Heatmap: Cluster_346 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d003220 (GRMZM2G021219)
0.21 1.0 0.27 0.3 0.26 0.02 0.04 0.37 0.05 0.04 0.05 0.08 0.45 0.17 0.1 0.3 0.56 0.18 0.24 0.1 0.58 0.28 0.19 0.76 0.28 0.23 0.32 0.37 0.09 0.43 0.53 0.1 0.28 0.31 0.32 0.12 0.1
Zm00001d004993 (GRMZM2G074351)
0.23 0.56 0.38 0.46 0.25 0.16 0.17 0.34 0.14 0.19 0.12 0.18 0.33 0.15 0.15 0.37 0.73 0.36 0.42 0.02 0.26 0.28 0.18 0.75 0.26 0.39 0.32 0.28 0.15 0.49 0.36 0.03 0.17 0.26 1.0 0.28 0.16
Zm00001d005089 (GRMZM2G155437)
0.2 1.0 0.15 0.23 0.23 0.02 0.05 0.29 0.14 0.12 0.09 0.09 0.27 0.09 0.15 0.24 0.43 0.14 0.16 0.0 0.21 0.19 0.07 0.5 0.23 0.05 0.27 0.18 0.03 0.14 0.37 0.02 0.19 0.23 0.35 0.08 0.06
0.23 1.0 0.11 0.14 0.27 0.01 0.02 0.35 0.06 0.06 0.05 0.09 0.37 0.08 0.24 0.29 0.44 0.19 0.15 0.02 0.55 0.21 0.07 0.64 0.18 0.04 0.38 0.07 0.01 0.12 0.57 0.09 0.1 0.13 0.78 0.12 0.15
Zm00001d006361 (GRMZM2G146761)
0.17 0.61 0.18 0.17 0.18 0.03 0.04 0.25 0.08 0.06 0.08 0.07 0.35 0.14 0.14 0.18 0.25 0.15 0.16 0.0 0.18 0.11 0.2 0.44 0.17 0.14 0.32 0.24 0.06 0.4 0.48 0.05 0.21 0.34 1.0 0.09 0.07
Zm00001d007490 (GRMZM2G135314)
0.28 0.83 0.3 0.64 0.35 0.09 0.17 0.25 0.07 0.07 0.15 0.2 0.55 0.34 0.16 0.45 0.65 0.26 0.3 0.0 0.4 0.56 0.64 0.97 0.51 0.22 0.36 0.23 0.02 0.39 0.56 0.01 0.24 0.32 1.0 0.16 0.19
Zm00001d008294 (GRMZM2G128080)
0.08 0.56 0.21 0.31 0.18 0.04 0.04 0.35 0.08 0.06 0.08 0.13 0.27 0.22 0.13 0.31 0.67 0.21 0.36 0.01 0.25 0.29 0.06 0.69 0.28 0.33 0.21 0.29 0.14 0.61 0.43 0.1 0.27 0.31 1.0 0.16 0.11
Zm00001d011199 (GRMZM2G170632)
0.09 0.73 0.27 0.26 0.22 0.01 0.02 0.43 0.04 0.03 0.1 0.07 0.4 0.36 0.1 0.42 0.84 0.26 0.25 0.02 0.5 0.3 0.09 1.0 0.38 0.16 0.25 0.35 0.05 0.57 0.5 0.06 0.36 0.36 0.67 0.1 0.09
Zm00001d012092 (GRMZM5G898314)
0.18 1.0 0.34 0.39 0.33 0.0 0.02 0.53 0.02 0.02 0.03 0.05 0.53 0.09 0.1 0.34 0.72 0.22 0.31 0.0 0.27 0.3 0.08 0.64 0.28 0.12 0.4 0.36 0.12 0.37 0.57 0.12 0.35 0.4 0.26 0.08 0.06
Zm00001d013283 (GRMZM2G131998)
0.18 1.0 0.26 0.51 0.31 0.05 0.07 0.28 0.09 0.09 0.1 0.13 0.41 0.2 0.14 0.34 0.44 0.27 0.39 0.0 0.3 0.22 0.12 0.41 0.35 0.15 0.39 0.27 0.04 0.37 0.4 0.02 0.23 0.35 0.3 0.17 0.13
