Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
Solyc00g284510.1.1 (Solyc00g284510)
0.7 0.91 0.2 4.02 3.37 - 2.24 -2.61 -3.28 - - - 0.65 - - - - -1.84 1.18 - - - -2.15 -1.73 -1.73 -0.25 - -0.01 -0.64 - -2.26 -2.09 -3.1 0.92 0.17 - - - - 0.6 - -1.65 - - 1.06 - - - 2.49 - - - -1.07 - - - -0.56 -
Solyc01g014020.1.1 (Solyc01g014020)
- - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.28 - - - - - - 5.22 - - - -0.97 - - - - -
Solyc01g014820.2.1 (Solyc01g014820)
- - - 3.5 4.48 - 3.41 - - - 0.11 - 0.91 - - - - - - 1.79 - - - - - - - - - - - -0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - -
- - - 1.68 5.69 - - - - - - - 1.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.28 - - - - - - - - - - -2.17 - - - - -
Solyc01g022760.1.1 (Solyc01g022760)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - - - - - - 5.43 - - - - - - - - -
Solyc01g044500.1.1 (Solyc01g044500)
- - - 4.38 5.0 - - - -0.45 - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.66 - - - - - - 1.3 - - - - - - - - -
Solyc01g044552.1.1 (Solyc01g044552)
- - - - 5.57 - 2.91 - - -3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.02 - - - - - - - - -
Solyc01g086815.1.1 (Solyc01g086815)
- - - 4.85 4.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.59 - - - - -
- - -3.52 -1.41 5.67 - 2.23 -5.55 - - - - -1.2 - - - - -4.81 - - - - - -5.35 - - -4.88 - - - -4.4 - - - - - - - - - - -5.52 - - - - -4.97 -2.72 -0.72 - - - -1.35 -3.97 - - - -
Solyc02g005550.1.1 (Solyc02g005550)
- - - - 4.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.77 - - - - - - - - -
Solyc02g014525.1.1 (Solyc02g014525)
- - - - 5.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.73 - - - - - - 4.46 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.57 - - - - - - 5.7 - - - - - - - - -
- - - 4.98 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.47 - - - - - - 3.22 - - - - - - - - -
Solyc02g069870.1.1 (Solyc02g069870)
- - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g082110.4.1 (Solyc02g082110)
1.1 0.35 0.46 3.56 3.49 -4.28 1.29 -3.67 -3.46 -3.56 -3.62 -3.89 0.8 -0.94 -0.95 -1.07 -0.72 -1.15 0.7 0.65 -1.34 -0.1 -1.28 -1.65 -1.69 -2.17 -3.15 -1.2 -0.91 -1.07 -1.1 -1.51 -1.56 -0.52 -1.27 -2.34 -1.59 -1.51 -2.17 -0.14 -2.85 -1.25 -1.25 -0.61 -1.32 0.25 -2.22 -0.05 1.45 -1.49 -0.59 -0.92 -0.4 -1.08 -1.42 -1.26 -1.15 -2.11
Solyc02g085410.1.1 (Solyc02g085410)
- - - 3.4 4.38 - 3.73 - - - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - 2.63 - - - - - - - - -
Solyc03g031640.2.1 (Solyc03g031640)
- - - - 5.74 - - 1.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.18 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.57 - - - - - - 5.7 - - - - - - - - -
- - - 4.19 4.61 - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g093777.1.1 (Solyc03g093777)
- - - 4.83 - - - - - - - - 1.28 - - - - - - - - - - - - 2.16 - - - - - - - - - - - - - - - 1.03 - - - - - - 3.86 - - - - - 2.61 - - -
Solyc04g012070.3.1 (Solyc04g012070)
-0.64 - - 4.27 3.86 - 3.86 -0.43 -2.69 - - - 0.13 -0.33 -0.73 -1.92 -0.82 -2.6 - - - - -0.43 - - - -0.32 - - - - -1.92 - - - - - - - - - -3.78 - - - -1.15 - - 0.98 - - - -1.61 - - - - -
Solyc04g018040.1.1 (Solyc04g018040)
- - - - 5.75 - - - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025640.1.1 (Solyc04g025640)
- - - - 5.15 - 4.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025860.1.1 (Solyc04g025860)
- - - - 4.88 - - 0.54 - - - - 1.01 3.82 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.12 2.75 - - - -0.24 - - - - -
Solyc04g049270.1.1 (Solyc04g049270)
- - - - 5.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.42 - - - -1.33 - - - - -
Solyc04g050030.1.1 (Solyc04g050030)
- - - 3.29 4.91 - - - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - -
- - - 4.48 4.0 - 1.45 - - - - - 1.16 1.44 -0.5 0.24 - - - 0.42 - - - -1.67 - 0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.66 - - - -2.59 - - - - -
