Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.36 0.73 0.17 0.08 1.0
0.51 0.75 0.3 0.02 1.0
0.34 0.72 0.45 0.01 1.0
0.57 1.0 0.74 0.0 0.85
0.33 0.69 0.36 0.06 1.0
0.51 0.89 0.4 0.08 1.0
0.49 1.0 0.48 0.0 0.74
0.66 1.0 0.59 0.07 0.71
0.62 0.71 0.63 0.02 1.0
0.25 1.0 0.06 0.01 0.8
0.48 1.0 0.32 0.04 0.92
0.34 1.0 0.4 0.04 0.55
0.54 1.0 0.34 0.06 0.59
0.38 0.74 0.39 0.23 1.0
Ppi_g08895 (ATB2)
0.55 1.0 0.23 0.03 0.5
0.41 0.66 0.3 0.09 1.0
0.4 1.0 0.31 0.03 0.62
0.45 0.97 0.69 0.14 1.0
0.32 0.73 0.33 0.06 1.0
0.48 0.8 0.25 0.03 1.0
0.43 1.0 0.18 0.14 0.98
Ppi_g09927 (CYP78A7)
0.46 1.0 0.37 0.07 0.99
0.33 1.0 0.41 0.3 0.89
Ppi_g10400 (SSADH)
0.6 1.0 0.39 0.09 0.98
0.52 1.0 0.36 0.05 0.89
0.35 0.82 0.43 0.02 1.0
0.52 1.0 0.28 0.08 0.49
0.32 0.87 0.22 0.07 1.0
0.4 0.83 0.35 0.0 1.0
Ppi_g11199 (ARD4)
0.38 0.81 0.31 0.1 1.0
0.57 0.8 0.0 0.07 1.0
0.31 0.52 0.12 0.13 1.0
0.36 0.96 0.33 0.02 1.0
0.18 0.73 0.28 0.1 1.0
Ppi_g12138 (FDH)
0.54 1.0 0.34 0.12 0.89
0.21 0.73 0.12 0.0 1.0
0.37 0.81 0.42 0.05 1.0
0.26 1.0 0.27 0.04 0.73
0.48 1.0 0.46 0.07 0.88
0.5 1.0 0.5 0.07 0.97
0.7 1.0 0.13 0.03 0.77
0.38 0.78 0.29 0.01 1.0
0.55 1.0 0.42 0.06 0.76
0.46 1.0 0.56 0.03 0.81
0.22 1.0 0.22 0.0 0.73
0.45 1.0 0.26 0.06 0.75
0.43 0.7 0.38 0.01 1.0
0.46 1.0 0.25 0.1 0.49
Ppi_g13873 (PFL)
0.51 0.67 0.33 0.03 1.0
Ppi_g13876 (ALDH2B)
0.45 0.98 0.59 0.09 1.0
0.42 0.9 0.04 0.05 1.0
0.39 0.8 0.38 0.08 1.0
0.31 0.68 0.23 0.02 1.0
0.35 0.77 0.05 0.08 1.0
Ppi_g15251 (PCK1)
0.65 1.0 0.48 0.12 0.88
0.41 0.63 0.32 0.07 1.0
0.46 0.71 0.28 0.0 1.0
0.27 0.97 0.32 0.03 1.0
0.28 0.61 0.24 0.03 1.0
0.59 1.0 0.6 0.07 0.92
0.45 1.0 0.33 0.09 0.72
0.53 0.78 0.31 0.12 1.0
0.61 1.0 0.38 0.05 0.83
0.51 1.0 0.35 0.04 0.85
0.4 0.71 0.46 0.06 1.0
0.56 0.89 0.64 0.08 1.0
0.4 0.67 0.35 0.08 1.0
0.15 1.0 0.33 0.02 0.96
0.41 0.78 0.42 0.0 1.0
0.55 1.0 0.37 0.04 0.55
Ppi_g18392 (CYN)
0.45 1.0 0.4 0.04 0.94
0.53 1.0 0.26 0.01 0.82
0.42 1.0 0.32 0.01 0.71
0.49 1.0 0.09 0.08 0.99
Ppi_g19566 (DRT102)
0.41 1.0 0.22 0.05 0.54
0.33 1.0 0.27 0.0 0.84
0.46 1.0 0.03 0.0 0.96
0.15 1.0 0.15 0.0 0.91
0.32 1.0 0.22 0.0 0.88
0.41 0.84 0.42 0.06 1.0
0.56 0.83 0.38 0.05 1.0
0.25 0.63 0.26 0.0 1.0
0.16 0.86 0.3 0.19 1.0
0.48 1.0 0.27 0.25 0.93
0.59 1.0 0.27 0.27 0.77
0.38 0.73 0.39 0.23 1.0
