Heatmap: Cluster_178 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d000205 (GRMZM2G106683)
-0.5 0.38 0.77 0.14 0.38 -1.78 -1.61 -0.17 -1.28 -0.95 -0.42 -0.81 -1.04 0.68 -1.05 1.15 0.77 0.27 0.46 -2.63 0.51 0.48 -0.8 0.58 -0.09 -0.12 0.51 0.57 -0.89 1.26 -0.29 -0.21 -0.65 -0.18 -0.34 -0.5 -0.76
Zm00001d000311 (GRMZM2G138076)
-0.07 0.94 1.69 0.01 0.51 -1.22 -0.91 -0.09 -0.61 -0.51 -0.32 -0.35 0.08 0.38 -0.78 1.1 1.01 -0.36 0.22 -7.26 0.14 -0.29 -1.94 0.37 0.48 -1.3 0.79 -0.43 -0.54 0.41 0.14 -0.84 -1.84 -0.37 -0.24 -0.14 -1.5
Zm00001d002140 (GRMZM5G886765)
-0.11 0.45 0.41 0.19 0.16 -1.31 -0.97 -0.36 -1.42 -1.15 -0.43 -0.53 0.17 0.4 -0.87 0.59 0.74 0.14 0.31 -6.72 -0.17 -0.15 -0.22 0.74 -0.17 0.4 0.48 0.5 -2.38 1.48 -0.42 -0.46 -0.09 0.49 0.22 -0.48 -0.72
Zm00001d002235 (GRMZM2G001334)
-0.62 0.13 0.75 -0.12 0.62 -0.59 -0.67 -0.27 -0.17 -0.09 -0.29 -0.29 -1.38 0.74 -0.83 1.07 0.81 0.58 0.92 -1.69 -0.23 0.21 -0.6 -0.11 -0.32 -0.55 0.04 -0.15 -1.03 1.4 0.11 -2.64 -1.0 -0.43 -0.35 0.03 -0.12
Zm00001d002419 (GRMZM2G156581)
-0.14 0.41 0.05 -0.04 0.0 -1.2 -0.62 -0.05 -1.07 -1.01 -0.33 -0.33 0.94 0.11 -0.79 0.69 0.92 0.02 0.36 -3.84 -0.22 -0.27 -1.28 0.35 -0.14 -0.54 0.74 0.34 -1.94 1.09 0.45 -0.64 -0.19 0.26 0.6 -0.24 -0.08
Zm00001d002946 (GRMZM2G176881)
-0.91 -0.58 1.05 0.23 0.27 -0.74 -0.62 -0.13 -0.88 -0.72 -0.87 -0.38 0.15 0.32 -0.8 0.72 0.64 0.22 0.43 -1.46 0.03 0.82 -1.62 -0.02 0.05 0.06 0.07 0.46 0.14 1.28 -0.57 -1.2 -0.24 0.18 -0.07 -0.21 -0.58
Zm00001d003207 (GRMZM5G876621)
0.11 0.48 1.1 0.57 0.44 -0.63 -1.54 -0.36 -0.94 -0.81 -0.67 -0.58 -0.74 0.27 -0.41 0.62 0.47 0.21 0.13 -1.23 -0.17 -0.41 -1.24 0.27 -0.55 0.4 0.38 0.24 -0.88 1.23 0.04 -1.76 -0.17 -0.0 0.01 0.25 0.21
Zm00001d003223 (GRMZM2G139022)
-0.79 0.14 1.24 0.4 0.26 -0.56 -0.16 0.41 -0.69 -0.45 -0.43 -0.27 0.42 -0.1 -1.02 0.94 0.92 -0.26 0.66 -5.04 -0.72 -0.15 -1.41 0.13 -0.08 -0.81 0.28 0.33 -1.45 1.17 0.31 -1.51 -0.22 0.11 -0.76 -0.01 -0.17
Zm00001d003476 (GRMZM2G049568)
0.0 0.44 0.96 -0.35 0.4 -0.4 -0.6 -0.25 -0.93 -0.78 -0.07 -0.34 -0.19 -0.05 -1.32 0.9 0.84 -0.02 0.37 -5.52 -0.08 0.51 -0.4 -0.09 0.48 0.07 0.48 0.3 -1.97 1.12 -0.13 -3.17 -0.39 0.13 0.31 -0.17 -0.52
Zm00001d003851 (GRMZM2G422938)
