Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
Pp3c10_14050V3.1 (Pp3c10_14050)
- - - 2.04 - - - - - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - 4.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c10_22310V3.1 (Pp3c10_22310)
- - 4.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c10_4180V3.1 (Pp3c10_4180)
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.69 - - - - - - - - 5.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c11_25610V3.1 (Pp3c11_25610)
- - 2.72 2.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c11_27010V3.1 (Pp3c11_27010)
- - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - 4.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_18430V3.1 (Pp3c12_18430)
- - 4.24 - - - - - - - - - - - -1.15 - 3.84 - - - - - - - - 3.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_21180V3.1 (Pp3c12_21180)
- - 4.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - -1.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - - - - 3.36 - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c13_13150V3.1 (Pp3c13_13150)
- - 2.26 1.86 - - - - - - - - - - - - 3.34 1.66 - - - - - 2.39 - 4.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c13_19021V3.1 (Pp3c13_19021)
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_13240V3.1 (Pp3c14_13240)
- - - - -0.01 - - - - - - - - - - - 4.13 1.96 - - - - - - - 4.67 - - - -2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_22710V3.1 (Pp3c14_22710)
- 2.28 2.99 0.36 - - - - - - - - - - - 1.23 3.33 1.52 - - - - - - - 4.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_3990V3.1 (Pp3c14_3990)
- - 4.59 - - - - - 2.61 - - - - - - - 2.97 - - - - - - - - 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c15_13750V3.1 (Pp3c15_13750)
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.58 3.35 - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c16_14270V3.1 (Pp3c16_14270)
- - 4.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c16_15820V3.1 (Pp3c16_15820)
- - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.26 - 4.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c16_3060V3.1 (Pp3c16_3060)
- - 3.56 - 3.16 - - - - - - - - - - - 3.26 - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.13 - -
Pp3c17_12640V3.1 (Pp3c17_12640)
- - 4.49 - 3.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_12770V3.1 (Pp3c18_12770)
- - 2.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_15090V3.1 (Pp3c18_15090)
- - - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_4910V3.1 (Pp3c18_4910)
- - - 1.85 - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - - - - - - 4.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c19_11110V3.1 (Pp3c19_11110)
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.17 2.71 - - - - - - - 4.52 - - - -1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c19_18730V3.1 (Pp3c19_18730)
- - 3.07 - - - - - - - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - 5.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c19_21250V3.1 (Pp3c19_21250)
- - 3.65 0.92 - - - - - - - - - - -0.98 2.79 2.83 - - - - - - 2.65 - 3.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c19_50V3.1 (Pp3c19_50)
- - 4.33 - 2.16 - - - - - - - - - - - - -2.73 -24.48 - - - - -0.03 - 4.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_12420V3.1 (Pp3c1_12420)
- - 1.51 2.95 - - - 2.47 - - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - 4.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_19690V3.1 (Pp3c1_19690)
- - 4.73 - - - - - - - - - - - 0.32 - - - - - - - - - - 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_23030V3.1 (Pp3c1_23030)
- - - 2.76 - - - - - - - - - - - - 3.38 - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_3810V3.1 (Pp3c1_3810)
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - 4.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_39710V3.1 (Pp3c1_39710)
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - - - - - - - - 4.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c20_15820V3.1 (Pp3c20_15820)
- - 2.76 - 3.11 - 0.14 - - - - - - - - - 2.07 -0.1 - - - - - - 0.51 3.64 2.88 - - -0.61 - - - - - - - -0.11 - - - 1.14 - - - - 0.38 -
Pp3c20_4110V3.1 (Pp3c20_4110)
