Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g068435.1.1 (Solyc01g068435)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g088635.1.1 (Solyc01g088635)
3.69 1.56 3.2 0.02 - - - - - - - - 4.39 - - - -1.91 3.28 - - - - - -5.09 - - - - - - -0.43 -3.11 -4.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.09 - 3.67 1.75 - - - - - - - - 5.24 - - - 0.21 -0.75 - - - - - - - - - - - - -1.94 -4.97 - -0.7 - - - - - - - - - - - - - - -1.89 - - - -8.3 - - - - -
Solyc01g106980.2.1 (Solyc01g106980)
1.22 -3.38 3.51 2.84 -1.2 - -4.59 -5.1 -4.26 -5.05 -6.28 -4.23 5.01 -5.82 - - -0.6 -2.56 - - - - -5.07 -6.8 -5.35 -4.19 -5.48 -2.37 - -4.21 -0.67 -3.47 -3.47 -1.13 -2.83 - -2.98 -2.49 - -3.31 -1.94 -2.53 - - - -3.86 - - -0.86 - -5.08 - -4.28 - - - -4.55 -
Solyc02g014543.1.1 (Solyc02g014543)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.97 - - - - - - - - - - 5.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g069480.3.1 (Solyc02g069480)
- 1.49 2.46 3.54 2.89 - - - -1.39 - - - 4.52 -0.69 - - - - - - - - - -0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.5 - - - -2.05 - - - - -
Solyc03g007780.1.1 (Solyc03g007780)
3.1 3.59 3.08 -5.24 - - - - - - - - 3.76 -5.98 -8.66 -9.28 -0.84 0.24 -4.34 -3.02 -3.57 -5.3 -1.65 -1.25 -2.89 - -9.95 1.45 -6.22 -1.9 2.2 0.07 -4.83 1.84 -3.8 - - - - - - -9.65 -6.69 - - - - -8.9 -5.63 - - - -10.47 -7.1 - - - -
Solyc03g033570.1.1 (Solyc03g033570)
1.94 - 3.05 - - - - - - - - - 5.24 - - - - -0.33 - - - - - - - - -0.9 - - - 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.24 - - - - - - - - -
-3.3 - 2.34 - - - - - - - - - 3.87 -1.53 -2.99 -1.89 0.63 1.97 0.42 - 0.81 - 1.77 0.36 -0.26 - - 0.63 -1.2 0.25 -1.9 -1.39 -0.21 3.84 0.66 -2.43 - - - - - -5.9 - - - -2.7 - 1.06 -4.44 -2.14 -4.28 - -5.81 - - - -4.3 -
Solyc03g071760.1.1 (Solyc03g071760)
- - - 2.11 2.45 - 2.88 - - - - - 4.8 0.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.2 - - - - - - - - - -0.22 - - 2.58 - - - 1.89 - - - -1.53 - - - - -
-1.73 -1.73 2.99 3.29 3.03 - - -1.72 -2.43 - -1.5 - 4.0 0.09 - -2.22 0.84 -0.42 - - -0.52 - -2.31 -1.76 -3.32 - - -0.25 0.28 -0.01 - -1.12 -0.81 - -0.57 - - - - - - -4.54 - - - - - -1.33 0.09 1.14 - - -1.79 -0.96 - - -1.8 -
Solyc03g117240.1.1 (Solyc03g117240)
- - - - - - - - - - - - 5.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - - - - - -
Solyc04g015790.1.1 (Solyc04g015790)
- - - 3.47 3.49 - - - - - - - 5.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.73 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.44 - 3.37 -0.66 - - - -3.29 - - - - 4.94 - - -2.17 0.45 -1.21 - 2.61 - - - - - - 0.63 - - - - -3.29 - - -0.02 - 0.33 - - - - -3.23 - - - - - - 1.13 - - - 0.63 - - - - -
Solyc04g071640.1.1 (Solyc04g071640)
2.78 1.98 3.32 2.58 - - - - -5.75 - - - 2.62 - -2.77 -3.05 -0.77 1.22 -1.63 - -3.67 - - -3.24 - - - - - - - -4.16 - - - - - -2.36 - - -0.42 -2.0 - - - -3.01 -3.77 1.41 -4.17 - - -0.78 -3.61 -0.17 3.42 -1.41 - 2.17
