Heatmap: Cluster_279 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
31.26 26.23 18.74 22.53 14.26
11.83 10.22 6.5 8.03 6.8
14.76 8.24 7.85 9.4 1.76
4.6 3.96 2.17 3.09 1.64
195.19 149.26 89.17 112.74 25.51
Ppi_g02441 (ORF107E)
5.95 5.08 0.8 3.34 1.06
17.64 14.67 7.06 10.65 4.02
Ppi_g04287 (CHUP1)
11.05 6.11 5.56 7.48 2.31
10.92 8.43 6.03 6.92 3.73
4.65 4.15 2.4 2.38 1.61
10.87 10.43 6.29 8.41 5.14
1.87 1.25 0.55 1.03 0.41
8.67 8.19 3.66 5.61 3.88
3.37 2.86 2.59 2.21 1.39
5.75 4.26 2.41 4.02 2.63
25.83 18.91 10.41 17.99 4.97
3.18 3.13 1.92 2.54 1.5
9.07 8.01 4.87 5.46 3.13
3.14 1.96 0.69 2.01 1.07
Ppi_g08235 (SOC1)
49.26 30.0 25.95 28.48 0.61
6.61 4.63 2.71 4.8 0.83
5.05 4.16 2.74 3.02 1.95
5.61 4.47 3.27 3.18 2.34
56.06 44.67 25.3 41.45 14.82
3.99 3.67 1.12 2.7 1.06
14.6 10.77 4.65 6.33 5.66
79.32 55.96 29.67 41.73 16.99
27.79 24.57 12.16 20.68 8.64
2.55 1.68 1.02 1.46 0.36
3.91 2.77 1.47 1.99 0.43
17.56 13.18 4.77 10.63 1.52
9.2 7.74 5.93 6.83 2.27
Ppi_g13692 (SAMT1)
15.83 17.68 13.35 12.62 9.85
3.83 2.66 1.08 3.04 0.18
2.27 1.52 0.82 1.01 0.83
3.46 2.21 0.62 2.18 0.24
7.75 5.66 1.83 4.08 1.62
4.28 3.3 2.24 2.93 1.02
Ppi_g16068 (SUFE1)
44.1 37.67 29.2 32.44 19.29
97.55 79.27 53.66 73.88 54.15
7.62 7.95 6.13 5.18 3.26
5.07 3.62 2.09 2.44 0.7
5.96 3.79 1.29 3.52 0.54
30.75 21.5 10.3 12.68 5.04
3.46 2.42 0.57 1.95 0.14
2.14 1.55 0.33 0.65 0.0
13.28 7.65 4.25 7.87 4.28
8.02 5.48 1.0 2.18 0.3
10.33 8.91 4.66 6.88 3.18
17.37 14.96 8.49 11.01 6.4
36.4 26.07 2.93 23.72 0.2
2.73 1.42 0.19 1.6 0.0
8.36 3.6 0.47 3.12 1.33
2.37 2.2 0.51 1.05 0.23
12.2 7.88 2.97 6.37 1.72
8.34 7.47 2.33 6.05 2.1
Ppi_g29916 (CRK8)
11.13 7.52 4.71 7.4 1.66
3.89 2.54 0.59 2.6 0.31
4.82 3.62 1.3 2.23 0.91
5.44 5.63 4.35 4.71 3.22
2.99 3.06 1.94 2.0 1.37
28.36 18.88 8.44 21.19 3.21
18.12 13.98 7.98 13.82 4.04
11.7 8.16 5.48 7.05 2.8
10.56 6.7 2.27 7.6 2.42
8.67 6.13 2.24 4.81 2.39
9.14 8.59 4.93 5.92 4.26
18.06 16.31 13.11 13.64 8.84
14.99 14.03 9.87 9.34 6.64
Ppi_g36007 (CRR22)
5.16 4.86 4.16 4.7 2.81
5.85 5.46 3.84 4.83 2.05
12.91 10.09 7.37 8.39 4.94
8.49 7.56 6.02 6.25 3.26
6.02 5.1 3.36 4.81 2.17
8.29 6.46 2.84 3.94 1.75
11.76 8.08 4.92 5.88 2.51
25.01 21.92 13.37 17.97 14.64
9.44 8.01 4.12 6.18 2.85
6.07 5.06 3.36 4.95 2.97
4.42 4.34 2.97 3.05 1.54
7.94 7.54 4.59 4.83 0.76
59.68 55.07 38.49 49.7 23.87
55.01 46.38 18.94 28.75 27.5
4.57 3.61 1.4 2.17 1.54
12.35 9.06 5.91 6.57 2.82
4.46 2.87 2.52 2.37 0.33
7.57 5.09 1.2 5.27 0.94
3.85 3.82 0.91 3.16 0.6
2.75 1.58 0.77 1.91 0.22
6.83 3.75 2.52 4.55 0.41
6.43 4.23 0.72 2.93 0.34
7.43 6.19 1.64 4.56 0.77
5.15 5.14 4.16 4.27 2.27
5.96 4.16 2.12 3.05 1.02
4.18 3.64 2.91 3.03 1.5
11.47 9.48 8.0 8.89 5.14
30.12 20.23 12.87 21.79 12.52
6.42 6.95 5.15 4.86 2.79
8.94 6.56 5.26 5.42 2.62
5.18 4.52 3.96 4.69 1.97
3.01 2.1 0.76 2.0 0.31
4.24 3.35 1.69 2.76 0.55
12.1 5.94 3.49 7.14 2.0
3.89 1.75 0.11 3.04 0.0
Ppi_g55199 (CRK8)
12.75 8.01 3.62 6.34 1.49
4.09 3.82 3.01 3.36 1.91
4.47 2.96 1.31 3.07 0.25
18.32 13.54 11.06 10.07 5.94
21.69 20.15 8.19 11.52 6.94
10.18 8.58 2.37 5.22 3.08
5.95 4.93 2.38 4.14 1.86
Ppi_g57182 (UGT85A1)
9.98 6.64 0.93 4.22 0.08
4.78 2.84 0.98 2.91 0.33
2.61 2.13 0.79 1.47 0.32
2.39 1.76 0.11 1.77 0.19
11.02 9.09 7.59 8.15 3.22
5.52 5.03 2.14 3.65 1.2
2.93 2.46 1.77 1.84 1.27
16.21 10.95 4.13 10.5 1.2
4.45 4.54 3.77 3.55 1.49
4.17 4.34 2.7 2.54 1.56
11.94 8.45 3.46 6.29 3.41
4.23 3.67 1.33 2.25 0.69
Ppi_g62332 (PDR12)
3.4 1.77 1.7 2.13 0.07
12.71 10.69 6.33 11.01 4.64
16.48 11.77 5.32 8.4 1.18
3.38 4.2 1.46 2.4 0.66
Ppi_g63150 (EMB86)
11.58 8.81 2.98 4.6 2.93
15.97 10.5 4.17 7.12 1.42
4.3 2.24 0.97 1.89 0.16

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)