Heatmap: Cluster_105 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.1 0.2 0.22 0.06 0.54 0.62 0.43 0.62 0.21 0.63 0.05 0.05 0.71 0.29 0.19 0.16 0.24 0.29 0.28 0.25 0.22 0.17 0.47 0.25 0.4 0.22 0.48 0.22 0.11 0.5 0.65 1.0 0.5 0.21 0.06 0.32 0.4 0.52 0.09 0.67 0.62 0.35 0.81 0.88 0.21 0.51 0.6 0.17
0.29 0.09 0.09 0.11 0.32 0.16 0.15 0.11 0.12 0.35 0.42 0.38 0.51 0.18 0.16 0.28 0.17 0.09 0.43 0.2 0.16 0.18 0.1 0.03 0.26 0.11 0.23 0.47 0.28 0.56 0.9 0.9 0.58 0.29 0.22 0.9 0.24 0.42 0.29 0.44 0.25 0.24 0.52 0.58 0.24 0.45 1.0 0.26
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.23 0.28 0.0 0.12 0.01 0.02 0.07 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 0.13 0.0 0.01 0.52 0.99 0.33 0.58 0.0 0.0 0.83 0.07 0.08 0.0 0.14 0.02 0.01 0.2 0.09 0.0 0.12 1.0 0.0
Pp3c11_11679V3.1 (Pp3c11_11679)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.16 0.19 0.0 0.1 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
Pp3c11_19480V3.1 (Pp3c11_19480)
0.0 0.1 0.19 0.0 0.25 0.27 0.19 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.02 0.03 0.0 0.06 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.45 0.02 0.07 1.0 0.1 0.03 0.14 0.0 0.0
0.02 0.03 0.01 0.0 0.3 0.22 0.19 0.21 0.03 0.21 0.0 0.0 0.15 0.04 0.05 0.0 0.06 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.24 0.23 0.04 0.04 0.05 0.01 0.04 0.04 0.58 0.03 0.59 0.05 0.22 1.0 0.34 0.16 0.5 0.14 0.22
Pp3c13_16300V3.1 (Pp3c13_16300)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01 0.21 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.05 0.24 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.05 0.7 0.0 0.47 0.25 0.19 1.0 0.03 0.0 0.85 0.18 0.52
Pp3c13_24480V3.1 (Pp3c13_24480)
0.0 0.0 0.06 0.07 0.23 0.04 0.03 0.06 0.0 0.28 0.16 0.11 0.5 0.81 0.56 0.0 0.02 0.02 0.37 0.46 0.4 0.24 0.0 1.0 0.62 0.05 0.38 0.33 0.11 0.18 0.35 0.08 0.22 0.14 0.27 0.19 0.53 0.3 0.43 0.47 0.68 0.46 0.31 0.42 0.24 0.49 0.28 0.29
Pp3c14_21650V3.1 (Pp3c14_21650)
0.0 0.0 0.58 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.09 0.08 0.57 0.2 0.16 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.63 0.0 0.9 0.25 0.22 0.31 0.1 0.16 0.0 0.3 0.0 0.26 0.43 0.38 0.14 0.28 1.0 0.0 0.24 0.11 0.0 0.0 0.25
Pp3c14_8980V3.1 (Pp3c14_8980)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.12 0.09 0.01 0.21 0.05 0.03 0.23 0.09 0.03 0.0 0.04 0.01 0.2 0.05 0.02 0.03 0.01 0.03 0.13 0.0 0.04 0.02 0.01 0.22 0.67 1.0 0.62 0.01 0.0 0.68 0.24 0.13 0.01 0.35 0.1 0.09 0.36 0.31 0.0 0.11 0.61 0.01
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.69 0.07 0.04 0.69 0.29 0.11 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.33 0.08 0.01 0.02 0.05 0.04 0.56 0.98 1.0 0.44 0.06 0.01 0.58 0.14 0.55 0.04 0.8 0.6 0.3 0.85 0.86 0.04 0.65 0.83 0.09
Pp3c15_23960V3.1 (Pp3c15_23960)