Zm00001d013449 (GRMZM2G177885)
0.2 0.98 0.5 0.77 0.45 0.03 0.04 0.4 0.06 0.06 0.13 0.22 0.5 0.33 0.15 0.64 0.99 0.4 0.78 0.0 0.63 0.48 0.11 0.88 0.5 0.33 0.76 0.45 0.25 1.0 0.64 0.18 0.26 0.35 0.76 0.18 0.18
Zm00001d013954 (GRMZM2G005199)
0.18 1.0 0.3 0.37 0.23 0.03 0.03 0.26 0.07 0.04 0.08 0.08 0.42 0.21 0.08 0.37 0.53 0.2 0.28 0.0 0.47 0.23 0.43 0.76 0.27 0.12 0.18 0.39 0.05 0.68 0.42 0.01 0.32 0.31 0.53 0.12 0.14
Zm00001d015795 (GRMZM2G117700)
0.35 0.92 0.18 0.34 0.28 0.0 0.01 0.36 0.02 0.01 0.02 0.03 0.54 0.48 0.12 0.49 0.61 0.36 0.39 0.06 0.32 0.46 0.02 0.61 0.37 0.2 0.39 0.3 0.14 0.74 0.78 0.12 0.19 0.45 1.0 0.12 0.14
Zm00001d017239 (GRMZM2G148301)
0.18 0.59 0.19 0.18 0.19 0.03 0.05 0.29 0.06 0.05 0.07 0.07 0.39 0.12 0.11 0.24 0.51 0.18 0.17 0.01 0.38 0.3 0.08 0.73 0.22 0.14 0.25 0.18 0.04 0.2 0.27 0.02 0.11 0.15 1.0 0.11 0.11
Zm00001d018141 (GRMZM2G359874)
0.19 0.77 0.36 0.28 0.31 0.03 0.03 0.61 0.06 0.05 0.13 0.12 0.67 0.35 0.15 0.46 0.76 0.26 0.43 0.0 0.44 0.25 0.11 1.0 0.39 0.25 0.51 0.31 0.23 0.65 0.64 0.09 0.29 0.6 0.36 0.16 0.18
Zm00001d018411 (GRMZM2G096815)
0.21 0.76 0.22 0.31 0.25 0.06 0.11 0.33 0.16 0.15 0.09 0.14 0.55 0.2 0.23 0.29 0.41 0.21 0.2 0.0 0.29 0.2 0.38 0.57 0.24 0.19 0.28 0.21 0.14 0.23 0.46 0.08 0.24 0.3 1.0 0.17 0.16
Zm00001d020188 (GRMZM2G003038)
0.21 1.0 0.36 0.61 0.39 0.02 0.05 0.38 0.09 0.08 0.18 0.16 0.49 0.13 0.14 0.42 0.72 0.18 0.3 0.02 0.29 0.17 0.1 0.64 0.32 0.45 0.41 0.25 0.03 0.4 0.34 0.01 0.27 0.34 0.4 0.15 0.16
Zm00001d022352 (GRMZM2G111713)
0.26 1.0 0.41 0.37 0.33 0.01 0.02 0.34 0.04 0.03 0.12 0.12 0.47 0.3 0.14 0.51 0.63 0.39 0.67 0.0 0.43 0.31 0.08 0.81 0.32 0.38 0.52 0.31 0.2 0.55 0.54 0.11 0.18 0.27 0.97 0.16 0.12
Zm00001d022498 (GRMZM2G036596)
0.31 1.0 0.3 0.4 0.31 0.04 0.06 0.3 0.12 0.11 0.03 0.1 0.32 0.19 0.16 0.27 0.42 0.33 0.28 0.03 0.15 0.23 0.12 0.61 0.22 0.19 0.3 0.29 0.06 0.35 0.39 0.05 0.27 0.38 0.38 0.16 0.11
Zm00001d024203 (GRMZM2G101900)
