Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - 1.75 - - - - - - -1.14 - 2.13 1.68 - -0.34 1.59 -0.99 - 2.88 - - - - 1.82 - 0.99 - 1.2 - 1.39 - - - - - - - - - - 0.44 - - - - - - 4.06 1.46 - - -0.07 - - 1.42 - -
Solyc00g500177.1.1 (Solyc00g500177)
- - - - 3.25 - - - -1.22 - -0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.21 - - - - - - - - - - 5.25 - - - -2.24 - - - - -
Solyc01g013870.1.1 (Solyc01g013870)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.59 - - 5.09 - - - - - - - - -
Solyc01g049720.1.1 (Solyc01g049720)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc01g058685.1.1 (Solyc01g058685)
- - - 1.54 - - - 0.86 -0.86 - - - 1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - 4.61 - - - -3.47 3.29 - - - -
Solyc02g005145.1.1 (Solyc02g005145)
- - - - 3.26 - - -0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.83 - - - - - 3.38 - - - - 4.32 - - - - - 3.9 - - - -1.64 - - - - -
Solyc02g005580.1.1 (Solyc02g005580)
- - - - 2.79 - 0.6 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.29 - - - - - - - - - - - - 1.61 3.26 -0.45 - - - - - - 5.09 - - - -1.26 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc02g043813.1.1 (Solyc02g043813)
-0.27 - 0.36 1.19 0.27 - -1.04 -3.66 -3.74 - - - -0.45 1.03 1.83 1.78 -2.73 -2.3 -0.2 -1.71 -1.48 - -3.4 -2.01 - -1.57 -2.17 -3.37 -2.81 -2.25 -2.73 -2.9 -3.28 - -0.79 -1.71 1.53 0.5 - 0.8 0.01 -0.38 1.92 1.05 -0.94 2.63 -4.24 -1.73 3.56 0.4 -1.34 -1.76 1.48 - - - -2.77 -
Solyc02g049090.1.1 (Solyc02g049090)
- 1.43 - - 1.79 0.7 - 0.48 1.24 0.64 0.1 0.67 0.32 - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - -0.57 -0.48 4.68 - - - - - - - - - - - 1.02 - - 3.45 - - - -1.86 - - - - -
Solyc02g049100.1.1 (Solyc02g049100)
- - - - - - - - - 2.53 2.41 - - - - - - 5.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g013470.1.1 (Solyc03g013470)
- - - 2.67 - - - 1.6 - - - - - - 2.93 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.08 - - - 0.24 - - - - -
Solyc03g043970.3.1 (Solyc03g043970)
- - - 2.82 - - - - 0.1 - - - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.5 - - - -0.41 - - - - -
Solyc03g051620.3.1 (Solyc03g051620)
- - - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.57 - - - -2.18 - - - - -
Solyc03g058650.1.1 (Solyc03g058650)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g058680.1.1 (Solyc03g058680)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.77 - - - 1.73 - - - - -
Solyc03g058800.1.1 (Solyc03g058800)
5.02 3.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.48 - - - - - 2.44 1.98 1.92 - - - - - - - -
Solyc03g071500.1.1 (Solyc03g071500)
- - 2.12 2.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.09 - - - -0.07 - - - - - - 5.26 - - - -0.75 - - - - -
Solyc03g077890.2.1 (Solyc03g077890)
- - - - 4.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.36 - - - - - - 4.97 - - - -1.08 - - - - -
Solyc03g078130.1.1 (Solyc03g078130)
- - - - - - - - - - - - 3.56 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 - - - - - - - - - 1.1 - - - - - - 5.11 - - - -1.68 - - - - -
Solyc04g017590.1.1 (Solyc04g017590)
- - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - - - 2.78 1.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.53 - - - 1.14 - - - - -
Solyc04g024450.1.1 (Solyc04g024450)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 - - 2.25 - - - 1.74 3.29 4.79 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.5 - - - - - - - - -
Solyc04g150120.1.1 (Solyc04g150120)
- - - 3.47 4.41 - - 0.07 - - - - 1.54 - - 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.28 - - - -2.45 - - - - -
Solyc05g016530.1.1 (Solyc05g016530)
- - - - - - - 0.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.37 - - - - - - 5.7 - - - 0.55 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.39 - - - - - - - - -
