Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo100345	-5.54	-	-	-	-	-	-	-3.97	-	-5.97	-	-	-	-4.79	-	-	-5.51	-4.86	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.61
Smo119899	-	-	-	-	-	-6.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.97	-	-1.02	-	-	-	-	-	-4.25	-	-	-4.77	-	-5.56
Smo122361 (LAP6)	-7.68	-6.81	-6.03	-	-	-	-	-	-	-	-6.21	-	-5.45	-	-6.02	-5.85	-4.57	-2.1	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.66	-5.59	-	-7.7
Smo126324	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.99	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo135301	-4.16	-2.19	-1.89	-3.95	-4.18	-3.31	-3.21	-3.33	-3.39	-2.75	-4.29	-2.69	-3.39	-6.96	-3.04	-4.08	-3.81	-2.42	4.81	-1.47	-	-3.69	-3.54	-2.61	-3.39	-1.64	-1.99	-1.32	-4.87	-4.03	-5.29	-5.95
Smo137590	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo19633	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	1.0	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo230666 (TOPP4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.41	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo24152	-	-	-	-	-	-4.47	-4.65	-	-	-3.94	-	-	-4.36	-	-3.53	-	-	-3.86	4.87	-	-	-	-3.57	-4.59	-1.06	-2.43	-1.22	-0.73	-2.54	-1.93	-4.55	-
Smo25501	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.64	4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo36119	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.45	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo403115	-	-	-	-	-	-	-1.89	-	-	-	-	-	-1.5	-	-	-	-	-1.71	4.89	-	-	-	-	-	-	-	-	0.53	-	-	-	-
Smo403198	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo403410	-2.12	-1.75	-1.65	-2.02	-1.94	-1.75	-2.03	-2.08	-1.82	-2.15	-2.14	-2.51	-7.02	-7.73	-10.08	-6.97	-5.61	-2.69	4.82	-	-	-	-5.23	-4.58	-2.82	-3.82	-4.62	-3.69	-5.15	-5.94	-5.51	-4.56
Smo404224	-4.73	-	-	-	-	-3.31	-	-3.61	-	-	-3.12	-3.32	-3.0	-1.55	-0.87	-	-1.57	-	4.82	-	0.68	-	-	-2.08	-	-	-	-	-	-	-3.19	-
Smo404401	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo404922	-8.27	-7.54	-2.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.18	-	-8.0	-	-7.2	-7.18	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.36	-	-	-
Smo405418	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo406668	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.73	-	-	-	-	-	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo406670	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.58	4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo406739	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo409560	-2.78	-5.3	-3.55	-3.24	-	-2.2	-1.82	-3.15	-2.9	-4.48	-2.8	-2.31	-5.01	-3.31	-3.87	-	-3.08	-1.75	4.83	-	-2.86	-	-3.05	-5.07	-2.34	-4.04	-2.74	-2.92	-2.57	-2.81	-2.58	-3.23
Smo409732	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-7.33	-	-	-	-2.64	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.26
Smo411155	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo411173	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.38	-	-	-	-	-	4.9	-	-	-	-	-0.47	-	-	-	-	-0.57	-	-	-
Smo411224	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo411859	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.02	-	-	-	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo412060	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo412520	-	-	-	-3.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.39	-	-1.59	-	4.94	-	-	-	-	-	-0.64	-	-	-	-	-2.65	-	-
Smo413719 (COPT5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo414596	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.92	-	-	-	-	-	-	-	0.82	-	-	-	-	-
Smo415793	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-20.57	0.85	-	-	-10.77	4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo417068	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo417072	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo417086	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo419116	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo419131	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo420065	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo420068	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo421197	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.97	-	-	-	-	-0.39	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo422359	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.38	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo422814	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo425085	-4.64	-5.75	-5.28	-4.77	-3.68	-3.29	-3.22	-3.21	-2.85	-3.54	-4.22	-4.07	-5.44	-7.06	-5.41	-5.72	-3.13	-1.41	4.9	-7.92	-7.59	-4.4	-4.15	-4.04	-4.04	-5.24	-3.78	-4.85	-3.3	-3.03	-4.36	-4.42
Smo426614	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo427082	-8.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.65	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo427139	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo428524	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.43	-	-	-	-	-1.89	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.65
Smo428754	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo6134	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.68	-3.73	-	-	-6.5	-	-6.34	-6.35	-1.77	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.44	-3.71
Smo6561	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo69980 (AGL67)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.21	-	-	4.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.3	-	-	-
Smo77903	-	-7.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.57	-	-7.42	-4.99	-1.89	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.56	-5.6	-6.67
Smo7860 (HTB11)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.5	-2.25	-	-0.28	-	-	4.91	-	-	-	-	-2.67	-	-	-	-	-2.49	-	-	-1.59
Smo81343 (PANB1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.54	-	-	-	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo86191 (SDH2-2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo90809	-7.2	-7.03	-	-6.94	-	-	-	-4.96	-	-	-5.59	-5.98	-4.36	-5.52	-4.41	-3.78	-6.83	-2.41	4.97	-	-	-	-5.69	-5.82	-	-5.77	-5.66	-	-5.9	-4.83	-3.55	-4.13
Smo92182	-6.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.25	-3.82	-5.02	-	-	-2.73	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo93661	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.65	4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Smo99066	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.