1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
10.97 2.66 0.0 0.39 0.0
36.8 8.46 0.0 0.2 0.0
21.38 2.49 0.0 0.0 0.0
50.89 10.08 0.0 0.27 0.0
Ppi_g00267 (ADF6)
 8.73 1.45 0.09 0.04 0.13
33.25 6.26 0.84 0.41 0.0
1.9 0.43 0.0 0.0 0.0
14.77 2.78 0.61 0.25 0.47
16.17 3.5 0.0 0.39 0.0
9.01 0.51 0.06 0.07 0.0
2.46 0.4 0.0 0.0 0.0
3.93 0.48 0.18 0.0 0.0
2.38 0.8 0.0 0.0 0.0
4.72 0.55 0.13 0.0 0.0
15.38 4.29 0.0 0.0 0.0
3.93 0.45 0.0 0.05 0.0
2.58 0.66 0.02 0.03 0.03
5.56 1.54 0.0 0.51 0.03
Ppi_g10425 (CAD9)
 4.48 0.76 0.04 0.07 0.09
5.09 0.68 0.0 0.0 0.0
3.3 0.9 0.0 0.0 0.0
3.13 0.39 0.0 0.0 0.0
127.21 36.2 0.4 13.02 3.09
4.93 1.3 0.0 0.14 0.04
Ppi_g12993 (ATB2)
 5.15 0.65 0.04 0.03 0.05
Ppi_g12998 (INT1)
 2.5 0.67 0.02 0.09 0.01
3.73 0.95 0.0 0.19 0.0
15.93 1.72 0.0 0.0 0.0
27.12 6.43 0.21 1.23 0.29
14.13 1.66 0.0 0.13 0.0
30.66 7.39 0.0 0.22 0.15
2.85 0.99 0.07 0.08 0.16
7.46 1.62 0.0 0.0 0.0
11.15 3.9 0.34 0.21 0.68
15.97 2.76 0.21 0.8 0.21
4.22 1.23 0.0 0.0 0.0
30.35 6.82 0.28 0.92 0.83
3.19 0.62 0.0 0.0 0.01
Ppi_g18011 (CYN)
 11.58 1.32 0.21 0.18 0.33
11.26 1.97 0.09 0.15 0.13
2.78 0.44 0.02 0.02 0.0
4.4 1.04 0.04 0.08 0.03
15.02 3.03 0.12 0.61 0.12
7.36 1.06 0.14 0.23 0.54
7.9 1.8 0.1 0.25 0.11
6.6 1.98 0.0 0.0 0.0
5.95 1.03 0.0 0.0 0.0
Ppi_g18968 (DELTA-OAT)
 8.49 1.8 0.03 0.13 0.05
2.04 0.56 0.0 0.0 0.0
20.41 3.64 0.08 0.19 0.44
4.81 0.52 0.0 0.0 0.0
3.78 0.26 0.0 0.0 0.05
2.0 0.35 0.06 0.02 0.05
Ppi_g20184 (CPN10)
 10.99 2.39 0.26 0.0 0.0
7.16 1.64 0.0 0.0 0.0
3.82 0.41 0.0 0.11 0.0
5.15 0.58 0.04 0.04 0.03
103.02 19.06 2.0 6.44 7.4
77.36 19.65 0.0 1.78 0.11
2.78 0.84 0.0 0.0 0.0
14.13 2.16 0.05 0.06 0.0
118.23 26.96 0.95 3.78 1.73
18.41 2.26 0.55 0.45 0.73
Ppi_g52041 (NOP10)
 5.1 0.7 0.0 0.0 0.0
4.67 0.72 0.12 0.0 0.0
5.68 1.96 0.0 0.0 0.0
11.21 1.04 0.0 0.0 0.0
4.58 0.37 0.07 0.05 0.02
Ppi_g52229 (CAD2)
 8.2 0.68 0.0 0.01 0.0
Ppi_g52264 (CDR1)
