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Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
-0.37 -0.2 -0.35 1.06 -1.01
-0.22 0.14 0.04 0.42 -0.58
0.08 -0.26 0.13 0.24 -0.26
Ppi_g00429 (GSL5)
 0.38 0.33 -2.57 1.09 -2.73
-0.78 0.82 0.47 0.23 -3.53
0.14 -0.38 -0.45 0.78 -0.57
0.12 -0.03 -0.0 0.7 -1.67
-0.39 0.25 -0.23 0.85 -1.35
-0.37 0.19 -0.07 0.34 -0.2
-0.09 -0.16 -1.22 0.56 0.34
Ppi_g01780 (GB1)
 0.05 -0.26 -0.03 0.47 -0.4
-0.4 0.34 -0.05 0.74 -1.56
0.14 0.53 -0.78 0.58 -1.39
0.28 0.37 -0.81 0.19 -0.36
0.11 0.32 0.12 0.23 -1.27
-0.16 -0.13 0.26 0.75 -1.67
0.41 0.01 -0.01 0.49 -1.88
0.14 0.04 -0.95 0.23 0.23
0.38 0.02 -0.35 0.7 -1.86
0.14 0.23 -0.68 0.27 -0.16
0.45 0.0 -0.72 0.07 -0.03
-0.09 0.18 -0.71 0.93 -1.27
-0.35 0.24 -0.2 0.54 -0.49
-0.22 -0.32 0.13 0.54 -0.34
-0.03 0.34 -0.05 0.41 -1.12
-0.49 0.57 -0.48 0.48 -0.52
-0.71 -0.08 -0.37 0.94 -0.41
0.17 0.19 -0.92 -0.14 0.38
0.42 0.26 -2.55 1.11 -2.89
0.37 0.48 -3.08 0.68 -0.75
-0.17 1.01 -1.28 0.76 -
0.11 0.4 -0.43 0.33 -0.72
-0.64 0.42 -0.28 1.06 -3.21
Ppi_g08095 (BAG5)
 -0.55 0.71 -0.15 0.67 -2.33
0.1 0.23 -0.41 0.17 -0.19
0.19 -0.26 -0.72 0.19 0.36
-0.34 0.06 -0.36 0.5 -0.03
0.41 0.11 -1.12 0.07 0.11
-1.37 0.76 0.49 0.53 -3.76
0.26 -0.36 0.07 0.25 -0.36
0.14 0.32 0.11 0.33 -1.64
0.48 -0.24 -0.35 0.02 -0.05
0.2 -0.0 -0.13 0.45 -0.79
Ppi_g10767 (HOT1)
 -0.01 0.26 0.15 0.46 -1.63
0.03 0.49 -0.82 0.29 -0.36
0.08 0.27 -0.86 1.13 -
0.5 -0.35 -1.72 0.56 0.03
Ppi_g11602 (EXS)
 -0.17 -0.33 0.4 0.72 -1.52
0.38 0.2 0.1 0.05 -1.16
0.09 0.36 0.1 0.12 -0.99
-0.52 0.0 -0.0 0.7 -0.56
Ppi_g12306 (HSP81-3)
 -0.25 0.39 0.2 0.24 -0.94
0.05 -0.23 -2.01 1.04 -0.32
-1.17 0.85 0.26 0.57 -4.05
-1.78 1.12 -1.47 1.06 -3.39
-0.06 -0.03 0.05 0.58 -0.92
0.02 0.25 -0.54 0.38 -0.31
0.63 -0.06 -0.86 0.04 -0.13
-0.15 -0.06 -0.29 0.22 0.21
-0.03 -0.19 -0.52 0.4 0.16
-0.33 0.71 -0.61 0.62 -1.39
0.4 0.42 -0.92 0.52 -1.4
Ppi_g15614 (LAP6)
 0.0 0.19 -0.85 0.63 -0.41
-1.2 0.99 -0.4 0.8 -3.7