0.14 0.69 0.32 0.49 0.28 0.04 0.05 0.46 0.09 0.06 0.09 0.18 0.6 0.34 0.15 0.42 0.75 0.24 0.37 0.01 0.42 0.46 0.12 1.0 0.4 0.19 0.64 0.28 0.06 0.49 0.83 0.05 0.16 0.36 0.3 0.15 0.1
0.17 0.64 0.27 0.62 0.31 0.14 0.1 0.48 0.11 0.11 0.19 0.16 0.36 0.25 0.19 0.4 0.76 0.35 0.3 0.01 0.55 0.27 0.14 1.0 0.38 0.11 0.18 0.23 0.2 0.58 0.39 0.06 0.19 0.24 0.51 0.19 0.25
Zm00001d025745 (GRMZM2G018689)
0.23 1.0 0.33 0.46 0.33 0.04 0.03 0.26 0.12 0.09 0.08 0.15 0.39 0.12 0.17 0.28 0.43 0.24 0.29 0.0 0.17 0.16 0.34 0.46 0.27 0.25 0.43 0.3 0.0 0.35 0.36 0.04 0.22 0.26 0.56 0.15 0.12
Zm00001d025767 (GRMZM2G096705)
0.27 0.9 0.41 0.51 0.34 0.06 0.07 0.26 0.2 0.21 0.18 0.17 0.43 0.39 0.21 0.39 0.6 0.41 0.4 0.03 0.3 0.18 0.47 0.7 0.23 0.69 0.44 0.28 0.03 0.21 0.4 0.01 0.19 0.32 1.0 0.23 0.16
Zm00001d026610 (GRMZM2G043776)
0.24 1.0 0.52 0.53 0.31 0.07 0.14 0.3 0.23 0.21 0.14 0.17 0.41 0.28 0.14 0.34 0.46 0.34 0.25 0.05 0.23 0.26 0.25 0.44 0.3 0.17 0.35 0.22 0.07 0.36 0.35 0.05 0.15 0.21 0.56 0.18 0.11
Zm00001d029380 (GRMZM2G104353)
0.18 0.69 0.35 0.5 0.24 0.04 0.06 0.41 0.03 0.04 0.08 0.12 0.55 0.28 0.13 0.48 0.74 0.57 0.58 0.09 0.63 0.62 0.13 1.0 0.51 0.36 0.42 0.27 0.3 0.47 0.67 0.19 0.31 0.36 0.47 0.12 0.12
Zm00001d030167 (GRMZM2G020620)
0.42 0.8 0.46 0.21 0.4 0.1 0.16 0.36 0.19 0.19 0.2 0.25 0.66 0.3 0.24 0.44 0.65 0.5 0.47 0.01 0.45 0.5 0.4 1.0 0.59 0.75 0.54 0.4 0.46 0.54 0.54 0.11 0.26 0.45 0.74 0.24 0.28
Zm00001d031326 (GRMZM2G080746)
0.17 1.0 0.21 0.34 0.23 0.04 0.07 0.45 0.11 0.1 0.11 0.09 0.38 0.1 0.17 0.3 0.73 0.32 0.33 0.04 0.46 0.26 0.21 0.75 0.3 0.2 0.31 0.21 0.05 0.47 0.54 0.02 0.21 0.29 0.6 0.17 0.14
Zm00001d032370 (GRMZM2G078022)
0.36 0.74 0.3 0.29 0.3 0.02 0.03 0.59 0.05 0.03 0.07 0.08 0.46 0.13 0.19 0.32 0.68 0.27 0.4 0.0 0.61 0.5 0.11 0.78 0.33 0.26 0.44 0.23 0.05 0.3 0.52 0.05 0.2 0.25 1.0 0.11 0.16
Zm00001d032748 (GRMZM2G001850)
0.17 1.0 0.44 0.48 0.34 0.01 0.04 0.47 0.11 0.1 0.16 0.15 0.54 0.11 0.14 0.44 0.88 0.27 0.34 0.01 0.4 0.32 0.14 0.91 0.32 0.24 0.36 0.3 0.05 0.47 0.47 0.04 0.22 0.26 0.32 0.19 0.14
Zm00001d034251 (GRMZM2G068028)
