Heatmap: Cluster_138 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
1.75 1.67 1.3 - - - - -2.89 -6.07 - -8.46 -8.33 - - - - - -3.74 3.24 2.04 - 1.75 - - - 1.77 - - - - - - - - - - 2.24 -0.75 - 2.54 -19.76 0.03 1.5 0.7 - - 2.18 0.63 - - - 1.81 0.93 -1.76 - - - -5.51
1.64 2.32 0.74 0.74 -3.54 -4.8 -5.76 -6.79 -6.9 -6.98 - -8.63 -0.12 -0.92 -2.13 -2.05 -3.14 -1.14 3.34 3.0 -2.96 -2.48 -3.01 -2.38 -5.8 -0.63 -0.1 - -4.82 -4.99 -3.05 -0.99 -2.04 - -2.82 -3.14 -2.76 -0.31 0.1 -0.85 -0.89 -1.2 -0.34 -2.12 -0.96 0.94 1.51 0.11 1.41 1.16 -5.44 1.26 1.33 -0.01 -2.32 -1.98 -3.23 -4.38
Solyc01g016890.1.1 (Solyc01g016890)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.96 4.34 - - - -1.71 - - - - -
- - - 3.65 - - - - - - - - 5.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.77 - - - - - - -0.28 - - - - -
Solyc01g095380.1.1 (Solyc01g095380)
- - - 4.81 - - - - 2.57 - - - - - - - 4.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g105250.1.1 (Solyc01g105250)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
Solyc01g110630.4.1 (Solyc01g110630)
-1.5 - -2.66 2.59 4.09 -2.77 -0.51 -4.19 -2.92 -2.17 -2.5 -3.12 0.12 0.73 1.7 0.97 -0.97 2.06 -2.49 - -3.65 - -4.25 -2.31 -0.93 -3.99 - -2.24 -1.24 -1.29 -1.85 -0.4 0.13 - -2.36 -2.97 -0.47 -1.02 0.03 -2.62 0.02 -2.64 -1.98 - - 0.59 2.48 -3.11 -4.73 -1.28 -1.82 0.33 -0.12 -2.38 -1.03 -3.55 -0.54 -1.84
Solyc01g112330.1.1 (Solyc01g112330)
- - - - - - - - - - - - 5.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.55 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g068485.1.1 (Solyc02g068485)
- - - 3.68 - - - - - - -0.0 - 5.02 1.78 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.93 - - - - - - - - -
Solyc03g058640.2.1 (Solyc03g058640)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.05 - - - 4.64 - - - - -
Solyc03g063250.1.1 (Solyc03g063250)
- - - - - - - - - - - - 5.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.51 - - - - -
Solyc03g079890.3.1 (Solyc03g079890)
- - - 5.41 1.33 - - -3.59 - - - - 0.43 - - - - -2.26 - - - - - - - - - - - - - -2.37 -1.74 - - - - - - - - - 1.55 - - - - - 2.97 - - - -2.43 - - - - -
Solyc03g113320.1.1 (Solyc03g113320)
- - - 5.61 - - 1.63 - - -2.57 - - - - 0.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.49 1.65 - - - -2.16 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.19 -1.4 3.47 - - - - - - - - -2.75 -0.49 1.93 0.75 0.84 2.35 - -0.94 - - - - - - -3.08 - -1.45 - - -3.0 -2.37 - - - - - - - - -4.45 - - - 4.66 1.1 -1.39 -2.93 - - 0.79 0.39 - - - - -
Solyc05g005265.1.1 (Solyc05g005265)
- - - 4.12 - - - - - - - - 3.3 - 0.24 - - - - 1.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.19 3.89 - - - 1.39 - - - - -
Solyc05g006300.1.1 (Solyc05g006300)
- - - -0.63 2.81 - 1.52 - - - - - - - - - - -4.78 - - -0.99 - - -0.43 -0.27 - -2.91 -0.67 0.04 1.0 -0.54 0.87 1.05 4.71 2.97 - - - - - - -1.86 - - - - - -2.8 1.21 - - -2.96 -3.31 - - - - -
Solyc05g014300.1.1 (Solyc05g014300)
- - -1.53 -2.51 -2.56 - - - - - - - - -4.79 0.33 -0.59 - -2.67 - - -3.75 0.95 - -5.45 -3.33 -1.46 -1.85 -3.87 - - - - -3.69 - - - - - - -2.14 - -4.15 - - - -3.08 -4.48 1.77 4.28 - - - 1.99 4.13 2.05 -1.26 - 1.55
Solyc05g024250.1.1 (Solyc05g024250)
