Heatmap: Cluster_142 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg cell	Ovule	Uninucleate microspore (Col-0)	Uninucleate microspore (Ler-0)	Pollen (bicellular, Col-0)	Pollen (late bicellular, Col-0)	Pollen (bicellular, Ler-0)	Pollen (tricellular, Col-0)	Pollen (tricellular, Ler-0)	Pollen (mature, Col-0)	Pollen (mature, Ler-0)	Sperm	Pollen tube (Col-0)	Flower (receptacles)	Flower (floral buds)	Flower (sepals)	Flower (petals)	Flower (stamen filaments)	Flower (anthers)	Flower (carpels)	Flower (stigmatic tissue)	Pedicel	Axis of the inflorescence	Silique	Silique (senescent)	Pods of siliques	Pods of siliques (senescent)	Embryo	Endosperm	Seed	Seed (young)	Seed (germinating)	Seedling	Seedling (etiolated)	Meristem	Stem (internode)	Stem (internode, senescent)	Stems	Leaf (rosette)	Epidermis cells	Mature guard cells	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)	Root (apex)	Root (stele)	Root (QC cells)	Root (tip)
AT1G04640 (LIP2)	0.18	0.2	0.41	0.31	0.37	0.14	0.32	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.33	0.49	0.95	0.13	0.17	0.08	0.25	0.23	1.0	0.6	0.5	0.13	0.82	0.29	0.28	0.08	0.17	0.2	0.54	0.71	0.33	0.26	0.33	0.34	0.44	0.35	0.16	0.0	0.1	0.14	0.33	0.2	0.0	0.0	0.19
AT1G14150 (PQL1)	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.13	0.93	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.54	0.12	0.46	0.01	1.0	0.12	0.0	0.0	0.01	0.01	0.16	0.52	0.1	0.0	0.15	0.03	0.26	0.15	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G14345	0.01	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.1	0.74	0.16	0.25	0.06	0.14	0.14	0.61	0.32	0.54	0.01	1.0	0.2	0.19	0.03	0.0	0.12	0.24	0.55	0.16	0.12	0.26	0.08	0.24	0.16	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01
AT1G16880	0.01	0.14	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.48	0.98	0.31	0.26	0.05	0.14	0.33	0.49	0.17	0.51	0.02	1.0	0.39	0.06	0.02	0.0	0.06	0.22	0.35	0.27	0.07	0.2	0.12	0.27	0.4	0.29	0.01	0.06	0.04	0.05	0.07	0.02	0.02	0.05
AT1G18170	0.02	0.26	0.03	0.08	0.07	0.04	0.08	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.22	0.54	1.0	0.46	0.66	0.08	0.27	0.33	0.68	0.44	0.52	0.06	0.93	0.05	0.26	0.05	0.06	0.13	0.31	0.66	0.31	0.14	0.22	0.02	0.34	0.38	0.06	0.03	0.08	0.07	0.09	0.05	0.01	0.08	0.04
AT1G27480	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.26	0.99	0.26	0.29	0.1	0.13	0.25	0.63	0.26	0.47	0.03	1.0	0.55	0.05	0.05	0.0	0.03	0.28	0.63	0.21	0.07	0.19	0.17	0.4	0.15	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G31690	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT1G44920	0.17	0.3	0.08	0.05	0.08	0.06	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.24	1.0	0.3	0.35	0.12	0.38	0.47	0.92	0.51	0.56	0.05	0.88	0.26	0.34	0.11	0.04	0.3	0.46	0.48	0.36	0.26	0.36	0.21	0.42	0.26	0.02	0.0	0.06	0.05	0.1	0.06	0.0	0.0	0.06
AT1G54500	0.02	0.32	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.33	0.94	0.41	0.53	0.11	0.24	0.33	0.73	0.42	0.61	0.05	1.0	0.49	0.26	0.05	0.02	0.15	0.29	0.57	0.32	0.23	0.39	0.16	0.42	0.24	0.04	0.0	0.16	0.05	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01
AT1G60950 (FED A)	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.11	0.7	0.14	0.27	0.11	0.18	0.29	0.88	0.33	0.63	0.02	1.0	0.2	0.37	0.1	0.01	0.17	0.25	0.86	0.26	0.19	0.36	0.11	0.43	0.39	0.1	0.0	0.05	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02
AT1G66820	0.13	0.32	0.29	0.27	0.27	0.19	0.37	0.04	0.03	0.04	0.02	0.48	0.02	0.22	0.07	0.67	0.32	0.6	0.24	0.39	0.84	1.0	0.55	0.58	0.07	0.72	0.32	0.36	0.13	0.05	0.48	0.57	0.93	0.49	0.6	0.44	0.26	0.53	0.23	0.02	0.0	0.16	0.23	0.56	0.41	0.0	0.01	0.31
AT1G67090 (RBCS1A)	0.01	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.21	0.69	0.13	0.2	0.05	0.12	0.21	0.58	0.23	0.45	0.01	0.72	0.08	0.17	0.07	0.0	0.07	0.17	0.94	0.21	0.06	0.24	0.05	0.32	0.24	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT1G70760 (CRR23)	0.01	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.1	0.11	1.0	0.04	0.03	0.03	0.07	0.17	0.46	0.12	0.42	0.0	0.84	0.01	0.01	0.02	0.0	0.02	0.17	0.48	0.12	0.01	0.1	0.03	0.23	0.14	0.17	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.13	0.0