-0.49 -0.07 1.64 0.51 0.72 -0.43 -0.53 -0.39 -0.95 -0.92 0.2 -0.31 -0.15 -0.0 -0.75 1.17 0.65 0.13 0.12 -1.58 -0.69 -0.61 0.26 0.37 -0.17 -0.06 0.39 -0.34 -1.45 0.47 -0.51 -2.68 -1.38 -0.58 0.9 0.11 -0.35
Zm00001d004132 (GRMZM2G177575)
0.6 -0.76 1.75 -1.09 0.88 -1.03 -1.29 -0.84 -1.13 -1.74 -1.22 -0.89 0.09 1.14 -1.03 1.37 0.39 0.77 1.24 -8.96 -0.04 -0.03 -1.44 -0.12 -0.11 0.32 0.44 -0.5 -0.83 -0.06 -0.22 -0.54 -1.4 -0.15 -0.86 0.02 -0.13
Zm00001d004152 (GRMZM2G106331)
0.28 0.44 0.79 -0.07 0.73 -0.87 -0.46 0.07 -1.04 -0.85 -0.12 -0.06 -0.43 0.94 -0.91 1.04 0.52 -0.41 -0.13 -6.24 0.38 -0.06 -0.09 0.43 0.19 0.41 0.27 -0.31 -3.0 0.9 -0.23 -2.75 -1.43 -0.12 0.42 -0.09 -0.18
Zm00001d004463 (GRMZM2G021849)
-0.62 -0.24 0.74 0.27 0.19 -0.31 -0.48 -0.2 -0.85 -0.97 -0.06 -0.32 0.12 0.63 -0.96 0.69 0.62 -0.12 0.66 -8.17 0.13 -0.2 -1.0 -0.3 -0.27 0.43 0.32 0.23 -4.3 1.83 0.37 -4.04 -0.61 0.14 -0.29 -0.07 0.13
Zm00001d004779 (GRMZM2G174919)
-0.75 0.33 0.11 0.23 -0.01 -0.39 -0.54 -0.64 -1.47 -1.27 0.05 -0.65 -0.33 0.95 -0.66 1.08 0.47 0.16 0.27 -0.28 -0.15 -0.14 -0.83 -0.26 -0.17 0.08 0.76 0.19 -0.83 1.62 -0.06 -1.28 -0.04 0.09 -0.86 -0.29 -0.07
Zm00001d005106 (GRMZM2G070284)
-1.37 -0.56 0.18 -0.11 0.03 -0.31 -0.28 0.05 -0.66 -0.36 0.18 -0.07 -1.25 0.25 -0.81 0.77 0.95 -0.27 0.27 -5.76 0.62 -0.24 -0.17 0.46 0.4 -0.34 -0.07 0.31 -1.3 1.09 0.26 -0.88 -0.04 0.37 0.05 0.21 0.17
Zm00001d005185 (GRMZM2G047316)
0.54 0.43 0.49 0.43 0.32 -2.2 -2.2 -0.44 -1.65 -1.65 -0.9 -0.46 0.01 0.35 -0.7 0.83 0.61 -0.04 0.15 -3.68 0.21 -0.32 -1.03 0.46 0.12 0.32 0.58 0.23 -1.54 1.25 0.42 -1.43 -0.16 0.31 1.01 -0.62 -0.47
Zm00001d005424 (GRMZM2G322661)
-0.63 0.0 1.58 0.56 0.67 -0.07 -0.17 0.03 -0.5 -0.47 -0.04 -0.31 -1.2 -0.12 -1.0 0.96 0.62 -0.12 -0.44 -4.37 -0.73 0.25 -0.39 0.13 0.09 0.12 0.35 -0.35 -1.41 0.71 0.15 -2.02 -0.76 -0.29 0.45 0.2 0.03
Zm00001d005647 (GRMZM2G150806)
-0.6 -0.7 0.51 -0.08 0.46 -0.67 -1.18 0.28 -1.31 -0.85 -0.72 -0.59 0.17 0.37 -0.6 1.16 0.82 -0.42 -0.08 -4.86 0.45 0.04 -0.88 0.6 -0.39 0.07 0.53 -0.29 -2.87 2.01 0.3 -2.57 -1.25 -1.09 -0.07 0.01 0.78
Zm00001d006350 (GRMZM2G057885)
-0.13 0.18 0.86 0.44 0.31 -0.86 -1.21 -0.05 -0.92 -0.61 -0.85 -0.52 -0.63 -0.13 -0.89 0.52 0.93 0.29 0.98 -5.41 -0.7 -0.4 0.04 0.64 -0.07 0.0 0.36 0.05 -1.73 1.53 -0.11 -1.5 -0.64 0.09 0.36 0.18 -0.6
Zm00001d006430 (GRMZM5G871936)
