Heatmap: Cluster_224 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d001877 (GRMZM2G452142)
-0.64 -0.79 0.94 1.27 0.3 -0.21 -0.85 -0.56 -1.68 -2.04 -0.67 -0.34 0.55 0.88 -0.37 1.25 -0.08 -0.04 -0.9 -7.38 -0.21 -0.04 -0.62 0.03 0.15 -0.25 -0.31 -0.38 1.0 0.76 -0.34 0.42 -1.91 -0.66 -0.83 0.09 0.88
Zm00001d002345 (GRMZM2G345667)
-1.45 0.23 -0.09 0.47 -0.24 -1.96 -2.76 -0.0 -1.13 -1.35 -0.51 -0.37 0.77 -0.09 -0.56 0.79 0.82 0.81 0.07 -2.4 0.22 0.44 -0.64 0.9 0.54 0.06 0.36 0.04 -1.66 1.43 0.63 -1.5 -0.64 -0.12 0.07 -0.55 -0.55
Zm00001d002369 (GRMZM2G111232)
-4.07 -4.9 0.54 0.19 0.93 -1.45 -1.35 -0.74 -1.59 -1.65 0.48 -0.13 -2.06 1.08 -0.94 0.65 -0.74 -0.3 0.78 -2.62 -1.52 -0.14 0.17 -1.69 -0.14 1.3 0.67 0.09 0.73 1.98 -0.9 -0.61 -0.4 0.3 -1.22 -0.16 0.62
Zm00001d002743 (GRMZM2G078648)
-3.36 -3.51 - -2.05 -0.46 - - 1.15 -4.04 -3.19 - -3.31 2.03 2.86 -0.95 2.21 0.22 -2.72 -2.65 -5.96 0.82 0.45 - -0.69 -0.53 - 0.02 -0.68 - 1.3 2.25 - -6.04 -1.24 -5.78 -0.77 0.07
Zm00001d002980 (GRMZM2G133012)
-0.13 0.39 -0.08 0.33 0.47 -0.86 -1.45 -0.32 -1.59 -1.47 -0.54 0.09 0.76 -0.28 -0.46 0.39 0.85 -0.23 -0.16 -4.88 0.66 0.56 -0.08 0.4 0.26 -0.58 0.78 -0.06 -0.69 0.82 0.37 -0.02 -0.83 -0.42 0.6 -0.35 -0.38
Zm00001d003017 (GRMZM2G003775)
-1.33 -0.95 0.94 -0.82 0.22 -2.22 -0.15 -2.22 -2.56 -2.78 -1.45 -1.25 -2.26 0.51 -2.78 0.84 0.44 0.32 0.1 -0.1 -0.79 -0.6 -1.22 -0.92 0.26 -1.08 0.9 0.53 0.05 1.88 2.5 -1.25 -0.15 0.94 -1.41 -1.46 -1.82
Zm00001d006070 (GRMZM2G013892)
-0.3 -0.22 1.06 -0.71 0.85 -0.62 -0.21 -0.62 -0.31 -0.49 -0.22 0.29 0.08 0.54 -0.36 1.1 0.38 -0.34 -0.07 -1.83 0.13 0.28 -1.48 -0.18 0.5 -0.29 0.32 -0.02 -0.06 0.21 -0.16 -1.01 -1.15 0.16 -0.61 0.15 0.54
Zm00001d007042 (GRMZM2G060109)
-0.21 -0.5 0.13 0.46 0.08 -1.17 -1.06 -0.36 -1.53 -1.46 -0.36 0.05 0.2 0.24 -0.61 -0.11 -0.39 0.51 0.52 -5.38 -0.25 -0.6 0.22 -0.25 -0.07 -1.14 0.04 0.95 0.84 0.47 0.63 0.64 0.82 0.32 -0.31 -0.09 0.25
-0.4 -0.63 0.55 0.33 0.3 -0.25 -0.34 -0.23 -1.13 -0.87 0.47 -0.18 0.29 0.21 -0.76 0.51 0.41 0.24 0.2 -3.36 0.06 0.83 -1.58 0.25 0.27 0.53 -0.14 0.09 0.27 0.29 -0.24 0.14 -0.76 -0.31 0.24 -0.25 -0.05
Zm00001d008502 (GRMZM2G003861)
-0.49 -0.6 0.15 -0.14 0.34 -0.46 -0.39 -0.11 -1.35 -1.4 -0.45 -0.28 -0.29 -0.12 -1.1 0.56 0.8 0.3 0.2 -3.15 0.98 1.01 -0.82 0.29 0.81 0.29 0.07 -0.61 -0.12 0.34 0.79 -0.92 -1.88 -0.08 0.47 -0.27 0.42