- - 0.19 - - - - - - - - - - - - - 3.67 - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c21_14700V3.1 (Pp3c21_14700)
- - 1.02 - - - - - - - - - - - - - 3.99 2.02 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c22_11910V3.1 (Pp3c22_11910)
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.71 2.8 - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c22_12130V3.1 (Pp3c22_12130)
- - 2.24 1.45 - 2.0 - - - 0.04 - - 1.49 2.06 -3.12 - 1.68 0.03 - - - - - - 0.23 4.03 - - -0.39 -0.88 -0.99 - - -0.2 - 0.59 - - - 0.53 - - 0.02 - - - - -
Pp3c22_7125V3.1 (Pp3c22_7125)
- - 1.34 - - - - - - - - - - - -2.13 - 3.47 - - - - - - - - 5.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c23_17450V3.1 (Pp3c23_17450)
- - 3.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c23_5410V3.1 (Pp3c23_5410)
- - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c24_16290V3.1 (Pp3c24_16290)
- 1.87 1.01 - 1.62 - - - - - - - - - - 3.23 3.54 - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c24_8020V3.1 (Pp3c24_8020)
- - 4.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c25_2550V3.1 (Pp3c25_2550)
- - 4.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_11990V3.1 (Pp3c2_11990)
- - 4.05 - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_20460V3.1 (Pp3c2_20460)
- - 2.65 - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - 4.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_30100V3.1 (Pp3c2_30100)
- - 1.24 0.67 - - - - - - - - - - - - 4.02 1.24 - - - - - - - 4.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_4110V3.1 (Pp3c2_4110)
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - 5.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c3_18210V3.1 (Pp3c3_18210)
- - 1.5 3.15 - - - - - - - - - - -2.91 - 2.71 0.51 - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.09 3.11 - - - - - - - - - - -0.9 - 1.24 0.93 - - - - - 0.68 - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c4_15120V3.1 (Pp3c4_15120)
- - 3.67 2.62 - - - - - - - - - - -1.49 - 1.49 1.65 - - - - - - - 4.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c4_18500V3.1 (Pp3c4_18500)
- - 4.0 0.74 - - - - - - - - - - - 1.61 1.36 - - - - - - - 1.18 4.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c4_30310V3.1 (Pp3c4_30310)
- - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.06 - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c4_7230V3.1 (Pp3c4_7230)
- - 4.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c5_12860V3.1 (Pp3c5_12860)
- - - - 1.61 - - - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c5_3950V3.1 (Pp3c5_3950)
- - 4.43 - - - - - - - - - - - -1.38 - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c6_15700V3.1 (Pp3c6_15700)
- 2.6 3.68 1.03 - - - - - - - - - - - - 3.51 1.19 - - - - - - - 3.72 - - - -1.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c6_22510V3.1 (Pp3c6_22510)
- - 1.11 - - - - - - - - - - - - - 3.62 0.17 - - - - - 2.47 - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.63
Pp3c6_9670V3.1 (Pp3c6_9670)
- - - 2.1 - - - - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - 4.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c7_3520V3.1 (Pp3c7_3520)
- - 3.66 - - - - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - 4.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.51 2.95 - - - - - - - - - - - - - 3.11 - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c7_500V3.1 (Pp3c7_500)
- - 3.58 2.68 - - - - - - - - - - -1.04 - 2.91 - - - - - - - - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c9_23470V3.1 (Pp3c9_23470)
- - 3.6 - - 3.17 - - - - - - - - - - - 2.93 - - - - - 2.45 - 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c9_7160V3.1 (Pp3c9_7160)
- - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.24 - - - - - - - - - - - 3.48 - - - - - - 2.35 - 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3s52_120V3.1 (Pp3s52_120)
- - 3.66 - - - - - - - - - - - - - 1.67 - - - - - - - - 5.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3s67_100V3.1 (Pp3s67_100)
- - 3.22 - - - - - - - - - - - - - 3.41 2.0 - - - - - - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3s794_20V3.1 (Pp3s794_20)
- 1.73 3.25 1.22 - - - - 2.23 - - - - - -0.16 - 3.27 - - -1.32 - - - - - 4.1 - - - -5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.