AT1G74070	0.06	0.26	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.29	0.24	0.77	0.11	0.11	0.23	0.26	0.23	1.0	0.44	0.5	0.01	0.79	0.06	0.4	0.19	0.0	0.12	0.28	0.67	0.18	0.21	0.47	0.1	0.28	0.17	0.02	0.0	0.03	0.02	0.04	0.03	0.0	0.0	0.01
AT1G78995	0.01	0.13	0.02	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.28	0.31	0.88	0.13	0.13	0.08	0.18	0.34	0.85	0.38	0.56	0.01	1.0	0.08	0.29	0.06	0.02	0.07	0.21	0.43	0.08	0.09	0.34	0.22	0.33	0.15	0.32	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.05	0.0	0.0
AT2G04700	0.28	0.28	0.3	0.31	0.35	0.25	0.33	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.34	0.71	0.99	0.32	0.36	0.09	0.24	0.35	0.58	0.33	0.62	0.1	1.0	0.47	0.24	0.24	0.09	0.15	0.29	0.52	0.27	0.17	0.36	0.29	0.6	0.3	0.41	0.05	0.14	0.16	0.13	0.07	0.16	0.12	0.11
AT2G21530	0.01	0.25	0.04	0.09	0.03	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.39	1.0	0.16	0.18	0.08	0.18	0.3	0.83	0.43	0.47	0.01	0.86	0.16	0.17	0.02	0.0	0.12	0.27	0.8	0.2	0.11	0.29	0.16	0.42	0.28	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT2G33855	0.03	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.2	0.12	1.0	0.32	0.7	0.12	0.33	0.79	0.82	0.59	0.6	0.16	0.99	0.35	0.19	0.03	0.18	0.2	0.46	0.43	0.19	0.33	0.74	0.3	0.35	0.19	0.02	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01
AT2G36835	0.3	0.43	0.68	0.4	0.53	0.26	0.36	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.55	0.32	1.0	0.46	0.59	0.25	0.4	0.65	0.66	0.4	0.68	0.21	0.99	0.74	0.46	0.11	0.21	0.3	0.35	0.61	0.42	0.18	0.48	0.51	0.57	0.52	0.11	0.04	0.38	0.26	0.32	0.14	0.0	0.26	0.21
AT2G37220	0.03	0.23	0.06	0.07	0.05	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.34	0.58	0.16	0.22	0.08	0.28	0.31	1.0	0.58	0.41	0.09	0.57	0.18	0.69	0.05	0.07	0.18	0.53	0.54	0.38	0.27	0.29	0.21	0.33	0.25	0.1	0.0	0.07	0.03	0.1	0.05	0.0	0.03	0.06
AT2G48070 (RPH1)	0.21	0.41	0.19	0.18	0.17	0.07	0.22	0.1	0.13	0.18	0.18	0.18	0.09	0.35	0.2	0.87	0.2	0.23	0.18	0.39	0.41	1.0	0.61	0.57	0.02	0.83	0.27	0.34	0.11	0.01	0.25	0.47	0.59	0.38	0.29	0.44	0.18	0.46	0.41	0.11	0.0	0.08	0.06	0.12	0.06	0.15	0.01	0.07
AT3G01440 (PQL1)	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.01	0.04	0.0	0.0	0.08	0.44	0.77	0.06	0.04	0.04	0.06	0.15	0.69	0.24	0.5	0.0	1.0	0.01	0.07	0.02	0.0	0.02	0.19	0.33	0.06	0.04	0.15	0.03	0.17	0.14	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G04550	0.02	0.14	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.23	0.43	0.61	0.08	0.14	0.06	0.17	0.2	1.0	0.53	0.32	0.03	0.57	0.22	0.24	0.07	0.02	0.09	0.32	0.53	0.22	0.15	0.21	0.22	0.37	0.19	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01
AT3G16250 (NDF4)	0.01	0.19	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.41	0.93	0.15	0.09	0.05	0.17	0.24	0.97	0.43	0.58	0.0	1.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.06	0.25	0.51	0.13	0.04	0.17	0.0	0.26	0.16	0.1	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G22210	0.01	0.19	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.22	1.0	0.21	0.27	0.07	0.22	0.42	0.62	0.38	0.57	0.02	0.83	0.15	0.03	0.0	0.0	0.19	0.18	0.22	0.11	0.14	0.4	0.08	0.2	0.09	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT3G44020	0.02	0.21	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.14	0.9	0.17	0.22	0.07	0.24	0.28	0.78	0.4	0.55	0.04	1.0	0.34	0.14	0.03	0.01	0.17	0.33	0.29	0.11	0.15	0.32	0.24	0.3	0.14	0.05	0.0	0.0	0.02	0.08	0.02	0.0	0.0	0.03
AT3G47070	0.04	0.13	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.05	0.81	0.13	0.14	0.08	0.11	0.26	0.54	0.19	0.58	0.05	1.0	0.13	0.1	0.01	0.05	0.09	0.21	0.46	0.13	0.09	0.23	0.04	0.33	0.2	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT3G55630 (DFD)	0.01	0.24	0.28	0.26	0.29	0.19	0.28	0.04	0.03	0.03	0.02	0.39	0.04	0.39	0.4	0.83	0.11	0.17	0.2	0.14	0.35	0.89	0.32	0.48	0.01	1.0	0.09	0.01	0.01	0.03	0.05	0.12	0.3	0.09	0.02	0.41	0.08	0.29	0.13	0.13	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.0