0.1 0.16 0.18 0.03 0.46 0.16 0.12 0.13 0.14 0.47 0.06 0.06 0.51 0.32 0.17 0.05 0.22 0.22 0.36 0.3 0.28 0.23 0.08 0.2 0.46 0.1 0.38 0.27 0.22 0.5 0.62 1.0 0.69 0.4 0.18 0.53 0.47 0.5 0.23 0.85 0.37 0.33 0.94 0.77 0.37 0.49 0.99 0.16
0.15 0.11 0.05 0.07 0.74 0.32 0.23 0.44 0.04 0.3 0.07 0.06 0.42 0.21 0.1 0.09 0.06 0.03 0.1 0.07 0.04 0.07 0.09 0.0 0.01 0.01 0.06 0.01 0.38 0.3 0.2 0.07 0.24 0.15 0.02 0.05 0.19 0.26 0.13 1.0 0.3 0.2 0.65 0.34 0.18 0.24 0.2 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.13 0.31 0.25 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.18 0.07 0.3 0.3 0.04 0.69 0.05 0.01 0.95 0.54 0.37 0.03 0.39 1.0 0.93 0.69 0.23 0.05 0.31 0.86 0.22
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.24 0.0 0.0 0.17 0.04 0.07 0.01 0.08 0.0 0.29 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.38 0.7 0.93 0.44 0.02 0.0 1.0 0.14 0.1 0.01 0.29 0.04 0.05 0.26 0.41 0.02 0.08 0.92 0.01
0.03 0.06 0.07 0.05 0.18 0.09 0.12 0.13 0.09 0.6 0.17 0.14 0.54 0.53 0.06 0.05 0.26 0.11 0.47 0.33 0.25 0.15 0.07 0.14 0.36 0.07 0.21 0.02 0.04 0.43 0.56 0.84 0.48 0.07 0.04 0.57 0.24 0.67 0.04 0.89 1.0 0.68 0.96 0.47 0.07 0.66 0.47 0.07
Pp3c1_28740V3.1 (Pp3c1_28740)
0.0 0.0 0.05 0.09 0.18 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.31 0.05 1.0 0.05 0.33 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Pp3c1_34260V3.1 (Pp3c1_34260)
0.0 0.37 0.14 0.09 0.34 0.09 0.15 0.21 0.37 0.34 0.05 0.04 0.29 0.27 0.27 0.19 0.13 0.01 0.13 0.1 0.0 0.02 0.24 0.01 0.02 0.07 0.17 0.0 0.01 0.08 0.18 0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.4 0.01 0.31 0.36 0.6 1.0 0.31 0.09 0.36 0.29 0.03
Pp3c20_5120V3.1 (Pp3c20_5120)
0.18 0.05 0.01 0.04 0.59 0.4 0.42 0.27 0.11 0.24 0.01 0.01 0.24 0.12 0.12 1.0 0.04 0.0 0.16 0.05 0.03 0.09 0.01 0.0 0.01 0.05 0.17 0.12 0.02 0.25 0.27 0.12 0.13 0.07 0.03 0.01 0.13 0.28 0.04 0.45 0.57 0.24 0.4 0.23 0.07 0.34 0.1 0.19
0.01 0.03 0.01 0.0 0.04 0.08 0.06 0.06 0.01 0.26 0.02 0.02 0.48 0.18 0.07 0.1 0.1 0.01 0.25 0.12 0.06 0.05 0.02 0.01 0.04 0.05 0.03 0.04 0.01 0.61 0.75 0.35 0.27 0.01 0.02 0.44 0.12 1.0 0.01 0.29 0.47 0.21 0.4 0.28 0.02 1.0 0.37 0.05
Pp3c22_21953V3.1 (Pp3c22_21953)
0.0 0.0 0.05 0.3 0.07 0.14 0.16 0.45 0.05 0.43 0.11 0.13 0.69 0.28 0.06 0.49 0.59 0.05 0.19 0.48 0.15 0.05 0.0 0.0 0.02 0.38 0.13 0.05 0.06 0.64 0.89 0.6 0.19 0.0 0.02 0.82 0.2 1.0 0.0 0.42 0.7 0.17 0.42 0.43 0.03 0.85 0.29 0.1
Pp3c23_1810V3.1 (Pp3c23_1810)
0.23 0.31 0.44 0.18 0.16 0.23 0.34 0.16 0.11 0.27 0.08 0.13 0.3 0.34 0.13 0.54 0.5 0.11 0.62 0.42 0.21 0.19 0.66 0.52 0.12 0.06 0.11 0.38 0.54 0.68 0.47 0.67 0.48 0.32 0.36 0.25 0.35 0.38 0.3 0.91 0.91 0.72 1.0 0.91 0.37 0.36 0.77 0.62
0.05 0.02 0.01 0.0 0.18 0.15 0.06 0.11 0.19 0.27 0.16 0.1 0.49 0.2 0.2 0.16 0.2 0.01 0.01 0.04 0.03 0.04 0.06 0.0 0.09 0.07 0.18 0.1 0.16 0.21 0.06 0.11 0.15 0.1 0.03 0.04 0.06 0.28 0.08 1.0 0.12 0.43 0.53 0.16 0.16 0.28 0.15 0.12
