Heatmap: Cluster_139 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
Solyc00g500281.1.1 (Solyc00g500281)
- - -0.81 -0.43 0.52 - - 0.37 -2.74 - - - - -2.71 - 0.42 - 5.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.36 - - 1.59 -4.18 - - - - - 3.11 1.18 - - -1.38 -1.34 -1.4 0.34 - -1.09 0.73
Solyc01g017750.1.1 (Solyc01g017750)
2.67 1.05 0.55 - 1.63 - 2.08 1.27 2.23 - -0.02 -0.74 0.16 - -0.02 - 1.64 0.4 - - - - - - - - - - - - - -1.05 -0.85 - - - - - - - 3.72 -2.0 - - - - - - 2.77 - - - -0.11 1.73 - - - -
Solyc01g020480.1.1 (Solyc01g020480)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.76 - - - - - - 2.01 4.0 2.48 - 0.4 - 4.03 - - - 1.2 3.41 - - - -3.8 - - - - -
Solyc01g068075.1.1 (Solyc01g068075)
- -1.61 -1.23 -1.03 - - -0.09 -0.72 -0.03 -2.91 -2.61 -2.77 -1.58 -1.81 - - - -2.14 - - - - - -3.97 - - - - - - - - - 1.79 - - - - - - - - - - - 4.09 - 1.0 -2.77 - - 1.72 0.94 2.56 -1.21 -1.27 -0.63 4.15
Solyc01g087525.1.1 (Solyc01g087525)
- - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.9 - - - - -
Solyc02g011740.1.1 (Solyc02g011740)
- - - - - - - 2.93 2.01 1.6 1.41 1.29 - - - 2.28 - 3.27 - - - - - - - - 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.56 - - - 0.35 - - - - -
Solyc02g032050.1.1 (Solyc02g032050)
- - - 1.63 - - - - 1.14 - - - - 1.86 1.99 0.02 4.68 3.15 - - - - - - - - - - - - - -5.22 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.18 - - - 1.89 1.82 - - - -
Solyc02g061860.1.1 (Solyc02g061860)
- - - -0.07 1.84 - - - - - - - - - - - 2.32 -0.91 - - - - - -0.12 -1.48 - - - 1.08 0.53 - 0.53 1.18 - 1.53 1.13 1.88 0.93 - - - -0.1 3.07 2.95 1.81 1.19 - - 2.46 - - - -1.49 - - - - -
- - - 2.44 3.63 - - - - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - 3.53 - - - - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - -
Solyc03g065230.1.1 (Solyc03g065230)
- - - - - - - 0.43 1.88 - - - 2.25 - - - 3.17 1.5 - - - - - - 1.55 - - - - - - - 3.11 - - - - - - - - 3.68 - - - - - - 3.06 - - - 1.86 - - - - -
Solyc03g065233.1.1 (Solyc03g065233)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.88 - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - 4.31 - 1.36 3.95 - - - - - - - - - -1.66 - - - - -
Solyc03g077900.1.1 (Solyc03g077900)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g077905.1.1 (Solyc03g077905)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.84 4.88 - - - - - - - - -
Solyc03g083993.1.1 (Solyc03g083993)
- -5.93 -4.61 -6.53 -3.94 -1.81 -5.27 -1.92 -2.17 -4.67 -3.6 -4.14 -4.78 - - -4.76 -3.78 -2.77 - - - -1.9 - -8.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.88 4.47 - -5.63 - -3.31 4.12 - - -6.38 3.22
Solyc03g083994.1.1 (Solyc03g083994)
- -5.93 -4.61 -6.53 -3.94 -1.81 -5.27 -1.92 -2.17 -4.67 -3.6 -4.14 -4.78 - - -4.76 -3.78 -2.77 - - - -1.9 - -8.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.88 4.47 - -5.63 - -3.31 4.12 - - -6.38 3.22
