Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
20.62 23.89 42.22 50.5 57.84
Ppi_g00812 (TFIIS)
13.82 16.04 16.89 17.28 18.9
28.84 32.98 23.76 38.22 50.28
Ppi_g00913 (UNE2)
6.06 5.44 6.4 8.16 8.62
Ppi_g01001 (SYP124)
55.95 48.75 63.17 55.5 65.58
8.02 7.79 8.19 9.19 8.3
2.51 3.14 4.26 6.38 6.65
11.18 20.46 52.24 124.36 177.0
59.79 65.83 52.41 84.92 105.85
5.01 6.23 5.47 7.92 7.21
20.48 19.68 18.85 22.98 18.17
Ppi_g02284 (STOP1)
12.65 13.61 16.8 21.57 21.04
Ppi_g02348 (AFP3)
9.89 6.5 14.0 22.13 26.13
16.89 16.04 22.16 39.46 36.47
10.12 11.39 13.46 17.81 19.61
8.6 13.13 12.25 16.98 17.58
Ppi_g03704 (NAC032)
7.05 10.42 15.76 25.95 44.03
13.46 11.98 13.44 13.33 12.92
10.82 12.22 14.82 26.91 39.14
8.7 9.71 13.43 15.68 18.11
2.15 2.74 2.49 3.54 4.02
9.91 38.84 50.18 36.88 37.88
11.19 9.35 14.47 17.94 26.81
Ppi_g05941 (SSADH)
12.76 11.79 15.02 23.98 25.15
3.21 5.34 8.36 10.84 12.37
38.15 43.94 43.62 52.49 62.54
18.34 16.08 16.65 26.38 32.64
Ppi_g06933 (SK13)
8.23 10.71 12.28 11.76 12.5
0.55 1.62 4.73 2.81 4.11
69.81 36.88 59.46 79.16 83.87
17.21 16.26 16.21 26.88 28.07
Ppi_g07494 (HSFA6B)
16.65 10.11 23.63 22.61 26.17
12.73 14.29 12.52 19.93 20.41
18.62 24.14 39.86 62.72 73.79
23.82 19.16 23.07 29.99 26.03
Ppi_g08871 (VTC4)
8.19 29.58 71.7 74.65 87.08
3.77 2.82 2.8 4.34 3.73
Ppi_g10492 (WRKY20)
4.02 4.53 3.96 5.79 6.27
9.21 23.25 22.11 22.54 16.76
178.16 178.47 202.25 335.97 380.51
0.06 3.96 2.12 3.78 4.21
66.2 63.61 152.16 259.97 269.28
19.02 21.04 18.13 28.84 28.75
2.97 4.13 6.86 8.22 11.3
Ppi_g14433 (ICL)
0.68 0.76 2.98 5.11 6.17
Ppi_g15405 (DREB2)
8.81 9.08 15.55 23.31 32.11
392.78 461.02 1108.86 1312.27 1594.07
Ppi_g15530 (ARF16)
8.12 5.95 6.66 9.47 8.24
2.14 2.29 4.11 6.72 5.55
Ppi_g16469 (KT1)
5.47 5.39 8.43 11.47 7.28
Ppi_g16705 (CYP76C2)
8.01 7.12 11.86 9.91 10.66
14.97 16.0 20.54 29.9 30.57
13.18 12.5 13.38 17.5 24.16
0.91 2.81 4.59 5.02 3.64
0.22 1.28 5.08 8.53 9.48
55.85 24.02 82.19 82.75 49.75
0.89 0.5 5.13 5.58 8.96
2.62 3.12 3.52 4.99 5.24
5.37 3.62 4.59 6.26 7.17
2.33 0.45 0.94 3.26 6.46
2.78 7.92 17.12 10.06 19.72
278.89 269.67 481.18 1275.85 1683.85
Ppi_g24710 (UGT74D1)
0.24 1.2 5.19 6.36 3.63
0.0 0.14 73.78 54.56 118.56
3.08 3.17 2.82 3.61 5.77
27.29 35.73 35.9 48.07 31.77
6.52 6.73 9.0 14.29 21.48
20.83 17.47 21.96 35.55 28.51
2.36 6.35 6.21 11.75 19.42
