Heatmap: Cluster_100 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.0 0.0 0.0 4.41 0.81
Ppi_g21483 (AAc1)
0.0 0.0 0.0 2.89 0.71
0.0 0.0 0.0 5.26 1.06
0.0 0.0 0.0 3.31 0.64
Ppi_g21821 (UBQ14)
0.04 0.29 0.21 21.28 3.94
Ppi_g21834 (BZIP49)
0.0 0.0 0.0 21.24 2.44
Ppi_g21882 (RAB7B)
0.0 0.26 0.24 8.63 1.62
0.0 0.0 0.0 9.17 1.67
Ppi_g21922 (UBC7)
0.0 0.0 0.0 4.69 0.68
0.0 0.0 0.0 21.71 3.42
Ppi_g22127 (PTP1)
0.0 0.0 0.0 2.49 0.24
0.0 0.0 0.0 9.81 1.4
0.0 0.0 0.0 4.57 0.72
0.0 0.0 0.0 10.16 1.28
Ppi_g22209 (DET1)
0.0 0.0 0.0 4.39 0.68
Ppi_g22217 (RLP31)
0.0 0.0 0.0 2.9 0.51
Ppi_g22246 (HK3)
0.0 0.03 0.0 7.92 0.91
0.0 0.0 0.0 3.07 0.36
0.0 0.0 0.0 2.52 0.31
Ppi_g22658 (EIF5A)
0.04 0.73 0.11 18.51 4.54
0.0 0.0 0.0 2.41 0.39
0.0 0.0 0.0 4.42 0.6
0.0 0.0 0.0 7.56 0.91
0.0 0.0 0.0 7.75 1.03
0.0 0.0 0.0 5.81 1.35
Ppi_g23532 (UGE5)
0.0 0.0 0.0 4.35 0.63
0.0 0.0 0.0 3.1 0.48
0.0 0.0 0.0 3.05 0.69
0.0 0.0 0.0 4.5 0.69
Ppi_g23618 (RACK1C_AT)
0.03 0.06 0.0 4.43 0.7
0.0 0.0 0.0 5.34 0.82
0.0 0.0 0.0 24.03 4.24
0.0 0.0 0.0 6.22 0.92
0.0 0.0 0.0 4.38 0.54
0.07 0.05 0.02 2.6 0.61
0.0 0.0 0.0 7.06 1.37
0.0 0.0 0.0 2.16 0.48
0.0 0.0 0.0 58.98 6.37
0.0 0.0 0.0 6.22 1.13
0.0 0.26 0.0 6.84 1.63
0.0 0.0 0.0 3.72 0.65
0.0 0.0 0.0 6.81 1.62
0.0 0.0 0.0 2.09 0.26
0.04 0.18 0.0 7.98 1.75
0.0 0.0 0.0 4.06 0.92
Ppi_g24420 (SDF2)
0.0 0.0 0.0 2.62 0.52
0.0 0.0 0.0 4.83 0.78
0.0 0.0 0.0 3.06 0.46
0.0 0.0 0.0 3.47 1.11
0.0 0.0 0.02 9.34 1.14
0.0 0.0 0.0 2.87 0.37
Ppi_g24869 (ASNAP)
0.0 0.0 0.0 3.81 0.4
0.0 0.05 0.0 15.29 2.04
0.0 0.0 0.0 15.66 2.27
0.0 0.0 0.0 11.32 1.21
0.0 0.0 0.0 25.89 3.18
0.0 0.0 0.0 3.42 0.41
0.0 0.0 0.0 8.67 1.15
0.0 0.0 0.0 9.38 0.91
0.0 0.0 0.0 4.81 1.12
0.0 0.0 0.0 22.02 3.96
0.0 0.05 0.0 6.58 1.49
0.0 0.0 0.0 8.05 1.07
0.0 0.0 0.0 2.9 0.36
0.0 0.0 0.0 31.21 4.08
Ppi_g25639 (ASK2)
0.0 0.0 0.0 9.96 1.54
Ppi_g25652 (SWC2)
0.0 0.0 0.0 8.06 1.06
Ppi_g25696 (TRX1)
0.0 0.0 0.0 7.32 0.89
0.0 0.0 0.0 3.13 0.34
0.0 0.0 0.0 2.18 0.36
0.0 0.0 0.0 6.51 0.9
0.0 0.0 0.0 5.69 1.12
Ppi_g25825 (RAB8)
0.08 0.07 0.0 3.44 0.49
0.0 0.0 0.0 9.15 0.99
0.0 0.0 0.0 6.67 0.83
0.0 0.0 0.0 3.13 0.47
Ppi_g26036 (MSRB2)
0.0 0.11 0.0 2.78 0.56
