Heatmap: Cluster_104 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002176 (GRMZM2G175321)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.42 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d003060 (GRMZM2G382747)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.09 0.07 0.02 0.1 0.01
Zm00001d004691 (GRMZM2G132154)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.54 1.0 0.36 0.03 0.06 0.02 0.0 0.15 0.04 0.0 0.01 0.14 0.09 0.13 0.01 0.35 0.13 0.23 0.06 0.02 0.01
Zm00001d006050 (GRMZM2G014526)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.5 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.63 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d010584 (GRMZM2G179728)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0 0.78 1.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.83 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0
Zm00001d011442 (GRMZM2G070913)
0.0 0.13 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.55 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.01 0.09 0.93 0.0 0.0 0.37 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0
Zm00001d011940 (GRMZM2G460581)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d012366 (GRMZM2G700784)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d012371 (GRMZM5G809262)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0
Zm00001d012375 (GRMZM2G470249)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.17 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d014931 (GRMZM2G040311)
0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 1.0 0.98 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.01
Zm00001d016620 (GRMZM2G504595)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 1.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03
Zm00001d019373 (GRMZM5G805697)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.75 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Zm00001d020346 (GRMZM2G150832)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d020875 (GRMZM2G078779)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d021357 (GRMZM2G058208)
0.03 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.99 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
Zm00001d024286 (GRMZM2G079965)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d024915 (GRMZM2G077951)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
Zm00001d025871 (GRMZM2G005284)
0.03 0.03 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.19 1.0 0.01 0.08 0.04 0.14 0.02 0.1 0.01 0.0 0.1 0.25 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.04
Zm00001d027490 (GRMZM2G008122)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.77 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Zm00001d027496 (GRMZM2G137374)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.58 0.48 0.19 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d029341 (GRMZM2G100452)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.78 0.01 0.02 0.04 0.0 0.02 0.01 0.0 0.09 0.03 0.0 0.03 0.0 0.05 0.06 0.05 0.0 0.01 0.0
Zm00001d031312 (GRMZM2G113229)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.3 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d031855 (GRMZM2G148867)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.59 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.26 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.27 1.0 0.01 0.03 0.0 0.15 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.1 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0
Zm00001d039845 (GRMZM2G162622)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d039875 (GRMZM2G384128)
0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.03 0.02 0.0 0.07 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.49 1.0 0.23 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.58 0.01 0.11 0.0 0.04 0.01
Zm00001d040502 (GRMZM2G085504)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.05 0.01 0.0 0.79 1.0 0.22 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.01 0.0 0.0 0.11 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d043393 (GRMZM2G162238)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.66 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04
Zm00001d044245 (GRMZM2G022440)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.63 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Zm00001d044374 (GRMZM2G122762)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.08 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.68 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d046143 (GRMZM2G040236)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d046772 (GRMZM2G146523)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.7 1.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Zm00001d047417 (GRMZM2G148969)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d049393 (GRMZM2G012251)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d050303 (GRMZM2G103186)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.75 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.02 0.0 0.0 0.01 0.4 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0
Zm00001d050603 (GRMZM2G043460)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d051696 (GRMZM2G124667)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.61 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d052158 (GRMZM2G356046)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d052592 (GRMZM2G094716)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d052966 (GRMZM2G076858)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.63 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04
Zm00001d053216 (GRMZM2G163801)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d053599 (GRMZM2G078862)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)