Zm00001d008907 (GRMZM2G069816)
-0.48 0.4 0.62 0.19 0.61 0.25 0.5 0.26 -0.38 -0.39 -0.4 0.04 0.58 -0.25 -0.68 0.51 0.78 -0.23 0.41 -5.61 0.03 0.61 -0.77 0.03 0.18 -0.29 0.28 0.02 -3.26 0.94 0.09 -3.46 -1.22 -0.17 -0.29 -0.03 -0.44
Zm00001d009709 (GRMZM2G044591)
-1.62 -1.08 0.51 0.05 0.05 -0.79 -0.59 -0.19 -0.94 -1.15 -1.59 -1.04 0.17 0.7 -1.12 1.04 0.12 0.5 -0.54 -2.27 -1.03 0.22 0.06 0.22 0.4 0.11 0.99 -0.32 2.15 -1.1 -0.29 0.95 -0.88 -0.2 -1.46 -1.1 0.24
Zm00001d010670 (GRMZM2G173195)
-2.22 -0.55 -0.12 0.34 0.98 -4.16 -6.06 -0.75 -1.69 -3.28 -3.82 -1.39 1.8 0.9 -0.14 0.92 0.44 -0.72 -0.95 -10.14 -0.05 0.29 -2.43 0.4 0.15 1.17 0.75 -0.11 -0.64 1.24 1.12 - -2.43 -0.18 1.03 -0.18 -0.11
Zm00001d011092 (GRMZM2G470513)
-0.13 -0.79 -0.27 0.12 -0.09 -0.3 0.77 0.22 -0.98 -1.35 -0.07 -0.23 0.49 0.2 -1.06 0.5 0.29 -0.16 -0.11 -3.3 0.63 1.3 -0.19 -0.01 0.7 -0.15 0.97 0.26 -0.62 -0.06 -0.2 -0.49 -0.39 -0.51 -0.56 -0.39 -0.01
-0.62 -0.38 0.55 -1.36 -0.14 -0.58 -1.34 -0.5 -2.34 -2.5 -1.04 -0.92 -1.62 0.61 -1.49 0.45 0.59 0.33 -0.3 -6.17 -0.39 0.31 0.03 -0.23 0.29 1.08 -0.4 0.01 -0.79 2.1 0.89 -1.72 -1.18 -0.01 1.03 0.05 0.98
Zm00001d011823 (GRMZM2G118636)
1.03 -2.36 0.26 1.35 1.27 -2.18 -6.21 -0.53 -3.63 -4.64 -1.14 -1.57 -2.6 -0.12 -3.13 0.39 0.82 -0.16 1.26 0.63 0.24 -0.23 0.04 0.48 -0.65 -1.42 0.59 0.2 - 1.15 1.33 0.9 -0.74 0.37 -1.67 -1.26 -1.68
Zm00001d011839 (GRMZM2G040309)
1.61 1.14 1.5 1.08 1.52 -3.87 -4.15 -0.19 -1.12 -1.44 -0.94 -0.66 -0.21 -1.47 -1.49 1.28 0.24 -1.39 0.03 -2.36 -1.59 -1.94 -2.19 0.48 -1.58 -1.76 1.96 -0.09 - 0.99 -0.25 -2.46 -2.66 -0.18 -1.84 -0.26 0.41
Zm00001d012140 (GRMZM2G091397)
0.62 -0.69 1.03 0.26 0.84 -1.68 -1.9 -0.6 -1.75 -2.14 -2.15 -0.63 0.83 0.78 -0.85 0.97 0.4 0.0 0.09 -2.94 -0.07 0.43 -0.95 -0.27 -0.32 -0.06 0.76 0.55 -0.16 0.7 0.61 -0.6 -0.11 -0.47 -0.74 0.07 0.11
Zm00001d012173 (GRMZM2G026969)
1.36 0.55 -0.41 0.84 0.67 -1.23 -1.3 -0.34 -0.84 -0.96 -0.91 -0.11 1.34 -0.3 0.3 0.66 0.6 -0.55 -0.46 -3.66 1.04 -0.13 -0.76 0.48 0.43 -0.69 0.52 -0.34 -2.56 -0.03 -0.33 -4.68 0.04 -0.53 -0.29 0.13 -0.33
Zm00001d012204 (GRMZM2G050803)
0.5 -1.6 -1.09 -0.17 0.24 -1.02 -1.83 0.16 -1.83 -1.09 -1.67 -0.56 1.27 1.19 -0.01 0.86 0.0 -0.04 -0.48 -5.71 0.53 0.55 -2.61 0.21 0.52 0.81 -0.68 0.3 -4.88 0.2 0.03 -0.27 -0.02 0.15 1.29 -0.05 0.09
Zm00001d012267 (GRMZM2G047214)