-2.47 -4.42 2.21 -6.2 - - - -8.71 -11.67 - - - 1.09 -0.23 0.95 0.84 1.5 2.11 1.49 -0.04 1.59 -3.0 -2.05 0.07 0.59 -0.06 0.32 1.83 3.15 2.04 0.1 0.5 0.46 0.88 0.51 -1.59 -4.82 -3.41 - -4.69 -2.22 -2.37 -4.45 - -1.36 -0.35 -3.36 -0.42 -7.54 - -7.81 -3.08 -1.86 -3.15 -3.45 -8.47 - -3.46
2.21 0.51 1.97 -2.16 - -7.18 - -5.24 -5.54 - - - 2.18 0.01 1.08 0.63 0.11 0.56 1.42 -0.68 0.23 - -1.92 -0.68 -0.29 0.36 -4.25 1.22 2.02 0.91 0.68 0.79 1.2 1.19 0.89 0.61 - -4.13 - -5.23 -4.01 -1.32 - - 0.28 -2.49 -1.23 1.7 -2.83 -4.82 -5.78 -2.21 -1.76 -1.57 -1.99 - - 1.0
Solyc05g009810.2.1 (Solyc05g009810)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g010190.2.1 (Solyc05g010190)
- -2.35 3.88 0.82 - - - - -5.49 -5.06 -4.9 -3.95 5.17 -4.38 - - 0.01 1.51 - - - - - - - - - - - - -2.89 - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - -3.51 - - - - - - - - -
Solyc05g015825.1.1 (Solyc05g015825)
- - - 3.24 - - - -0.77 - - - - 4.86 - - - - - - - - - - - - - 1.32 - - - - 0.76 - - - - - - - - - -0.36 - - - - - - 3.79 - - - -2.74 - - - - -
Solyc05g041170.3.1 (Solyc05g041170)
1.1 2.08 3.31 - 2.13 - - - -2.14 - - -2.06 4.42 - - - -0.62 - - - - - - -2.0 - - - 0.69 - 0.2 2.86 0.58 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.42 - 0.75 - -3.44 - - - - -
Solyc05g041210.1.1 (Solyc05g041210)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.44 -1.48 2.24 4.06 2.19 -0.91 - -5.72 -4.21 - - - 4.52 - - -4.25 -0.19 0.27 - - - - - - - - -3.83 - - - -3.18 -3.54 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.68 - - - - - - - - -
Solyc06g005030.1.1 (Solyc06g005030)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.34 0.34 3.24 -1.34 -2.23 - - -7.59 - - - - 4.21 -0.51 -4.41 -2.58 2.29 0.65 2.39 -1.77 -3.2 -3.22 -3.62 -3.46 -4.87 -2.33 -2.05 -2.46 -5.63 -2.84 -1.59 -2.81 -4.97 -2.11 -2.3 0.22 -2.56 -3.98 -2.5 -5.15 - -1.09 -4.36 -1.88 0.69 -2.47 -5.37 -2.93 1.64 -1.76 -0.88 -0.39 0.02 -1.58 - -5.08 -3.93 -3.9
Solyc06g069550.1.1 (Solyc06g069550)
-2.27 -0.57 2.48 2.11 -5.74 - - -7.95 -10.25 - - -8.74 4.03 0.1 -0.81 -1.15 -1.92 -1.83 1.92 1.19 -0.41 -3.35 -0.5 -0.51 -0.2 -0.61 0.07 -0.0 -1.0 -0.58 1.3 0.26 -0.59 -1.03 -2.81 -4.55 -4.21 -5.16 -3.74 -3.4 -3.74 -3.51 -4.11 -3.7 -3.21 -2.48 -1.31 -0.33 0.58 -3.01 -3.47 -2.67 -0.5 0.42 -1.13 -4.27 1.68 -1.19
Solyc06g069640.3.1 (Solyc06g069640)
- - -2.89 -4.01 - - - - - - - - -2.04 -1.02 -0.62 -1.25 0.31 2.81 - -2.65 1.96 0.59 -2.21 0.04 0.7 0.75 0.11 1.85 3.76 1.5 -2.9 -0.75 0.22 -1.64 0.26 -2.21 - - - - - -4.26 -4.04 - -1.82 2.41 -1.52 1.34 -4.2 - - -0.7 -3.24 0.5 -4.36 -5.6 - 1.11
Solyc06g074520.1.1 (Solyc06g074520)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g075200.1.1 (Solyc06g075200)
- - 3.35 -1.29 -1.35 - - - - - - - 3.66 -1.25 -1.71 -1.18 - -2.28 - -2.03 - - -1.75 - -3.12 - - -2.86 - -0.59 0.2 -0.99 -1.88 4.44 1.16 - - - - - - - - - - - - - -2.02 - - - -2.62 0.24 - - - 2.0
Solyc07g006210.1.1 (Solyc07g006210)