0.16 0.88 0.75 0.51 0.32 -1.22 -0.93 -0.38 -1.75 -1.7 0.01 -0.66 0.16 0.47 -1.05 0.74 0.85 0.35 0.82 -4.43 -0.74 -0.38 -1.07 0.18 -0.06 -0.07 0.86 0.61 -2.47 1.34 0.13 -2.84 -0.39 0.43 -0.95 -0.29 -0.82
Zm00001d006440 (GRMZM2G171613)
-0.65 -0.25 0.19 0.22 -0.1 -0.88 -0.3 -0.18 -0.65 -0.66 0.38 -0.08 0.03 -0.17 -0.99 0.75 1.01 -0.25 -0.0 -2.22 0.46 0.55 -0.07 1.08 0.4 0.31 -0.01 -0.33 -2.77 0.48 0.07 -2.21 -0.95 0.06 0.87 -0.15 0.04
Zm00001d006457 (GRMZM2G179505)
-0.18 -0.2 0.34 0.09 -0.01 -0.56 -0.42 -0.02 -1.26 -0.76 -0.24 -0.34 -0.27 -0.31 -0.82 0.33 1.1 0.07 0.78 -5.17 -0.03 0.44 -0.68 0.59 0.19 0.04 -0.15 0.19 -1.77 1.71 0.19 -2.21 -0.47 0.49 -0.14 -0.03 -0.24
Zm00001d006737 (GRMZM5G823629)
0.27 0.17 0.79 -0.16 0.43 -0.52 -0.27 -0.67 -0.58 -0.46 0.02 -0.35 -0.51 -0.37 -0.91 0.73 0.46 0.42 0.64 -4.02 -0.47 -0.28 0.17 -0.16 0.27 0.23 0.62 0.06 0.08 0.86 -0.18 -1.83 -0.65 0.16 0.59 -0.14 -0.74
Zm00001d007029 (GRMZM2G422576)
-0.08 -1.84 1.01 0.21 0.45 -0.59 -1.06 -0.19 -0.51 -0.77 -0.7 -0.51 -0.31 0.73 -0.13 1.51 0.93 0.48 0.72 -6.26 0.7 0.83 -1.09 0.24 0.73 -0.95 -0.24 -0.44 -1.06 -0.24 -0.89 -3.0 -1.65 -0.55 0.17 0.31 0.34
Zm00001d007455 (GRMZM2G090559)
-1.25 -0.71 1.07 0.71 0.28 -0.11 -0.21 -0.42 -1.35 -1.27 0.31 -0.48 -0.66 0.23 -1.29 0.95 0.85 -0.13 0.91 -1.73 -0.27 -0.25 -0.42 -0.02 -0.47 0.69 0.43 0.14 -2.72 1.5 -0.05 -2.14 -1.35 -0.24 0.01 0.13 -0.03
Zm00001d007575 (GRMZM2G135087)
-1.39 -0.04 0.89 -0.31 0.3 -0.75 -0.66 -0.4 -1.53 -1.07 -0.2 0.06 0.26 0.17 -0.9 1.13 0.84 0.35 0.2 -3.6 0.59 0.42 -1.91 0.64 0.88 -0.61 1.04 0.28 -1.05 0.62 -0.59 0.3 -0.94 -0.1 -0.83 -0.47 -0.71
Zm00001d007577 (GRMZM2G094959)
-0.75 0.27 0.29 -0.29 0.06 -0.83 -0.89 -0.11 -0.46 -0.53 -0.24 -0.1 0.44 0.41 -0.62 0.82 0.69 0.32 0.52 -7.04 0.09 0.56 -1.23 0.19 0.56 0.35 0.16 0.18 -1.76 1.12 -0.03 -2.07 -0.33 -0.18 0.0 0.12 -0.11
Zm00001d007640 (GRMZM2G001180)
-0.07 0.29 1.25 0.75 0.52 -0.76 -0.88 -0.45 -1.42 -1.43 -0.32 -0.67 -0.67 0.34 -1.1 0.83 0.68 0.41 0.14 -2.12 -0.51 0.02 -0.98 0.34 0.07 0.12 0.21 0.26 -1.29 1.13 -0.15 -0.31 -0.49 -0.07 -0.06 -0.27 0.18
Zm00001d008648 (GRMZM2G139369)
-0.55 0.11 0.45 0.26 0.23 -0.66 -0.64 -0.21 -1.16 -0.79 -0.66 -0.55 -0.75 0.05 -0.86 0.8 0.76 0.18 0.33 -5.65 -0.3 0.39 -0.2 0.63 -0.22 -0.05 -0.14 0.64 -0.24 1.34 0.05 -0.09 -0.26 -0.03 0.34 -0.03 -0.4