AT3G62410 (CP12)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.25	0.73	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.38	0.05	0.47	0.02	1.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.29	0.03	0.0	0.15	0.16	0.33	0.23	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
AT3G63160	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.09	0.81	0.02	0.02	0.04	0.06	0.14	0.72	0.15	0.49	0.05	0.99	0.02	0.01	0.0	0.03	0.01	0.17	1.0	0.37	0.04	0.11	0.04	0.31	0.34	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT4G00163	0.0	0.04	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.05	1.0	0.06	0.2	0.02	0.06	0.15	0.65	0.27	0.32	0.0	0.66	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.18	0.53	0.14	0.04	0.23	0.04	0.17	0.16	0.02	0.0	0.07	0.06	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0
AT4G00165	0.0	0.13	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.13	0.94	0.09	0.16	0.03	0.06	0.29	0.88	0.16	0.34	0.0	0.6	0.12	0.01	0.0	0.01	0.01	0.14	1.0	0.25	0.03	0.22	0.04	0.31	0.45	0.05	0.0	0.1	0.09	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT4G10300	0.06	0.24	0.11	0.12	0.11	0.05	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.16	1.0	0.29	0.33	0.1	0.22	0.41	0.54	0.29	0.51	0.07	0.79	0.4	0.13	0.02	0.04	0.22	0.24	0.27	0.09	0.15	0.29	0.2	0.3	0.12	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.04	0.03	0.0	0.04
AT4G12310 (CYP706A5)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.03	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.4	1.0	0.26	0.12	0.14	0.14	0.2	0.25	0.13	0.0	0.06	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.03
AT4G22830	0.12	0.43	0.15	0.11	0.17	0.25	0.21	0.03	0.03	0.01	0.02	0.0	0.01	0.47	0.22	0.92	0.56	0.6	0.22	0.45	0.47	1.0	0.71	0.58	0.05	0.76	0.11	0.55	0.24	0.03	0.26	0.49	0.68	0.31	0.52	0.6	0.34	0.62	0.39	0.17	0.0	0.02	0.03	0.09	0.07	0.0	0.0	0.05
AT5G20935	0.01	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.07	1.0	0.12	0.08	0.07	0.14	0.29	0.51	0.3	0.35	0.01	0.77	0.03	0.07	0.0	0.0	0.04	0.45	0.52	0.21	0.16	0.16	0.13	0.25	0.11	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
AT5G23920	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.4	0.57	0.49	0.41	0.17	0.07	0.33	0.33	0.17	0.05	0.01	0.04	0.02	0.12	0.04	0.01	0.01	0.2	0.44	0.32	0.12	0.37	0.15	0.31	0.19	0.04	0.0	1.0	0.15	0.01	0.11	0.0	0.0	0.01
AT5G38410	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.01	0.09	0.17	0.73	0.08	0.11	0.03	0.06	0.16	0.67	0.15	0.54	0.0	1.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.02	0.22	0.75	0.18	0.01	0.19	0.01	0.36	0.27	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G38420	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.15	0.58	0.01	0.01	0.0	0.03	0.08	0.39	0.05	0.52	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.18	0.71	0.28	0.0	0.1	0.0	0.23	0.3	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G38430	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.06	0.39	0.44	0.03	0.03	0.01	0.03	0.1	0.44	0.11	0.34	0.0	0.68	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.1	1.0	0.08	0.0	0.14	0.01	0.18	0.33	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G39210 (CRR7)	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.48	0.9	0.02	0.01	0.07	0.25	0.25	1.0	0.88	0.42	0.02	0.75	0.11	0.2	0.0	0.0	0.03	0.34	0.41	0.22	0.14	0.19	0.08	0.29	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AT5G52780	0.01	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.3	0.42	1.0	0.07	0.11	0.15	0.28	0.42	0.95	0.77	0.45	0.16	0.77	0.08	0.04	0.0	0.21	0.07	0.37	0.92	0.46	0.1	0.21	0.1	0.39	0.31	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
AT5G58260	0.0	0.11	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.17	0.95	0.02	0.02	0.04	0.1	0.14	0.74	0.21	0.51	0.01	1.0	0.07	0.0	0.01	0.0	0.03	0.25	0.41	0.13	0.03	0.16	0.08	0.28	0.14	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)