1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_233 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
Ppi_g00486 (PDIL5-1)
 24.4 26.61 37.36 27.82 33.34
Ppi_g01033 (ERDJ3B)
 23.98 30.42 49.46 28.29 36.4
Ppi_g01132 (HMG1)
 12.93 38.32 116.78 66.98 51.85
Ppi_g01231 (QSO2)
 8.16 8.58 14.33 11.09 11.69
1.45 4.47 13.48 6.15 12.27
12.86 11.26 33.7 20.65 20.72
1.32 3.72 5.98 3.69 4.26
Ppi_g01531 (PFN3)
 200.0 235.84 382.99 243.27 322.08
7.49 11.26 28.47 18.49 22.06
9.13 8.59 12.57 8.41 10.37
Ppi_g02022 (DGL1)
 18.5 26.47 45.18 28.26 31.88
Ppi_g02046 (WIN2)
 60.12 64.75 83.15 69.08 78.25
3.45 4.64 9.02 5.3 7.36
Ppi_g02132 (PP5)
 15.22 18.73 24.85 21.78 23.08
1.11 11.56 33.59 14.9 26.71
Ppi_g02291 (BMY4)
 5.7 12.21 23.06 11.58 15.36
Ppi_g02323 (VEL1)
 8.28 10.71 19.79 14.66 15.25
Ppi_g02344 (STT3A)
 10.33 13.56 22.51 14.61 17.73
Ppi_g02641 (SP7)
 0.6 2.97 5.57 2.59 2.7
14.83 15.43 25.11 18.81 17.9
16.28 21.84 31.89 23.75 24.33
Ppi_g03020 (ELF9)
 8.6 11.62 15.54 12.41 12.67
4.53 5.42 7.0 5.61 6.14
8.92 12.72 15.1 11.71 13.51
Ppi_g03122 (C4H)
 2.63 42.11 130.63 61.66 95.26
Ppi_g03135 (NHX6)
 17.42 21.58 33.09 21.01 24.82
Ppi_g03180 (NSF)
 18.3 20.84 34.56 21.38 24.57
Ppi_g03195 (MAN)
 7.0 7.48 11.76 8.44 10.07
Ppi_g03205 (VHA-A3)
 6.85 9.61 14.74 11.59 14.96
9.49 10.65 16.28 13.75 13.23
5.07 7.19 8.05 6.15 7.2
Ppi_g03595 (ARPC4)
 16.71 19.23 32.25 20.18 23.33
7.38 11.65 17.24 11.46 14.12
3.48 7.52 14.16 8.8 11.63
6.65 8.26 15.9 12.02 17.11
Ppi_g03907 (ALS1)
 3.82 3.99 7.4 5.07 6.62
2.46 3.69 8.75 6.19 5.61
12.59 13.44 27.74 17.43 17.37
Ppi_g04300 (MAMI)
 10.78 17.19 35.36 18.89 23.16
Ppi_g04419 (ZAC)
 11.25 17.73 32.29 19.75 26.34
Ppi_g04585 (CAX11)
 5.75 7.71 15.41 9.85 11.55
1.14 1.8 2.84 1.77 1.54
Ppi_g04639 (PSD2)
 2.15 3.4 10.18 5.28 8.97
Ppi_g04646 (ETR)
 2.05 3.34 6.1 4.42 5.53
4.11 7.47 9.65 7.65 8.47
24.28 35.41 68.46 48.56 48.35
Ppi_g05019 (NPSN13)
 23.82 21.5 49.39 27.74 40.64
Ppi_g05061 (STPP)
 34.6 37.55 61.11 44.77 53.92
9.67 14.8 25.34 18.8 20.96
14.12 19.96 37.47 23.51 27.57
8.16 13.67 25.16 11.0 16.69
2.73 4.26 10.11 6.59 5.55
2.88 4.45 7.06 4.24 6.5
7.94 9.34 17.83 13.47 12.88
