Heatmap: Cluster_273 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.46 0.7 -0.43 -0.12 -1.61
0.28 0.34 -0.38 0.07 -0.53
Ppi_g00711 (CLPP3)
0.37 0.08 0.11 -0.05 -0.73
0.27 0.22 -0.1 0.15 -0.78
0.11 0.17 0.08 -0.03 -0.39
0.18 0.07 -0.11 0.08 -0.26
Ppi_g01513 (MIA40)
0.33 0.22 -0.04 -0.03 -0.67
0.39 0.38 -0.17 0.06 -1.14
-0.2 0.16 0.24 0.12 -0.42
Ppi_g02854 (NAGK)
0.44 0.14 0.0 0.05 -1.01
Ppi_g03107 (APO2)
0.31 0.29 -0.17 -0.06 -0.53
Ppi_g03237 (RVE1)
0.38 -0.04 -0.37 0.19 -0.3
0.28 0.1 0.04 -0.07 -0.46
Ppi_g03881 (VAC1)
0.16 0.26 0.07 0.1 -0.83
0.19 0.16 0.04 -0.05 -0.43
0.13 0.69 0.1 -0.25 -1.4
0.44 0.13 -0.1 -0.01 -0.68
0.58 0.28 -0.17 -0.01 -1.29
Ppi_g04458 (APO1)
0.34 0.11 -0.12 0.18 -0.74
-0.1 0.06 0.02 0.2 -0.22
0.38 0.17 0.25 -0.17 -1.02
0.34 0.06 0.24 -0.07 -0.85
Ppi_g04599 (AIM1)
0.35 0.44 -0.08 0.06 -1.4
0.54 0.16 -0.25 -0.09 -0.64
Ppi_g04939 (TAF9)
0.07 0.16 -0.04 0.26 -0.6
0.44 0.17 -0.06 -0.16 -0.59
0.53 0.23 -0.08 -0.0 -1.19
0.16 0.21 0.03 0.08 -0.63
0.38 0.11 -0.09 0.07 -0.66
0.16 0.24 -0.1 -0.09 -0.27
0.54 0.23 -0.05 0.15 -1.8
0.09 -0.03 -0.05 0.2 -0.25
0.47 0.43 -0.04 0.06 -2.0
0.23 0.27 -0.19 0.22 -0.78
Ppi_g09505 (BAM1)
0.4 0.27 -0.06 0.13 -1.25
Ppi_g09699 (COQ3)
0.26 0.21 0.02 0.04 -0.74
0.19 0.28 0.22 0.07 -1.21
Ppi_g10995 (NF-YB13)
0.34 0.29 -0.07 0.12 -1.09
Ppi_g11000 (CRR22)
0.64 0.31 -0.09 -0.32 -1.12
0.33 0.33 -0.12 0.13 -1.08
0.52 0.76 -0.55 0.18 -4.22
1.12 0.22 -0.59 0.0 -
0.14 0.3 0.19 -0.05 -0.84
Ppi_g12514 (LAF3)
0.27 0.21 0.03 -0.01 -0.7
0.0 0.11 -0.04 0.08 -0.17
0.12 0.19 0.03 0.05 -0.48
0.15 0.12 -0.2 -0.04 -0.06
0.28 0.06 -0.14 0.17 -0.49
0.48 0.21 -0.14 0.03 -0.94
0.27 0.51 0.41 0.03 -5.14
0.88 0.39 -0.22 -0.53 -1.74
Ppi_g14921 (RIF1)
0.43 0.25 -0.05 -0.01 -0.99
0.31 0.08 -0.23 0.02 -0.25
-1.05 0.83 0.39 0.39 -3.18
0.5 0.6 -0.33 -0.08 -1.58
Ppi_g17262 (GRP4)
0.3 0.23 0.11 -0.1 -0.77
-0.5 0.77 0.2 0.08 -1.37
0.34 0.19 0.34 -0.0 -1.63
Ppi_g17920 (GRP4)
0.16 0.17 -0.03 0.07 -0.47
0.35 0.28 0.23 0.01 -1.56
0.47 0.13 -0.09 -0.12 -0.6
0.12 0.28 0.1 -0.1 -0.53
0.42 0.33 -0.08 0.03 -1.2
0.5 0.37 -0.32 -0.09 -0.86
0.46 0.16 -0.13 0.0 -0.75
0.77 -0.18 -0.14 -0.2 -0.65
0.65 0.36 -0.2 -0.25 -1.2
0.23 0.44 -0.09 -0.05 -0.83
0.5 0.53 -0.29 0.02 -1.7
-0.13 0.57 -0.35 0.37 -0.94