0.19 0.98 0.54 0.66 0.46 0.04 0.07 0.42 0.09 0.07 0.34 0.23 0.48 0.25 0.17 0.54 1.0 0.51 0.67 0.01 0.61 0.56 0.23 0.94 0.47 0.39 0.5 0.55 0.78 0.79 0.58 0.42 0.39 0.4 0.78 0.22 0.27
Zm00001d037925 (GRMZM2G170365)
0.33 0.78 0.42 0.27 0.35 0.07 0.08 0.38 0.12 0.11 0.12 0.12 0.39 0.55 0.18 0.62 0.83 0.38 0.48 0.0 0.49 0.52 0.28 0.87 0.45 0.47 0.47 0.39 0.19 0.78 0.58 0.13 0.37 0.54 1.0 0.21 0.17
Zm00001d038832 (GRMZM2G159032)
0.2 0.84 0.22 0.43 0.28 0.01 0.02 0.54 0.05 0.03 0.05 0.07 0.66 0.35 0.15 0.29 0.63 0.29 0.27 0.0 0.36 0.31 0.08 1.0 0.33 0.31 0.31 0.39 0.13 0.63 0.71 0.06 0.4 0.72 0.36 0.15 0.16
Zm00001d038857 (GRMZM2G074790)
0.15 1.0 0.21 0.3 0.2 0.01 0.0 0.22 0.01 0.01 0.04 0.04 0.3 0.08 0.06 0.26 0.67 0.25 0.31 0.0 0.32 0.44 0.03 0.73 0.3 0.06 0.19 0.21 0.05 0.29 0.3 0.01 0.19 0.19 0.32 0.09 0.05
0.14 1.0 0.07 0.3 0.2 0.0 0.01 0.29 0.0 0.0 0.0 0.01 0.22 0.08 0.04 0.18 0.33 0.19 0.15 0.01 0.31 0.13 0.0 0.31 0.17 0.01 0.15 0.1 0.0 0.14 0.39 0.0 0.07 0.06 0.42 0.03 0.06
Zm00001d041994 (GRMZM2G174196)
0.28 1.0 0.32 0.36 0.3 0.05 0.09 0.51 0.12 0.12 0.18 0.14 0.55 0.27 0.15 0.45 0.68 0.32 0.4 0.01 0.33 0.31 0.19 0.93 0.39 0.22 0.42 0.18 0.08 0.8 0.52 0.03 0.17 0.41 0.32 0.19 0.18
Zm00001d042427 (GRMZM2G151285)
0.25 0.74 0.4 0.49 0.31 0.02 0.03 0.32 0.06 0.04 0.07 0.12 0.57 0.24 0.11 0.42 0.61 0.29 0.39 0.01 0.31 0.27 0.21 0.93 0.25 0.46 0.39 0.29 0.17 0.47 0.59 0.07 0.21 0.29 1.0 0.16 0.17
Zm00001d043625 (GRMZM2G116282)
0.32 1.0 0.28 0.27 0.32 0.02 0.02 0.32 0.1 0.09 0.11 0.12 0.54 0.24 0.23 0.35 0.4 0.14 0.18 0.0 0.38 0.18 0.26 0.86 0.21 0.25 0.56 0.29 0.15 0.23 0.6 0.08 0.19 0.28 0.48 0.15 0.26
Zm00001d043632 (GRMZM2G055276)
0.32 1.0 0.2 0.21 0.35 0.02 0.03 0.39 0.1 0.09 0.1 0.11 0.55 0.47 0.22 0.39 0.39 0.11 0.22 0.0 0.42 0.15 0.36 0.78 0.17 0.2 0.43 0.3 0.1 0.18 0.51 0.09 0.21 0.27 0.9 0.15 0.21
Zm00001d044615 (GRMZM2G467086)
0.28 1.0 0.28 0.2 0.3 0.05 0.05 0.29 0.16 0.13 0.19 0.13 0.34 0.11 0.16 0.31 0.42 0.17 0.26 0.0 0.23 0.1 0.14 0.38 0.25 0.12 0.44 0.28 0.12 0.17 0.28 0.11 0.21 0.22 0.29 0.12 0.09
Zm00001d044945 (GRMZM2G160964)
