Heatmap: Cluster_104 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002176 (GRMZM2G175321)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 38.58 16.13 4.05 0.0 0.27 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 1.26 0.01 0.01 0.07 0.16 0.0
Zm00001d003060 (GRMZM2G382747)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1 0.07 0.03 0.11 0.01
Zm00001d004691 (GRMZM2G132154)
0.0 0.0 0.32 0.0 0.14 0.01 0.0 10.03 0.06 0.01 0.0 0.3 0.0 0.21 0.52 0.3 12.7 23.68 8.64 0.8 1.49 0.4 0.0 3.49 0.92 0.04 0.15 3.27 2.19 3.08 0.29 8.32 3.12 5.42 1.31 0.54 0.35
Zm00001d006050 (GRMZM2G014526)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.03 0.0 0.09 0.22 0.0 0.18 0.0 0.0 1.12 0.18 0.02 164.38 82.7 0.02 0.08 7.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.21 0.0 0.0 0.06 9.55 0.32 0.03 1.31 0.82 0.82
0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.87 1.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d010584 (GRMZM2G179728)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.28 0.0 0.04 0.0 4.17 5.35 0.54 0.04 0.0 0.0 0.13 0.06 0.0 4.45 1.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.29 0.0 0.03 0.02
Zm00001d011442 (GRMZM2G070913)
0.0 1.29 0.0 0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 5.34 9.67 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.74 0.08 0.87 9.03 0.0 0.01 3.56 0.0 0.64 0.01 0.08 0.05
Zm00001d011940 (GRMZM2G460581)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 341.24 729.57 0.0 0.0 2.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 4.84 0.11 0.04 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d012366 (GRMZM2G700784)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d012371 (GRMZM5G809262)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d012375 (GRMZM2G470249)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.27 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d014931 (GRMZM2G040311)
0.53 0.12 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.23 0.62 0.04 0.12 0.05 14.15 13.86 0.08 0.02 0.99 0.0 0.02 0.1 0.06 0.0 0.14 0.0 0.0 0.09 0.0 0.14 0.01 0.66 0.04 0.16
Zm00001d016620 (GRMZM2G504595)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 25.92 103.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 2.37 3.35 0.2 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.35 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1
Zm00001d019373 (GRMZM5G805697)
0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 5.18 3.88 0.18 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0
Zm00001d020346 (GRMZM2G150832)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 2.48 4.82 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d020875 (GRMZM2G078779)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.51 0.02 2.22 0.47 852.2 2505.27 1.46 5.23 17.39 0.0 0.01 1.99 0.08 1.58 0.71 1.37 0.0 66.06 0.0 18.86 1.41 0.0 0.25 0.33
Zm00001d021357 (GRMZM2G058208)
0.3 0.0 0.75 0.0 0.4 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.23 0.1 0.03 0.07 0.0 11.68 11.82 0.06 0.01 0.11 0.1 0.0 0.02 0.17 0.0 0.03 0.0 0.12 0.06 0.0 0.02 0.03 0.07 0.22 0.02
Zm00001d024286 (GRMZM2G079965)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 10.18 15.76 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.68 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
Zm00001d024915 (GRMZM2G077951)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
Zm00001d025871 (GRMZM2G005284)
0.1 0.09 0.08 0.0 0.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.05 0.05 0.52 2.75 0.03 0.23 0.1 0.38 0.05 0.27 0.03 0.0 0.28 0.68 0.0 0.02 0.0 0.01 0.09 0.01 0.03 0.1
Zm00001d027490 (GRMZM2G008122)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 4.35 3.34 0.39 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Zm00001d027496 (GRMZM2G137374)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.35 0.29 0.11 0.01 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d029341 (GRMZM2G100452)
0.01 0.09 0.02 0.0 1.03 0.01 0.04 0.01 0.06 0.04 0.07 0.44 0.0 0.0 0.35 0.07 0.36 45.87 35.87 0.47 0.79 1.97 0.0 0.9 0.45 0.11 3.97 1.35 0.0 1.24 0.13 2.12 2.87 2.15 0.14 0.28 0.07
Zm00001d031312 (GRMZM2G113229)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.06 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.05 0.46 2.37 98.38 331.21 0.01 0.98 3.4 0.0 0.38 0.69 0.0 0.03 0.2 2.19 3.0 0.05 0.38 0.16 0.12 0.0 0.51 0.34
Zm00001d031855 (GRMZM2G148867)
0.03 0.0 0.07 0.0 0.13 0.07 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.39 1.76 0.34 1.39 0.39 0.24 103.42 174.15 0.03 0.2 0.0 0.03 0.24 0.71 0.03 0.36 1.17 44.71 0.44 0.26 4.77 0.21 0.9 0.15 1.65 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.25 0.92 0.01 0.02 0.0 0.14 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 8.71 17.92 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.0 0.0 0.0 1.83 3.07 0.24 0.0 0.0 0.01
Zm00001d039845 (GRMZM2G162622)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.03 0.09 12.53 0.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.11 0.23 0.0 67.06 111.43 0.0 0.02 3.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 7.52 0.0 0.0 0.0 1.21 0.15 0.02 0.02 0.0
Zm00001d039875 (GRMZM2G384128)
0.01 0.0 0.03 0.12 0.01 0.09 0.06 0.0 0.18 0.03 0.06 0.05 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 1.26 2.57 0.6 0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.3 1.48 0.01 0.27 0.01 0.1 0.02
Zm00001d040502 (GRMZM2G085504)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.24 0.14 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0 0.1 0.02 0.0 1.47 1.85 0.41 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.35 0.01 0.0 0.0 0.2 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d043393 (GRMZM2G162238)
0.08 0.0 0.26 0.0 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.23 0.07 0.1 0.0 12.28 18.72 0.19 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 2.17 0.0 0.28 0.07 0.0 0.09 0.66
Zm00001d044245 (GRMZM2G022440)
0.24 0.08 0.0 0.0 0.01 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 19.97 12.58 0.63 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.23
Zm00001d044374 (GRMZM2G122762)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 5.99 6.25 13.6 4.86 6.67 0.1 1.91 0.17 0.19 0.35 1.32 0.0 175.59 119.22 3.51 0.04 5.44 3.79 0.01 0.05 1.32 0.0 0.44 0.0 0.0 0.02 0.31 0.03 0.16 0.01 0.52 0.06
Zm00001d046143 (GRMZM2G040236)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d046772 (GRMZM2G146523)
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.04 0.0 10.09 14.5 0.42 0.2 0.11 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.12 0.0 0.23 0.16 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.11
Zm00001d047417 (GRMZM2G148969)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.02 0.0 0.03 0.01 0.07 0.0 38.32 31.1 0.07 0.0 0.16 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.68 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.03 0.0 0.07
Zm00001d049393 (GRMZM2G012251)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.89 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d050303 (GRMZM2G103186)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.03 1.37 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.03 0.0 0.0 0.01 0.54 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0
Zm00001d050603 (GRMZM2G043460)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.27 0.0 22.32 158.36 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d051696 (GRMZM2G124667)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 20.11 12.2 0.77 0.0 0.55 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d052158 (GRMZM2G356046)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.39 5.45 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
Zm00001d052592 (GRMZM2G094716)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 5.76 6.66 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d052966 (GRMZM2G076858)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.7 1.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04
Zm00001d053216 (GRMZM2G163801)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.47 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d053599 (GRMZM2G078862)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 45.99 45.8 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)