Solyc05g025517.1.1 (Solyc05g025517)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g039970.1.1 (Solyc05g039970)
- - - 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.25 - - - 1.92 - - - - -
- - - 3.33 2.96 - - - 0.07 - - - 0.44 1.92 2.75 1.97 2.38 0.47 - - - - - -0.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.31 - - - - - - 3.87 - - - 0.1 - - - - -
Solyc06g016685.1.1 (Solyc06g016685)
- 1.51 - - - - - -1.82 - - - - 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.2 - - - -0.0 - - - - - - 5.47 - - - -0.51 - - - - -
Solyc06g016710.1.1 (Solyc06g016710)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.85 - - - -1.29 - - - - -
Solyc06g016720.3.1 (Solyc06g016720)
- - - -0.79 1.76 - 0.54 -0.88 -2.41 -1.49 -1.1 -0.47 -1.36 - - - - -1.63 - - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - - - 1.7 - - - -0.37 - - - 0.65 - - 5.13 - - - -0.15 - - - - -
Solyc06g036500.1.1 (Solyc06g036500)
- - - 2.24 3.14 - 5.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.47 - - - - - - - - -
Solyc06g036725.1.1 (Solyc06g036725)
- - 0.05 - - - 2.57 - - - - - 0.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - 1.06 - - - 2.38 - - 4.9 - - - 1.73 - - - - -
Solyc06g069610.1.1 (Solyc06g069610)
- - 1.25 3.86 - 2.07 1.9 2.1 - - - - 0.99 - - - 1.5 - - - - - - - - - 0.65 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - -0.99 - - - - -
Solyc07g018005.1.1 (Solyc07g018005)
- - - - - - 1.99 2.83 1.78 - 0.58 1.95 1.08 - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - 1.81 - - - - -
Solyc07g025430.1.1 (Solyc07g025430)
- - - - - - - 1.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.8 - - - - - - - - -
Solyc07g032370.1.1 (Solyc07g032370)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.92 - - - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.43 - - - - - - 4.43 - - - - - - - - -
Solyc07g042410.1.1 (Solyc07g042410)
- 2.22 - - - - - -0.45 - - - - 0.76 - - - 0.44 - - - - - - -1.02 - 2.94 2.15 - - - - 1.34 2.27 - - - 2.62 - - - - -2.07 - - - 3.09 - - 3.78 - - - 0.01 - - - - -
Solyc07g043530.2.1 (Solyc07g043530)
4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - - - - 3.9 - - - 3.38 - - - - -
Solyc07g061865.1.1 (Solyc07g061865)
- 2.28 - - - - - -1.07 1.42 - - - - 2.77 - 0.98 - 0.84 - - - - - - - - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.15 - - - 0.68 - - - - -
Solyc08g029070.2.1 (Solyc08g029070)
- - - - - - - 0.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.78 - - - 0.51 - - - - -
Solyc08g042065.1.1 (Solyc08g042065)
- - - - - - - - - - - - - - - 1.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.86 - - - - - - - - - 4.67 - - - 0.32 - - - - -
Solyc08g047950.1.1 (Solyc08g047950)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.99 - - - - - - 5.74 - - - -0.89 - - - - -
Solyc08g047960.1.1 (Solyc08g047960)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g047990.1.1 (Solyc08g047990)
- - - - 3.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.59 - - - 0.48 - - - - -
Solyc08g048010.1.1 (Solyc08g048010)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc08g048160.1.1 (Solyc08g048160)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.21 - - - - - - 5.74 - - - - - - - - -
Solyc08g048170.1.1 (Solyc08g048170)
- - - - - - - -0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.96 - - - 0.68 - - - - - - 5.57 - - - -0.45 - - - - -
Solyc08g062725.1.1 (Solyc08g062725)
- - - 2.54 4.14 - - - - - - - 1.58 - 1.63 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.69 0.78 - - - - - - - - - - - - 1.89 - - 4.3 - - - 0.75 - - - - -
Solyc09g037140.1.1 (Solyc09g037140)
- - - - 5.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.47 - - - -0.57 - - - - -
Solyc09g037150.1.1 (Solyc09g037150)
- - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.38 - - - -1.25 - - - - -
Solyc09g042480.2.1 (Solyc09g042480)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 - - - - - 3.7 1.16 - - - - - - - - - 1.72 - - - - - - 5.06 - - - - - - - - -