0.86 0.01 0.63 0.05 0.59 -1.01 -1.3 -0.36 -0.7 -0.86 -0.56 0.1 1.17 0.14 0.1 0.47 0.06 -0.36 -0.37 -5.31 0.92 0.36 -1.15 0.29 -0.12 -0.34 0.95 0.52 -1.71 -0.2 0.27 -1.19 -0.15 -0.72 0.05 -0.19 -0.2
Zm00001d012516 (GRMZM5G805026)
-0.51 -1.54 0.84 -0.59 0.16 -3.0 -2.8 -1.81 -3.49 -3.39 -1.89 -2.01 0.37 0.73 -1.89 1.3 -0.34 -1.42 -1.39 -6.52 0.09 1.08 -2.27 -1.04 0.57 0.62 1.16 -0.21 1.85 1.23 1.98 -0.25 -2.62 0.51 -1.19 -1.34 -0.44
Zm00001d012652 (GRMZM2G079257)
0.25 0.59 0.66 0.05 0.07 -0.14 0.02 -0.08 -0.45 -0.27 -0.04 -0.07 0.07 -0.68 -0.41 0.09 0.07 0.21 0.24 -0.59 -0.34 -0.97 0.66 0.33 -0.27 -0.15 0.54 0.63 -1.37 -0.28 0.08 -1.98 -0.05 0.29 0.37 0.1 -0.3
Zm00001d012823 (GRMZM2G384339)
0.37 0.08 1.16 0.6 0.84 -0.17 0.2 -0.33 -0.61 -0.71 -0.41 -0.01 0.11 -0.03 -0.85 0.38 0.33 -0.25 0.03 -4.66 -0.62 -0.8 0.22 -0.28 -0.22 -0.33 1.28 -0.53 -3.29 0.2 -0.0 -0.99 -1.09 -0.35 0.86 0.15 0.35
Zm00001d012880 (GRMZM2G447976)
-0.06 -0.45 0.21 -0.82 -0.39 -0.55 -1.81 0.09 -1.41 -1.94 -1.2 -1.09 0.89 1.27 -0.46 1.15 0.72 0.2 0.1 -2.36 0.97 0.66 -2.07 0.47 1.11 -0.45 -0.21 -0.59 -3.32 1.16 0.59 -2.28 -2.24 -0.89 0.54 -0.4 0.44
Zm00001d013840 (GRMZM2G074314)
0.05 0.28 0.99 0.09 0.09 -0.15 0.31 0.21 -0.94 -0.67 0.41 -0.01 -0.54 0.47 -0.86 0.06 0.26 -0.02 -0.29 -4.31 -1.11 -0.34 -0.25 -0.15 -0.21 0.53 0.37 -0.34 -0.22 0.38 1.07 -3.72 -1.07 0.97 0.47 -0.06 -0.64
Zm00001d014019 (GRMZM2G369939)
0.5 0.32 1.34 0.68 0.46 -0.6 -0.89 -0.58 -0.87 -0.91 0.05 -0.33 0.28 0.69 -0.76 0.31 0.2 -0.05 0.01 -4.45 -0.74 0.78 -0.04 0.14 0.05 0.03 0.03 -0.29 -2.9 0.24 -0.33 -2.73 -0.05 0.45 0.86 -0.22 -0.59
Zm00001d014058 (GRMZM2G167505)
-0.69 0.14 -0.08 0.06 -0.09 -1.47 -0.97 0.35 -1.42 -0.96 -0.58 -0.59 0.26 -0.43 -0.66 -0.05 1.15 0.06 0.21 -4.6 0.52 0.2 -1.21 1.01 -0.47 -0.2 0.17 0.85 0.36 0.68 0.65 -0.34 0.4 -0.14 0.37 -0.61 0.04
Zm00001d014299 (GRMZM2G136901)
0.04 -0.43 0.91 0.35 0.64 -0.22 0.49 -0.11 -0.26 -0.26 -0.13 0.35 0.23 0.71 -0.51 0.64 -0.25 -0.43 0.1 -2.09 0.16 0.0 -0.4 -0.85 0.02 1.22 0.61 -0.55 -0.85 0.25 -0.41 -1.37 -1.97 -0.8 -0.32 0.1 -0.1
Zm00001d015581 (GRMZM2G118939)
-0.12 -0.86 0.73 -0.01 0.43 -0.84 -0.94 -0.11 -1.29 -1.08 0.06 -0.07 1.31 0.07 -0.55 0.67 0.82 -0.43 -1.51 - 0.65 1.78 -1.66 0.17 1.03 0.35 -0.34 0.0 -3.99 -0.45 -0.89 -1.41 -0.37 -0.43 0.52 0.03 -0.39
Zm00001d015842 (GRMZM2G087719)