- - - 4.69 4.69 - - - 0.36 -0.23 -1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.94 - - - - - - - - -
Solyc05g042060.1.1 (Solyc05g042060)
- - - 2.86 3.84 - - - - - - - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - 4.71 - - - -1.09 - - - - -
Solyc05g048755.1.1 (Solyc05g048755)
- - - 4.11 3.96 - -22.71 -23.62 - - - - 2.45 - - - - - - - - - - -6.07 - - - - - -1.47 - -8.72 - - - - - - - 2.92 - - - - - - - - 3.54 - - - -2.44 - - - - -
2.05 -0.66 1.3 3.23 4.43 - 2.4 -1.29 -2.79 - - -2.25 2.6 - 0.05 0.51 - 0.35 - - - - - - - - - - - - - - -2.88 - - - - - - - - -2.27 - - - - - -0.32 1.19 - - - -4.14 -0.93 - - - -
Solyc06g017870.1.1 (Solyc06g017870)
- - - 4.88 4.38 - - - - - - - - -0.88 0.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.31 - - - - - - 2.47 - - - -1.99 - - - - -
Solyc07g039480.1.1 (Solyc07g039480)
- - - - 5.15 - 2.08 0.14 -0.48 -0.46 - -0.89 - -0.24 - 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - -0.02 - - - - - - 2.5 - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - -
Solyc07g041470.3.1 (Solyc07g041470)
- - - - 4.67 - 1.2 - -2.31 - - - - 2.84 1.86 0.46 - - - - - - - - - - - - 0.04 - -0.75 -0.4 1.76 - 2.61 - - - - - - - - - - - - - 2.56 - - - -2.93 - - - - -
Solyc07g049340.1.1 (Solyc07g049340)
- - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.97 4.95 - - 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.2 - - - - - - - - -
Solyc08g074770.3.1 (Solyc08g074770)
- - - - 5.71 - 2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g015535.1.1 (Solyc09g015535)
- - - - 5.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.39 - - - - - - 4.05 - - - 0.95 - - - - -
Solyc09g037170.3.1 (Solyc09g037170)
- - - - 5.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - 0.18 - - - - -
Solyc09g059870.1.1 (Solyc09g059870)
- - - - 5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - - - - - - -
Solyc09g059890.2.1 (Solyc09g059890)
- - - - 5.21 - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.46 - - - - - - - - -
- - - 3.8 4.78 - 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g150136.1.1 (Solyc09g150136)
- - - - 4.34 - - 0.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - -1.45 - - - - -
- - - - 4.69 - - 0.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.94 - - - - - - - - -
Solyc10g049283.1.1 (Solyc10g049283)
- - - 4.69 4.05 - - -1.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - -3.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.44 - - - - - - 5.71 - - - - - - - - -
Solyc10g049810.1.1 (Solyc10g049810)
- - - 4.42 4.36 - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.24 - - - - - - - - -
Solyc10g062060.1.1 (Solyc10g062060)
- - - - 5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - - - - - - -
Solyc11g039390.1.1 (Solyc11g039390)
- - - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.29 - - - - - - - - -
Solyc11g072370.1.1 (Solyc11g072370)
- - - 2.78 4.35 - - -1.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.98 3.67 - - - - 0.62 - - - - - - 3.01 - - - -3.03 - - - - -
Solyc11g150132.1.1 (Solyc11g150132)
- -0.24 - 3.6 4.54 - 2.04 -3.18 -2.23 -2.26 -2.44 - -1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.9 - 2.0 0.82 - - - - - - -1.88 - - - - - - 3.25 - - - -0.11 - - - - -
Solyc12g014340.1.1 (Solyc12g014340)
- - - 1.65 5.41 - - - - - - - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.55 - - - - - - 2.88 - - - -3.33 - - - - -
- - - - 5.54 - 2.88 - - - - - -0.85 - - - -0.49 - - - - - - - - - - - - - -0.54 - - - - - - - - - - - - - - - -1.27 - 0.55 - - - -2.84 - - - - -
Solyc12g062207.1.1 (Solyc12g062207)
- - - 2.8 4.22 - - - - - - - - - - - 2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.4 - - - - - - 4.59 - - - -1.8 - - - - -
- - - - 5.23 - 2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.42 - - - -0.74 3.07 - - - 1.32 - - - 0.04 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.15 - 4.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.