0.28 0.78 0.76 -0.3 0.2 -0.37 0.03 -0.26 -0.19 -0.43 0.05 -0.38 -0.06 -1.36 -0.86 0.58 0.6 0.21 0.54 -4.73 0.03 -0.25 -1.18 0.54 0.08 0.29 0.22 -0.66 -2.92 1.49 0.52 -4.18 -1.14 -0.25 0.51 0.08 -0.35
Zm00001d009317 (GRMZM2G302405)
0.04 0.76 0.38 0.35 -0.2 -0.57 -0.05 0.29 -0.45 -0.49 0.38 -0.51 -0.23 -1.28 -0.38 0.11 0.41 0.01 0.61 -5.56 -0.47 -0.2 -0.42 0.58 -0.39 0.08 -0.11 -0.76 -0.14 1.27 0.18 0.03 -0.93 0.15 0.74 0.17 -1.12
Zm00001d009396 (GRMZM2G142964)
-0.8 0.5 0.31 0.05 0.61 -0.59 -0.73 0.01 -0.48 -0.3 0.27 -0.06 -0.55 -0.94 -0.72 0.48 1.05 -0.31 0.46 -6.42 -0.23 -0.35 -0.29 0.16 0.12 -0.82 0.18 0.28 -0.8 1.61 0.45 -3.78 -0.05 0.23 0.37 -0.08 -0.43
Zm00001d009520 (GRMZM2G043764)
-0.05 -0.08 0.24 0.79 0.31 -0.77 -0.57 0.04 -1.58 -1.54 0.09 -0.15 0.56 0.15 -0.79 0.68 0.47 0.19 0.89 -4.99 -0.1 0.67 -0.68 -0.01 0.19 0.06 0.24 0.27 -2.86 1.43 0.11 -2.26 -0.52 0.03 -0.97 -0.17 -0.16
Zm00001d010710 (GRMZM2G060327)
-0.38 0.68 0.71 0.62 0.17 -0.71 -0.64 -0.33 -1.17 -0.89 -0.12 -0.62 -0.82 -0.08 -1.19 0.61 0.76 0.39 0.58 -4.17 -0.61 0.05 -0.42 0.31 -0.21 -0.12 0.2 -0.19 -1.41 1.98 0.26 -2.71 -0.86 0.09 0.01 -0.08 -0.03
-0.72 -0.51 0.68 -0.05 0.08 -0.81 -0.56 -0.09 -0.72 -0.6 0.56 -0.64 -0.09 0.05 -1.01 0.76 0.8 -0.07 0.56 -8.2 -0.11 0.12 -0.7 0.21 -0.11 0.53 0.1 0.49 -1.63 1.36 0.38 -2.18 -0.34 0.49 0.49 -0.1 -0.74
Zm00001d011037 (GRMZM2G005350)
-0.26 0.08 0.74 0.99 0.43 -0.64 -0.85 -0.22 -1.25 -1.06 0.14 -0.42 -0.04 -0.05 -0.67 0.39 1.0 0.11 0.03 -7.59 -0.15 0.29 -0.49 0.63 -0.33 0.19 -0.11 0.16 -3.21 1.25 -0.15 -1.11 -0.66 -0.0 0.43 0.09 0.07
Zm00001d011258 (GRMZM2G094039)
-1.32 0.35 0.44 -0.21 0.35 -0.9 -0.87 0.56 -0.83 -0.58 -0.34 -0.58 -1.72 0.19 -1.24 1.08 1.48 0.11 0.36 -3.58 0.67 0.1 -0.59 0.64 0.49 -0.07 0.1 -0.77 -0.98 1.52 0.34 -1.63 -2.37 -0.52 -0.61 -0.34 0.21
Zm00001d011329 (GRMZM2G157589)
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Zm00001d051136 (GRMZM2G162670)
-0.33 -0.22 0.52 0.93 0.26 -1.06 -0.95 -0.54 -1.24 -1.36 -0.18 -0.28 0.49 0.35 -0.91 0.83 0.39 0.18 0.39 -1.96 -0.72 0.18 -1.72 -0.5 0.21 0.74 0.15 0.44 -1.98 1.61 -0.1 -1.33 -0.27 0.61 -0.78 0.04 -0.06
Zm00001d051633 (GRMZM2G065044)
