0.65 0.56 0.53 0.25 0.25 0.36 0.31 0.45 0.35 0.46 0.01 0.02 0.01 0.43 0.45 0.24 0.75 0.9 1.0 0.5 0.53 0.43 0.36
Smo145357 (RNR1)
 0.26 0.3 0.35 0.42 0.51 0.58 0.63 0.75 0.58 0.5 0.43 0.38 0.19 0.14 0.41 0.22 0.31 0.25 0.31 0.1 0.06 0.12 0.28 0.26 0.23 0.42 0.95 1.0 0.33 0.38 0.18 0.18
Smo146160 (SAMT1)
 0.52 0.46 0.52 0.58 0.74 0.76 0.85 0.88 0.86 0.72 0.67 0.59 0.21 0.3 0.49 0.26 0.57 0.33 0.48 0.2 0.14 0.22 0.41 0.43 0.44 0.72 0.95 1.0 0.71 0.68 0.28 0.24
0.26 0.26 0.33 0.41 0.51 0.51 0.48 0.42 0.32 0.27 0.25 0.24 0.05 0.04 0.02 0.07 0.35 0.3 0.25 0.02 0.03 0.05 0.31 0.23 0.16 0.47 0.8 1.0 0.32 0.3 0.16 0.14
0.4 0.41 0.43 0.46 0.53 0.51 0.52 0.54 0.48 0.38 0.4 0.39 0.21 0.29 0.19 0.26 0.4 0.39 0.43 0.0 0.01 0.0 0.33 0.32 0.09 0.63 0.96 1.0 0.41 0.43 0.36 0.41
Smo154280 (OVA1)
 0.31 0.27 0.31 0.36 0.4 0.49 0.52 0.57 0.45 0.42 0.38 0.33 0.18 0.18 0.17 0.2 0.31 0.23 0.26 0.03 0.06 0.11 0.25 0.24 0.18 0.47 1.0 0.97 0.3 0.33 0.27 0.27
Smo156007 (AGY1)
 0.31 0.36 0.45 0.52 0.55 0.5 0.53 0.57 0.44 0.42 0.4 0.35 0.07 0.14 0.08 0.12 0.45 0.21 0.28 0.03 0.07 0.01 0.33 0.27 0.4 0.65 0.93 1.0 0.39 0.38 0.47 0.42
0.28 0.25 0.25 0.29 0.34 0.39 0.43 0.51 0.42 0.39 0.33 0.31 0.06 0.08 0.18 0.1 0.24 0.16 0.24 0.02 0.07 0.02 0.19 0.16 0.27 0.39 1.0 0.92 0.25 0.25 0.23 0.22
Smo166436 (EX1)
 0.38 0.36 0.4 0.46 0.54 0.51 0.64 0.73 0.68 0.61 0.59 0.53 0.21 0.2 0.27 0.23 0.38 0.23 0.36 0.1 0.1 0.11 0.31 0.27 0.42 0.71 0.87 1.0 0.44 0.42 0.32 0.32
Smo166773 (EMB2083)
 0.43 0.44 0.47 0.55 0.64 0.71 0.57 0.59 0.51 0.46 0.44 0.37 0.31 0.22 0.4 0.31 0.44 0.28 0.42 0.05 0.05 0.02 0.35 0.34 0.18 0.53 0.93 1.0 0.39 0.4 0.2 0.24
Smo172681 (ERS)
 0.47 0.42 0.43 0.53 0.56 0.56 0.55 0.58 0.61 0.5 0.51 0.5 0.18 0.3 0.28 0.19 0.48 0.35 0.39 0.11 0.18 0.03 0.36 0.37 0.36 0.56 0.87 1.0 0.42 0.45 0.38 0.37
0.49 0.51 0.55 0.64 0.62 0.57 0.67 0.73 0.66 0.68 0.61 0.59 0.21 0.19 0.21 0.28 0.4 0.23 0.47 0.03 0.05 0.06 0.33 0.27 0.14 0.89 0.9 1.0 0.49 0.48 0.35 0.34
Smo186974 (RNL)
 0.44 0.46 0.46 0.51 0.55 0.65 0.72 0.84 0.69 0.63 0.54 0.51 0.16 0.15 0.37 0.23 0.43 0.33 0.44 0.09 0.06 0.1 0.34 0.31 0.15 0.56 0.97 1.0 0.45 0.46 0.31 0.25