11.29 15.1 19.46 32.1 27.99
2.71 3.76 3.88 3.86 3.84
41.79 29.04 44.69 60.24 88.65
0.0 0.13 5.18 0.99 3.83
74.91 67.31 76.51 103.94 115.22
Ppi_g30130 (E1 ALPHA)
16.54 20.57 27.21 42.46 49.24
3.42 2.3 4.11 9.24 11.42
7.71 9.24 14.0 27.12 25.33
0.71 1.26 3.22 4.05 2.84
55.27 56.89 85.97 102.99 125.58
73.97 72.69 82.54 110.55 132.32
Ppi_g31018 (ERD5)
2.23 2.53 2.63 4.73 3.75
31.1 19.98 46.98 62.75 64.07
0.24 0.96 7.44 8.69 11.01
Ppi_g32062 (DREB2C)
20.98 14.62 12.3 21.63 21.17
4.1 3.68 7.3 8.79 4.15
3.68 4.53 7.14 6.9 10.46
6.16 7.69 8.28 7.88 6.67
13.96 7.43 7.52 16.46 20.36
96.53 89.25 157.72 231.57 227.74
Ppi_g33126 (UGT85A7)
17.32 14.6 17.75 23.92 28.2
4.26 5.59 5.56 5.39 5.31
0.95 1.18 2.49 2.68 3.2
2.94 3.37 12.22 13.98 20.81
Ppi_g34821 (UBQ11)
2.74 3.5 3.11 7.77 9.18
Ppi_g36016 (PHO1)
0.81 1.62 2.83 2.23 3.95
0.86 2.01 3.17 1.96 1.49
0.4 1.22 1.48 1.47 3.99
3.23 3.88 2.67 4.86 5.04
3.66 4.96 4.0 7.81 6.68
59.95 55.02 72.2 113.45 139.52
Ppi_g44883 (CXE17)
1.74 11.88 18.82 22.85 22.91
Ppi_g45896 (PTS)
8.23 7.99 8.58 16.06 15.55
9.21 9.56 8.77 10.31 10.71
Ppi_g48059 (RPS15A)
0.0 0.16 2.44 2.09 3.81
12.68 14.59 23.83 40.22 41.5
2.92 3.48 3.23 4.73 3.01
68.66 31.84 74.84 87.01 135.99
7.01 7.86 9.34 10.42 13.99
0.81 1.24 14.44 14.57 16.45
73.97 106.88 164.42 282.97 250.53
96.85 93.39 212.92 411.38 445.44
0.89 0.91 4.24 3.53 7.83
12.63 15.53 19.27 42.11 38.34
Ppi_g55218 (MIZ1)
4.16 4.55 5.21 7.05 8.97
4.46 5.54 6.36 8.31 6.93
29.91 26.58 25.35 39.84 37.64
Ppi_g55556 (ABF2)
0.68 0.75 12.5 19.61 23.76
5.32 6.07 2.95 7.99 8.93
99.54 170.86 561.16 944.09 1348.91
3.55 3.47 3.51 5.2 4.41
Ppi_g57131 (SWEET2)
7.5 2.92 5.5 17.56 14.34
2.4 3.23 3.03 11.15 14.13
33.71 33.16 31.3 42.05 43.62
1.36 3.63 5.13 4.6 4.0
9.37 9.96 10.47 12.71 13.23
Ppi_g59254 (HSF1)
11.81 10.65 10.12 16.66 13.82
0.1 0.2 1.56 0.96 2.61
8.09 6.03 8.6 9.25 11.23
2.99 12.53 230.3 217.49 345.91
53.1 119.51 852.61 1135.73 1893.85
20.35 18.77 23.92 49.34 60.61
87.52 133.49 448.63 685.61 806.95
9.63 9.05 16.63 13.69 17.17
Ppi_g61374 (SAT-106)
6.62 7.37 16.73 20.0 29.73
0.0 0.0 1.98 0.79 1.58
10.45 10.9 14.82 24.22 29.93
2.52 5.06 5.19 4.56 4.61
2647.91 2100.86 3295.21 7384.82 10402.7
7.66 7.51 8.8 10.91 9.08
1.57 1.48 6.96 5.83 7.98
49.2 52.96 176.98 267.31 234.17

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)