0.31 0.69 0.08 0.06 1.0 0.79 0.57 0.72 0.51 0.4 0.03 0.02 0.39 0.21 0.17 0.4 0.26 0.08 0.24 0.12 0.12 0.08 0.18 0.2 0.08 0.03 0.02 0.13 0.15 0.3 0.34 0.03 0.57 0.21 0.06 0.18 0.29 0.41 0.1 0.6 0.48 0.31 0.47 0.22 0.28 0.48 0.21 0.18
Pp3c26_1560V3.1 (Pp3c26_1560)
0.09 0.06 0.2 0.11 0.03 0.06 0.05 0.04 0.1 0.27 0.08 0.09 0.44 0.35 0.22 0.19 0.35 0.21 1.0 0.28 0.16 0.2 0.06 0.07 0.2 0.16 0.13 0.19 0.11 0.38 0.59 0.6 0.5 0.22 0.15 0.9 0.32 0.36 0.16 0.45 0.26 0.36 0.48 0.42 0.16 0.36 0.9 0.16
Pp3c26_2320V3.1 (Pp3c26_2320)
0.0 0.0 0.2 0.0 0.02 0.19 0.11 0.24 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.06 0.11 0.0 0.08 0.05 0.46 0.27 0.0 0.13 0.0 0.05 0.31 0.03 1.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02
Pp3c26_4790V3.1 (Pp3c26_4790)
0.18 0.11 0.15 0.08 1.0 0.11 0.11 0.1 0.23 0.42 0.32 0.29 0.62 0.6 0.16 0.16 0.33 0.24 0.45 0.35 0.32 0.26 0.04 0.25 0.52 0.18 0.34 0.14 0.34 0.3 0.61 0.41 0.42 0.22 0.15 0.27 0.4 0.3 0.19 0.81 0.72 0.72 0.82 0.59 0.3 0.31 0.45 0.15
0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.04 0.03 0.03 0.01 0.4 0.02 0.01 0.48 0.49 0.09 0.0 0.03 0.0 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.04 0.01 0.01 0.32 0.6 1.0 0.49 0.0 0.0 0.48 0.23 0.23 0.01 0.48 0.24 0.21 0.45 0.58 0.01 0.22 0.73 0.0
Pp3c2_1220V3.1 (Pp3c2_1220)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c2_32860V3.1 (Pp3c2_32860)
0.0 0.06 0.07 0.01 0.09 0.06 0.06 0.04 0.05 0.25 0.03 0.02 0.1 0.02 0.09 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.26 0.43 0.8 0.68 0.38 0.05 0.01 0.58 0.16 0.23 0.06 0.3 0.14 0.13 0.23 0.41 0.01 0.2 1.0 0.11
0.03 0.05 0.03 0.03 0.08 0.08 0.04 0.06 0.06 0.77 0.18 0.18 0.46 0.28 0.13 0.06 0.12 0.04 0.15 0.11 0.07 0.06 0.02 0.02 0.15 0.07 0.1 0.11 0.18 0.49 0.62 1.0 0.57 0.3 0.3 0.61 0.32 0.85 0.09 0.55 0.4 0.32 0.48 0.82 0.2 0.86 0.85 0.15
0.0 0.05 0.0 0.0 0.23 0.14 0.12 0.03 0.05 0.15 0.44 0.45 0.47 0.51 0.08 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.25 0.11 0.15 0.08 0.02 0.0 0.02 0.05 0.55 0.07 1.0 0.37 0.41 0.69 0.54 0.14 0.41 0.2 0.35
Pp3c4_6530V3.1 (Pp3c4_6530)
0.0 0.01 0.13 0.3 0.0 0.36 0.46 0.07 0.18 0.1 0.0 0.13 0.08 0.16 0.41 0.0 0.12 0.35 0.02 0.22 0.18 0.07 0.0 0.29 0.16 1.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.11 0.0 0.1 0.01 0.05 0.0 0.07 0.08 0.06 0.1 0.2 0.09 0.14 0.02 0.15 0.0 0.0 0.35
Pp3c4_9740V3.1 (Pp3c4_9740)
0.14 0.03 0.0 0.01 0.02 0.03 0.04 0.07 0.06 0.16 0.02 0.01 0.15 0.21 0.18 0.05 0.09 0.0 0.03 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.02 0.34 0.0 0.12 1.0 0.21 0.1 0.17 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.21 0.07 0.21 0.59 1.0 0.04 0.0 0.07 0.88 0.49 0.0 0.0 0.31 0.6 0.18 0.45 0.26 0.17 0.46 0.24 0.11 0.36 0.1 0.42 0.24 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.08 0.07 0.04