Smo20706 (EMB1865)
 0.25 0.3 0.34 0.33 0.39 0.37 0.42 0.39 0.38 0.36 0.33 0.29 0.11 0.11 0.18 0.14 0.26 0.16 0.27 0.03 0.01 0.01 0.23 0.19 0.01 0.75 0.86 1.0 0.28 0.27 0.22 0.21
Smo231207 (LAC11)
 0.31 0.26 0.22 0.25 0.36 0.42 0.39 0.59 0.46 0.5 0.44 0.29 0.09 0.07 0.18 0.14 0.22 0.25 0.25 0.0 0.0 0.0 0.2 0.2 0.12 0.73 0.9 1.0 0.3 0.29 0.33 0.29
0.45 0.51 0.54 0.6 0.6 0.67 0.63 0.61 0.51 0.5 0.4 0.44 0.17 0.13 0.25 0.22 0.42 0.24 0.35 0.04 0.2 0.04 0.41 0.31 0.41 0.51 1.0 0.87 0.4 0.39 0.27 0.25
0.46 0.47 0.43 0.48 0.55 0.5 0.54 0.5 0.55 0.5 0.53 0.45 0.29 0.41 0.51 0.32 0.55 0.49 0.44 0.11 0.09 0.08 0.47 0.42 0.34 0.72 1.0 1.0 0.46 0.51 0.4 0.34
0.3 0.35 0.39 0.5 0.53 0.52 0.52 0.49 0.42 0.35 0.33 0.3 0.16 0.19 0.22 0.18 0.37 0.17 0.29 0.03 0.18 0.06 0.27 0.23 0.18 0.44 0.79 1.0 0.33 0.36 0.21 0.19
0.53 0.51 0.47 0.54 0.7 0.56 0.58 0.61 0.66 0.54 0.51 0.52 0.22 0.26 0.29 0.32 0.54 0.39 0.55 0.07 0.05 0.03 0.44 0.4 0.2 0.69 1.0 0.93 0.54 0.54 0.41 0.44
Smo405767 (EMB36)
 0.25 0.3 0.37 0.45 0.49 0.54 0.57 0.52 0.45 0.38 0.33 0.27 0.18 0.22 0.31 0.18 0.3 0.12 0.29 0.03 0.04 0.01 0.32 0.3 0.15 0.23 0.89 1.0 0.3 0.33 0.28 0.25
0.37 0.55 0.53 0.67 0.67 0.6 0.49 0.45 0.39 0.34 0.29 0.31 0.1 0.1 0.07 0.13 0.35 0.19 0.27 0.0 0.01 0.0 0.33 0.27 0.09 0.46 0.9 1.0 0.25 0.26 0.18 0.17
0.29 0.3 0.4 0.51 0.55 0.54 0.59 0.65 0.52 0.45 0.4 0.34 0.06 0.09 0.09 0.09 0.35 0.21 0.21 0.02 0.04 0.02 0.24 0.18 0.09 0.91 0.95 1.0 0.31 0.3 0.24 0.21
Smo410877 (SPD1)
 0.37 0.32 0.34 0.37 0.39 0.41 0.45 0.5 0.58 0.58 0.5 0.44 0.03 0.12 0.16 0.07 0.31 0.17 0.26 0.02 0.06 0.04 0.23 0.18 0.17 0.41 1.0 0.88 0.31 0.32 0.27 0.25
0.62 0.54 0.58 0.6 0.64 0.59 0.68 0.73 0.67 0.66 0.61 0.55 0.29 0.19 0.36 0.28 0.42 0.32 0.46 0.01 0.0 0.04 0.35 0.3 0.07 0.67 0.97 1.0 0.47 0.51 0.43 0.44
0.47 0.7 0.66 0.6 0.64 0.69 0.69 0.52 0.44 0.4 0.41 0.43 0.21 0.13 0.5 0.28 0.44 0.3 0.37 0.01 0.01 0.01 0.32 0.26 0.29 0.52 1.0 0.97 0.4 0.39 0.27 0.29
0.41 0.41 0.39 0.47 0.49 0.55 0.6 0.72 0.57 0.54 0.47 0.48 0.19 0.12 0.37 0.21 0.45 0.31 0.31 0.06 0.03 0.06 0.29 0.27 0.52 0.63 1.0 0.95 0.44 0.42 0.41 0.39