0.2 0.35 -0.48 0.1 -0.35
-0.54 -0.02 0.05 0.59 -0.35
-0.03 -0.13 -0.25 0.49 -0.21
-0.18 0.02 -0.4 0.25 0.2
0.24 0.05 -0.14 0.43 -0.91
0.49 0.59 -1.77 0.81 -4.23
-0.53 -0.1 -0.04 0.89 -0.89
Ppi_g18194 (HSP70T-2)
 -0.31 0.24 0.18 0.49 -1.05
Ppi_g18600 (AGO1)
 -0.1 -0.06 -0.16 0.28 -0.0
0.11 0.03 -0.1 0.4 -0.64
0.28 -0.26 -0.33 0.98 -2.43
0.25 0.02 -0.31 0.28 -0.36
-0.06 -0.29 0.01 0.45 -0.25
-0.55 0.56 -0.37 0.8 -1.61
0.17 0.23 -3.66 1.21 -1.73
0.11 -0.3 -0.61 1.29 -
0.17 -0.54 -0.38 0.42 0.11
-0.49 -0.46 0.18 0.87 -0.72
0.28 -0.25 -1.81 1.2 -1.46
-0.03 0.39 -0.79 0.62 -0.77
0.39 0.24 -0.16 0.37 -1.61
-0.16 0.09 -0.51 0.79 -0.7
0.23 -0.16 -0.42 0.37 -0.16
0.03 -0.83 0.05 0.72 -0.45
Ppi_g21921 (ALDH2)
 -0.01 0.29 -3.37 1.11 -0.9
0.5 0.24 -0.6 -0.26 -0.13
-0.25 0.88 -1.54 0.75 -1.77
0.56 -1.1 -0.58 1.23 -4.24
0.05 0.17 -0.28 0.81 -1.92
0.26 -1.23 -0.18 1.12 -1.63
-1.3 1.05 -0.9 0.79 -1.94
-1.17 0.36 0.42 0.53 -1.03
0.26 0.02 -0.31 0.8 -2.08
-0.67 0.55 0.17 0.7 -2.74
0.24 0.21 -0.66 0.38 -0.46
0.08 -0.21 -1.39 0.74 0.04
-0.15 0.63 -0.07 0.53 -2.74
-0.24 -0.06 -0.18 0.79 -0.78
-0.05 0.29 -3.99 1.34 -2.19
0.18 -0.35 -0.43 1.19 -4.2
0.03 0.01 -1.19 0.7 -0.14
0.49 -0.3 -1.76 0.88 -0.63
-0.68 0.07 0.26 1.04 -3.78
-0.7 0.48 0.02 0.48 -0.78
0.59 0.67 - 0.79 -2.45
0.53 -1.09 -2.55 1.01 -0.16
0.18 0.02 -0.33 0.62 -0.94
-0.65 0.41 -0.77 0.71 -0.3
-0.54 -0.37 -0.16 0.8 -0.16
-0.13 -0.23 -0.76 0.67 0.07
0.67 0.42 -1.2 -0.21 -0.38
0.13 -0.13 -1.8 1.13 -0.98
0.06 -0.01 -0.52 0.38 -0.05
-0.57 -0.11 -0.13 0.63 -0.08
-0.27 -0.48 -0.07 0.35 0.3
-0.14 -0.24 -0.26 0.82 -0.65
0.25 0.31 -0.75 0.74 -1.7
-0.3 -0.08 -1.99 0.83 0.27
0.24 -0.15 -0.69 0.35 0.04
0.41 0.01 -0.49 0.37 -0.61
0.24 0.34 -0.66 0.53 -1.06
-0.16 -0.04 -0.67 0.37 0.27
-0.67 0.54 -2.54 0.93 -0.24
0.68 0.56 -3.66 0.87 -7.04
0.31 -0.47 -0.19 0.44 -0.33
0.15 0.47 -0.71 0.56 -1.25
-0.11 -0.11 -0.56 0.89 -0.7
-0.47 -0.11 -0.27 0.76 -0.26
0.06 -0.31 -0.07 0.45 -0.27
0.05 -0.01 -0.37 0.17 0.1
0.05 -0.3 -0.77 0.13 0.56