2.6 2.63 1.72 4.81 - 0.05 - -1.56 -2.11 - 0.01 - 2.38 - - - - 1.51 - - - - - -1.86 - - - - - - - - -1.34 - - - - - - - - -2.27 - - - - - - 1.06 - - - -0.45 - - - - -
-5.8 -2.33 -1.19 0.7 -3.91 - -2.09 -7.63 -0.11 - -4.87 -2.69 -0.64 -5.19 -3.26 -3.24 -1.62 1.71 - -3.14 0.25 -2.82 -2.45 -1.39 -1.1 -2.0 -3.51 0.6 1.15 0.99 -0.09 -0.38 -1.15 -0.37 -2.05 -3.65 - -4.19 - - -4.18 -5.04 - - -4.33 2.52 2.45 2.51 2.48 -7.79 - 2.11 1.29 0.07 1.84 0.39 1.38 -3.61
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.41 -2.86 -6.98 - -6.1 - - - - - 0.6 -2.41 -2.96 -2.03 2.59 0.3 -2.08 -4.48 -0.77 -1.59 -2.04 -1.99 -0.91 -3.89 -2.69 -1.21 0.12 -1.35 -5.75 -3.22 -2.49 -3.82 1.66 -0.23 -5.02 -5.33 -4.36 -7.6 -5.95 -3.61 -5.32 -4.91 -2.56 2.19 2.11 4.25 -2.86 -5.28 -1.1 0.01 0.28 1.87 -1.7 -1.97 -2.97 1.52
2.35 1.93 0.64 -3.69 -3.61 -3.78 -3.94 -2.65 -2.86 -6.85 -6.86 -7.1 -0.63 -3.29 1.52 0.96 -2.85 2.99 -4.51 -4.07 -1.11 1.09 -2.29 -1.98 -1.36 -3.1 - 0.49 -1.89 0.68 1.81 1.77 0.54 4.03 0.06 -5.04 - -6.13 - - -4.15 -3.33 - - -2.62 -7.07 -4.24 -6.95 -7.91 -5.53 -7.29 - -3.32 -6.04 - -6.73 - -
-0.99 -1.64 -1.13 -0.59 -6.27 -4.68 - -3.96 -5.56 -6.92 -4.57 -5.55 1.78 2.49 2.98 2.08 2.41 3.62 -2.84 -5.51 -0.46 -3.26 -0.52 -0.69 -0.9 -2.25 - -0.63 -1.23 -0.7 -0.87 -0.74 -0.67 -1.66 -0.36 -3.21 -4.34 -2.29 -4.27 -3.43 -2.27 -0.57 -0.88 - -4.23 -2.44 -2.88 1.04 -2.6 -1.01 1.23 -1.61 0.03 -2.5 -4.49 -5.84 -1.71 -2.47
-3.47 - -0.76 -0.33 -0.42 - -2.33 - -5.16 - - - -0.34 3.54 -0.03 0.43 3.69 0.66 - -1.12 0.94 - 1.17 0.66 -1.13 -3.59 -3.57 -2.89 -1.85 -1.58 -3.9 - -2.02 - - - - - - - - -4.59 - - - -2.01 -0.41 3.1 -2.1 - - 2.34 1.65 -1.66 - - - -
Solyc05g015538.1.1 (Solyc05g015538)
2.49 - 2.99 2.13 2.05 - 3.78 - - - - - - 2.02 0.64 1.11 1.37 - - - - - - - -0.12 - - - - - - - 1.25 - - - - - - - - -1.6 - - - - - 0.32 1.37 2.0 - - -1.32 - - - - -
Solyc05g024420.1.1 (Solyc05g024420)
- - - - - - - - - - - - -4.42 2.44 4.89 3.84 1.38 2.31 - - - - - -5.93 -5.09 - - -2.8 - - - - - - - - - - - - - -6.21 - - - - -0.84 - -4.61 - -4.0 - -8.65 -3.85 - - - -
Solyc05g032670.3.1 (Solyc05g032670)
- - - - - - - - -2.68 2.02 2.14 1.94 - 3.74 2.41 3.23 - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - 1.92 0.68 - - - 0.5 - - - - - 0.22 - - - - 1.13 1.03 - - - -
Solyc05g041340.2.1 (Solyc05g041340)
-3.64 -1.42 - -2.4 -1.41 - - -6.99 - - - - -2.36 -1.01 -0.97 -0.28 0.95 5.07 - - -4.58 -3.6 -4.41 -3.26 -2.1 - -2.28 - -1.69 -3.26 -0.86 -2.12 -0.7 - -1.14 -0.26 - -1.41 -0.4 - - -2.11 -2.0 - -0.43 -3.99 - 2.52 0.18 -1.42 -4.14 - -2.05 1.52 -1.69 -1.81 -3.08 1.07
Solyc06g007950.2.1 (Solyc06g007950)
- - 0.67 - - - - - - - - - 2.07 0.85 - - - 0.97 - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.96 - - - 2.45 - - 3.79 - - 1.71 - 4.18 - - - -
