Heatmap: Cluster_144 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - - 3.52 0.13 2.1 3.31 2.45 - - - - - - - 2.06 -0.35 1.08 - - - - -0.14 2.92 - -2.16 - - - -4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c10_7630V3.1 (Pp3c10_7630)
- - -0.66 -0.99 0.35 3.22 4.5 2.32 - -0.53 -1.66 - 1.31 -1.37 0.1 - -1.65 0.93 - - - - -0.62 - - - -1.48 - - -2.37 -2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -2.3
Pp3c10_7670V3.1 (Pp3c10_7670)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.13 3.69 1.35 1.25 4.6 2.15 - - - - - - -6.52 - -3.15 - - - - - - - - -1.98 - - - -5.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c11_23198V3.1 (Pp3c11_23198)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c11_791V3.1 (Pp3c11_791)
- 0.01 -1.11 3.41 -0.77 2.23 3.8 3.13 0.59 - - - - - -7.32 0.87 1.3 -3.32 - - - - - - - 1.06 - - - -7.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_10510V3.1 (Pp3c12_10510)
- - - - - 1.97 5.0 - - - - - - - - 1.71 1.46 - - - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_14120V3.1 (Pp3c12_14120)
- - -2.12 3.5 2.38 2.14 4.04 2.1 2.3 - - - - - -6.59 - -0.83 -3.17 - - - - - - -1.65 -2.58 - - - -4.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_23560V3.1 (Pp3c12_23560)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c13_14070V3.1 (Pp3c13_14070)
- - - 2.78 - - 5.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c13_22320V3.1 (Pp3c13_22320)
- -0.21 - 2.82 -1.51 2.45 4.38 2.53 2.7 - - - - - - - -0.22 - - - - - - - - -1.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c13_22330V3.1 (Pp3c13_22330)
- 1.21 -0.84 3.64 -0.2 1.95 3.82 2.26 1.98 - - -4.25 - - -6.09 0.87 0.65 -3.61 - - - - - -5.28 - 0.54 - - - -7.6 - - - - - - - - - -5.64 - - - - - - - -
Pp3c14_13091V3.1 (Pp3c14_13091)
2.72 0.14 -2.72 -1.21 0.45 0.72 3.58 2.22 2.8 -2.57 -3.46 - -2.86 -2.72 -0.65 0.03 1.15 1.58 0.52 -0.29 -1.83 -1.59 0.01 -3.87 -2.39 -1.08 -3.01 -3.18 -5.55 -3.5 -6.14 - - - - -5.14 - -1.58 - - - - - -3.83 -5.37 -2.11 - -4.4
Pp3c14_16820V3.1 (Pp3c14_16820)
- - - - -0.25 3.3 4.69 2.2 - - 0.87 - - - -3.24 - - - - - - - - - - - - 1.01 - -2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.5
Pp3c14_20600V3.1 (Pp3c14_20600)
- - - - - - 5.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_22610V3.1 (Pp3c14_22610)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c15_7670V3.1 (Pp3c15_7670)
1.37 - 0.71 1.96 - 2.15 3.88 3.54 1.62 - - - - - - 1.65 0.98 - - - - - - - - -0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c17_2102V3.1 (Pp3c17_2102)
-1.03 -4.48 -2.51 3.81 2.64 2.43 3.44 2.72 1.61 -6.39 - - - - -6.78 -0.56 -2.86 -4.96 - -4.53 -4.94 - -4.25 - - -3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c17_7500V3.1 (Pp3c17_7500)
-1.95 - 0.52 -2.56 -1.11 2.75 3.8 2.5 1.05 - 2.39 2.76 - - - - - -1.11 - - - - 0.42 -1.0 - - -1.16 -1.85 -0.96 -3.52 -3.14 - - - 0.27 - - - - - - - - - -2.03 - - -3.75
Pp3c17_9470V3.1 (Pp3c17_9470)
- - - - -0.21 2.85 4.99 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_1990V3.1 (Pp3c18_1990)
-1.61 0.94 - 3.43 0.61 1.92 4.12 3.18 -1.36 - - - - - - 0.53 -0.47 -2.57 - - - - - - - -1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_1998V3.1 (Pp3c18_1998)
-1.74 1.15 -2.05 3.22 1.01 2.11 3.84 2.63 0.89 - - - - - -6.6 2.16 0.24 -1.89 - -3.77 - - - -3.76 -4.98 0.2 - - - -8.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_2630V3.1 (MAP70-2)