Solyc09g042510.1.1 (Solyc09g042510)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc09g042520.1.1 (Solyc09g042520)
- - - - - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.52 - - - 1.31 - - - - -
Solyc09g042570.1.1 (Solyc09g042570)
- - - - 4.08 - - 1.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - -0.63 - - - - -
Solyc09g042575.1.1 (Solyc09g042575)
- - - - - - - - - - - - - 0.68 2.1 0.88 3.67 - - - - - - 1.54 0.93 - - - - - - 0.84 0.84 - - - - - - - - - - - - 2.06 - - 4.14 - - - -0.22 - - - 2.7 -
Solyc09g042630.1.1 (Solyc09g042630)
- - - - - - - 2.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.24 - - - 4.01 - - - - -
- - - 1.75 - - - - - - -1.14 - 2.13 1.68 - -0.34 1.59 -0.99 - 2.88 - - - - 1.82 - 0.99 - 1.2 - 1.39 - - - - - - - - - - 0.44 - - - - - - 4.06 1.46 - - -0.07 - - 1.42 - -
Solyc09g055210.1.1 (Solyc09g055210)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.84 - - - -0.52 - - - - -
Solyc09g098410.3.1 (Solyc09g098410)
0.41 - - 0.79 2.14 - 0.56 -3.78 - - - - 2.32 - - -2.82 0.25 - - - - - - -2.22 - 0.63 - -1.38 - 0.45 - - -2.07 - - 0.22 2.15 2.17 - 1.77 2.21 0.79 2.79 - - - - - 2.78 1.05 0.66 - -0.86 - 0.02 - - -
Solyc10g036640.3.1 (Solyc10g036640)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc10g036660.1.1 (Solyc10g036660)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc10g036770.1.1 (Solyc10g036770)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc10g044940.1.1 (Solyc10g044940)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
Solyc10g045090.3.1 (Solyc10g045090)
- - - - - - - 0.46 - - - - 1.55 - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.4 - - - -0.02 - - - - -
Solyc10g049945.1.1 (Solyc10g049945)
- - - - - - - - - - - - 2.49 - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.92 - - - - - 3.57 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.84 4.88 - - - - - - - - -
Solyc10g076770.1.1 (Solyc10g076770)
- - - - - - - 2.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.66 - - - 1.37 - - - - -
Solyc11g020847.1.1 (Solyc11g020847)
- - - - - - - - - - - - 2.9 - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.48 - - - -1.26 - - - - -
Solyc11g045400.1.1 (Solyc11g045400)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g015750.1.1 (Solyc12g015750)
- - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.35 - - - 0.51 - - - - -
- - 0.93 - 1.89 - - - -1.53 - - - 0.36 - - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - -0.33 3.72 2.98 - - - - - - -1.33 - - - - 1.26 - 3.97 - - - -1.31 - - - - -
Solyc12g035380.1.1 (Solyc12g035380)
- - - 2.42 4.44 - - - - - - - 1.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.72 - - - -0.19 - - - - -
Solyc12g040230.1.1 (Solyc12g040230)
- 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - 2.21 - - - 0.57 - - - - - - - - -0.69 - - - 2.11 - - 4.84 - - - -0.23 - - - - -
- - - - - - - - - - 0.45 - 1.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.14 - - - - - - - 4.19 - - - -1.78 - - - - -
Solyc12g055687.1.1 (Solyc12g055687)
- - 1.42 - - - - 2.52 - - - - - 0.1 1.98 2.02 - - 3.21 2.04 - - - - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - -
Solyc12g062443.1.1 (Solyc12g062443)
-0.24 -2.06 1.44 2.0 1.13 - 0.27 -1.37 -3.21 - - - -0.69 1.89 2.64 2.62 - - 0.39 -0.54 - - - -0.84 - -0.52 -3.29 - -3.08 - -2.81 -2.07 -2.55 - - - - 0.13 2.2 0.74 - -0.64 0.68 - -0.55 -2.98 - -1.53 3.7 -0.66 -2.54 - -0.01 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.78 - - - 1.57 - - - - -
Solyc12g077600.1.1 (Solyc12g077600)
- - - - 4.35 - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.64 - 2.25 - -2.57 - - - - -
Solyc12g082700.1.1 (Solyc12g082700)
- - - - - - 4.5 - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.85 - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.