Heatmap: Cluster_190 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.04 0.31 1.0 0.27 0.66
Ppi_g03116 (IP5PII)
0.33 0.49 1.0 0.63 0.57
Ppi_g03262 (VPS54)
0.52 0.64 1.0 0.7 0.72
Ppi_g03754 (CSY4)
0.68 0.81 1.0 0.73 0.8
Ppi_g03997 (PI4KBETA1)
0.57 0.72 1.0 0.75 0.75
0.32 0.44 1.0 0.49 0.38
0.46 0.56 1.0 0.78 0.52
Ppi_g04428 (PSY)
0.2 0.34 1.0 0.49 0.27
0.58 0.62 1.0 0.81 0.68
0.56 0.72 1.0 0.75 0.68
0.26 0.48 1.0 0.69 0.39
0.01 0.24 1.0 0.89 0.34
0.56 0.66 1.0 0.68 0.6
0.27 0.58 1.0 0.45 0.57
0.42 0.73 1.0 0.64 0.56
0.3 0.44 1.0 0.52 0.52
0.16 0.21 1.0 0.29 0.07
0.11 0.12 1.0 0.4 0.14
0.12 0.31 1.0 0.56 0.25
0.02 0.17 1.0 0.48 0.09
0.18 0.34 1.0 0.41 0.55
Ppi_g10575 (SAMDC)
0.13 0.27 1.0 0.47 0.25
0.3 0.54 1.0 0.36 0.03
0.04 0.33 1.0 0.04 0.41
0.07 0.1 1.0 0.23 0.18
Ppi_g13224 (HMG)
0.25 0.51 1.0 0.48 0.36
0.17 0.44 1.0 0.29 0.36
0.3 0.41 1.0 0.72 0.41
0.71 0.7 1.0 0.89 0.77
Ppi_g15418 (MIA)
0.65 0.73 1.0 0.78 0.74
0.02 0.14 1.0 0.81 0.37
0.41 0.56 1.0 0.65 0.57
0.39 0.43 1.0 0.51 0.5
0.62 0.79 1.0 0.71 0.71
0.1 0.12 1.0 0.27 0.14
0.58 0.66 1.0 0.7 0.64
Ppi_g17665 (FUT2)
0.14 0.25 1.0 0.44 0.12
Ppi_g17949 (VEP1)
0.47 0.61 1.0 0.68 0.46
0.44 0.67 1.0 0.64 0.63
0.0 0.18 1.0 0.23 0.23
Ppi_g18743 (APC8)
0.53 0.66 1.0 0.72 0.57
0.15 0.21 1.0 0.38 0.34
0.04 0.02 1.0 0.18 0.19
0.09 0.13 1.0 0.38 0.28
0.24 0.31 1.0 0.26 0.29
0.31 0.47 1.0 0.39 0.31
Ppi_g22247 (GC5)
0.41 0.62 1.0 0.64 0.61
0.24 0.45 1.0 0.42 0.09
0.0 0.0 1.0 0.2 0.32
0.27 0.14 1.0 0.35 0.19
0.08 0.1 1.0 0.37 0.06
0.29 0.09 1.0 0.56 0.02
Ppi_g30887 (UGT85A1)
0.21 0.15 1.0 0.84 0.28
0.23 0.2 1.0 0.36 0.17
0.07 0.37 1.0 0.49 0.29
0.0 0.06 1.0 0.28 0.22
Ppi_g32577 (EMB2777)
0.6 0.73 1.0 0.73 0.61
0.32 0.28 1.0 0.38 0.09
0.07 0.03 1.0 0.2 0.17
0.3 0.39 1.0 0.51 0.1
0.54 0.7 1.0 0.7 0.62
0.23 0.51 1.0 0.35 0.33
0.02 0.07 1.0 0.46 0.27
0.61 0.61 1.0 0.75 0.39
0.04 0.12 1.0 0.12 0.18
0.0 0.01 1.0 0.13 0.18
0.0 0.01 1.0 0.21 0.18
Ppi_g39534 (ANR1)
0.24 0.25 1.0 0.51 0.42
0.08 0.41 1.0 0.38 0.18
0.0 0.02 1.0 0.27 0.24
0.0 0.07 1.0 0.17 0.36
0.0 0.02 1.0 0.16 0.3
0.0 0.0 1.0 0.17 0.3
0.13 0.41 1.0 0.34 0.41
Ppi_g45119 (UCC1)
0.0 0.05 1.0 0.17 0.55
0.0 0.0 1.0 0.6 0.21
0.4 0.45 1.0 0.36 0.23
0.36 0.58 1.0 0.59 0.64
Ppi_g47997 (PK1B)
0.05 0.47 1.0 0.18 0.36
Ppi_g48205 (XTH16)
0.03 0.11 1.0 0.45 0.1
Ppi_g48621 (ACA7)
0.01 0.05 1.0 0.23 0.3
0.35 0.5 1.0 0.69 0.51
0.08 0.0 1.0 0.18 0.24
0.0 0.0 1.0 0.0 0.22
0.05 0.05 1.0 0.08 0.13
Ppi_g52231 (TT7)
0.25 0.36 1.0 0.87 0.43
0.32 0.36 1.0 0.64 0.38
0.16 0.0 1.0 0.37 0.28
0.12 0.39 1.0 0.56 0.43
0.34 0.4 1.0 0.67 0.53
Ppi_g54662 (ROF2)
0.57 0.72 1.0 0.7 0.59
0.16 0.59 1.0 0.46 0.54
0.11 0.21 1.0 0.1 0.24
0.07 0.59 1.0 0.22 0.32
0.28 0.08 1.0 0.48 0.06
0.24 0.36 1.0 0.49 0.33
0.12 0.05 1.0 0.27 0.02
0.0 0.51 1.0 0.29 0.4
0.0 0.06 1.0 0.33 0.29
0.17 0.36 1.0 0.49 0.1
0.34 0.29 1.0 0.4 0.19
0.18 0.48 1.0 0.43 0.73
0.16 0.51 1.0 0.28 0.67
0.04 0.06 1.0 0.24 0.25
0.0 0.0 1.0 0.21 0.21
0.3 0.4 1.0 0.34 0.71
0.36 0.07 1.0 0.47 0.04
0.13 0.43 1.0 0.36 0.0
Ppi_g60838 (SYT5)
0.26 0.52 1.0 0.81 0.46
0.24 0.22 1.0 0.46 0.01
0.04 0.07 1.0 0.15 0.39
0.1 0.23 1.0 0.38 0.14
0.0 0.01 1.0 0.09 0.27
0.0 0.01 1.0 0.11 0.22
0.0 0.03 1.0 0.15 0.27
0.02 0.11 1.0 0.15 0.29
0.13 0.52 1.0 0.41 0.19
0.09 0.1 1.0 0.34 0.08
0.16 0.14 1.0 0.29 0.12
0.0 0.01 1.0 0.07 0.41
0.27 0.41 1.0 0.49 0.37
0.03 0.11 1.0 0.39 0.29
0.0 0.0 1.0 0.26 0.01
0.06 0.1 1.0 0.43 0.28
0.49 0.52 1.0 0.6 0.49
Ppi_g63464 (TIL1)
0.18 0.52 1.0 0.34 0.42
0.01 0.08 1.0 0.16 0.21
0.1 0.31 1.0 0.44 0.22
0.16 0.4 1.0 0.24 0.18
0.05 0.1 1.0 0.46 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)