- 2.56 2.41 1.69 - 1.27 4.31 2.46 - - - - - - -5.95 0.77 1.33 - - - - - - -1.82 - 0.15 - - - -3.59 - - -2.87 - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_4970V3.1 (Pp3c18_4970)
0.27 -1.56 -1.2 3.37 2.03 2.05 3.61 3.19 1.4 -7.04 -7.67 -8.05 -4.64 -3.67 -6.23 0.81 -1.84 -2.04 -7.46 -6.22 -8.87 -7.38 -4.85 -1.95 -4.86 -1.57 -4.48 - - -4.84 -8.87 - -7.69 -6.35 - - - - -5.23 -8.21 -3.39 -3.45 -6.6 -8.1 -7.5 - - -7.2
Pp3c19_17240V3.1 (Pp3c19_17240)
- - - - - - 5.14 3.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_21780V3.1 (Pp3c1_21780)
- - - 3.82 1.29 1.87 3.85 2.49 0.84 - - - - - - - - -1.64 - - -0.61 - - 0.9 0.79 - - - -1.47 - - - - - - - - -1.06 - - - - - - - - -0.86 -
Pp3c1_34640V3.1 (Pp3c1_34640)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_34850V3.1 (Pp3c1_34850)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_3771V3.1 (Pp3c1_3771)
1.89 - -0.8 0.88 -5.31 2.92 3.23 2.34 - -0.84 -1.57 -0.94 -1.94 -0.9 -1.3 -3.59 0.0 -0.93 - - -2.19 -1.77 -2.68 -1.94 0.24 0.63 -0.42 -1.16 1.12 -1.94 -0.01 -0.29 -1.55 -0.83 0.44 -2.23 -0.63 -2.64 -1.4 -2.5 -0.33 -0.65 -1.52 -2.09 -1.65 - -4.02 -1.84
Pp3c20_20740V3.1 (Pp3c20_20740)
- 2.53 1.33 3.96 -0.88 1.6 3.19 1.8 1.48 - - - - - -4.89 -0.17 1.05 -1.47 - - - - - - - 0.82 - - - -3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c20_9550V3.1 (Pp3c20_9550)
-4.36 - -0.88 4.16 0.91 1.43 3.61 3.65 -3.11 - - -4.63 - - - - -3.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c21_19490V3.1 (Pp3c21_19490)
2.06 1.31 -0.48 0.47 -2.73 1.76 3.19 2.11 -0.27 -1.84 -2.72 -4.55 -2.69 -4.01 -2.3 1.51 0.47 -0.13 0.95 -1.16 -0.47 -1.37 -0.72 -1.39 -1.76 -0.51 -0.04 0.11 -1.5 -1.41 -2.28 -1.48 -1.83 -1.29 -0.17 -1.9 -1.76 -0.49 -2.08 -0.92 -3.88 -2.83 -1.17 -1.88 -1.95 -0.95 -1.19 -0.3
Pp3c21_22160V3.1 (Pp3c21_22160)
- - - 4.13 - 3.79 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c21_7000V3.1 (Pp3c21_7000)
-0.7 0.49 -2.12 3.34 0.07 1.65 4.29 3.03 0.45 - - - - - -7.6 -0.14 -1.41 -1.49 - - - - - - - -0.42 - - - -6.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c21_9930V3.1 (Pp3c21_9930)
1.67 -0.34 -0.14 2.57 -0.31 2.73 3.75 3.64 - - - - - - - 1.1 -1.15 - - - - - - - -2.0 -1.6 - - - -5.17 -1.77 - - - -1.79 - - - - - - - - - - - - -
Pp3c22_12750V3.1 (Pp3c22_12750)
-2.37 -1.5 - 3.71 1.93 1.7 3.95 2.92 1.9 - -2.71 -3.38 - - -8.18 -3.09 -4.34 - - - - - - - - -4.49 - - - - - - - - - - -4.54 - - - - - - - - - - -
Pp3c22_7210V3.1 (Pp3c22_7210)
- - - - - 4.04 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.91 - - - - -0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c23_11220V3.1 (Pp3c23_11220)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c24_18767V3.1 (Pp3c24_18767)
2.71 1.94 0.4 - -0.52 1.69 3.55 1.47 - 0.13 - - -2.47 - -1.23 - -1.32 -3.22 - -0.77 -0.85 - - - - -3.36 - - - -0.17 0.35 -1.81 -1.39 -3.6 - -2.39 -3.33 -2.28 - 0.13 1.9 1.01 -0.41 -0.88 - -2.89 1.24 -1.53
Pp3c25_14700V3.1 (Pp3c25_14700)
- - - - 3.13 4.15 4.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_27150V3.1 (Pp3c2_27150)
- - - - 3.84 - 5.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_27170V3.1 (Pp3c2_27170)
-3.63 1.1 -1.86 3.8 0.2 2.26 4.03 2.11 -0.44 - -4.98 - - - -8.47 1.09 -0.75 -3.15 - - - - - -3.25 - 0.31 - - -6.45 -6.66 - - - - -6.24 - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_5080V3.1 (Pp3c2_5080)
