Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.0 2.75 0.0 0.0 0.51
0.0 3.81 0.0 0.0 0.45
0.0 4.92 0.0 0.12 0.93
0.0 17.36 0.0 0.44 1.95
0.0 28.02 0.62 1.07 4.46
0.0 2.85 0.0 0.06 0.41
0.0 39.73 0.0 1.95 6.37
0.0 6.68 0.0 0.0 0.61
0.0 4.93 0.0 0.17 0.48
0.0 21.46 0.0 0.39 4.44
0.0 8.39 0.19 0.5 1.87
0.0 4.24 0.0 0.04 0.38
0.0 1.94 0.0 0.0 0.19
0.0 10.57 0.0 0.38 1.18
0.0 2.28 0.0 0.13 0.44
0.05 5.69 0.08 0.2 1.23
0.0 8.37 0.0 0.24 1.48
0.06 3.65 0.0 0.13 0.43
0.0 3.22 0.04 0.13 0.66
0.0 11.81 0.01 0.32 1.34
0.04 3.1 0.07 0.17 0.7
0.0 1.88 0.02 0.04 0.18
Ppi_g01203 (CP31)
0.0 3.5 0.01 0.12 0.35
Ppi_g01252 (MK1)
0.0 2.2 0.0 0.05 0.37
Ppi_g01650 (NRPE11)
0.0 2.43 0.0 0.0 0.43
0.0 10.21 0.0 0.35 1.83
0.0 14.64 0.0 0.7 3.19
Ppi_g01856 (ARA5)
0.13 12.75 0.05 0.48 1.21
0.02 5.08 0.03 0.19 0.98
0.0 1.91 0.0 0.02 0.19
0.0 3.24 0.02 0.09 0.51
0.0 5.58 0.0 0.33 1.22
0.0 21.6 0.02 0.26 1.91
0.0 2.96 0.0 0.06 0.24
0.09 6.46 0.0 0.24 1.11
Ppi_g02365 (MSL9)
0.0 2.14 0.0 0.03 0.22
0.01 2.33 0.0 0.07 0.31
0.0 7.09 0.0 0.05 0.96
0.0 4.7 0.0 0.17 0.49
0.21 10.62 0.54 0.72 1.56
0.0 11.19 0.0 0.2 1.07
0.0 5.23 0.0 0.27 0.98
0.23 8.35 0.14 0.21 1.16
0.0 8.52 0.0 0.18 0.79
0.0 3.99 0.0 0.08 0.32
Ppi_g03422 (MTACP1)
0.0 6.42 0.0 0.0 1.26
0.48 64.88 0.0 3.98 11.33
0.0 5.11 0.0 0.12 1.06
0.0 6.73 0.14 0.27 1.26
0.01 7.2 0.02 0.55 1.73
0.0 2.82 0.13 0.0 0.47
0.0 5.6 0.0 0.11 0.65
0.0 3.88 0.0 0.1 0.55
Ppi_g04229 (HTA11)
0.0 4.16 0.0 0.15 0.63
0.0 2.18 0.0 0.0 0.32
0.0 3.15 0.0 0.0 0.26
0.0 4.3 0.0 0.04 0.39
Ppi_g04509 (GPA1)
0.12 3.81 0.09 0.25 1.05
0.16 6.8 0.15 0.37 1.68
0.0 7.4 0.0 0.33 0.95
0.07 6.36 0.05 0.16 0.8
0.0 13.76 0.0 0.0 1.1
0.22 12.25 0.11 0.6 2.82
0.25 10.2 0.36 0.47 2.48
0.0 3.9 0.0 0.1 0.38
0.1 144.06 0.0 4.35 26.14
0.0 2.24 0.0 0.17 0.24
Ppi_g05813 (CAT1)
0.04 4.65 0.0 0.05 0.52
0.29 8.51 0.2 0.85 2.1
Ppi_g06254 (ARFA1F)
0.45 10.51 0.31 0.65 2.46
0.01 3.9 0.02 0.05 0.39
0.21 3.78 0.12 0.34 0.95
Ppi_g06394 (UGP2)
0.06 5.5 0.03 0.32 1.0
0.0 7.92 0.0 0.63 1.57
1.35 17.08 0.69 1.89 4.18
0.0 10.48 0.0 0.4 1.03
0.0 7.07 0.02 0.27 1.13
0.0 11.53 0.0 0.73 1.82
0.15 11.24 0.0 0.13 1.66
0.0 2.25 0.0 0.0 0.37
0.08 17.76 0.1 0.97 2.28
0.0 2.8 0.0 0.02 0.53
0.13 8.8 0.03 0.37 1.39
0.0 7.58 0.0 0.0 0.52
0.0 2.77 0.0 0.04 0.36
0.0 2.82 0.0 0.08 0.45
0.0 4.15 0.0 0.0 0.45
0.0 4.72 0.0 0.0 0.64
0.0 2.92 0.0 0.06 0.28
0.0 10.26 0.0 0.13 0.89
0.79 21.42 0.41 1.76 6.56
0.0 2.38 0.0 0.23 0.28
0.0 17.51 0.0 0.53 2.05
0.0 2.78 0.0 0.11 0.56
0.0 2.05 0.0 0.0 0.29
0.0 3.62 0.0 0.3 0.73
0.0 3.05 0.0 0.0 0.34
0.0 2.45 0.0 0.08 0.46
