Heatmap: Cluster_213 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
39.83 27.88 6.53 9.03 5.08
76.31 52.91 29.71 18.6 10.59
Ppi_g00398 (RPL9)
76.81 53.54 25.16 13.49 10.35
Ppi_g00448 (FKBP13)
99.11 70.97 22.36 9.89 5.62
122.36 97.97 45.38 41.15 20.62
143.55 106.34 49.86 32.85 17.96
24.77 20.15 9.89 6.69 4.92
24.76 19.08 7.85 6.42 6.86
109.9 77.27 29.79 23.38 12.44
36.81 27.59 11.65 10.87 9.42
Ppi_g00735 (RPL15)
134.99 100.56 28.57 18.66 11.84
13.76 11.01 7.41 5.65 5.8
12.95 10.25 4.75 2.0 0.49
20.08 16.47 3.56 2.14 0.71
33.95 29.53 14.98 11.85 8.45
Ppi_g00841 (HCF136)
47.91 37.9 12.13 7.57 4.38
Ppi_g00842 (CA1)
769.62 487.56 76.3 47.11 34.29
258.49 209.86 63.89 40.96 22.65
Ppi_g01146 (STN8)
17.15 11.97 4.35 2.67 0.67
30.88 24.91 11.03 4.13 1.16
43.51 36.71 19.09 17.71 10.45
37.33 26.72 10.42 7.63 5.27
109.7 80.26 39.92 23.14 18.73
362.3 279.54 183.13 111.81 122.06
Ppi_g02835 (CP31)
100.81 84.35 37.73 27.89 23.21
Ppi_g03016 (BAS1)
13.02 9.67 4.93 4.41 3.17
Ppi_g03585 (GPX7)
213.71 170.16 73.77 54.43 32.59
Ppi_g05695 (RPS1)
131.14 100.51 40.69 34.18 15.97
Ppi_g05762 (SUFS)
28.93 23.74 15.09 11.75 10.5
73.93 60.17 12.92 6.67 2.48
112.94 87.33 42.55 39.08 27.17
31.14 24.46 15.9 12.01 10.07
225.79 166.08 106.21 89.88 63.1
27.84 21.08 9.62 8.67 3.57
246.33 186.78 61.02 35.49 10.54
Ppi_g08994 (CDF1)
28.15 21.53 16.55 12.05 11.53
90.51 73.22 45.5 24.09 20.93
6.18 4.91 1.14 1.11 0.34
Ppi_g09288 (LEJ1)
65.63 57.62 21.34 22.07 18.25
144.01 110.6 71.08 48.81 22.98
Ppi_g10001 (CRB)
248.66 176.24 42.51 22.98 2.27
13.64 12.52 2.85 2.75 1.46
17.33 13.24 6.3 5.06 2.31
219.34 157.03 53.1 37.51 14.12
Ppi_g11153 (PETE2)
1645.02 1210.54 332.67 128.25 8.01
106.28 82.46 33.07 21.6 13.54
Ppi_g11794 (emb1473)
48.28 37.13 17.4 11.81 8.27
211.98 161.55 78.04 45.84 19.24
Ppi_g12249 (HEMC)
60.63 52.61 30.25 26.16 13.58
115.35 98.26 33.04 17.25 11.36
23.97 17.19 5.67 5.04 1.83
Ppi_g13143 (CPN21)
146.43 123.43 67.64 41.92 27.56
1208.79 813.46 324.66 100.46 13.38
85.02 70.86 12.16 14.99 11.05
16.82 11.3 4.57 2.12 1.26
Ppi_g14751 (CRR6)
11.41 9.74 3.21 1.52 0.92
Ppi_g15327 (CSD2)
513.01 361.95 170.55 123.49 85.81
32.09 28.51 10.93 13.73 8.05
Ppi_g15587 (RPH1)
53.33 39.43 14.84 11.98 8.13
Ppi_g15929 (RPL4)
37.76 28.26 14.16 8.35 4.12
242.88 178.32 37.55 31.79 9.95
9.72 8.47 1.86 2.07 1.53
Ppi_g16597 (PHR2)
92.48 70.96 25.88 20.92 12.4
Ppi_g16649 (SPPL1)
25.93 20.13 6.01 5.63 1.51
11.48 10.07 5.98 4.05 3.62
Ppi_g17470 (AGT)
192.5 149.08 24.36 29.96 19.0
Ppi_g17567 (TLP18.3)
251.38 173.08 55.55 27.67 7.37
197.75 183.19 86.89 75.83 52.97
Ppi_g18284 (LHCA2)
1416.94 936.2 342.55 162.68 22.97
304.98 240.34 141.36 118.36 87.36
Ppi_g18476 (SVR1)
11.52 10.4 4.57 4.38 2.05
Ppi_g18504 (ACSF)
426.5 288.48 156.37 60.7 13.64
338.32 247.07 94.25 45.37 33.59
35.8 28.44 10.59 11.12 5.78
7.34 6.08 1.82 1.94 1.36
21.08 18.63 0.8 0.03 0.0
85.08 68.47 34.64 31.12 21.86
80.42 64.87 22.11 12.08 12.34
81.68 60.28 23.48 21.88 12.36
Ppi_g27216 (PDF1A)
47.28 33.94 10.43 9.15 1.98
43.41 33.24 11.74 5.0 1.32
214.38 187.11 78.66 43.15 22.89
24.13 19.08 8.0 7.57 6.03
16.16 12.98 5.94 3.59 4.13
Ppi_g30450 (PSRP6)
90.82 79.69 39.1 29.43 13.32
Ppi_g30788 (CXIP2)
65.12 48.74 16.79 15.55 10.55
Ppi_g31046 (EGY2)
18.56 13.97 5.22 3.71 1.94
60.69 57.62 3.14 3.95 0.05
Ppi_g31514 (YLMG2)
19.42 14.93 5.66 2.76 1.1
10.88 9.34 2.93 2.62 0.84
1421.24 1070.97 334.68 285.7 106.25
Ppi_g32919 (CLPP4)
35.8 31.96 17.39 14.08 10.87
Ppi_g33020 (ATF1)
111.58 91.84 45.28 24.54 9.32
59.31 43.79 17.03 16.6 6.83
169.8 144.13 67.65 55.63 28.5
Ppi_g39760 (GPX7)
43.5 30.14 7.82 4.84 1.39
116.59 94.6 35.8 26.41 13.14
22.46 16.53 4.3 3.6 2.74
Ppi_g42655 (OEC33)
1072.44 719.08 270.71 175.38 23.43
10.23 8.13 4.56 2.43 3.02
270.88 211.85 45.47 45.04 18.15
56.99 43.5 22.55 10.19 2.96
36.86 26.24 7.36 2.59 3.14
Ppi_g52142 (NDH-O)
223.56 161.53 49.99 52.1 22.92
53.39 46.38 24.95 23.06 14.7
Ppi_g57412 (emb2726)
46.97 33.93 12.3 10.77 2.17
Ppi_g57764 (OE23)
291.45 212.41 51.11 33.73 16.8
Ppi_g58111 (AAC3)
469.25 356.79 216.42 128.21 88.74
75.65 52.28 17.6 14.12 2.74
Ppi_g60381 (PPL1)
39.31 29.95 11.35 7.54 3.36
74.75 55.57 10.83 8.83 4.07
Ppi_g61036 (FLN1)
11.98 10.42 3.01 3.51 2.93
58.44 45.22 13.81 8.63 5.15
23.44 21.17 11.26 5.37 3.76

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)