2.33 -1.81 3.98 - - - - - - - - - 4.97 -4.58 - - 0.49 1.77 - - -3.31 - -2.63 -3.3 -4.5 - - - - - -3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.02 - - - -5.13 - -2.51 - - -
Solyc07g018145.1.1 (Solyc07g018145)
- - 2.99 - - - -1.08 - - - - - 5.45 - - - -1.35 -2.08 - - - - - -3.33 - - - - - - 0.61 -0.4 -2.89 1.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g019640.1.1 (Solyc07g019640)
2.02 -0.42 1.41 2.7 -1.76 - - -4.75 -3.68 - - - 3.54 -0.95 -1.06 -1.37 -1.02 -1.24 2.74 -0.78 -1.0 - - -2.55 -2.97 -0.09 - -0.48 -1.49 -0.99 -2.18 -0.39 -0.34 0.05 - -1.48 1.1 -1.74 - -0.13 0.24 0.02 0.24 0.83 - -1.35 - - 2.3 -0.2 - -2.68 -1.29 -1.75 -2.24 - -2.44 -
Solyc07g021000.1.1 (Solyc07g021000)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g047870.1.1 (Solyc07g047870)
3.22 1.45 4.54 0.15 - - -3.09 -2.82 -3.86 -0.34 -1.02 -0.74 -0.33 -3.36 -3.18 -2.96 0.53 0.65 0.21 -0.37 -2.12 - -0.98 -1.44 -3.28 -1.98 - -1.93 -3.16 -1.99 -1.08 -2.06 -2.25 -0.63 -1.24 - -1.53 - - -2.08 - -3.82 - - - 0.44 - -0.29 -0.99 1.57 0.45 -2.35 -1.87 -0.37 - - -2.13 -
Solyc07g053300.1.1 (Solyc07g053300)
0.48 -3.62 3.08 -3.86 -4.78 - - - -10.04 - - -8.77 4.33 2.74 1.31 1.08 1.12 -3.34 - -7.12 -1.98 -5.91 -7.85 -2.47 -3.24 -6.27 -6.84 -2.29 -1.93 -0.95 -4.03 0.47 1.15 1.17 -1.25 - -0.32 -0.56 -0.21 -0.38 -0.98 -1.17 -0.08 -0.35 -1.92 - - -2.56 -4.25 - - - -8.14 -5.14 -5.79 -6.56 - -
Solyc07g054635.1.1 (Solyc07g054635)
- - 2.87 -0.21 -0.85 - - -4.16 - - - - 5.41 - - - - -1.53 - - -2.37 - - - -2.64 - - - -2.02 -1.53 - 0.27 -0.83 - 0.83 - - - - - - - - - - - - - -2.54 - - - -5.7 - - - - 0.74
Solyc07g056620.1.1 (Solyc07g056620)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g056680.1.1 (Solyc07g056680)
- - - 3.6 - - - - - - - - 5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.68 - - - - - - 2.09 - - - -3.16 - - - - -
Solyc08g067640.1.1 (Solyc08g067640)
-1.86 -1.78 4.22 -5.37 - - - - - - - - 4.67 - -6.26 -3.93 -2.03 1.14 - - -3.18 - -4.39 -4.08 -2.44 - - -2.51 -1.92 -2.36 -0.55 -0.9 0.55 0.82 2.03 -5.27 -5.42 - - - - -6.29 - - -5.34 - -8.58 -5.15 -1.54 - -3.41 - -1.28 -7.37 -5.74 -6.63 -6.99 -2.94
Solyc08g074950.2.1 (Solyc08g074950)
1.36 -3.88 4.72 -4.02 -6.42 - - -6.69 -5.38 -35.13 - -34.48 3.38 2.28 2.85 2.24 -0.72 -1.48 -4.94 - -5.22 - -4.41 -7.17 -5.84 - - -4.23 - -4.97 -1.33 -4.35 -5.33 - - - - - - - - -9.93 - - -5.38 - - -6.56 -4.78 - - - -9.47 - - - - -
Solyc08g080820.1.1 (Solyc08g080820)
2.65 0.14 1.71 3.91 -1.33 - -1.41 -3.12 - - - - 4.08 - - - -2.09 -1.95 -0.61 - -2.6 - -0.21 -2.42 -4.33 - - -2.91 -2.47 -2.97 2.68 0.49 -1.61 -0.45 -0.05 -1.83 - - - - - -3.68 - - - -3.12 - -1.43 -0.88 - - - -4.73 -3.24 -2.45 -2.83 - -
Solyc09g018237.1.1 (Solyc09g018237)
-0.9 - - 1.47 - - - 1.16 1.23 2.65 2.38 2.57 4.54 -2.21 - - - -1.14 0.38 -0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.39 - - - - - - - - 2.23 -0.21 - - -3.24 - - - - -
