Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
Solyc00g007340.1.1 (Solyc00g007340)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.65 - - - 2.95 - - - - -
Solyc01g011530.1.1 (Solyc01g011530)
- - - 2.02 2.92 - - -0.99 0.57 - - - 1.44 - - - - - - - - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.28 - - - 1.75 - - 4.83 - - - 2.26 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.78 - - - 1.65 - - - - -
Solyc01g091170.3.1 (Solyc01g091170)
2.76 2.48 2.67 -5.21 - - -11.25 -14.59 - - - - 2.84 -3.66 -5.5 -2.9 2.29 0.22 -2.38 3.05 -1.63 -7.35 0.12 -1.04 -2.85 -1.55 -6.77 -0.36 -2.4 -2.63 -2.72 -2.61 -1.51 -3.3 -3.02 -6.34 -8.63 -10.92 - - -7.59 -7.87 -7.9 -7.55 -7.96 -9.11 -0.61 -8.36 -8.44 -1.35 3.47 -3.14 -0.7 -8.17 -9.15 - - -
Solyc01g111480.1.1 (Solyc01g111480)
- - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - 2.57 - - - - - - -1.54 - -1.07 - - - - -0.36 1.6 - - - - - - - - 1.31 - - - - - - 5.06 - - - 0.85 - - - - -
Solyc02g021520.1.1 (Solyc02g021520)
- - - - 2.92 1.33 1.29 0.88 0.88 2.46 2.71 0.68 1.23 0.97 - -0.48 0.89 1.56 - - - - - -1.37 - - - - - - - -0.59 - - - - - - - - - -0.41 - - - 1.36 - - 3.66 - - - 0.44 - - - - -
Solyc02g050263.1.1 (Solyc02g050263)
- - - 2.62 - - - - - - - - 2.89 - - 1.11 - - - - - - - - 1.75 - - - - - - 1.11 - - - - - - - - - -0.16 - - - - - - 5.02 - - - 1.72 - - - - -
Solyc03g034203.1.1 (Solyc03g034203)
- - - 3.84 - - - - - - - - - 1.62 3.09 -2.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.22 - - - - - - 4.08 - - - 2.01 2.66 - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - - 3.31 2.01 - - - 0.43 0.28 - - 2.39 - - - -0.35 1.53 - - - - - - - - -0.67 - - 3.87 - - - 3.07 - - - 1.45 - - - - -
Solyc03g058230.1.1 (Solyc03g058230)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g098790.3.1 (Solyc03g098790)
-2.3 -5.83 3.49 -4.78 -12.58 - -12.15 -13.59 -14.87 - - - 4.05 -3.65 -4.41 -2.11 3.41 1.63 0.71 1.36 1.07 - 2.26 1.1 -2.27 -9.52 -8.69 0.48 -3.75 -1.92 -4.9 -4.49 -2.19 -6.62 -6.0 -10.33 - - - - - - - - - - -4.29 -12.65 -11.68 -13.2 -8.45 -12.45 -2.2 -9.21 - - - -
Solyc03g098795.1.1 (Solyc03g098795)
-0.85 -1.95 4.69 -3.87 -10.19 -10.35 -5.35 -10.68 -11.24 -13.11 - - 2.31 -0.8 -1.02 0.19 2.47 3.63 1.54 1.29 -6.84 -8.46 -7.6 -6.26 -5.33 -7.78 -11.12 -7.27 -9.39 -9.66 - -11.1 -8.44 -7.06 -4.08 -7.83 - - - - - -11.68 - - - -7.61 -1.89 - -7.55 -7.76 -2.62 -7.01 -1.91 -7.02 - - - -
Solyc04g015770.1.1 (Solyc04g015770)
- - - 2.55 - - 3.74 -0.26 - - - 1.26 3.33 - - - - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.03 - - - - - - 4.36 - - - -2.27 - - - - -
Solyc04g039750.3.1 (Solyc04g039750)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - 3.27 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - 5.33 - - - 3.11 - - - - -
Solyc04g050320.1.1 (Solyc04g050320)
- - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g053102.1.1 (Solyc04g053102)
5.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g150127.1.1 (Solyc04g150127)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.37 - - - 4.05 - - - - -
Solyc05g015651.1.1 (Solyc05g015651)
2.3 - - 2.92 - - - 0.57 - - - - 2.71 - - - - 2.64 - - - - - - - - - - 1.22 - - - 0.69 - - - - - - - - 0.6 - - - 1.66 - - 4.5 - - - - - - - - -
Solyc05g023880.2.1 (Solyc05g023880)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.64 - 1.79 - - - - - - - - - - 2.21 - - - - -
Solyc05g024050.1.1 (Solyc05g024050)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g066245.1.1 (Solyc06g066245)
- - - - - - - - 5.08 - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g041460.1.1 (Solyc07g041460)
- - - - - - - - - - 1.79 1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.67 - - - - - - - - -
0.48 -1.99 1.86 -0.37 -13.15 -13.56 -9.49 -11.29 -14.32 - -15.28 - 3.36 -4.58 -4.45 -1.77 3.13 1.91 1.11 1.72 0.36 -11.0 1.1 -0.28 -1.13 -5.92 -8.0 1.35 -0.21 1.02 3.2 0.72 -0.63 -3.68 -0.53 -4.22 -10.58 -8.61 -6.42 -5.36 -6.31 -6.76 -6.78 -6.5 -9.86 -9.69 -4.27 -5.87 -7.96 -6.54 -4.46 -4.7 -0.76 -7.66 -12.31 -8.8 -9.01 -8.82