Ppi_g29461 (CFM2)
0.38 0.24 -0.04 0.13 -1.14
0.48 0.27 -0.0 -0.2 -0.89
0.5 0.81 -0.78 -0.08 -1.71
0.31 0.18 -0.05 0.23 -1.01
0.41 0.21 -0.04 -0.04 -0.81
0.21 0.26 0.03 0.05 -0.78
Ppi_g31654 (PAL4)
0.91 -0.01 -0.48 0.36 -2.9
Ppi_g31674 (LOX3)
0.29 0.54 0.29 0.11 -5.22
Ppi_g31848 (CPK4)
0.22 0.17 0.18 -0.2 -0.5
0.34 0.05 -0.05 0.15 -0.68
0.19 0.22 0.31 0.11 -1.45
0.73 0.25 -0.77 0.11 -1.02
0.28 0.16 -0.05 -0.02 -0.47
0.5 0.59 -0.09 -0.3 -1.58
0.21 0.28 -0.2 -0.01 -0.38
0.5 -0.01 -0.06 0.05 -0.74
1.07 0.32 -1.42 0.02 -1.89
0.37 0.16 0.17 -0.22 -0.72
0.57 0.34 -0.22 -0.07 -1.16
0.24 0.1 0.09 -0.04 -0.49
Ppi_g43252 (ACN1)
0.52 0.24 -0.0 -0.06 -1.22
0.47 0.56 -0.32 -0.0 -1.53
0.2 0.31 -0.06 0.24 -1.09
0.73 0.53 -0.28 -0.28 -1.96
0.33 0.13 -0.25 0.12 -0.49
0.19 0.06 -0.09 0.01 -0.19
Ppi_g46380 (Phox2)
0.22 0.15 0.07 -0.03 -0.52
0.56 0.35 -0.36 0.03 -1.16
0.59 0.16 -0.01 -0.06 -1.23
0.49 0.3 0.04 -0.22 -1.08
Ppi_g48560 (EMB2654)
0.08 0.31 0.0 0.09 -0.64
0.61 0.36 -0.06 -0.36 -1.12
0.56 -0.0 -0.25 0.13 -0.76
0.61 0.03 -0.07 -0.08 -0.86
0.73 0.22 -0.04 -0.45 -1.07
0.27 0.17 -0.01 0.09 -0.72
Ppi_g52244 (RPAC43)
-0.1 0.17 0.18 0.14 -0.48
0.6 0.37 -0.29 -0.21 -0.96
0.24 0.46 0.04 -0.19 -0.9
0.62 0.59 -0.3 0.12 -4.1
0.43 0.24 -0.24 -0.23 -0.38
Ppi_g53680 (DSPTP1)
0.22 0.12 -0.04 -0.12 -0.23
0.59 0.15 -0.34 0.03 -0.8
Ppi_g53962 (CRR22)
0.54 0.29 -0.12 -0.07 -1.15
0.29 0.6 -0.62 0.57 -3.0
0.21 0.2 -0.13 0.1 -0.5
0.68 -0.12 -1.22 0.75 -1.46
Ppi_g54773 (MS2)
0.62 0.35 -0.08 0.21 -3.6
0.56 0.23 -0.27 0.04 -0.99
0.37 0.46 0.28 -0.44 -1.39
0.79 0.18 0.15 -0.26 -2.36
0.93 0.41 -0.92 0.08 -2.55
0.11 0.09 0.04 0.11 -0.42
0.54 0.13 -0.09 -0.42 -0.39
1.01 -0.0 0.02 -0.4 -2.28
0.84 0.41 -0.72 -0.09 -1.56
0.17 0.29 -0.23 0.03 -0.35
1.08 0.4 -0.74 -0.36 -2.4
Ppi_g58226 (UBQ11)
0.11 0.32 0.03 -0.18 -0.37
-0.03 0.86 0.21 -0.1 -3.13
0.42 0.49 -0.32 0.07 -1.29
0.39 0.19 -0.07 0.09 -0.9
0.65 0.24 -0.61 -0.03 -0.71
0.1 0.35 0.08 0.17 -1.11
0.87 0.4 -0.31 -0.43 -1.71
0.51 0.52 -0.37 -0.37 -0.74
0.38 0.24 -0.11 0.12 -0.99
Ppi_g62620 (CRL)
0.57 0.45 -0.45 -0.05 -1.12
0.42 0.61 0.07 0.0 -3.48
0.54 0.27 -0.13 -0.02 -1.2
0.6 0.22 0.18 -0.31 -1.43
0.91 -0.75 0.06 0.29 -1.99

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.