0.65 0.59 0.67 0.73 0.73 0.8 0.86 0.85 0.76 0.72 0.63 0.57 0.41 0.36 0.58 0.49 0.57 0.45 0.57 0.05 0.2 0.02 0.38 0.4 0.33 0.91 1.0 0.92 0.58 0.58 0.45 0.46
0.5 0.47 0.45 0.53 0.58 0.55 0.67 0.6 0.6 0.57 0.53 0.5 0.24 0.26 0.33 0.31 0.67 0.42 0.44 0.01 0.16 0.07 0.43 0.42 0.09 0.49 0.88 1.0 0.62 0.67 0.46 0.43
Smo437676 (OVA2)
 0.27 0.33 0.35 0.42 0.46 0.42 0.6 0.64 0.64 0.63 0.59 0.48 0.08 0.1 0.07 0.12 0.48 0.21 0.31 0.02 0.06 0.01 0.3 0.21 0.08 0.45 0.96 1.0 0.54 0.48 0.32 0.28
Smo438142 (GR)
 0.58 0.59 0.59 0.61 0.72 0.72 0.82 0.83 0.7 0.67 0.62 0.56 0.43 0.47 0.46 0.45 0.44 0.33 0.43 0.1 0.09 0.04 0.34 0.38 0.28 0.7 1.0 0.96 0.43 0.4 0.52 0.43
Smo438805 (PTAC10)
 0.22 0.24 0.26 0.28 0.39 0.43 0.53 0.51 0.43 0.32 0.28 0.22 0.13 0.1 0.22 0.14 0.28 0.19 0.2 0.02 0.09 0.05 0.21 0.18 0.2 0.32 0.98 1.0 0.3 0.35 0.19 0.14
0.38 0.53 0.55 0.57 0.57 0.55 0.51 0.51 0.36 0.34 0.31 0.31 0.22 0.2 0.23 0.28 0.38 0.2 0.42 0.01 0.02 0.0 0.32 0.28 0.11 0.6 0.85 1.0 0.3 0.31 0.2 0.18
0.4 0.35 0.44 0.53 0.6 0.66 0.72 0.68 0.67 0.57 0.59 0.46 0.11 0.25 0.18 0.14 0.62 0.43 0.29 0.08 0.07 0.06 0.4 0.37 0.12 0.57 0.95 1.0 0.58 0.57 0.34 0.23
Smo442211 (EMB2761)
 0.48 0.5 0.49 0.56 0.6 0.61 0.62 0.66 0.6 0.6 0.51 0.47 0.25 0.27 0.3 0.34 0.39 0.24 0.39 0.01 0.03 0.01 0.29 0.27 0.08 0.84 0.9 1.0 0.41 0.43 0.3 0.28
0.25 0.27 0.34 0.44 0.52 0.54 0.65 0.68 0.5 0.46 0.39 0.31 0.22 0.2 0.42 0.24 0.32 0.17 0.29 0.04 0.02 0.02 0.29 0.27 0.06 0.71 1.0 0.98 0.33 0.33 0.31 0.34
Smo45172 (SVR1)
 0.4 0.48 0.55 0.6 0.6 0.57 0.56 0.5 0.44 0.4 0.39 0.37 0.28 0.19 0.44 0.29 0.54 0.36 0.5 0.0 0.04 0.06 0.38 0.39 0.4 0.53 0.78 1.0 0.5 0.51 0.31 0.32
0.26 0.26 0.26 0.32 0.5 0.49 0.53 0.54 0.4 0.34 0.26 0.25 0.03 0.03 0.05 0.08 0.33 0.36 0.31 0.01 0.06 0.01 0.29 0.25 0.32 0.36 0.91 1.0 0.42 0.4 0.26 0.21
Smo60327 (MIM)
 0.23 0.24 0.28 0.41 0.42 0.44 0.51 0.6 0.52 0.48 0.44 0.38 0.18 0.2 0.39 0.17 0.25 0.14 0.3 0.04 0.03 0.05 0.24 0.25 0.17 0.59 1.0 0.9 0.26 0.28 0.34 0.34