Pp3c5_19420V3.1 (Pp3c5_19420)
0.19 0.32 0.01 0.1 0.02 0.05 0.14 0.09 0.53 0.79 0.05 0.04 1.0 0.65 0.47 0.11 0.08 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.18 0.1 0.03 0.15 0.07 0.07 0.1 0.11 0.52 0.09 0.37 0.16 0.27 0.76 0.58 0.1 0.49 0.35 0.25
Pp3c6_25029V3.1 (Pp3c6_25029)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.29 0.0 0.0 0.04 0.15 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0 0.32 0.03 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.19 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.17 0.11 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.3 0.0 0.08 0.0 0.1 1.0 0.23 0.1 0.2 0.06 0.0
0.04 0.03 0.0 0.0 0.03 0.09 0.08 0.08 0.12 0.23 0.03 0.02 0.17 0.07 0.07 0.03 0.09 0.0 0.17 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.07 0.01 0.16 0.28 0.05 0.25 0.36 0.71 0.33 0.03 0.0 1.0 0.15 0.25 0.05 0.34 0.05 0.08 0.31 0.55 0.04 0.22 0.94 0.03
Pp3c7_13340V3.1 (NRT2.4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.01 0.19 0.04 0.01 0.18 0.18 0.02 0.0 0.03 0.0 0.2 0.06 0.04 0.04 0.01 0.19 0.09 0.0 0.01 0.01 0.01 0.18 0.35 1.0 0.48 0.05 0.0 0.81 0.2 0.07 0.03 0.24 0.08 0.11 0.22 0.38 0.02 0.07 0.81 0.01
Pp3c7_1641V3.1 (Pp3c7_1641)
0.0 0.27 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.08 0.12 0.23 0.18 0.22 0.16 0.09 0.0 0.08 0.1 0.26 0.16 0.0 0.0 0.0 0.12 0.25 0.08 0.08 0.0 0.11 0.9
0.25 0.16 0.03 0.03 0.84 0.71 0.87 0.7 0.56 0.41 0.21 0.2 1.0 0.38 0.44 0.31 0.05 0.0 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.42 0.43 0.39 0.5 0.26 0.13 0.16 0.07 0.33 0.48 0.09 0.68 0.77 0.53 0.68 0.48 0.28 0.55 0.3 0.23
0.0 0.17 0.11 0.2 0.08 0.2 0.17 0.15 0.2 0.17 0.02 0.01 0.08 0.03 0.03 0.4 0.29 0.03 0.11 0.63 0.06 0.0 0.02 0.03 0.02 0.09 0.0 0.12 0.36 0.21 0.37 0.13 0.03 0.09 0.34 0.0 0.05 0.6 0.05 0.39 0.36 0.15 1.0 0.1 0.03 0.36 0.22 0.44
Pp3c8_20410V3.1 (Pp3c8_20410)
0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.15 0.11 0.12 0.51 0.18 0.03 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.13 0.18 0.03 0.01 0.08 0.05 0.03 0.0 0.01 0.37 0.02 1.0 0.49 0.44 0.3 0.03 0.04 0.46 0.0 0.34
Pp3c8_7410V3.1 (Pp3c8_7410)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.22 0.02 0.18 0.0 0.14 1.0 0.25 0.11 0.19 0.14 0.01
Pp3c9_1380V3.1 (Pp3c9_1380)
0.0 1.0 0.13 0.05 0.18 0.15 0.07 0.32 0.19 0.84 0.21 0.22 0.82 0.2 0.37 0.22 0.14 0.02 0.03 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.08 0.04 0.19 0.13 0.05 0.15 0.09 0.01 0.1 0.14 0.64 0.04 0.47 0.24 0.22 0.63 0.37 0.09 0.64 0.14 0.18
0.0 0.0 0.04 0.22 0.48 0.0 0.23 0.59 0.0 0.54 0.06 0.11 0.41 0.16 0.41 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.05 0.0 0.0 0.14 0.35 0.31 0.6 0.05 0.52 0.35 1.0 0.19 0.44 0.13 0.21 0.77 0.95 0.53 0.4 0.53 0.47 0.12 0.45 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)