Ppi_g05851 (ALDH11A3)
 20.12 30.95 77.18 59.34 62.56
Ppi_g06320 (ATSMO2)
 49.67 69.37 99.68 68.85 93.79
23.18 24.16 32.86 24.54 25.18
Ppi_g06407 (VFB4)
 3.04 5.36 12.72 7.11 9.96
Ppi_g06433 (TMN1)
 9.34 11.69 18.58 15.54 16.51
Ppi_g06447 (CNGC7)
 17.52 22.0 31.96 23.7 30.4
Ppi_g06449 (TPC1)
 4.19 3.73 13.41 8.04 10.72
Ppi_g06453 (PEN2)
 16.34 23.04 32.95 23.5 23.98
26.81 40.31 56.95 46.23 46.75
Ppi_g07415 (SDIR1)
 8.57 13.48 22.39 14.74 17.32
Ppi_g07503 (BSK1)
 19.59 20.18 33.48 25.64 27.51
Ppi_g07508 (IMPA-9)
 5.15 5.69 8.49 6.94 5.9
4.73 4.95 11.98 7.83 12.06
7.16 9.47 14.88 9.5 12.8
5.6 7.62 11.44 7.24 7.18
0.75 1.97 3.17 2.62 3.15
1.11 3.47 12.3 6.85 6.89
0.61 0.97 2.86 1.59 2.83
Ppi_g08849 (MGT9)
 0.5 0.8 2.39 1.05 2.16
11.34 14.61 19.94 13.03 16.65
Ppi_g09241 (FRA1)
 0.04 1.56 4.5 1.5 2.28
3.58 4.96 7.12 5.95 6.66
Ppi_g09290 (AAT)
 17.53 29.06 46.62 23.43 30.39
Ppi_g09742 (ARFC1)
 15.21 20.36 26.19 19.71 21.02
5.77 6.93 10.32 8.68 8.87
Ppi_g10829 (MAB1)
 17.47 19.37 26.42 20.66 22.12
3.28 4.36 8.23 5.35 8.09
Ppi_g11572 (ASP1)
 5.13 15.29 41.59 18.38 27.62
Ppi_g12182 (GDI1)
 75.02 87.26 134.71 88.4 103.18
56.93 60.27 95.39 68.14 80.69
Ppi_g12663 (ENO1)
 15.66 27.63 48.12 30.27 34.46
Ppi_g12672 (SRF8)
 3.89 4.56 12.06 6.75 9.2
20.08 40.19 52.84 39.19 45.65
Ppi_g13145 (NFA3)
 19.08 24.84 42.13 27.89 30.11
8.73 8.08 32.11 14.75 24.9
Ppi_g13411 (AR401)
 18.64 25.56 34.17 24.06 26.07
Ppi_g14072 (AUD1)
 24.11 40.89 63.1 39.6 43.74
13.23 14.5 20.52 14.0 16.6
Ppi_g14622 (ZCW7)
 5.41 6.78 9.39 7.77 7.55
Ppi_g14709 (MAB1)
 55.97 53.74 83.08 59.82 76.3
Ppi_g14876 (DPL1)
 3.33 6.77 8.69 5.81 8.01
4.79 9.3 13.84 6.8 9.62
Ppi_g15156 (SPL1)
 18.09 25.27 48.96 29.47 29.43
Ppi_g15176 (ACX1)
 18.8 28.32 30.54 24.76 26.53
0.6 1.11 2.49 1.32 1.77
9.46 12.42 17.18 12.67 14.41
3.32 10.02 23.11 11.84 12.58
11.11 15.17 22.3 15.78 20.99
1.92 2.83 4.19 2.86 3.21
Ppi_g15628 (ADH)
 7.08 9.39 21.11 8.33 13.79
0.55 1.19 4.87 1.83 2.9
Ppi_g17204 (TUBG1)
 3.59 6.44 12.36 6.31 8.04
0.7 2.7 5.6 2.8 3.23
8.76 29.76 80.37 40.08 50.34
Ppi_g17556 (SSADH)
 16.28 18.44 26.05 19.2 25.33
5.54 8.93 51.99 11.97 32.76
