Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_11720V3.1 (Pp3c10_11720)	-	3.52	-	1.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	0.55	-0.44	-	-	-	-	-	-	-	-0.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_12159V3.1 (Pp3c10_12159)	-	-	-	-	0.32	-	-	2.45	-	-	-	-	-	-	-	5.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_20080V3.1 (Pp3c10_20080)	-	4.31	-	-	-	-	-	-	1.16	-	-	-	-	-	-	3.84	1.05	-0.19	-	-	-	-	-	0.05	-	2.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_21500V3.1 (Pp3c10_21500)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.46	2.21	-	-	-	-	-	3.28	-	-	3.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_7960V3.1 (Pp3c10_7960)	-	1.46	1.95	-	1.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.0	3.99	0.7	-	-	-	-	-	-	-	2.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_1220V3.1 (Pp3c11_1220)	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.98	3.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_23470V3.1 (Pp3c11_23470)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.08	3.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_23960V3.1 (Pp3c11_23960)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	4.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_8500V3.1 (Pp3c13_8500)	-	4.45	-	-0.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.23	1.4	-0.06	-	-	-	-	-	-	-	1.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_12530V3.1 (Pp3c14_12530)	-	-	2.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_13670V3.1 (Pp3c14_13670)	-	-	2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.13	2.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_5320V3.1 (Pp3c14_5320)	-	2.97	2.01	-0.78	0.8	-	-	-0.52	-	-	-	-	-	-	-	4.43	2.09	-1.25	-	-	-	-	-0.06	0.77	-	2.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_19470V3.1 (Pp3c15_19470)	-	1.63	-0.12	-	0.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.39	4.91	3.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_6070V3.1 (Pp3c15_6070)	-	3.9	-2.87	0.35	-	-	-1.47	0.16	-	-	-	-	-	-	-6.26	4.34	0.77	-1.99	-	-	-	-	-	-	-	3.0	-	-	-	-6.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_6480V3.1 (Pp3c15_6480)	-	1.67	-	1.83	-	-	-	-	0.76	-	-	-	-	-	-	4.11	3.49	-	-	-	-	-	-	-	-	3.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_5260V3.1 (Pp3c16_5260)	-	2.98	2.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.78	1.54	-	-	-	-	-	-	-	-	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_11620V3.1 (Pp3c17_11620)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.66	4.12	2.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_140V3.1 (Pp3c17_140)	-	3.71	-0.5	1.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.03	4.64	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_22590V3.1 (Pp3c17_22590)	-	4.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_1150V3.1 (Pp3c18_1150)	-	0.06	-0.2	-1.86	-0.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.82	3.44	-	-	-	-	-	-	-	-	2.54	-	-	-	-2.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_19929V3.1 (Pp3c18_19929)	-	3.05	0.35	0.43	0.4	0.78	-0.58	0.83	-	-1.99	-1.52	-	-2.73	-2.61	-2.34	3.65	0.96	1.05	-	0.02	-1.81	0.79	-0.07	-0.91	-1.04	-1.52	-0.95	-0.27	-0.78	-1.69	-1.33	-2.22	-1.45	-0.9	-2.14	-2.1	-2.5	-1.0	-	-1.73	-	-0.57	-1.11	-2.26	-0.18	-0.78	-3.0	-1.24
Pp3c19_620V3.1 (Pp3c19_620)	-	-	-	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.81	3.73	-	-	-	-	-	-	-	-	1.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_15080V3.1 (Pp3c1_15080)	-	4.2	-	-	-	0.82	2.05	-	-	-	-	-	-	-	-	4.46	0.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_20081V3.1 (Pp3c1_20081)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.85	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	3.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_22970V3.1 (Pp3c1_22970)	-	4.38	0.12	-	0.32	-	-	-	0.08	-	-	-	-	-	-	4.52	-0.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_30050V3.1 (Pp3c1_30050)	-	3.8	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.48	3.2	-	-	-	-	-	-	-	-	0.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_31420V3.1 (Pp3c1_31420)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_700V3.1 (Pp3c1_700)	-	3.79	1.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.72	2.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_8700V3.1 (Pp3c20_8700)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.48	4.23	-	-	-	-	-	-	-	-	2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_20820V3.1 (Pp3c21_20820)	-	2.16	0.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.68	2.99	1.16	-	-	-	-	-	-	-	2.59	-	-	-	-2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_20990V3.1 (Pp3c21_20990)	-	2.26	1.36	0.01	-	-	-	-1.95	1.39	-	-	-	-	-	-5.31	4.45	2.48	-0.72	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.57
