1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
Pp3c10_15700V3.1 (Pp3c10_15700)
 0.0 0.0 2.01 0.32 0.09 0.48 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.74 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.2 0.18 0.09 0.83 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c10_17859V3.1 (Pp3c10_17859)
 0.0 0.0 0.85 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.35 0.09 0.09 0.0 0.04 0.0 0.0 0.14 0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.25 0.04 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01
Pp3c10_2390V3.1 (Pp3c10_2390)
 0.0 0.0 2.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c10_2400V3.1 (Pp3c10_2400)
 0.0 0.0 2.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c10_25320V3.1 (Pp3c10_25320)
 1.51 0.52 2.15 0.13 0.31 0.3 0.04 1.17 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.06 0.19 0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.48 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c11_22080V3.1 (Pp3c11_22080)
 0.0 0.49 1.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 3.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c11_26090V3.1 (Pp3c11_26090)
 0.0 0.0 0.94 0.0 0.02 0.08 0.93 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.04 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c11_26100V3.1 (Pp3c11_26100)
 0.0 0.0 2.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c11_7010V3.1 (Pp3c11_7010)
 0.0 0.0 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c12_10530V3.1 (Pp3c12_10530)
 0.0 0.0 6.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c12_20500V3.1 (Pp3c12_20500)
 0.0 8.76 17.12 4.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 18.73 14.44 1.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c13_3200V3.1 (Pp3c13_3200)
 0.0 0.0 2.82 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c13_3296V3.1 (Pp3c13_3296)
 0.0 0.14 0.8 0.08 1.45 0.27 0.56 0.14 0.03 0.25 0.08 0.18 0.11 0.02 0.42 0.05 0.33 0.22 0.0 0.08 0.31 0.63 0.0 0.17 0.13 0.31 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.09 0.03 0.06 0.0 0.09
Pp3c14_20520V3.1 (emb2731)
 0.0 0.0 3.74 0.64 1.49 3.1 3.18 2.38 0.0 0.21 1.19 0.4 0.0 0.0 0.1 0.0 0.16 0.36 0.0 0.67 0.22 0.36 0.0 0.0 1.41 0.75 1.24 0.19 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.23 0.0
Pp3c14_22070V3.1 (Pp3c14_22070)
 0.0 0.47 1.26 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.36 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c14_3210V3.1 (Pp3c14_3210)
 0.0 0.0 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.32 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
Pp3c14_4662V3.1 (Pp3c14_4662)
 0.0 2.17 13.68 3.29 0.0 0.0 0.0 0.0 2.31 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.15 2.95 2.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.27 0.0 5.92 1.01 0.0 0.0 0.35 0.1 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c15_2880V3.1 (Pp3c15_2880)
 0.0 0.16 1.16 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.19 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.13 0.19 0.0
Pp3c16_22689V3.1 (Pp3c16_22689)
 1.39 0.93 3.52 0.71 2.07 4.08 2.55 3.16 0.15 0.66 0.26 0.19 0.23 0.51 0.28 3.61 1.25 0.99 0.5 0.93 0.63 0.53 0.04 0.32 0.43 1.06 0.23 0.05 0.24 0.24 0.03 1.04 0.12 0.08 0.0 0.02 0.03 0.3 0.1 0.27 0.15 0.4 0.18 0.09 0.18 0.21 0.05 0.11
Pp3c16_2450V3.1 (Pp3c16_2450)
 0.0 0.0 2.6 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c17_1440V3.1 (Pp3c17_1440)
 0.0 0.03 0.52 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.34 0.19 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.03 0.06 0.27 0.0 0.07 0.15 0.06 0.06 0.02 0.06 0.11 0.18 0.05 0.03 0.07 0.04 0.0 0.0 0.03 0.11 0.09 0.09 0.03 0.17 0.04
Pp3c17_18590V3.1 (Pp3c17_18590)
 0.0 0.0 0.54 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c1_40130V3.1 (Pp3c1_40130)
 0.0 0.0 2.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c20_15920V3.1 (Pp3c20_15920)
 0.02 0.38 0.55 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.34 0.28 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c20_22230V3.1 (Pp3c20_22230)
 0.0 1.25 1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c21_3429V3.1 (Pp3c21_3429)
 0.0 0.0 3.41 0.56 0.05 0.84 0.14 0.0 0.0 0.23 0.25 0.16 0.09 0.1 0.13 0.0 0.68 0.9 0.24 0.45 0.18 0.42 0.0 0.36 0.08 0.06 0.0 0.0 0.3 0.15 0.09 0.05 0.25 0.0 0.2 0.0 0.12 0.2 0.2 0.14 0.0 0.11 0.03 0.19 0.2 0.29 0.0 0.09
Pp3c24_16620V3.1 (Pp3c24_16620)
 0.0 11.03 13.35 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.89 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c24_7010V3.1 (Pp3c24_7010)
 0.0 0.0 2.02 0.0 2.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c3_1470V3.1 (Pp3c3_1470)
 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.17 0.0 0.0 0.03 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.28 0.33 0.19 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c3_35890V3.1 (Pp3c3_35890)
 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c3_5790V3.1 (Pp3c3_5790)
 0.0 0.0 1.8 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c5_16790V3.1 (Pp3c5_16790)
 0.0 0.0 1.41 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c5_3860V3.1 (Pp3c5_3860)
 0.0 0.0 4.68 0.0 4.15 9.78 2.31 2.73 0.0 1.19 0.0 0.44 0.69 0.0 0.0 1.54 1.07 0.0 1.18 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 1.79 2.24 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.14 0.63 0.44 0.49 1.2 1.22 0.0 1.17 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 1.67 0.69 0.39
Pp3c5_8940V3.1 (Pp3c5_8940)
 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c6_28960V3.1 (Pp3c6_28960)
 0.0 0.0 4.39 0.0 1.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c7_11480V3.1 (Pp3c7_11480)
 0.0 0.0 2.13 0.4 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.65 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c7_12820V3.1 (Pp3c7_12820)
 0.0 0.0 1.95 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c7_23370V3.1 (Pp3c7_23370)
 0.0 0.0 1.31 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c7_24920V3.1 (Pp3c7_24920)
 0.04 0.0 1.17 0.0 0.17 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c8_15150V3.1 (ORF240B)
 0.0 0.0 1.16 0.07 0.0 0.04 0.1 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.99 0.32 0.32 0.5 0.4 0.23 0.0 0.06 0.05 0.19 0.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.02 0.01 0.06 0.0 0.03 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.03
Pp3c9_16620V3.1 (Pp3c9_16620)
 0.0 1.19 6.22 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c9_21950V3.1 (Pp3c9_21950)
 0.0 0.0 4.65 2.03 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.35 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)