-1.13 -0.08 1.1 -0.24 0.34 0.19 -0.48 -0.56 -1.09 -0.61 0.28 -0.38 -1.27 0.34 -1.57 1.18 1.01 0.38 -0.21 -6.96 -0.53 0.35 -0.24 0.51 0.05 0.65 0.28 -0.06 -1.5 1.37 0.04 -2.95 -0.64 0.31 -0.8 -0.21 -0.39
Zm00001d051910 (GRMZM2G142806)
0.44 0.3 0.75 0.49 0.32 -0.76 -0.84 -0.44 -1.17 -1.2 -0.39 -0.49 0.44 0.2 -0.74 0.75 0.56 0.33 0.15 -3.33 0.08 -0.07 -0.6 -0.03 0.18 0.26 0.21 0.26 -0.57 1.09 0.08 -0.53 -0.38 -0.12 -0.2 -0.12 -0.44
Zm00001d052320 (GRMZM2G038667)
-0.27 0.09 1.42 0.29 0.33 -0.49 -0.39 -0.12 -0.57 -0.67 -0.13 -0.39 -0.52 0.34 -1.06 0.8 0.62 0.26 0.91 -0.77 -0.33 0.03 -1.38 0.03 0.23 0.23 0.07 -0.12 -2.47 1.03 -0.04 -3.17 -1.11 -0.2 0.41 -0.02 -0.52
Zm00001d052850 (GRMZM2G048665)
-0.49 0.05 0.12 -0.48 0.28 -1.54 -0.73 -0.33 -1.44 -1.23 -0.1 -0.15 0.33 0.93 -0.82 0.85 1.05 -0.21 0.2 -8.41 -0.03 0.09 -1.06 0.33 -0.02 -0.15 0.22 0.52 -1.05 1.49 0.22 0.64 -0.45 0.09 -1.33 -0.18 -0.17
Zm00001d052993 (GRMZM2G006780)
0.79 0.08 0.34 0.59 0.51 -1.3 -1.7 0.05 -1.96 -1.55 -0.46 -0.84 -0.04 0.9 -1.35 0.93 1.01 0.15 0.5 -5.47 -0.24 0.89 -1.68 0.14 -0.04 0.33 0.14 0.19 - 1.62 -0.01 -5.68 -0.25 -0.14 -0.75 -0.17 -0.38
0.51 0.08 0.42 0.78 0.63 -0.92 -1.49 -0.4 -1.82 -1.41 0.15 -0.72 -0.46 0.81 -1.2 0.58 0.74 0.39 0.97 -5.39 -1.1 0.64 -1.32 0.2 -0.32 0.64 -0.37 0.06 -1.8 1.27 -0.01 -2.43 -0.03 0.16 -0.07 -0.04 -0.19
Zm00001d053100 (GRMZM2G040720)
-0.48 0.08 1.38 0.18 0.55 -0.74 -0.69 -0.08 -0.94 -0.98 -0.82 -0.82 -1.64 0.36 -1.55 1.05 0.83 0.18 1.04 0.63 -0.24 -0.39 0.51 0.19 -0.18 0.4 -0.53 -0.61 -3.33 1.19 -0.01 -3.98 -1.17 -0.37 0.35 -0.49 -0.33
Zm00001d053200 (GRMZM2G096622)
-0.36 -0.15 0.92 0.39 0.12 -0.86 -0.83 -0.29 -1.05 -1.33 -0.35 -0.47 -0.15 0.13 -1.3 0.49 0.52 1.0 0.8 -1.38 -0.59 0.33 -0.61 0.32 0.42 -0.22 0.47 -0.05 -3.19 1.37 -0.06 -0.96 -0.84 -0.01 0.56 -0.36 -0.02
Zm00001d053548 (GRMZM2G121790)
0.54 -0.15 0.62 0.77 0.46 -0.66 -0.39 -0.2 -1.13 -1.03 -1.12 -0.49 -0.09 0.27 -0.65 0.65 0.68 -0.18 0.52 -2.3 -0.33 0.32 -0.59 0.37 -0.17 0.24 0.34 0.4 -5.3 1.24 -0.47 -1.82 -0.07 0.23 -0.29 0.06 0.15
Zm00001d053969 (GRMZM2G324863)
-0.68 0.44 1.07 -0.32 0.42 -0.69 -0.85 0.04 -0.75 -0.6 0.06 -0.47 -0.64 -0.06 -1.03 0.91 0.98 0.36 0.36 -7.71 -0.22 -0.22 -0.27 0.14 0.21 0.22 0.41 0.21 -3.04 0.89 0.0 -0.5 -0.32 0.16 0.28 -0.2 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.