0.55 0.56 0.64 0.61 0.68 0.67 0.74 0.69 0.73 0.61 0.56 0.53 0.28 0.24 0.44 0.3 0.58 0.41 0.52 0.0 0.01 0.0 0.49 0.36 0.04 0.51 0.92 1.0 0.58 0.59 0.37 0.38
0.65 0.61 0.63 0.7 0.76 0.77 0.82 0.75 0.74 0.67 0.63 0.63 0.38 0.38 0.36 0.44 0.78 0.6 0.75 0.05 0.14 0.03 0.64 0.6 0.56 0.75 0.82 1.0 0.79 0.78 0.59 0.53
0.38 0.37 0.45 0.53 0.58 0.51 0.51 0.5 0.45 0.37 0.34 0.37 0.23 0.33 0.43 0.3 0.46 0.31 0.36 0.05 0.04 0.02 0.34 0.3 0.12 0.39 0.87 1.0 0.39 0.38 0.31 0.32
0.22 0.28 0.33 0.39 0.51 0.52 0.7 0.67 0.58 0.46 0.38 0.31 0.23 0.21 0.22 0.25 0.3 0.21 0.36 0.0 0.0 0.0 0.29 0.26 0.06 0.72 1.0 0.94 0.39 0.41 0.16 0.18
0.33 0.36 0.38 0.42 0.42 0.5 0.51 0.43 0.39 0.32 0.31 0.3 0.01 0.04 0.12 0.05 0.31 0.14 0.34 0.02 0.12 0.17 0.19 0.19 0.32 0.34 0.88 1.0 0.28 0.29 0.18 0.16
Smo75404 (ATM1)
 0.4 0.52 0.55 0.66 0.62 0.65 0.53 0.54 0.4 0.38 0.31 0.38 0.17 0.22 0.26 0.26 0.42 0.38 0.42 0.01 0.14 0.03 0.32 0.29 0.46 0.5 1.0 0.96 0.4 0.4 0.34 0.35
0.24 0.31 0.33 0.39 0.47 0.48 0.5 0.61 0.48 0.44 0.41 0.38 0.08 0.07 0.1 0.09 0.29 0.19 0.19 0.04 0.16 0.05 0.2 0.16 0.4 0.44 1.0 0.97 0.29 0.26 0.23 0.22
0.52 0.55 0.59 0.59 0.68 0.65 0.71 0.69 0.59 0.58 0.54 0.52 0.36 0.3 0.34 0.3 0.35 0.33 0.35 0.04 0.1 0.03 0.33 0.32 0.19 0.69 0.97 1.0 0.39 0.39 0.26 0.25
0.22 0.21 0.23 0.3 0.33 0.46 0.52 0.54 0.41 0.33 0.29 0.25 0.03 0.1 0.09 0.04 0.28 0.18 0.09 0.03 0.05 0.05 0.14 0.09 0.17 0.15 1.0 0.97 0.22 0.22 0.19 0.14
Smo79851 (OVA5)
 0.44 0.44 0.48 0.55 0.61 0.61 0.67 0.75 0.73 0.61 0.66 0.56 0.29 0.32 0.44 0.33 0.42 0.28 0.38 0.05 0.16 0.03 0.38 0.41 0.32 0.73 0.88 1.0 0.41 0.46 0.42 0.39
0.4 0.38 0.38 0.46 0.51 0.5 0.62 0.7 0.61 0.56 0.51 0.51 0.08 0.11 0.09 0.12 0.44 0.23 0.27 0.08 0.11 0.03 0.29 0.2 0.34 0.66 0.98 1.0 0.45 0.44 0.45 0.36
Smo81522 (EMB36)
 0.25 0.29 0.32 0.42 0.48 0.51 0.51 0.53 0.44 0.36 0.32 0.28 0.14 0.2 0.33 0.15 0.28 0.16 0.25 0.01 0.02 0.01 0.25 0.25 0.12 0.3 0.91 1.0 0.28 0.31 0.16 0.13
0.29 0.27 0.36 0.38 0.35 0.41 0.41 0.47 0.41 0.31 0.3 0.29 0.05 0.1 0.16 0.09 0.3 0.28 0.17 0.09 0.1 0.02 0.18 0.16 0.4 0.24 1.0 0.94 0.3 0.31 0.26 0.22
