1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
Pp3c10_17710V3.1 (Pp3c10_17710)
 0.0 0.0 4.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c10_22190V3.1 (Pp3c10_22190)
 0.0 0.27 2.01 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c11_17140V3.1 (Pp3c11_17140)
 0.0 0.0 7.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c11_22167V3.1 (Pp3c11_22167)
 0.0 0.36 2.35 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c11_22170V3.1 (Pp3c11_22170)
 0.0 0.0 9.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.3 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.3 0.18 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.17 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
Pp3c12_17310V3.1 (Pp3c12_17310)
 0.0 0.0 1.05 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c13_24434V3.1 (Pp3c13_24434)
 0.0 0.0 7.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c13_3840V3.1 (Pp3c13_3840)
 0.0 0.0 3.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c14_8840V3.1 (Pp3c14_8840)
 0.0 0.0 3.37 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.22 0.05 0.08 0.14 0.05 0.26 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0 0.01 0.09 0.14 0.03 0.0 0.12 0.0 0.0 0.21 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0
Pp3c15_23710V3.1 (Pp3c15_23710)
 0.0 0.69 3.44 0.09 0.0 0.0 0.0 0.32 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c18_11740V3.1 (Pp3c18_11740)
 0.06 0.84 2.21 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.39 0.33 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c18_7610V3.1 (Pp3c18_7610)
 0.0 0.0 1.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c1_22160V3.1 (Pp3c1_22160)
 0.0 0.0 2.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c20_15770V3.1 (Pp3c20_15770)
 0.0 0.93 4.06 0.13 0.12 0.0 0.0 0.0 4.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.77 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c20_23720V3.1 (Pp3c20_23720)
 0.0 0.0 22.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.33 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c20_23870V3.1 (Pp3c20_23870)
 0.0 0.07 1.28 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 2.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c21_4820V3.1 (Pp3c21_4820)
 0.0 0.0 3.43 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c22_17012V3.1 (Pp3c22_17012)
 0.0 0.0 2.07 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 2.63 0.11 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.29 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.05 0.08 0.05 0.0 0.09 0.06 0.06 0.0 0.33 0.0 0.22 0.3 0.0 0.09 0.0 0.37 0.04
Pp3c24_19170V3.1 (Pp3c24_19170)
 0.0 0.0 3.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c24_5369V3.1 (Pp3c24_5369)
 0.0 0.0 2.01 0.66 0.14 1.63 1.33 1.67 2.33 0.16 0.38 0.94 0.05 0.05 0.1 0.0 0.31 0.43 0.0 0.16 0.0 0.05 0.22 0.04 0.07 0.71 0.24 0.68 1.26 0.23 0.3 0.07 0.09 0.43 0.2 0.11 0.08 0.09 0.0 0.03 0.0 0.04 0.08 0.24 0.04 0.2 0.04 0.16
Pp3c24_850V3.1 (Pp3c24_850)
 0.0 0.0 12.47 1.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c25_2940V3.1 (Pp3c25_2940)
 0.0 0.0 4.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.3 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.36 0.41 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Pp3c26_10150V3.1 (Pp3c26_10150)
 0.0 1.64 1.79 0.0 0.04 0.14 0.04 0.05 4.29 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.13 0.26 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c2_2650V3.1 (Pp3c2_2650)
 0.0 0.0 2.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c2_27040V3.1 (Pp3c2_27040)
 0.0 0.0 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c2_33540V3.1 (Pp3c2_33540)
 0.0 0.0 2.74 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 4.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.48 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c4_16080V3.1 (Pp3c4_16080)
 0.06 0.22 3.2 0.89 0.03 0.47 0.15 0.0 1.81 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 1.6 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c4_2500V3.1 (Pp3c4_2500)
 0.0 0.0 2.34 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c4_7560V3.1 (Pp3c4_7560)
 0.0 0.0 1.35 0.03 0.01 0.1 0.41 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c4_7790V3.1 (Pp3c4_7790)
 0.0 0.0 12.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.18 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c5_17710V3.1 (Pp3c5_17710)
 0.0 0.0 5.54 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 2.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c5_25653V3.1 (Pp3c5_25653)
 0.0 0.0 4.1 1.17 0.1 0.42 0.18 0.22 1.73 0.22 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.37 1.29 0.77 0.09 0.4 0.16 0.5 0.0 0.24 0.25 0.84 0.14 0.19 0.13 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.08 0.0 0.01
Pp3c5_29040V3.1 (Pp3c5_29040)
 0.0 0.0 1.17 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c6_12530V3.1 (Pp3c6_12530)
 0.0 1.71 1.42 0.5 0.05 0.16 0.0 0.0 1.75 0.09 0.05 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.86 0.45 0.11 0.2 0.24 0.0 0.0 0.71 0.15 0.21 0.04 0.0 0.12 0.07 0.03 0.09 0.08 0.0 0.0 0.17 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.07 0.0 0.11 0.07 0.05
Pp3c6_5810V3.1 (Pp3c6_5810)
 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c7_5600V3.1 (Pp3c7_5600)
 1.7 2.03 4.25 1.83 0.71 3.1 2.11 2.3 2.09 0.46 0.18 0.18 0.42 0.25 0.92 0.53 0.99 0.6 1.03 0.26 0.18 0.26 0.3 0.42 0.33 0.96 0.37 0.09 0.27 0.4 0.28 0.14 0.16 0.11 0.16 0.2 0.14 0.31 0.07 0.5 0.29 0.43 0.32 0.15 0.09 0.19 0.07 0.71
Pp3c8_11850V3.1 (Pp3c8_11850)
 0.0 0.0 1.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c9_20450V3.1 (Pp3c9_20450)
 0.0 0.0 13.3 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.39 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c9_3990V3.1 (Pp3c9_3990)
 0.0 0.57 1.22 0.0 0.37 0.24 0.17 0.2 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)