- - - 5.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.01 - - - - -
Solyc06g016670.1.1 (Solyc06g016670)
- - - - - - - - 3.78 - - 2.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.31 - - - - - - - - -
Solyc06g035540.1.1 (Solyc06g035540)
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g052045.1.1 (Solyc06g052045)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g064673.1.1 (Solyc06g064673)
- - - 5.65 - - - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.73 - - - - -
- - - 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.92 - - - - - - - - - - - 2.2 - - - - - - - - -
Solyc07g025095.1.1 (Solyc07g025095)
- - - 3.33 - - - - - - - - - - - - 1.01 2.47 - - - - - - - 4.03 - - - - - 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.16 - - - -0.67 - - - - -
Solyc07g065410.1.1 (Solyc07g065410)
-1.63 -0.05 -2.41 -1.84 -4.13 - -3.08 -11.2 -7.01 - - -12.23 -2.31 -5.08 -2.14 -2.7 -1.96 0.91 -6.36 -3.87 -2.62 -1.75 -2.92 -2.67 -1.65 -0.47 -0.06 -1.63 -1.33 -1.11 0.48 0.62 1.05 4.17 3.14 2.0 -1.16 0.15 -2.53 -0.98 0.04 0.29 -1.83 -1.46 1.34 -2.6 -2.05 -2.87 1.6 -3.63 -1.81 -4.21 0.58 -2.73 -5.23 -7.04 -4.65 -3.38
Solyc08g029270.2.1 (Solyc08g029270)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.81 - - - 0.77 - - - - -
- - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.99 - - - - -
Solyc08g045760.1.1 (CYP77A5P)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.84 4.88 - - - - - - - - -
- - - 3.15 3.04 - - - - - - - 1.23 2.41 - - - - - - 2.45 - - - - 2.11 - - - - - 0.03 - - - - - - - - - -0.46 - - - - - - 4.18 - - - 1.83 - - - - -
Solyc08g079560.1.1 (Solyc08g079560)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g009736.1.1 (Solyc09g009736)
- - - - - - - - - -0.33 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.49 5.03 - - - -1.17 - - - - -
Solyc09g018480.1.1 (Solyc09g018480)
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - -3.22 - - - - 4.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.69 1.92 3.62 - - - -
Solyc09g065490.2.1 (Solyc09g065490)
- - - - - - - - - 4.42 4.56 3.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g045440.1.1 (Solyc10g045440)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g045510.1.1 (Solyc10g045510)
- - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.83 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.48 0.82 0.6 2.83 - - - - - - - - 1.99 -2.15 -16.32 - -0.45 1.32 1.44 1.1 - - - -1.89 -0.88 - -15.24 - -22.71 - - -16.67 -0.93 - -11.02 - 3.03 1.37 - 2.7 -14.76 -1.65 1.85 -5.67 - -0.77 - - 1.43 - - -17.59 -0.52 -17.05 -18.74 0.91 0.45 -
Solyc11g020090.1.1 (Solyc11g020090)
- - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - -
Solyc11g066030.1.1 (Solyc11g066030)
- - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.99 - - - - -
Solyc12g013480.3.1 (Solyc12g013480)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - 5.27 - - - 1.22 - - - - -
Solyc12g019840.1.1 (Solyc12g019840)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g040210.2.1 (Solyc12g040210)
- - - 2.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 3.83 - 1.15 - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - 2.86 - - - -0.95 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.