 2.94 0.49 0.01 0.12 0.04
2.3 0.53 0.0 0.0 0.0
4.76 1.03 0.06 0.1 0.09
4.21 0.64 0.25 0.0 0.0
2.15 0.37 0.0 0.0 0.0
5.11 1.16 0.09 0.04 0.08
Ppi_g52659 (ACS)
 3.2 0.45 0.06 0.07 0.13
4.93 1.22 0.0 0.11 0.09
7.21 0.98 0.2 0.02 0.19
12.5 1.69 0.0 0.0 0.0
14.88 1.01 0.09 0.0 0.0
19.06 3.55 0.19 0.45 0.53
15.81 3.14 0.51 0.81 1.03
5.7 0.86 0.05 0.05 0.0
4.35 1.32 0.0 0.11 0.0
2.72 0.21 0.03 0.0 0.03
Ppi_g53390 (DRP4C)
 2.68 0.55 0.0 0.06 0.03
7.42 0.92 0.0 0.0 0.0
34.46 4.69 0.14 0.14 0.09
3.52 0.58 0.24 0.02 0.09
6.15 0.61 0.04 0.1 0.06
3.88 1.1 0.0 0.16 0.0
2.16 0.54 0.0 0.02 0.0
Ppi_g53911 (CAT2)
 7.04 2.6 0.41 0.13 0.55
2.54 0.44 0.0 0.11 0.0
2.79 0.23 0.0 0.0 0.01
2.05 0.18 0.0 0.03 0.05
16.01 3.54 0.0 0.1 0.0
6.58 1.38 0.15 0.0 0.14
Ppi_g54687 (CNX1)
 3.2 0.66 0.1 0.03 0.14
6.25 0.72 0.0 0.0 0.0
6.05 1.64 0.17 0.54 0.36
2.21 0.43 0.1 0.04 0.15
3.15 0.53 0.0 0.06 0.04
Ppi_g55368 (CPK20)
 2.35 0.32 0.0 0.0 0.0
2.62 0.45 0.0 0.0 0.0
2.69 0.66 0.0 0.0 0.0
3.36 0.41 0.0 0.11 0.0
5.48 1.08 0.06 0.26 0.16
6.86 1.38 0.0 0.04 0.16
1.99 0.1 0.0 0.0 0.0
3.49 0.26 0.1 0.07 0.0
2.33 0.26 0.0 0.0 0.0
5.3 1.79 0.0 0.08 0.16
5.22 0.77 0.05 0.09 0.05
2.24 0.22 0.0 0.03 0.0
2.93 0.37 0.09 0.03 0.14
18.89 2.25 0.26 0.23 0.0
2.7 0.44 0.07 0.11 0.0
1.98 0.36 0.0 0.0 0.0
2.6 0.19 0.0 0.03 0.0
2.07 0.48 0.0 0.05 0.0
1.88 0.26 0.01 0.03 0.02
86.44 18.0 0.11 9.54 2.96
3.46 0.52 0.0 0.07 0.0
Ppi_g56991 (RCI2B)
 1.89 0.34 0.02 0.06 0.07
2.23 0.19 0.09 0.02 0.04
2.06 0.16 0.0 0.0 0.0
5.09 1.63 0.0 0.31 0.04
2.33 0.45 0.0 0.0 0.0
4.16 0.52 0.0 0.0 0.1
9.25 1.07 0.0 0.0 0.0
4.51 0.98 0.0 0.01 0.17
2.02 0.56 0.0 0.0 0.04
14.18 1.71 0.0 0.0 0.0
17.11 2.35 0.09 0.35 0.27
7.45 1.28 0.2 0.18 0.0
2.91 0.47 0.05 0.06 0.09
Ppi_g58261 (ALDH2)
 27.02 3.34 0.26 0.4 0.62
12.86 1.08 0.0 0.26 0.13
2.6 0.61 0.0 0.0 0.0
2.87 0.43 0.0 0.0 0.0
6.73 1.46 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)