Solyc09g059770.1.1 (Solyc09g059770)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g066005.1.1 (Solyc09g066005)
- 1.2 3.77 - - - - - - - - - 4.4 - -3.1 - -2.03 -1.08 - - -1.28 - -2.01 -1.11 -1.78 - - 0.06 -1.06 -1.14 2.99 1.49 -0.55 2.2 - - - - - - - - - - - - - - -2.35 - - - - - - -0.79 - -
Solyc09g098480.1.1 (Solyc09g098480)
- - 1.6 2.42 - - - - - - - - 4.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.1 -0.2 - 3.23 2.05 - - - - - - - - - - 0.18 - - 2.3 - - - - - - - - -
Solyc10g006430.3.1 (Solyc10g006430)
0.55 -3.31 1.73 -3.08 -4.46 - -5.05 - - - - - 4.94 -1.31 -2.37 -1.0 1.87 1.09 1.8 - -4.51 - -5.55 -3.66 -5.25 - -4.43 -3.63 - - -5.53 -7.26 - - - - - - - - - - - - - - -2.76 -0.32 - - - -5.36 -3.32 -0.32 1.96 -2.72 - 2.46
Solyc10g017480.1.1 (Solyc10g017480)
3.9 - 2.77 2.99 - - - - - - - - 4.43 - - -1.69 2.15 0.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.95 - - - - - - - - -
2.42 0.33 1.86 2.57 1.49 - -0.12 -7.1 -6.81 - - - 3.66 -5.74 - - -2.64 -0.61 - - -0.66 -3.72 1.46 -0.23 -2.07 -4.02 - -2.22 -1.86 -1.47 0.24 -0.18 -1.2 2.4 -0.49 2.36 - -2.24 - - - 1.06 - - 1.08 -2.86 - -2.03 -1.4 - -3.7 - -5.14 -2.32 - - -3.79 -
Solyc10g055000.3.1 (Solyc10g055000)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g080990.3.1 (Solyc10g080990)
- -4.82 2.25 -0.36 - - - - - - - - 1.87 -0.05 0.24 1.1 1.01 2.45 -1.88 - 1.95 - -0.65 0.79 1.0 -4.07 -5.7 3.07 2.03 2.44 1.36 0.81 0.02 -0.77 -2.3 - - -4.11 - - - -7.75 - - - -5.41 -2.25 -1.67 -4.91 - -3.75 -5.13 -3.92 -3.46 0.78 -2.09 - 0.65
Solyc11g005500.1.1 (Solyc11g005500)
3.48 2.62 3.2 1.14 2.68 - - - - - - - 3.87 - - - - 2.53 - - - - - - - - - - - 0.3 -1.86 -3.23 - - - - - - - -0.08 - - - - - - - - - - - - -5.99 - - - - -
Solyc11g006800.2.1 (Solyc11g006800)
- - 3.11 - - - - - - - - - 3.98 - - -0.87 - 1.25 - - - - - - - - - - - - 3.0 0.11 - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g068970.2.1 (Solyc11g068970)
1.44 -0.61 1.71 -3.74 - 1.39 - -3.36 -0.17 -6.58 - - 2.86 0.77 1.21 1.42 1.42 1.08 -2.49 -0.64 -0.47 -1.88 -2.47 -0.88 -2.6 -0.91 -4.98 0.39 2.14 0.43 -1.97 -0.12 0.23 -1.47 1.0 1.59 - -1.23 - - 0.54 0.27 - - 1.77 1.38 - 0.12 -2.83 - -4.42 -1.9 -3.98 -3.14 - - - -3.83
Solyc11g069055.1.1 (Solyc11g069055)
3.42 2.25 1.76 -2.58 - - - - - - - - 3.97 -0.08 -2.61 -2.63 -1.03 -2.15 - -3.96 - - - -4.95 -4.44 - - - - - - -2.11 0.6 3.67 0.94 1.69 - - - - - -3.47 - - -0.19 - - -3.27 -4.86 - - - -3.71 -3.84 -1.93 - - -
Solyc11g072780.1.1 (Solyc11g072780)
- - - 3.94 - - - - - - - - 5.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g044830.1.1 (Solyc12g044830)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g049250.2.1 (Solyc12g049250)
-5.13 - 2.34 -2.76 - - - - - - - - 4.75 0.45 -2.1 -0.61 2.19 0.28 -2.2 - 0.99 - - -0.59 -2.32 - - 1.23 0.8 1.93 -5.23 -0.65 -3.82 - -0.94 -4.76 - -3.75 - - - -8.04 - - - -6.02 - 1.85 -6.31 - -0.11 -5.69 - -0.36 - - - -3.63

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.