Pp3c21_2870V3.1 (Pp3c21_2870)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.8	4.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_5320V3.1 (Pp3c21_5320)	0.8	0.98	2.47	0.03	-2.31	-	-	-	1.66	-	-	-	-	-	-4.94	4.47	2.13	-1.88	-	-	-	-	-	-1.26	-	2.83	-	-	-	-6.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_9850V3.1 (Pp3c21_9850)	2.72	-	-	-	0.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_11640V3.1 (Pp3c22_11640)	-	-	-	-	-0.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.79	5.04	3.46	1.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_2320V3.1 (Pp3c22_2320)	-	2.82	1.27	1.43	-3.46	-	-	-	-2.6	-	-	-	-	-	-3.17	4.43	2.77	0.49	-	-	-	-	-	-2.24	-	2.41	-	-	-	-3.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_3600V3.1 (Pp3c22_3600)	-	-	-	-	-0.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.93	-	0.9	-	-	-	-	-	1.15	-	3.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_20250V3.1 (Pp3c23_20250)	-	3.42	-	-	-	-	-	-	2.44	-	-	-	-	-	-2.86	4.42	2.4	-	-	-	-	-	-	-	-	2.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_8570V3.1 (Pp3c23_8570)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.23	3.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_17790V3.1 (Pp3c24_17790)	-	-	0.51	-0.11	-	-	-	-	1.99	-	-	-	-	-	-	4.76	3.32	-	-	-	-	-	-	-	-	2.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_8790V3.1 (Pp3c25_8790)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.76	3.19	1.87	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_38440V3.1 (Pp3c2_38440)	-	-	2.5	2.13	-0.7	2.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.04	2.92	1.64	-	-	-	-	-	-	-	1.97	-	-	-	-3.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_9400V3.1 (Pp3c2_9400)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.29	4.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_29090V3.1 (Pp3c3_29090)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.48	-	-	-	-	-	5.07	3.46	0.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_33130V3.1 (Pp3c3_33130)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.13	-	-	-	-	-	-	-	2.67	-	2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_37740V3.1 (Pp3c3_37740)	-	1.3	2.37	1.37	0.05	-	-	-	3.24	-	-	-	-	-	-	4.45	1.22	-3.34	-	-	-	-	-	-	-	1.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_38000V3.1 (Pp3c3_38000)	-	4.19	1.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-5.4	4.02	2.4	-	-	-	-	-	-	-	-	2.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_8360V3.1 (Pp3c3_8360)	-	-	1.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.96	3.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_14790V3.1 (NRPC1)	-	2.05	-0.64	0.77	-2.54	-	-	-	2.18	-	-	-	-	-	-4.7	4.62	2.08	-	-	-	-	-	-	-	-	2.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_23690V3.1 (Pp3c4_23690)	-	3.33	0.3	-	-	0.64	-	2.61	-	-0.79	-	-	-	-	-1.54	3.41	2.47	-	-	-	-	-	-	0.47	-	2.08	-	-	-	-1.99	-0.59	-	-	-	-	-	-	1.18	-	-	-	-	-	0.82	-	-	0.08	-1.5
Pp3c4_24900V3.1 (Pp3c4_24900)	-	-	0.11	-0.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.8	3.26	-1.3	-	-	-	-	-	-	-	3.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_24920V3.1 (Pp3c4_24920)	-	4.27	-1.15	-0.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.63	3.5	0.48	-	-	-	-	-	-	-	1.34	-	-	-	-3.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_7683V3.1 (Pp3c4_7683)	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.23	4.75	3.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_15080V3.1 (Pp3c5_15080)	-	-	1.37	1.15	-	-	-	-	1.84	-	-	-	-	-	-	4.51	3.3	-	-	-	-	-	-	-	-	2.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_17440V3.1 (Pp3c5_17440)	-	-	2.94	0.31	-0.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_11840V3.1 (Pp3c6_11840)	-	-	1.95	2.77	-	-	-	-	2.42	-	-	-	-	-	-	4.77	1.06	-	-	-	-	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_4830V3.1 (Pp3c7_4830)	-	-	1.75	-	1.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.22	5.06	2.8	-	-	-	-	-	-	-	0.02	-	-	-	-	-2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_780V3.1 (Pp3c7_780)	-	-	3.07	-	-2.95	-0.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.58	4.14	3.35	0.11	-	-	-	-	-	3.0	-	0.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_14940V3.1 (Pp3c9_14940)	-	-	2.4	2.39	-0.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.26	4.61	2.12	-1.45	-	-	-	-	-	-0.02	-	2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s203_50V3.1 (Pp3s203_50)	-	2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.75	2.92	-	-	-	-	-	-	-	-	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.