Solyc06g031712.1.1 (Solyc06g031712)
- - 1.43 - - - - - -1.81 - - - - - - - - -0.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.74 2.43 - - 3.46 - - - - - - -0.74 - -0.23 0.03 4.95 - 0.08 - - - - -
Solyc07g016020.1.1 (Solyc07g016020)
2.86 0.09 1.33 -2.56 - -2.05 - - - - - - -1.65 3.13 0.75 0.81 0.83 4.56 -0.79 - - - - -4.68 - - - - - - - -2.52 -3.68 - - - - - - - - -3.55 -0.43 - -0.72 - - 1.98 -2.32 - - - 0.94 -0.97 - - - -
Solyc07g032395.1.1 (Solyc07g032395)
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g054810.1.1 (Solyc07g054810)
1.79 3.16 1.28 -4.41 - - - - -6.79 - - - -3.63 1.34 1.13 1.22 -2.89 3.49 2.96 2.58 -4.53 - -3.33 -2.63 -2.33 - -3.75 -3.38 -1.66 -3.7 -3.33 -3.59 -3.62 - - - - - - - -1.44 - - - - 0.7 -3.09 -2.65 -1.27 - -4.03 -2.27 0.31 2.07 - -4.01 -2.52 -0.14
Solyc08g016799.1.1 (Solyc08g016799)
- - - 2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.95 - - - - - - 0.4 - - - - - - 3.22 - 2.51 - 4.91 - - - - - - - - -1.59 - - - - -
Solyc08g021980.2.1 (Solyc08g021980)
- - - - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 3.19 - 1.07 - - - - - - 1.94 - - - - 1.99 - - - -
Solyc08g023320.1.1 (Solyc08g023320)
- - - - 4.42 - 2.21 - - - - - - - - - 2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.64 3.86 - - - - 2.07 2.11 - - - -1.05 - - - - -
Solyc08g036410.1.1 (Solyc08g036410)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.07 - - - - - - - - 4.54 - - - 0.25 - - - - -
Solyc08g043147.1.1 (Solyc08g043147)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g044470.1.1 (Solyc08g044470)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
Solyc08g059690.1.1 (Solyc08g059690)
- - - - 5.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - 1.03 - - - - -
Solyc08g066400.3.1 (Solyc08g066400)
- -2.89 - 1.13 -2.37 - - -5.95 - - - - -3.28 - - - 2.79 -5.14 - - -1.29 -2.32 -3.28 -3.2 -1.55 -0.04 - -1.15 0.47 0.2 -0.39 1.27 2.36 0.09 3.11 1.26 1.54 1.11 2.16 1.34 1.02 1.44 -0.26 -1.26 2.11 - - -3.09 -1.59 - - - -4.0 - - - - -
Solyc08g082790.3.1 (Solyc08g082790)
- - 1.57 - - - - - - - - - -2.51 -1.2 -2.66 -2.38 2.68 2.62 -2.96 - - - -5.21 -3.98 -4.38 -4.76 -5.0 -1.96 -3.53 -2.18 -5.16 -2.48 -3.1 0.65 2.08 -2.63 - -3.08 - -3.25 -1.74 0.52 - - 1.48 1.58 -0.19 2.65 - -3.03 - 3.39 2.71 1.14 - - - -3.3
Solyc09g005510.1.1 (Solyc09g005510)
2.24 1.64 2.79 - - 0.46 - -2.16 - -1.76 -1.94 -2.15 - 1.43 1.45 0.23 - -0.91 1.63 1.12 - - -1.33 -0.88 -2.5 -1.2 -1.56 - - - -0.25 -0.97 - - 0.31 - - - - - - - - - - -0.95 - 2.53 -0.02 - - - 1.31 3.82 - - - -
-3.55 - -3.26 2.16 -1.68 - - -4.81 -4.67 - - - -2.03 -5.87 - - 2.86 3.68 - -4.61 - - -1.5 -3.35 - - -5.83 - - - -2.52 -4.82 -5.81 -2.12 - - - - - - - -7.25 - - -3.08 -5.17 1.08 3.13 -1.85 -3.26 - 3.08 3.47 -0.52 - - - -