0.13 -1.05 0.13 0.02 0.46 -0.62 -0.61 0.14 -0.89 -0.96 -0.06 -0.09 0.7 0.5 0.16 0.48 0.61 -0.02 -0.58 -1.53 0.6 1.12 -1.54 0.29 0.54 -0.11 0.18 -0.24 -0.54 0.27 -0.19 -1.05 -0.48 0.03 0.31 -0.08 -0.47
Zm00001d017091 (GRMZM2G116872)
0.75 0.67 0.72 0.44 0.44 -0.0 -0.14 -0.08 -0.1 -0.09 -1.13 0.28 0.2 -0.13 -0.29 0.22 0.56 0.48 0.43 -2.99 -0.33 -0.22 -0.22 0.25 -0.46 0.02 0.4 0.18 -2.17 0.44 -0.2 -3.17 -0.27 -0.69 -0.05 0.1 -0.65
Zm00001d017120 (GRMZM2G031496)
-1.11 -0.42 0.01 0.18 0.43 -1.22 -1.02 -0.74 -1.24 -1.25 0.38 0.01 -0.28 -0.73 -0.85 -0.36 -0.67 -0.1 -0.96 -6.84 -1.27 -0.08 -0.32 -0.11 0.37 -0.1 2.29 -0.04 -0.99 1.2 1.02 -2.9 -0.3 1.34 0.32 -0.25 0.26
Zm00001d017829 (GRMZM2G123796)
-0.97 -1.29 1.5 -0.1 0.78 -0.34 -0.32 -0.68 -0.89 -0.52 -0.44 -0.18 -0.09 0.84 -0.44 0.8 0.08 -0.5 -0.58 -1.74 -1.08 -0.58 -0.21 -0.62 -0.42 -0.0 0.8 0.35 -0.73 0.01 0.74 0.53 0.36 0.18 -1.16 0.26 0.49
Zm00001d018370 (GRMZM2G178958)
0.66 0.7 1.76 0.38 0.38 -0.88 -0.67 -1.06 -0.32 -0.25 0.26 0.26 -0.52 -0.08 -0.47 0.2 -1.14 -0.38 -0.45 -5.39 -0.69 -0.49 -0.12 -0.74 0.26 -0.5 1.97 0.09 -1.21 -0.27 0.0 -1.74 -1.06 -0.64 0.43 0.07 -0.35
Zm00001d018495 (GRMZM2G003028)
0.02 0.25 0.58 -0.31 0.5 -1.57 -1.36 0.19 -1.61 -1.51 -0.42 -0.78 0.14 -0.03 -0.78 1.01 0.7 0.39 -0.24 -2.67 0.59 0.74 -1.29 0.44 1.32 -0.34 1.06 -0.72 -2.53 0.76 0.72 -0.72 -1.0 -0.54 -0.16 -0.44 -0.49
Zm00001d018506 (GRMZM2G101502)
-0.52 0.54 0.91 0.2 0.35 -1.18 -0.85 0.07 -0.57 -1.08 -1.2 -0.22 -0.46 0.52 -0.53 0.72 0.22 -0.46 -0.13 -6.9 0.01 -0.72 -1.85 0.16 0.05 0.37 0.43 0.32 1.27 0.25 -0.57 1.03 -0.26 -0.01 0.5 -0.5 -0.92
Zm00001d018758 (GRMZM2G064799)
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Zm00001d041329 (GRMZM2G061629)
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Zm00001d042088 (GRMZM2G367026)
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0.15 -0.94 0.14 -0.73 -0.09 -0.04 -0.32 0.73 -1.2 -1.06 -1.07 -0.66 0.65 0.95 -0.94 0.97 -0.06 -0.16 -1.31 -2.75 0.65 1.17 -1.03 0.16 1.23 -0.23 -0.26 -0.85 -0.81 0.96 1.09 -2.09 -1.48 -0.17 -0.52 0.01 0.05
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Zm00001d047801 (GRMZM2G161293)
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0.59 -0.03 0.59 0.49 0.6 -0.89 -1.41 -0.46 -1.14 -1.17 -0.89 -0.2 0.81 0.81 -0.03 0.7 0.08 0.17 -0.13 -8.23 0.47 0.22 -0.88 0.48 0.29 -0.25 0.28 0.16 -1.34 -0.45 -0.19 -0.59 -0.1 -0.22 -0.2 0.2 0.64
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Zm00001d047993 (GRMZM2G177878)