0.31 0.51 0.34 0.08 1.0
0.6 0.94 0.63 0.03 1.0
0.4 0.74 0.52 0.06 1.0
0.37 0.68 0.44 0.2 1.0
0.57 0.66 0.53 0.07 1.0
0.62 0.84 0.6 0.04 1.0
0.46 0.73 0.38 0.06 1.0
Ppi_g36382 (CBR)
0.27 1.0 0.08 0.0 0.89
0.11 1.0 0.22 0.12 0.94
0.3 0.79 0.08 0.07 1.0
0.43 0.46 0.16 0.0 1.0
0.17 1.0 0.27 0.0 0.92
0.73 1.0 0.34 0.05 0.73
0.26 0.57 0.07 0.15 1.0
0.47 0.74 0.46 0.1 1.0
Ppi_g40966 (HINT3)
0.43 0.7 0.35 0.01 1.0
0.35 0.48 0.35 0.18 1.0
0.69 1.0 0.43 0.03 0.54
0.42 1.0 0.1 0.02 0.81
0.5 0.84 0.32 0.09 1.0
0.35 0.67 0.33 0.0 1.0
0.42 0.72 0.22 0.01 1.0
0.49 1.0 0.2 0.04 0.64
Ppi_g45517 (RPL34)
0.31 0.69 0.23 0.1 1.0
0.32 0.68 0.28 0.01 1.0
0.78 0.98 0.4 0.02 1.0
0.73 0.93 0.21 0.0 1.0
Ppi_g48105 (FDH)
0.45 0.85 0.58 0.07 1.0
0.55 1.0 0.32 0.0 0.99
0.33 0.78 0.45 0.03 1.0
0.67 0.99 0.33 0.27 1.0
0.34 0.61 0.22 0.03 1.0
Ppi_g49757 (ATB2)
0.51 1.0 0.5 0.03 0.81
0.47 0.89 0.31 0.0 1.0
0.48 1.0 0.36 0.08 0.65
0.84 0.81 0.33 0.16 1.0
0.63 0.8 0.46 0.02 1.0
0.44 0.86 0.58 0.04 1.0
0.38 1.0 0.67 0.08 0.97
0.44 1.0 0.1 0.03 0.77
0.45 1.0 0.14 0.0 0.71
0.43 0.76 0.22 0.04 1.0
0.88 0.84 0.18 0.08 1.0
0.54 1.0 0.27 0.1 0.74
0.4 0.79 0.4 0.1 1.0
0.55 1.0 0.13 0.0 0.97
0.43 0.99 0.6 0.05 1.0
0.41 0.91 0.42 0.0 1.0
0.47 1.0 0.28 0.05 0.53
0.35 0.62 0.26 0.03 1.0
Ppi_g56211 (ELF5A-3)
0.36 0.77 0.27 0.26 1.0
0.62 1.0 0.29 0.05 0.96
Ppi_g56438 (SSADH)
0.37 0.8 0.54 0.1 1.0
0.46 1.0 0.38 0.11 0.56
0.31 0.63 0.33 0.2 1.0
0.47 0.68 0.43 0.05 1.0
0.7 1.0 0.5 0.02 0.96
0.51 1.0 0.3 0.05 0.64
0.55 1.0 0.48 0.4 0.72
0.25 0.82 0.07 0.0 1.0
0.44 0.64 0.39 0.02 1.0
0.38 0.72 0.32 0.17 1.0
0.3 0.72 0.22 0.08 1.0
Ppi_g58219 (CYN)
0.47 0.83 0.7 0.04 1.0
0.41 0.6 0.16 0.21 1.0
0.63 1.0 0.4 0.03 0.62
0.4 0.89 0.61 0.06 1.0
0.38 0.82 0.44 0.01 1.0
0.25 0.83 0.35 0.05 1.0
0.43 0.77 0.34 0.18 1.0
0.25 0.59 0.27 0.0 1.0
0.49 0.98 0.37 0.08 1.0
0.3 0.83 0.43 0.04 1.0
0.56 0.93 0.3 0.01 1.0
0.47 0.64 0.43 0.01 1.0
0.37 0.72 0.43 0.12 1.0
0.42 0.65 0.5 0.1 1.0
0.35 0.71 0.36 0.1 1.0
0.4 0.5 0.33 0.01 1.0
0.42 0.79 0.39 0.08 1.0
0.39 0.88 0.49 0.11 1.0
0.47 0.86 0.53 0.0 1.0
0.28 1.0 0.17 0.04 0.97
0.33 0.6 0.36 0.03 1.0
0.3 0.77 0.29 0.1 1.0
0.68 0.91 0.82 0.01 1.0
0.61 1.0 0.14 0.01 0.67
0.53 0.92 0.64 0.06 1.0
0.44 1.0 0.17 0.0 0.78

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)