-3.44 - -5.61 3.87 2.04 2.42 3.48 3.63 -3.04 - - - - - -9.83 -6.15 -5.82 -6.36 - - - - - - - -4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_5230V3.1 (Pp3c2_5230)
3.82 - - 2.48 1.97 0.7 4.11 1.41 -0.16 - - - -0.37 - - - - - - - - - - - 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c3_15124V3.1 (Pp3c3_15124)
- - 2.08 - - - 4.79 - - - - - - - - - 2.55 - - - - - - 2.27 0.7 1.09 - - - -0.99 - - 0.18 - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c3_24330V3.1 (Pp3c3_24330)
3.56 - - 3.14 0.51 2.32 3.41 2.9 0.35 - - - - - - 0.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c3_6530V3.1 (Pp3c3_6530)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c5_14040V3.1 (Pp3c5_14040)
- - - - 2.32 4.28 4.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c5_19810V3.1 (Pp3c5_19810)
- - - 3.63 2.29 - 4.64 2.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c5_6279V3.1 (Pp3c5_6279)
- - - 1.58 1.28 2.17 3.79 2.89 -2.26 -2.12 -1.39 -3.57 -2.94 -0.13 -4.65 - -1.94 -0.62 - -2.15 -1.97 -1.27 -1.38 - -0.93 -0.53 -3.24 -1.37 0.51 -0.99 -2.55 -2.59 -2.1 -0.88 1.99 - - -2.12 -2.74 -1.52 -0.11 -1.2 -1.53 -1.79 -1.95 -1.66 -1.22 -2.44
Pp3c6_21410V3.1 (Pp3c6_21410)
- - - 2.4 - - 4.87 - 2.63 - - - - - - 2.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c7_15650V3.1 (Pp3c7_15650)
3.46 0.04 - 0.48 0.66 2.59 2.86 2.25 1.87 0.49 -2.3 -3.34 -1.83 -4.65 -0.72 0.49 - -1.01 - -3.69 - -1.67 - -4.14 -2.77 -2.17 - - - -2.19 -3.29 -1.04 - - - - - 0.28 - -0.48 -4.02 -0.54 -1.28 -1.04 - -0.04 -1.15 -3.8
Pp3c7_18590V3.1 (Pp3c7_18590)
- - - 2.96 - 1.88 4.49 - - - - - - - - - 2.15 - - - - - - 2.02 - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c7_4910V3.1 (Pp3c7_4910)
- -4.29 -1.16 3.74 -1.37 2.29 4.08 3.12 -0.06 - - - - - -6.7 -3.07 -0.15 - - - - - - -4.13 - 0.29 - - - -8.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c8_12480V3.1 (Pp3c8_12480)
- - - - - - 5.1 - - - - - - - - - 2.12 - - - - - - - 1.63 - 1.74 - 1.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c8_20656V3.1 (Pp3c8_20656)
- -1.24 -1.96 3.22 2.4 1.61 4.15 1.68 1.67 - 0.41 1.28 - - - - 0.07 -1.54 -5.98 - - - - -4.14 -3.19 - - - - -6.75 - - -4.2 - - - - - -3.73 - - - - - - - - -
Pp3c8_4520V3.1 (Pp3c8_4520)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c8_9410V3.1 (Pp3c8_9410)
- - - 4.52 - 2.47 3.75 - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c8_9439V3.1 (Pp3c8_9439)
2.68 0.58 2.25 2.84 -5.38 1.61 3.54 1.63 -0.34 - - - - - -7.31 -1.69 -1.05 1.61 - -2.99 -2.97 - - 1.25 -1.19 -1.51 - -1.77 -1.86 -2.83 -2.06 -2.47 -3.99 -4.06 - - -1.96 -3.87 - -3.51 -3.36 -4.25 -3.19 - - -2.84 -2.63 -4.19
Pp3c9_12620V3.1 (Pp3c9_12620)
- - - -2.05 1.52 3.19 4.65 3.2 - - - - - - - - -0.08 - - - - - - - - -0.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c9_20760V3.1 (Pp3c9_20760)
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c9_2230V3.1 (Pp3c9_2230)
- 2.5 1.44 0.59 1.44 3.12 4.03 1.97 2.11 -4.89 - - - - -7.17 -3.7 0.1 -2.54 - -2.47 -3.98 -3.91 - -4.3 -4.8 -1.29 - - - -8.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - -6.27
Pp3c9_6065V3.1 (Pp3c9_6065)
- - - 3.22 3.06 - 4.41 1.97 - -2.13 - - -1.61 - -4.29 - -1.29 - - - - - - - - -0.12 - - - -1.33 -2.31 - -2.22 -0.95 - - - - - - - - -1.3 - - -1.32 -0.1 -2.68

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.