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Zm00001d048314 (GRMZM2G178787)
-1.64 -0.37 0.98 1.34 0.59 -1.68 -0.77 -0.42 -0.84 -1.31 -1.06 -0.44 -0.05 0.94 -0.32 1.17 0.36 -0.01 -0.72 -9.3 -0.05 0.8 -0.58 0.38 0.63 0.24 0.33 -0.46 - -1.7 0.5 -4.74 -2.12 0.38 0.67 0.48 0.68
Zm00001d049083 (GRMZM2G173354)
-1.46 -0.59 0.31 0.41 -0.08 -0.39 -0.33 -0.16 -1.05 -1.01 -0.05 -0.49 -0.11 0.66 -0.97 0.29 0.55 0.28 0.56 -2.93 -0.05 0.29 -0.54 0.0 0.35 0.42 0.35 -0.15 0.08 0.79 0.97 -2.67 -0.65 0.71 0.04 -0.39 0.23
Zm00001d050095 (GRMZM2G076389)
1.3 0.49 0.52 1.69 1.01 -2.2 -1.69 -0.88 -2.25 -2.41 -4.04 -1.02 0.84 1.48 -0.3 1.12 0.09 -0.29 -0.82 -5.42 -0.59 -1.06 0.2 -0.16 -0.03 -0.06 0.16 -0.65 - 0.84 0.93 -2.17 -1.62 -0.24 0.45 -0.42 -1.65
Zm00001d050347 (GRMZM2G067277)
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Zm00001d050575 (GRMZM2G140095)
0.17 -0.21 0.92 0.43 0.75 -0.67 -1.07 -0.74 -0.59 -0.67 -0.45 -0.24 0.34 0.62 -0.37 0.51 0.34 0.34 0.34 -3.29 0.02 -0.08 -0.98 0.06 -0.18 -0.1 0.29 0.45 -1.27 -0.05 0.1 0.04 -0.07 -0.23 0.52 0.03 -0.09
Zm00001d050785 (GRMZM2G094871)
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Zm00001d050992 (GRMZM2G087323)
1.48 0.25 -0.17 1.85 0.82 -1.9 -2.27 -1.11 -0.66 -1.71 -1.02 -0.4 0.97 0.62 0.11 0.38 0.23 0.94 0.08 -1.05 0.68 -0.76 -0.63 0.38 -0.05 0.04 0.51 -1.5 -0.64 -0.14 -0.39 -6.48 -3.24 -1.53 -1.14 -0.09 0.06
Zm00001d051584 (GRMZM2G119258)
-1.15 -1.1 -0.37 -0.11 0.88 -0.52 -0.49 -0.18 -1.19 -1.2 -0.35 -0.13 -1.44 1.33 -0.24 0.32 0.28 -0.76 -0.7 -7.51 -0.94 0.39 0.3 -1.22 0.43 2.17 -1.16 0.06 -1.46 1.09 0.5 -2.28 -1.31 -0.02 0.13 0.51 0.49
Zm00001d051977 (GRMZM2G130002)
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Zm00001d052061 (GRMZM2G070138)
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Zm00001d052145 (GRMZM2G158811)
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Zm00001d052182 (GRMZM2G107414)
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Zm00001d052735 (GRMZM2G084406)
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Zm00001d053671 (GRMZM2G058866)
0.15 -1.22 0.31 -0.56 0.2 -0.08 0.56 0.06 -0.89 -0.88 -0.92 -0.09 0.52 0.3 -0.11 0.48 0.66 -0.05 -0.33 -2.01 0.31 1.76 -0.88 0.06 0.75 0.04 0.08 -0.29 -0.49 0.34 -0.44 -2.43 -1.22 -0.6 0.42 -0.08 -0.49

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.