Heatmap: Cluster_145 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
Ppi_g00905 (TPPE)
0.52 6.76 24.89 4.62 9.11
Ppi_g01106 (ACLB-1)
29.74 61.4 125.84 44.52 60.61
1.66 3.97 10.55 3.7 5.27
Ppi_g01159 (GH9B5)
2.41 10.89 47.47 8.03 11.1
Ppi_g01317 (CSLC5)
1.8 3.84 21.36 4.8 9.21
36.7 44.13 78.46 44.76 47.14
30.52 38.2 74.7 36.78 39.14
4.49 5.55 11.47 3.85 6.12
Ppi_g02187 (CID12)
2.48 4.62 21.14 4.52 10.28
0.15 26.31 227.4 54.8 80.37
9.76 12.6 25.53 10.18 13.47
Ppi_g03146 (KOR)
5.53 22.18 121.27 29.68 40.45
Ppi_g03776 (HAP13)
21.32 27.73 52.07 28.29 32.98
3.3 9.97 32.23 10.62 15.6
9.25 14.76 96.06 16.42 19.36
3.6 7.39 17.66 8.55 8.65
29.63 44.26 93.72 35.67 48.87
0.62 3.86 19.25 4.39 4.4
Ppi_g05082 (ERD2B)
18.44 26.09 58.9 19.91 31.88
0.51 1.93 16.42 4.51 5.34
Ppi_g05194 (AMSH1)
5.23 8.16 14.38 6.37 9.06
10.5 16.23 38.64 11.04 13.96
2.92 5.27 9.26 3.87 4.4
Ppi_g05619 (RPN12a)
17.03 26.16 43.3 20.94 27.3
7.69 13.71 33.88 13.28 20.07
0.03 1.63 6.46 1.44 1.42
Ppi_g05854 (D6PKL1)
0.13 2.03 7.74 2.3 3.2
0.25 3.76 11.25 2.17 2.45
Ppi_g06426 (EDR3)
16.4 30.51 108.83 31.75 49.28
Ppi_g06495 (KINESIN-13A)
4.88 10.52 29.68 9.12 10.55
1.65 3.32 10.43 3.82 4.91
6.54 8.54 29.59 6.81 10.56
0.11 2.33 9.8 2.96 2.85
0.75 1.69 12.19 2.32 2.92
Ppi_g08668 (BGLU40)
0.1 1.32 8.0 1.07 2.31
Ppi_g08711 (ARA4)
1.1 7.05 39.17 9.28 13.61
0.92 5.32 16.39 3.81 5.24
Ppi_g08874 (ACLA-2)
66.49 101.39 213.73 97.75 115.78
1.47 2.62 5.92 3.11 3.31
0.17 0.72 3.4 0.72 1.46
Ppi_g09612 (IAA3)
11.88 14.03 43.21 18.86 21.82
1.18 1.94 18.08 2.76 2.98
Ppi_g09920 (RABA4D)
36.93 52.89 96.69 44.8 60.36
0.27 2.08 8.88 0.72 2.96
Ppi_g10495 (KJK)
0.12 1.3 4.67 0.88 1.73
0.02 0.85 7.89 1.86 1.48
Ppi_g10663 (UER1)
31.05 40.81 152.38 29.28 60.72
0.02 0.52 3.05 0.53 1.12
Ppi_g10846 (TMN1)
23.1 26.78 50.99 26.03 29.9
Ppi_g11624 (RAC3)
33.6 40.97 65.33 31.43 37.69
3.06 4.7 19.13 4.92 6.22
0.12 1.77 7.15 1.67 1.72
Ppi_g12843 (SAHH2)
65.61 83.9 141.99 81.67 78.21
Ppi_g13060 (ERD3)
1.04 2.65 6.91 2.62 3.22
Ppi_g13333 (BZIP34)
1.71 4.37 10.42 2.74 3.66
Ppi_g13510 (ABI8)
0.87 2.14 8.64 2.71 2.49
0.16 4.78 22.01 2.65 4.33
Ppi_g14522 (CLF)
1.09 2.27 5.76 2.23 3.06
0.0 2.48 8.55 0.71 2.04
1.52 2.91 11.97 3.27 4.54
Ppi_g15869 (SUB1)
0.08 1.17 15.11 1.8 4.41
10.64 43.14 127.11 29.08 54.3
0.2 0.97 8.29 1.45 1.25
0.41 2.79 22.83 4.3 3.41
Ppi_g17078 (TTL1)
0.46 2.57 18.03 2.44 5.1
0.06 1.06 3.08 0.96 0.96
0.08 1.33 7.73 1.4 1.53
Ppi_g17407 (SOL1)
0.13 1.06 3.19 0.47 0.9
Ppi_g17918 (CHR1)
0.07 1.58 4.36 1.06 1.36
0.01 0.98 5.47 0.93 1.17
0.04 1.54 5.43 0.92 2.34
0.06 0.72 4.42 1.47 1.66
0.0 0.12 18.91 2.84 3.18
Ppi_g22252 (IXR1)
0.05 8.1 38.08 9.22 11.0
0.0 0.45 71.23 7.23 26.37
0.0 0.0 38.05 5.7 8.65
11.02 18.71 38.94 12.61 19.42
Ppi_g30955 (FATB)
0.63 5.92 19.1 2.59 4.86
Ppi_g31387 (PDI2)
8.56 13.11 26.16 11.89 13.1
0.0 0.15 2.19 0.5 0.26
0.09 0.87 4.02 1.02 1.42
Ppi_g31950 (TSO2)
0.0 6.15 22.36 1.57 5.85
1.17 5.86 21.29 5.09 8.35
1.03 2.57 4.65 1.77 2.12
Ppi_g32686 (CRT1)
83.81 109.05 232.53 83.34 136.67
Ppi_g33129 (QUA1)
15.51 20.32 43.37 19.1 21.16
Ppi_g33188 (ARO4)
0.43 0.72 7.17 1.13 1.78
2.04 9.96 16.66 7.66 6.93
3.24 5.51 27.41 7.06 10.74
0.3 1.66 9.84 2.64 2.61
Ppi_g39086 (BGAL1)
0.25 1.32 4.61 0.81 1.39
Ppi_g39212 (RHD6)
0.0 0.44 3.6 0.87 1.17
0.16 2.18 8.94 2.4 3.28
5.68 12.0 28.98 10.79 12.87
Ppi_g41142 (emb1075)
0.0 0.0 2.75 0.18 0.42
9.78 12.2 25.85 11.75 17.87
0.29 1.55 5.28 2.18 2.16
Ppi_g46457 (ACT7)
59.22 103.44 227.58 78.17 130.9
6.12 22.63 49.05 14.81 17.56
2.08 2.73 14.86 2.32 3.93
0.07 0.76 2.94 0.56 0.81
Ppi_g53726 (MAN2)
8.65 12.55 43.19 9.77 14.69
0.96 2.69 10.46 2.62 3.81
1.03 1.15 9.07 1.6 2.88
4.48 6.32 14.65 5.99 7.29
Ppi_g60346 (SEU)
1.32 2.66 14.53 3.36 4.79
Ppi_g62521 (PSF3)
0.1 1.26 7.79 0.63 1.62
0.0 0.95 2.87 0.75 0.68
170.86 214.1 308.4 184.5 207.66

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)