Solyc09g018610.1.1 (Solyc09g018610)
- - - - - - - - 4.97 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - -
Solyc09g059800.1.1 (Solyc09g059800)
- - - - - - - - - - - - - 3.09 2.56 1.42 - - - 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.3 4.0 - - - - - - - - - - 4.34 - - - -
Solyc09g060210.1.1 (Solyc09g060210)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g061490.1.1 (Solyc09g061490)
1.34 1.9 - -0.07 0.98 4.19 - 2.1 1.75 -0.61 1.14 0.85 0.42 1.19 0.89 1.22 -0.1 2.6 - - - - -0.44 -1.45 - - -1.56 - - - -1.44 -1.35 -1.31 - - - - - - - - -2.74 - - - - - - -0.58 - - - -4.58 - - - - -
Solyc09g061580.1.1 (Solyc09g061580)
- - - - - - 3.64 - - - - - - - - - - 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - - - - - - -
Solyc10g018700.1.1 (Solyc10g018700)
- - - - - - - - - 3.85 3.65 4.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g045480.1.1 (Solyc10g045480)
- -1.09 1.51 - - - - - - -2.82 - - -1.96 3.73 3.23 2.59 - -0.96 - -1.19 - - - - -2.39 - -1.58 -1.48 - -0.79 -0.26 -1.51 - - 0.36 - - - - - - -3.58 - - - 0.82 - 2.64 -0.57 - - - 2.88 2.21 - - - -
Solyc10g047767.1.1 (Solyc10g047767)
- - - - - - - - - - - - - - - 0.37 - 5.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.0 - - - 1.51 - - - - -
Solyc10g052565.1.1 (Solyc10g052565)
- - - - - - - - 2.2 - - - - - - - - 5.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - -0.35 - - - - -
Solyc10g052580.3.1 (Solyc10g052580)
- - - - - - - - -2.71 - - - - - - - 1.66 5.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.57 - - - - - - - - -
Solyc10g055330.3.1 (Solyc10g055330)
0.55 - -0.4 0.86 - - - - - 0.0 0.71 0.6 1.41 - - - - -1.75 - - -0.67 - - - - - - - - 0.52 - -0.59 - - - 0.92 1.87 2.3 - 2.94 2.91 0.27 - - 1.96 -0.01 - -0.88 2.48 - - - 0.56 2.25 - - - -
Solyc11g006290.2.1 (Solyc11g006290)
-5.96 -6.76 -4.02 -3.52 -0.54 0.41 -1.31 0.69 0.73 -1.36 -0.79 -0.8 -4.1 -2.76 -0.45 -2.47 0.68 4.25 - -7.14 1.15 2.52 1.73 2.37 1.2 -4.97 -0.57 -0.77 -4.16 -2.41 -1.72 -0.77 -0.96 - -3.53 - - -5.54 - -4.96 - -4.37 -4.18 -4.28 -3.69 0.83 -0.77 -1.69 -4.67 -5.41 - -5.09 0.26 -3.04 0.8 -1.68 -7.1 -0.61
Solyc12g009850.1.1 (Solyc12g009850)
-2.67 -1.5 2.02 1.3 1.41 -2.48 - -3.32 -3.55 - - - 3.81 -3.34 -0.94 0.11 3.95 3.14 -0.09 0.36 -0.42 - -2.79 -2.44 -3.37 -2.78 - -1.77 -1.95 -1.64 -1.46 -0.85 -1.32 - - - - - - - - -4.21 - - - - 0.1 - -0.28 - - - -3.95 - -2.06 - - -
- - - - 3.52 - - - 0.28 - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g044660.3.1 (Solyc12g044660)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.63 - - - 1.72 - - - - -
Solyc12g049610.1.1 (Solyc12g049610)
- - - - - - - - - 2.89 3.54 2.88 - - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - 1.02 1.06 - - - -0.14 2.83 - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.