0.25 0.34 0.34 0.5 0.56 0.57 0.78 0.82 0.69 0.61 0.45 0.43 0.21 0.17 0.3 0.2 0.43 0.29 0.36 0.03 0.01 0.05 0.37 0.33 0.22 0.62 1.0 0.94 0.45 0.51 0.34 0.38
Smo85469 (TAPX)
 0.41 0.37 0.37 0.41 0.5 0.46 0.51 0.53 0.48 0.44 0.45 0.44 0.07 0.08 0.11 0.1 0.33 0.24 0.2 0.06 0.13 0.07 0.23 0.2 0.42 0.5 0.93 1.0 0.32 0.33 0.39 0.47
0.48 0.47 0.48 0.47 0.48 0.48 0.53 0.53 0.5 0.46 0.4 0.43 0.29 0.26 0.17 0.33 0.43 0.25 0.24 0.01 0.01 0.0 0.25 0.19 0.12 0.56 0.84 1.0 0.4 0.42 0.22 0.19
0.37 0.4 0.38 0.4 0.45 0.47 0.47 0.47 0.46 0.43 0.39 0.36 0.16 0.15 0.31 0.18 0.29 0.22 0.29 0.01 0.04 0.03 0.2 0.24 0.17 0.5 0.93 1.0 0.3 0.33 0.24 0.27
0.34 0.34 0.44 0.51 0.58 0.63 0.56 0.55 0.49 0.43 0.38 0.38 0.11 0.14 0.11 0.13 0.54 0.41 0.28 0.05 0.23 0.05 0.29 0.24 0.53 0.6 0.98 1.0 0.43 0.43 0.33 0.32
0.4 0.53 0.55 0.56 0.51 0.53 0.54 0.51 0.44 0.42 0.42 0.37 0.26 0.28 0.19 0.31 0.37 0.21 0.24 0.06 0.03 0.06 0.37 0.31 0.27 0.61 0.84 1.0 0.32 0.34 0.2 0.19
0.37 0.42 0.43 0.46 0.53 0.47 0.41 0.48 0.44 0.37 0.38 0.32 0.13 0.15 0.16 0.23 0.41 0.22 0.37 0.01 0.04 0.05 0.31 0.27 0.23 0.52 0.83 1.0 0.38 0.39 0.2 0.21
0.35 0.37 0.47 0.55 0.55 0.63 0.72 0.78 0.7 0.62 0.59 0.48 0.15 0.15 0.19 0.18 0.43 0.27 0.26 0.03 0.02 0.14 0.29 0.24 0.19 0.71 0.98 1.0 0.38 0.35 0.23 0.24
0.37 0.36 0.43 0.44 0.45 0.48 0.5 0.52 0.45 0.38 0.37 0.38 0.12 0.11 0.08 0.12 0.4 0.24 0.32 0.03 0.1 0.0 0.29 0.23 0.54 0.43 0.84 1.0 0.41 0.45 0.28 0.24
0.32 0.34 0.37 0.42 0.46 0.55 0.57 0.63 0.46 0.52 0.39 0.36 0.27 0.18 0.28 0.28 0.28 0.2 0.48 0.0 0.1 0.0 0.32 0.32 0.09 0.7 1.0 0.92 0.31 0.31 0.42 0.47
Smo94171 (OVA6)
 0.34 0.37 0.38 0.47 0.44 0.49 0.55 0.52 0.47 0.43 0.41 0.34 0.19 0.33 0.37 0.2 0.43 0.24 0.25 0.12 0.14 0.07 0.23 0.22 0.31 0.36 0.9 1.0 0.31 0.34 0.32 0.24
0.54 0.53 0.49 0.6 0.69 0.62 0.67 0.69 0.6 0.51 0.48 0.52 0.12 0.14 0.12 0.27 0.62 0.35 0.6 0.0 0.02 0.0 0.39 0.32 0.3 0.45 0.84 1.0 0.69 0.68 0.57 0.51
0.43 0.48 0.51 0.55 0.56 0.55 0.6 0.65 0.62 0.61 0.56 0.5 0.27 0.29 0.36 0.27 0.43 0.23 0.38 0.11 0.09 0.0 0.31 0.26 0.11 0.53 0.82 1.0 0.46 0.46 0.29 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)