0.0 5.58 0.0 0.14 1.25
0.0 7.36 0.0 0.25 1.56
0.0 5.38 0.0 0.24 0.68
0.0 4.29 0.0 0.11 0.76
0.0 2.63 0.0 0.14 0.55
0.09 3.56 0.13 0.22 0.73
0.0 12.48 0.06 0.2 2.92
0.0 7.58 0.0 0.54 0.59
0.0 5.65 0.0 0.27 0.7
0.0 2.02 0.0 0.04 0.37
0.0 2.99 0.0 0.0 0.44
0.0 4.28 0.0 0.03 0.57
0.0 2.92 0.0 0.07 0.23
0.14 51.5 0.0 3.6 9.49
Ppi_g11671 (RABH1e)
0.0 2.16 0.0 0.0 0.22
0.0 3.47 0.0 0.0 0.48
0.0 11.55 0.0 0.0 2.38
0.0 1.86 0.0 0.06 0.29
0.03 2.12 0.0 0.02 0.25
Ppi_g12588 (PHT3;1)
0.06 2.06 0.02 0.21 0.68
0.0 5.1 0.0 0.07 0.52
0.0 9.6 0.0 0.07 1.97
0.0 4.3 0.0 0.07 0.82
0.0 3.19 0.0 0.0 0.25
0.12 3.99 0.02 0.12 0.57
0.0 6.32 0.0 0.54 1.86
0.0 1.98 0.0 0.0 0.14
0.0 2.77 0.0 0.0 0.29
0.0 2.24 0.0 0.0 0.36
0.02 3.49 0.0 0.18 0.42
Ppi_g14088 (HMG)
0.05 10.07 0.23 0.78 3.19
0.0 3.02 0.0 0.11 0.48
0.0 6.11 0.0 0.06 0.7
0.29 7.39 0.29 0.42 1.86
0.0 3.04 0.0 0.0 0.42
0.0 2.51 0.0 0.17 0.22
0.0 5.06 0.21 0.0 0.45
0.0 1.98 0.0 0.09 0.22
0.03 2.52 0.0 0.04 0.27
Ppi_g15794 (IPP1)
0.0 2.35 0.0 0.14 0.3
0.0 7.42 0.03 0.48 1.3
0.0 2.24 0.0 0.1 0.26
0.0 2.15 0.0 0.07 0.38
0.0 6.97 0.0 0.46 1.03
0.1 11.99 0.0 0.13 1.61
0.0 11.57 0.0 0.0 2.07
0.0 9.73 0.13 0.31 1.79
0.1 14.41 0.03 0.77 2.97
0.0 2.12 0.0 0.0 0.34
0.0 18.97 0.0 0.65 2.84
0.0 3.18 0.0 0.0 0.22
Ppi_g17599 (ASP1)
0.0 2.49 0.0 0.13 0.39
0.0 2.47 0.02 0.08 0.6
0.0 5.05 0.0 0.22 0.53
0.0 2.43 0.0 0.1 0.2
0.0 8.83 0.0 0.18 0.7
0.0 3.52 0.0 0.0 0.46
0.0 4.29 0.03 0.14 0.3
0.0 9.33 0.0 0.49 0.91
0.06 20.77 0.01 0.54 2.14
0.05 4.31 0.01 0.31 0.77
0.0 2.4 0.0 0.11 0.37
0.0 1.94 0.0 0.01 0.16
Ppi_g18611 (PER1)
0.0 2.91 0.0 0.29 0.72
0.0 4.35 0.0 0.07 0.91
0.0 2.22 0.0 0.03 0.3
0.0 2.32 0.03 0.05 0.45
0.0 5.25 0.0 0.33 0.98
0.0 2.06 0.0 0.0 0.28
0.0 3.43 0.0 0.18 0.54
0.0 12.0 0.0 0.28 1.76
0.0 2.19 0.0 0.0 0.3
Ppi_g19703 (ALY4)
0.0 5.91 0.0 0.0 0.93
0.0 3.0 0.0 0.21 0.29
0.0 3.77 0.0 0.13 0.38
0.0 15.36 0.0 0.39 2.02
0.0 1.9 0.0 0.02 0.19
0.0 2.7 0.0 0.0 0.21
Ppi_g20358 (FKBP12)
0.0 4.39 0.0 0.12 0.42
0.0 5.43 0.0 0.11 0.32
0.0 5.15 0.02 0.26 1.21
0.0 1.9 0.0 0.0 0.13
0.03 4.65 0.0 0.1 0.66
0.0 14.44 0.0 0.22 3.76
0.0 2.7 0.0 0.0 0.39
0.0 2.19 0.0 0.0 0.17
0.0 2.95 0.05 0.04 0.48
0.34 14.46 0.0 0.22 2.28
0.3 17.93 0.7 1.52 2.48
0.0 6.9 0.0 0.12 0.74
0.0 3.05 0.0 0.04 0.51
0.0 8.84 0.0 0.05 1.45
0.0 5.98 0.0 0.14 1.01
0.0 2.78 0.04 0.04 0.36
0.0 14.41 0.0 0.44 1.64
0.0 4.39 0.0 0.32 0.51
0.0 230.47 0.0 2.23 28.15
0.0 7.68 0.0 0.13 1.34
0.0 3.72 0.0 0.21 0.42
0.0 13.37 0.0 0.56 1.73
0.0 5.63 0.0 0.31 0.4

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)