Ppi_g26068 (NTRA)
0.0 0.0 0.0 2.25 0.36
0.0 0.0 0.03 6.17 0.73
0.06 0.25 0.0 6.39 2.15
0.0 0.0 0.0 4.15 0.56
0.0 0.0 0.0 15.54 2.71
0.0 0.0 0.0 3.74 0.6
0.0 0.01 0.0 61.46 9.3
0.0 0.0 0.0 10.91 1.25
Ppi_g26539 (RPL16A)
0.0 0.15 0.0 6.46 0.94
0.0 0.05 0.0 9.22 1.88
0.0 0.0 0.0 2.4 0.48
0.0 0.0 0.0 3.79 0.49
0.0 0.0 0.0 3.86 0.45
0.0 0.0 0.0 21.65 3.56
0.0 0.0 0.0 11.9 1.76
0.0 0.0 0.0 6.77 0.94
0.0 0.0 0.0 5.08 0.75
0.0 0.0 0.0 2.62 0.31
0.0 0.0 0.0 9.27 0.88
Ppi_g27054 (YKT61)
0.0 0.0 0.0 3.07 0.43
Ppi_g27068 (RANBP1)
0.0 0.0 0.0 6.74 1.39
0.0 0.0 0.0 3.64 0.61
0.0 0.0 0.0 3.04 0.38
0.0 0.0 0.0 3.19 0.48
0.0 0.0 0.0 5.44 1.1
0.0 0.0 0.0 7.99 1.51
0.05 0.1 0.08 19.76 4.16
0.0 0.0 0.0 3.54 0.74
0.0 0.0 0.0 5.36 1.24
0.0 0.0 0.0 10.18 2.13
0.0 0.0 0.0 3.72 0.5
0.0 0.0 0.0 87.33 12.31
0.0 0.0 0.0 7.87 1.02
Ppi_g27896 (PYR6)
0.0 0.0 0.0 3.61 0.65
Ppi_g27971 (P40)
0.01 0.0 0.0 4.25 0.71
0.0 0.0 0.0 2.94 0.31
0.0 0.0 0.0 2.71 0.26
0.0 0.0 0.0 3.55 0.62
0.0 0.0 0.0 4.12 0.66
0.0 0.0 0.0 4.33 0.52
Ppi_g29243 (HHP1)
0.0 0.0 0.0 3.76 0.36
0.0 0.0 0.0 4.43 0.76
0.0 0.0 0.0 5.45 1.43
0.0 0.0 0.0 2.65 0.32
0.0 0.0 0.0 2.88 0.51
0.0 0.0 0.0 4.92 0.61
Ppi_g30272 (LIP1)
0.0 0.0 0.0 7.53 0.9
Ppi_g30456 (ACT11)
0.96 0.57 0.51 293.82 34.35
0.0 0.0 0.0 4.76 0.94
0.0 0.0 0.0 3.94 0.53
0.0 0.0 0.0 2.64 0.37
0.0 0.0 0.0 2.49 0.28
0.0 0.0 0.0 2.59 0.28
0.0 0.0 0.0 6.73 0.9
0.0 0.0 0.0 2.24 0.33
0.0 0.0 0.0 4.39 0.68
0.0 0.0 0.0 2.43 0.37
0.0 0.24 0.0 4.37 1.23
Ppi_g32514 (SULTR4;1)
0.0 0.0 0.0 2.14 0.25
Ppi_g32559 (cycp3;1)
0.0 0.0 0.0 4.13 0.52
0.01 0.02 0.0 2.18 0.5
0.0 0.0 0.0 3.19 0.31
Ppi_g33114 (ftsh4)
0.0 0.0 0.0 3.1 0.38
0.0 0.0 0.0 2.88 0.58
0.0 0.0 0.0 6.28 0.97
0.0 0.0 0.0 3.09 0.41
0.0 0.0 0.0 4.5 1.14
Ppi_g37243 (RAB1C)
0.12 0.09 0.0 11.16 3.1
0.0 0.0 0.0 3.31 0.68
0.0 0.0 0.0 2.83 0.74
0.0 0.0 0.0 3.71 1.05
0.0 0.0 0.0 18.27 1.89
0.0 1.04 0.0 18.02 3.98
Ppi_g43078 (ARFA1F)
0.02 0.17 0.0 15.62 1.47
0.0 0.0 0.0 8.5 1.02
0.0 0.0 0.0 40.99 4.65
0.0 0.0 0.0 29.51 4.55
0.0 0.0 0.0 2.28 0.6
0.0 0.24 0.0 4.43 0.63
0.0 0.0 0.0 2.38 0.51
0.0 0.04 0.08 3.77 0.6

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)