Solyc09g011125.1.1 (Solyc09g011125)
- - - 3.4 - - 2.73 2.39 3.16 - - - 1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.63 1.02 - - - - - - - - - - - - - - - 3.32 - - - -0.86 - 2.9 - - -
Solyc09g011695.1.1 (Solyc09g011695)
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.47 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.13 - - - - - 2.6 4.65 - - - -1.56 - - - - -
Solyc09g059830.3.1 (Solyc09g059830)
- - 3.09 - - - - - 1.03 - 1.9 1.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - 5.09 - - - 2.29 - - - - -
Solyc09g074785.1.1 (Solyc09g074785)
- - - 2.54 - - - 2.7 2.78 2.81 2.31 2.31 - - - - - 1.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.01 - - - - - - 4.09 - - - 0.85 - - - - -
Solyc09g083435.1.1 (Solyc09g083435)
1.64 0.22 3.47 -4.48 -8.29 - - -8.54 -11.8 - - - 3.11 -0.26 -1.75 -0.14 2.81 2.91 0.76 1.14 -1.33 - 0.57 -0.97 -1.5 -9.31 -9.83 -1.88 -4.74 -3.76 -2.9 -2.25 -1.28 -3.9 -1.76 -8.01 - - - - - -9.87 - - - -6.1 0.56 -7.42 - -4.78 -3.49 0.33 2.66 -7.15 - - - -
Solyc09g084470.3.1 (Solyc09g084470)
-4.36 -3.93 1.41 -4.0 -10.34 -9.66 - -7.88 -9.25 - - - 2.6 3.61 2.36 2.3 3.29 2.61 -2.89 -1.89 -3.88 - 0.88 -1.47 -2.49 -9.05 -9.73 -3.26 -7.77 -4.49 -5.72 -6.42 -7.13 -8.53 -9.71 -9.33 - - - - - -11.89 - - - -4.32 -3.77 -8.13 -12.06 -2.59 2.69 -3.74 0.14 -8.74 - - - -
Solyc09g084490.4.1 (Solyc09g084490)
0.2 -1.83 1.39 -3.51 -10.41 - -10.19 -9.1 -10.56 - - - 4.83 1.51 0.61 1.32 2.86 0.29 -1.85 0.65 -2.51 - 2.13 -1.06 -3.69 -11.32 -9.26 -0.68 -6.15 -2.85 -2.51 -3.15 -3.24 -4.28 -6.7 - - - - - - - - - - -8.63 0.0 -9.54 -12.16 -10.08 -2.99 -4.23 -0.6 -9.07 -10.6 - - -
Solyc09g089490.4.1 (Solyc09g089490)
0.52 -2.58 3.73 -4.66 -9.26 -11.8 -6.16 -11.07 -10.21 - - -14.15 4.78 -1.3 -1.89 -0.84 2.58 2.44 -2.92 -0.84 -6.18 - -1.51 -3.81 -6.55 -9.1 -9.65 -4.77 -8.28 -6.73 -8.56 -9.38 -6.45 -6.06 -6.15 - - - - - - - - - - -11.26 0.13 -11.32 -8.55 -12.68 -7.49 -3.24 -1.03 -7.7 - - - -
Solyc09g089500.3.1 (Solyc09g089500)
-4.09 -1.83 3.65 -4.24 - - - - -9.07 - - - 0.4 -3.19 -4.61 -3.18 4.34 3.07 - -0.4 -1.55 - 2.58 0.95 -3.15 - - -2.58 - -0.71 -3.86 -4.35 -6.83 - - - - - - - - - - - - - 1.02 - -7.28 -2.96 1.02 -2.37 -1.22 - - - - -
Solyc09g089530.3.1 (Solyc09g089530)
-2.17 -3.54 2.38 -3.96 -9.04 - -8.59 - -12.46 - - - 4.29 -1.86 -2.95 -0.51 3.26 1.35 -0.01 0.01 -0.57 - 2.95 1.05 -0.9 - -10.21 -0.73 -5.84 -2.31 -2.44 -2.17 -1.99 -6.15 -4.59 -8.67 - - - - - - - - - -10.2 -3.54 - -9.71 -1.41 1.96 -2.41 -0.82 -7.79 - - - -
Solyc09g089540.4.1 (Solyc09g089540)
-2.04 -3.18 3.1 -2.64 - - - - - - - - 4.4 - -4.68 -1.04 3.13 1.15 1.3 1.22 -1.34 - 1.93 0.34 -4.07 - - -1.08 -5.08 -3.32 -4.81 -5.17 -2.75 -2.42 -0.26 -4.69 - - - - - -8.24 - - - - 0.97 - - - -1.35 -4.28 0.77 - - - - -5.2
Solyc10g024440.1.1 (Solyc10g024440)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - 4.86 - - - 3.53 - - - - -
Solyc10g044620.2.1 (Solyc10g044620)
- - - 3.23 - - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - 2.96 - - 4.04 - - - 1.13 - - - - -
Solyc10g044950.1.1 (Solyc10g044950)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.45 - - 4.21 - - - 5.07 - - - 1.64 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g052823.1.1 (Solyc10g052823)
- 2.64 - - - - - - - - - - 1.53 - - - - 0.61 - - - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - 3.92 - - - 1.34 - - - - -
Solyc12g011460.1.1 (Solyc12g011460)
- - - - 1.81 - 4.49 -2.1 - - - - 0.33 - - - - - - 1.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.95 - - - 1.0 - - - - - - 4.39 - - - 0.7 - - - - -
Solyc12g062850.1.1 (Solyc12g062850)
- - - - - - - 3.14 3.27 - - - - - - 1.64 3.03 2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.19 - - - - - - 4.53 - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.