0.2 1.0 0.22 0.28 0.22 0.03 0.05 0.24 0.1 0.1 0.1 0.11 0.33 0.19 0.15 0.24 0.41 0.16 0.26 0.0 0.18 0.16 0.2 0.46 0.23 0.1 0.41 0.22 0.12 0.28 0.33 0.06 0.26 0.34 0.33 0.14 0.09
Zm00001d045179 (GRMZM5G824137)
0.08 0.91 0.29 0.21 0.24 0.01 0.04 0.32 0.05 0.06 0.18 0.1 0.12 0.13 0.07 0.3 0.68 0.26 0.14 0.17 0.5 0.29 0.26 1.0 0.26 0.17 0.45 0.2 0.0 0.2 0.59 0.0 0.16 0.27 0.43 0.14 0.14
Zm00001d045352 (GRMZM2G140051)
0.14 0.62 0.24 0.35 0.22 0.01 0.02 0.46 0.04 0.03 0.09 0.08 0.64 0.39 0.15 0.36 0.88 0.33 0.34 0.01 0.45 0.4 0.32 0.87 0.44 0.54 0.26 0.25 0.11 1.0 0.62 0.1 0.21 0.4 0.5 0.12 0.12
Zm00001d045487 (GRMZM2G370155)
0.3 0.99 0.18 0.39 0.27 0.03 0.13 0.52 0.11 0.11 0.1 0.13 0.58 0.26 0.25 0.44 0.85 0.29 0.31 0.01 0.69 0.36 0.14 0.94 0.63 0.23 0.37 0.49 0.21 1.0 0.61 0.12 0.5 0.51 0.7 0.2 0.19
Zm00001d045819 (GRMZM2G133050)
0.29 1.0 0.3 0.27 0.33 0.02 0.07 0.31 0.1 0.08 0.09 0.14 0.57 0.29 0.2 0.43 0.51 0.32 0.42 0.01 0.47 0.51 0.06 0.5 0.41 0.16 0.37 0.46 0.11 0.37 0.65 0.09 0.3 0.37 0.56 0.16 0.1
Zm00001d048445 (GRMZM2G075505)
0.15 1.0 0.16 0.58 0.3 0.0 0.01 0.43 0.01 0.01 0.03 0.04 0.47 0.22 0.12 0.3 0.55 0.13 0.2 0.0 0.53 0.25 0.01 0.56 0.25 0.08 0.28 0.12 0.02 0.16 0.47 0.02 0.13 0.16 0.6 0.07 0.17
Zm00001d049043 (GRMZM2G139441)
0.26 0.9 0.47 0.74 0.45 0.04 0.05 0.42 0.12 0.09 0.15 0.2 0.61 0.31 0.22 0.48 0.66 0.31 0.46 0.01 0.7 0.31 0.33 1.0 0.32 0.42 0.51 0.39 0.25 0.45 0.59 0.15 0.33 0.47 0.74 0.19 0.18
Zm00001d050874 (GRMZM2G157019)
0.19 0.81 0.29 0.43 0.27 0.01 0.02 0.38 0.05 0.04 0.08 0.09 0.34 0.31 0.16 0.35 0.72 0.27 0.4 0.0 0.38 0.3 0.07 1.0 0.47 0.28 0.39 0.35 0.12 0.43 0.66 0.01 0.35 0.68 0.76 0.13 0.11
Zm00001d052921 (GRMZM2G104375)
0.11 0.85 0.23 0.5 0.26 0.02 0.06 0.48 0.05 0.05 0.13 0.11 0.29 0.4 0.13 0.4 0.86 0.28 0.45 0.01 0.43 0.41 0.12 0.68 0.34 0.13 0.34 0.41 0.07 1.0 0.52 0.16 0.36 0.53 0.24 0.16 0.17
Zm00001d053640 (GRMZM2G180971)
0.29 0.81 0.35 0.5 0.4 0.05 0.04 0.42 0.07 0.08 0.13 0.11 0.4 0.52 0.14 0.69 0.92 0.33 0.6 0.0 0.59 0.5 0.1 1.0 0.56 0.3 0.49 0.32 0.06 0.86 0.67 0.11 0.31 0.37 0.34 0.2 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)