Heatmap: Cluster_250 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.0 0.68 5.17 0.55 10.25
0.0 0.11 1.67 0.35 2.8
0.88 2.5 5.49 2.85 10.48
0.23 1.13 7.3 0.73 11.31
0.45 1.91 5.89 0.03 10.48
0.28 0.57 6.99 2.22 12.28
0.42 0.98 6.42 1.92 11.69
0.36 0.8 5.81 1.54 9.74
0.14 1.0 5.19 0.89 13.25
0.09 0.82 7.6 1.12 12.43
0.05 0.91 6.53 0.88 12.64
0.32 1.0 10.59 1.53 16.6
0.09 0.48 2.0 0.48 3.65
0.38 1.8 10.24 0.54 19.97
0.08 0.18 3.37 0.1 7.86
0.9 2.1 5.59 2.0 11.4
0.29 0.35 3.0 1.22 5.41
0.14 0.48 1.67 0.49 3.17
0.2 0.19 6.93 0.36 16.1
0.34 1.27 9.95 1.17 14.7
0.08 0.19 1.44 0.38 2.46
0.96 0.91 6.66 1.46 13.48
1.13 1.16 13.63 2.29 26.22
0.25 0.41 4.41 1.32 7.09
0.0 0.13 5.02 1.83 9.17
0.26 1.09 6.43 1.57 9.97
0.71 0.83 10.3 1.6 19.68
Ppi_g23918 (FKBP15-2)
0.24 2.14 6.86 1.51 12.35
0.19 0.76 4.03 1.28 9.46
0.56 0.56 3.77 1.24 5.97
0.02 0.09 3.67 0.66 5.51
Ppi_g25110 (HSP91)
0.83 1.35 7.67 1.32 11.44
0.18 0.86 5.38 0.52 9.11
0.32 0.19 9.3 3.01 16.49
0.24 0.85 3.14 0.75 4.89
0.0 0.21 2.08 0.67 5.11
2.65 5.39 24.91 5.61 41.59
0.23 0.54 4.0 0.7 6.45
0.0 0.08 3.27 0.35 6.35
0.0 0.67 3.1 0.56 4.82
0.13 1.07 3.58 0.49 6.06
0.6 0.86 5.2 2.11 11.26
0.17 0.5 4.91 0.79 9.73
0.0 0.18 2.07 0.62 4.09
0.27 0.53 4.91 0.74 7.19
1.34 1.93 12.61 4.22 20.85
0.49 0.9 3.79 1.43 7.15
0.82 2.03 11.07 3.21 17.29
0.71 2.17 11.29 3.23 16.57
0.0 0.45 4.29 1.09 6.36
0.43 1.59 9.39 2.59 12.85
0.78 1.6 6.77 1.99 15.18
0.49 2.21 19.18 6.39 28.53
0.48 0.81 11.44 2.81 21.65
0.25 1.17 6.97 2.33 10.47
0.08 0.23 1.32 0.52 2.65
0.72 1.28 11.84 1.7 20.55
0.0 0.64 5.63 1.04 8.79
0.41 0.0 5.74 0.77 10.41
0.1 0.12 2.59 0.19 4.32
0.12 0.14 1.9 0.45 4.14
0.0 0.0 2.23 0.49 5.38
0.33 0.13 2.7 0.21 6.52
0.0 0.28 4.84 0.58 9.33
1.42 2.54 8.61 2.31 16.98
0.11 0.0 1.28 0.1 3.08
0.0 0.92 3.9 0.85 7.61
0.0 0.42 2.59 0.67 3.73
Ppi_g35299 (EMB2296)
0.81 1.51 9.3 3.01 14.2
0.0 0.0 1.03 0.0 2.46
0.27 0.61 4.59 0.62 8.66
0.07 0.2 2.64 0.48 4.62
Ppi_g35830 (PPa6)
0.65 1.33 5.7 1.5 9.06
0.19 0.39 2.99 0.48 4.72
0.0 0.38 2.71 0.0 5.35
0.0 0.0 1.48 0.23 2.56
0.0 0.0 2.52 0.0 5.15
Ppi_g37314 (SUM1)
0.0 0.0 1.58 0.0 2.84
0.21 1.67 6.67 1.44 13.0
1.07 4.38 19.18 0.7 33.44
0.37 0.3 2.78 0.43 4.89
0.0 0.31 3.73 0.38 6.49
0.06 0.41 2.37 0.03 5.44
Ppi_g40689 (ROF1)
0.0 0.0 2.8 0.31 5.56
0.14 0.75 2.92 0.63 5.88
0.12 0.71 4.44 1.14 6.22
0.51 1.39 13.17 2.39 22.03
0.0 0.0 1.44 0.14 2.98
0.55 1.12 4.47 0.64 8.09
Ppi_g42602 (PGM2)
0.43 0.29 5.93 2.06 8.33
0.0 0.06 1.12 0.1 2.43
0.6 1.37 4.63 0.7 8.12
0.46 1.39 4.63 1.25 9.9
0.0 0.28 7.82 0.0 16.5
0.71 2.23 8.87 0.86 15.15
