1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
13.75 14.74 16.25 11.41 12.12
20.4 21.59 18.9 10.77 13.31
5.68 7.15 5.69 4.22 4.37
Ppi_g02077 (ARG1)
 7.32 8.83 12.37 7.63 10.89
102.87 139.54 139.38 91.39 96.29
167.61 184.6 285.54 198.42 190.55
Ppi_g02945 (PDV2)
 8.94 9.28 10.42 8.04 8.75
14.55 15.07 12.68 10.58 6.36
73.76 84.71 94.5 73.85 78.19
13.39 15.64 19.04 12.61 15.38
3.64 7.38 6.21 4.99 6.05
Ppi_g03720 (RFC2)
 12.19 12.9 15.37 10.93 9.71
4.63 6.25 6.09 4.88 5.61
Ppi_g03864 (PKP1)
 17.7 18.02 17.7 12.11 14.67
4.53 5.56 6.04 3.38 3.19
61.32 60.98 56.15 38.88 44.81
7.06 10.56 11.07 8.19 7.65
138.28 149.08 148.02 108.38 97.28
16.72 18.59 20.79 13.95 12.94
Ppi_g05601 (SUM1)
 300.02 371.35 332.18 260.24 287.64
Ppi_g06193 (RABH1e)
 133.34 135.75 159.66 97.8 118.25
67.63 71.39 63.65 54.11 44.72
Ppi_g06286 (OEP34)
 17.17 21.06 25.37 20.63 23.62
8.38 7.62 5.18 4.25 6.1
7.97 9.65 10.69 7.42 8.7
2.16 5.07 3.94 3.03 5.14
4.41 12.58 13.81 3.6 1.64
30.37 32.36 38.28 30.52 28.15
Ppi_g08370 (SYNC1)
 31.74 35.66 32.12 26.32 24.99
1.55 2.15 3.18 1.8 3.05
39.93 33.29 33.3 21.37 17.14
2.46 3.79 4.52 0.7 0.8
4.74 5.05 5.77 3.55 3.85
Ppi_g08869 (CYB-1)
 47.17 41.18 58.16 45.67 57.66
48.49 59.76 83.91 51.55 46.64
18.62 19.8 15.97 11.46 10.07
25.73 25.8 25.85 18.36 20.31
19.21 20.4 18.31 12.54 10.77
16.37 18.37 14.41 12.16 11.1
4.06 8.68 7.51 3.48 4.52
Ppi_g10730 (AGD2)
 10.03 13.69 11.9 8.04 6.08
26.52 23.45 24.32 16.48 16.85
21.27 20.42 25.72 15.05 12.22
8.86 9.61 12.22 9.95 9.07
Ppi_g11807 (ARA7)
 97.66 97.9 107.86 92.51 92.4
5.29 6.72 8.25 4.15 3.83
Ppi_g13710 (PAKRP1L)
 1.04 2.72 2.61 1.17 0.96
284.89 318.99 347.4 238.69 216.26
6.02 6.0 6.64 5.34 4.68
35.86 39.68 45.11 27.74 30.59
Ppi_g14669 (PHB1)
 49.1 57.66 58.4 56.41 57.08
Ppi_g14698 (ATSMO2)
 67.07 74.33 67.7 62.41 56.4
216.54 210.56 229.45 150.86 165.47
93.72 144.59 128.4 61.25 68.82
48.13 49.08 53.9 45.27 42.89
16.64 21.4 19.25 11.37 14.49
8.94 12.25 10.79 11.86 9.42
Ppi_g16576 (DCP5)
 11.18 10.95 11.12 10.26 10.06
10.64 10.81 11.63 10.28 8.39
2.6 3.95 4.08 3.36 3.3
13.12 20.86 26.14 13.5 15.86
100.96 129.39 128.69 88.4 93.95
101.39 111.08 108.79 100.29 106.99
17.86 19.16 18.93 16.65 15.18
1.86 3.42 3.45 0.99 1.55
40.05 33.54 57.1 13.49 5.43
3.33 11.63 13.91 2.89 1.04
0.49 2.01 1.54 0.95 0.18
Ppi_g25046 (NEDD1)
 2.66 3.05 5.18 3.58 2.44
4.46 4.57 6.56 2.67 2.16
50.62 60.21 66.09 46.67 52.76
9.85 10.72 7.66 4.22 3.43
Ppi_g28736 (ECR)
 14.22 26.82 28.45 12.15 11.37
12.44 15.0 14.24 9.08 9.5
16.74 22.52 21.41 19.88 19.25
11.28 12.24 14.1 10.03 7.61
22.5 22.31 18.3 12.94 8.82
25.03 19.81 20.86 14.42 12.65
10.06 15.53 20.95 11.21 10.81
Ppi_g31963 (UVR2)
 1.78 2.93 2.19 1.37 1.46
22.61 19.39 12.0 8.16 17.55
Ppi_g32173 (GLIP7)
 0.15 3.36 4.52 1.51 0.22
Ppi_g33113 (CYP704B1)
 1.27 6.07 7.72 1.75 1.23
Ppi_g33202 (BGLU42)
 24.48 20.53 31.59 19.72 26.1
15.21 17.27 18.22 7.6 11.2
Ppi_g33462 (DCA1)
 6.0 6.15 5.07 3.93 4.9
30.69 40.85 26.28 18.52 19.96
1.75 4.49 3.89 1.38 1.38
Ppi_g39011 (REV7)
 24.32 28.55 28.84 20.17 21.55
23.58 24.63 27.36 23.04 22.47
6.03 6.76 4.09 1.3 2.22
29.4 33.0 34.32 23.51 20.07
4.44 4.94 4.87 4.42 4.63
21.1 21.45 25.48 16.2 19.93
34.39 42.74 52.93 30.6 35.01
Ppi_g47542 (MAPR4)
 11.57 16.5 17.96 11.6 11.62
9.48 9.58 12.64 5.56 6.91
Ppi_g48686 (STG1)
 49.1 57.42 51.13 35.0 37.21
69.83 76.12 89.41 59.45 51.53
23.8 25.3 21.77 21.24 24.35
0.23 1.35 2.31 0.58 0.23
Ppi_g52248 (ORP4B)
 20.6 43.11 30.72 21.29 18.17
3.63 3.38 3.34 2.09 2.17
6.82 8.25 9.17 5.38 4.19
1.98 2.86 3.58 0.7 2.06
6.2 10.44 12.28 7.82 5.79
407.34 336.82 361.73 255.03 220.49
7.72 9.91 9.35 6.94 7.32
Ppi_g55949 (UGT85A1)
 7.86 8.78 12.32 4.47 6.05
2.45 3.14 3.15 2.3 2.81
8.23 8.83 7.58 7.16 6.44
19.25 24.31 29.05 19.52 22.24
1.4 2.66 2.57 1.3 1.04
35.6 36.55 37.82 21.79 31.0
51.21 55.13 53.27 46.93 48.62
0.87 5.5 4.3 2.11 1.48
0.48 3.02 2.88 0.73 0.0
0.88 2.99 2.07 0.7 0.07
22.12 21.8 22.14 17.68 11.01
2.48 3.74 2.89 1.48 1.24
5.28 8.64 6.29 2.88 4.21
3.14 2.14 2.08 1.33 2.04
1.79 2.71 2.98 1.6 1.45
Ppi_g62311 (RPL10B)
 320.94 351.37 393.71 298.43 268.48

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)