0.17 -0.33 -0.54 0.68 -0.33
0.61 0.51 -1.26 -0.17 -0.44
0.29 0.19 -0.38 0.45 -0.98
Ppi_g38985 (emb1067)
 -0.02 0.18 -0.31 0.41 -0.42
0.05 0.2 -0.18 0.26 -0.44
Ppi_g40526 (HSP18.2)
 -1.17 0.9 -0.11 0.73 -3.12
Ppi_g40527 (HSP18.2)
 -0.74 0.87 -0.03 0.42 -1.96
Ppi_g40528 (HSP18.2)
 -1.09 0.8 0.15 0.59 -2.52
-0.4 0.29 -0.34 0.83 -1.12
-0.08 -0.33 -0.11 0.26 0.19
Ppi_g42509 (PLDALPHA2)
 -0.34 -0.26 0.0 0.67 -0.35
-1.3 0.79 -0.34 0.65 -0.98
Ppi_g44293 (HSP18.2)
 -1.35 0.76 -0.06 0.71 -1.67
-0.19 -0.32 -0.43 1.01 -0.84
0.1 0.05 0.07 0.12 -0.4
-0.1 -0.22 -0.07 0.5 -0.26
0.3 -0.08 -0.76 0.38 -0.09
0.04 0.06 -0.31 0.5 -0.49
0.39 0.48 -0.86 -0.48 0.03
0.18 -0.13 -0.2 0.24 -0.15
-0.17 -0.38 0.15 0.52 -0.31
0.34 0.19 -0.36 0.26 -0.68
-1.76 0.96 -1.23 0.95 -1.29
-0.32 0.43 -0.7 0.74 -0.81
-0.12 0.72 -0.98 0.33 -0.58
0.17 -0.61 -0.46 0.85 -0.52
Ppi_g53090 (UGE5)
 0.12 -0.46 -0.99 0.64 0.18
0.21 0.22 -1.62 0.27 0.19
-0.33 0.12 -0.07 1.01 -2.64
-0.39 0.43 -0.14 0.88 -2.84
-0.33 -0.23 -0.47 0.54 0.23
-0.01 0.42 -0.43 -0.09 -0.01
-0.41 0.27 0.1 0.7 -1.52
-0.26 0.84 -1.26 0.71 -1.66
0.31 -0.82 -0.01 0.99 -2.22
0.17 0.05 -0.34 0.89 -2.36
0.44 0.53 -1.07 0.11 -0.62
0.11 0.32 -2.88 0.95 -0.73
-0.26 0.07 -0.82 0.8 -0.32
0.1 -0.23 -0.18 0.4 -0.2
Ppi_g56531 (UBQ11)
 0.02 0.26 -0.18 0.21 -0.42
0.01 0.41 -0.54 0.65 -1.32
0.38 -0.16 -0.39 0.37 -0.42
0.03 -0.22 -0.21 0.3 0.04
-0.29 -0.12 -0.62 0.91 -0.46
0.61 0.12 -1.31 0.61 -1.12
0.06 -0.08 -0.62 0.95 -1.22
Ppi_g58791 (LIP2)
 0.51 -0.32 -1.08 0.72 -0.6
-0.58 0.48 -0.33 0.58 -0.62
-0.4 0.23 0.1 0.31 -0.41
-0.34 -0.03 -0.02 0.76 -0.87
0.19 -0.82 -0.07 0.78 -0.68
-2.5 0.42 0.46 0.93 -2.3
0.05 0.26 -0.54 0.73 -1.27
-0.26 -0.35 -0.2 1.06 -1.25
0.12 0.03 -0.28 0.55 -0.71
-0.3 -0.0 0.02 0.52 -0.43
0.2 0.51 0.01 0.17 -1.76
-1.66 0.55 -0.1 0.95 -1.53
0.1 0.15 0.13 0.29 -1.0
-0.41 -0.05 0.21 0.77 -1.23
-0.32 -0.25 -0.74 1.24 -1.33
-0.02 -0.0 -0.05 0.87 -2.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.