Ppi_g17819 (EXO70A1)
 8.28 10.84 17.84 10.4 12.17
0.04 0.96 3.15 1.37 1.4
0.13 3.44 7.68 2.4 4.54
4.28 19.23 27.57 12.98 18.62
Ppi_g19907 (NHL8)
 5.89 6.68 8.63 6.54 7.69
Ppi_g20177 (P58IPK)
 5.84 8.65 13.2 9.07 10.43
8.25 12.31 15.98 9.53 13.08
4.73 8.68 13.22 8.18 9.22
9.37 13.14 21.6 14.06 17.92
Ppi_g22258 (MMT)
 1.39 3.98 12.22 4.5 9.0
26.44 21.33 66.58 30.56 58.75
0.01 1.14 3.85 1.55 1.34
2.13 2.8 5.51 4.11 3.37
Ppi_g30118 (VHA-E3)
 0.43 2.96 7.29 2.99 4.14
1.52 1.68 4.01 1.68 2.24
1.01 1.59 4.33 2.76 3.68
1.65 2.75 5.81 3.77 5.38
Ppi_g30916 (GRP2)
 15.13 19.16 30.88 22.59 21.69
36.51 42.33 120.5 68.1 106.27
Ppi_g31026 (TPT)
 26.98 37.84 84.6 52.43 65.92
30.56 36.55 51.23 40.0 35.03
9.6 10.32 16.9 11.81 11.43
Ppi_g31228 (ZWI)
 2.05 3.28 5.66 3.1 3.66
4.17 6.09 12.11 8.65 8.86
5.15 8.56 13.47 8.5 8.24
0.0 1.45 2.84 1.41 2.35
Ppi_g32590 (PDF1)
 33.13 42.64 68.54 42.23 48.02
Ppi_g33332 (EIF4A-2)
 112.55 121.89 151.53 121.6 144.31
17.23 19.69 28.47 19.56 27.31
1.43 2.09 3.92 2.43 3.04
Ppi_g35454 (GRF7)
 11.06 14.14 18.35 11.71 15.71
1.86 3.52 22.26 6.56 11.68
Ppi_g36002 (ROPGEF1)
 0.58 1.8 5.82 2.05 3.76
0.08 4.22 4.56 2.66 5.49
Ppi_g39673 (CAM3)
 74.84 109.14 191.62 111.08 147.34
22.59 36.03 67.78 41.28 50.63
0.74 0.78 2.26 1.22 1.76
Ppi_g43520 (HTB4)
 122.03 166.2 288.65 169.02 221.81
0.48 0.84 3.62 1.37 2.12
5.82 5.98 10.16 7.22 7.07
Ppi_g47048 (SPHK1)
 2.9 3.54 5.06 3.23 4.34
33.77 51.07 82.27 51.6 51.89
51.64 50.22 77.32 63.43 62.59
12.93 14.17 39.0 20.89 26.62
7.49 12.68 20.35 13.54 19.52
0.85 1.61 2.4 1.26 1.35
4.36 5.96 10.66 6.45 7.91
4.57 8.06 20.17 11.59 14.33
12.2 49.87 84.75 27.27 48.69
0.76 1.42 6.71 2.81 3.84
4.58 6.99 17.88 11.14 12.71
1.71 4.49 7.26 3.24 6.71
Ppi_g59242 (UGT85A1)
 1.31 10.44 17.99 8.94 17.99
2.05 7.14 8.12 5.1 10.35
Ppi_g60428 (BGLU42)
 3.91 3.96 17.18 5.91 13.29
0.0 0.52 3.6 0.67 2.45
Ppi_g60794 (GTG1)
 5.88 6.98 11.06 7.86 8.67
12.48 19.31 24.51 15.72 22.33
12.55 15.83 29.0 16.83 22.52
0.34 1.87 3.19 1.5 2.92
5.98 9.15 16.23 9.82 10.55
Ppi_g62897 (PDR6)
 0.8 2.19 10.49 3.25 5.57
1.65 2.31 3.02 2.35 3.35

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)