0.44 1.09 3.4 0.64 8.53
0.11 0.76 3.62 0.39 6.71
0.79 2.18 11.62 2.16 19.4
1.03 7.15 27.98 10.64 48.41
0.04 0.26 1.5 0.12 3.78
0.72 2.29 18.08 4.19 25.07
0.12 0.28 2.68 0.34 3.93
0.12 0.14 2.39 0.49 3.46
0.29 0.0 3.33 1.28 7.46
0.07 0.0 1.06 0.0 2.7
0.09 0.0 2.84 0.8 5.03
4.53 9.01 179.41 6.85 373.93
0.0 0.79 2.29 0.17 4.31
0.23 0.07 2.93 0.7 4.55
0.0 0.48 1.55 0.24 4.25
0.46 2.04 12.6 1.48 21.38
0.0 0.38 1.69 0.0 2.89
0.39 1.08 6.14 1.48 9.18
0.12 0.0 2.01 0.25 3.21
0.24 0.14 3.22 0.78 6.51
0.33 0.77 6.03 0.92 13.43
0.05 0.17 1.4 0.16 2.33
0.26 0.83 4.51 1.33 7.57
1.09 2.18 11.07 3.41 17.35
0.09 0.21 1.45 0.53 3.58
0.0 0.22 1.44 0.0 3.46
0.03 0.28 2.58 0.48 3.84
0.0 0.0 1.34 0.0 3.38
0.03 0.25 2.03 0.11 5.12
0.19 0.7 4.27 1.67 7.23
0.0 0.32 3.03 0.29 7.51
0.11 0.53 3.13 0.35 5.66
0.0 0.0 6.73 0.0 12.24
0.82 0.52 6.8 1.4 12.38
0.09 0.71 7.14 2.38 13.83
Ppi_g49676 (GLT1)
0.26 0.32 2.28 0.86 3.84
0.72 1.2 6.29 0.67 12.1
0.0 0.42 2.85 0.72 5.47
0.24 0.27 2.29 0.11 5.51
0.47 0.27 4.07 0.0 8.74
0.0 0.0 1.52 0.14 2.72
Ppi_g50456 (RPL34)
1.19 1.71 4.72 0.79 8.32
0.0 0.0 1.48 0.0 2.55
0.0 0.0 1.63 0.0 2.65
0.58 0.28 2.66 0.33 4.53
1.28 1.35 8.58 2.73 13.85
0.99 1.27 13.36 3.59 33.57
0.52 0.0 2.23 0.0 4.94
0.6 3.3 10.54 2.48 24.38
0.11 0.27 4.42 1.36 8.15
0.33 1.02 3.27 0.83 6.2
0.08 0.6 2.82 0.0 4.69
0.0 0.0 1.24 0.3 2.89
0.3 0.65 9.05 1.18 18.01
0.15 0.32 4.16 0.33 6.76
0.0 0.2 1.86 0.25 4.23
0.2 0.0 1.56 0.47 2.26
0.0 0.0 1.5 0.08 3.09
0.11 1.34 7.16 1.02 13.65
0.12 0.94 2.39 0.0 4.64
0.27 0.68 2.17 0.19 3.6
0.34 2.07 14.36 4.16 23.33
0.0 0.0 1.23 0.0 2.34
0.0 0.48 6.22 2.11 9.75
0.05 0.52 8.01 0.0 13.29
0.25 0.59 5.38 1.76 8.21
0.37 1.96 5.04 1.02 8.15
0.0 0.17 1.16 0.1 2.88
0.41 1.0 8.9 0.79 14.94
0.3 2.69 15.82 3.11 26.1
0.0 0.09 1.58 0.38 3.08
0.0 0.45 1.96 0.58 4.11
0.55 0.15 4.02 1.43 7.98
0.26 0.0 5.57 0.99 13.91
0.02 0.25 1.48 0.51 3.25
0.29 1.51 12.73 3.09 18.13
Ppi_g62615 (RPS15A)
0.89 2.1 11.35 1.66 18.31
0.24 1.0 3.94 0.11 6.84
0.09 0.58 1.98 0.1 3.43
3.48 6.97 102.3 14.86 172.05
0.0 0.0 2.01 0.0 5.03
0.07 0.0 2.32 0.14 5.18
0.05 0.23 2.67 0.51 4.19
1.66 3.16 38.34 4.8 62.83
0.86 3.42 24.98 6.66 37.19
0.05 0.64 4.36 0.41 7.96
0.29 0.85 3.05 0.14 5.45
0.9 2.36 23.49 4.65 41.92
Ppi_g63681 (CYTC-1)
0.79 1.64 6.88 2.67 12.17
0.0 0.73 3.77 0.47 6.44
1.06 3.54 14.22 3.79 25.17
0.0 0.43 4.7 1.43 7.88
0.0 0.0 1.53 0.27 3.01
0.0 0.0 1.15 0.0 2.3
0.2 0.12 1.35 0.09 3.22
0.06 0.0 1.12 0.0 2.6
0.0 0.0 1.35 0.0 2.27
1.9 5.76 75.58 10.12 131.55

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)