Heatmap: Cluster_137 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_2760V3.1 (Pp3c10_2760)	0.39	0.38	0.8	0.29	0.19	0.28	0.17	0.18	0.41	0.64	0.03	0.02	0.39	0.31	0.37	0.59	0.66	0.81	0.41	0.43	0.44	0.57	0.2	0.84	0.48	0.51	0.19	0.47	0.35	0.38	0.45	0.2	0.52	0.51	0.23	0.38	0.45	0.89	0.28	0.5	0.28	0.36	0.35	0.45	0.29	1.0	0.5	0.26
Pp3c11_3130V3.1 (FLU)	0.18	0.32	0.42	0.1	0.25	0.26	0.3	0.26	0.26	0.68	0.02	0.02	0.37	0.15	0.34	0.14	0.49	0.56	0.44	0.51	0.49	0.37	0.09	0.22	0.28	0.17	0.11	0.71	0.43	0.6	0.65	0.5	0.52	0.67	0.14	0.71	0.52	0.99	0.32	0.28	0.03	0.05	0.33	0.59	0.33	1.0	0.75	0.34
Pp3c11_8730V3.1 (Pp3c11_8730)	0.07	0.28	1.0	0.03	0.15	0.28	0.19	0.14	0.04	0.05	0.0	0.0	0.08	0.02	0.03	0.0	0.07	0.0	0.05	0.13	0.17	0.09	0.04	0.0	0.03	0.02	0.09	0.71	0.05	0.44	0.75	0.4	0.39	0.29	0.03	0.16	0.73	0.27	0.19	0.34	0.24	0.27	0.58	0.49	0.28	0.25	1.0	0.44
Pp3c13_21030V3.1 (Pp3c13_21030)	0.11	0.12	1.0	0.13	0.12	0.2	0.09	0.09	0.0	0.51	0.03	0.01	0.21	0.2	0.06	0.0	0.77	0.32	0.35	0.51	0.33	0.21	0.01	0.06	0.23	0.06	0.23	0.37	0.33	0.42	0.65	0.93	0.33	0.45	0.15	0.3	0.36	0.68	0.13	0.26	0.04	0.06	0.17	0.27	0.17	0.63	0.21	0.31
Pp3c13_2320V3.1 (Pp3c13_2320)	0.64	0.48	0.97	0.46	0.14	0.22	0.42	0.4	0.29	0.61	0.3	0.28	0.71	0.84	0.43	0.29	0.94	0.97	0.63	0.66	0.68	0.58	0.42	0.51	0.94	0.54	0.67	0.67	0.74	0.76	0.47	0.67	0.63	0.82	0.34	0.58	0.63	0.81	0.63	0.66	0.64	1.0	0.74	0.68	0.5	0.79	0.71	0.93
Pp3c14_11170V3.1 (Pp3c14_11170)	0.09	0.24	1.0	0.24	0.01	0.49	0.36	0.76	0.14	0.06	0.08	0.05	0.04	0.03	0.02	0.2	0.19	0.15	0.2	0.14	0.07	0.1	0.03	0.01	0.07	0.1	0.07	0.27	0.07	0.18	0.09	0.24	0.13	0.15	0.1	0.13	0.07	0.14	0.05	0.17	0.09	0.09	0.14	0.13	0.14	0.17	0.06	0.57
Pp3c14_3630V3.1 (Pp3c14_3630)	0.23	0.73	0.84	0.05	0.17	0.28	0.14	0.23	0.13	0.38	0.01	0.0	0.16	0.08	0.12	0.14	1.0	0.21	0.37	0.62	0.23	0.14	0.07	0.08	0.06	0.05	0.03	0.04	0.05	0.12	0.13	0.12	0.17	0.12	0.03	0.03	0.04	0.55	0.03	0.15	0.09	0.1	0.24	0.25	0.09	0.53	0.09	0.04
Pp3c15_1830V3.1 (POK2)	0.07	1.0	0.19	0.07	0.12	0.21	0.15	0.33	0.21	0.0	0.03	0.03	0.05	0.02	0.11	0.56	0.17	0.02	0.11	0.04	0.0	0.01	0.51	0.2	0.0	0.14	0.0	0.18	0.09	0.46	0.19	0.05	0.26	0.21	0.0	0.26	0.0	0.26	0.12	0.25	0.08	0.11	0.2	0.32	0.0	0.31	0.0	0.04
Pp3c16_25500V3.1 (Pp3c16_25500)	0.28	0.58	0.12	0.26	0.03	0.02	0.04	0.01	0.39	0.09	0.01	0.0	0.05	0.06	0.02	0.33	0.3	0.14	0.0	0.02	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.24	0.02	0.08	0.11	0.49	0.04	0.02	0.11	0.12	0.04	0.02	0.04	0.92	0.05	0.23	0.07	0.15	0.08	0.23	0.05	1.0	0.05	0.05
Pp3c17_9590V3.1 (Pp3c17_9590)	0.0	0.22	0.01	0.0	0.1	0.5	0.17	0.34	0.0	0.15	0.0	0.0	0.07	0.05	0.01	0.34	0.03	0.23	0.0	0.03	0.07	0.07	0.03	0.91	0.89	0.08	0.43	1.0	0.35	0.34	0.3	0.9	0.22	0.27	0.08	0.4	0.41	0.76	0.12	0.17	0.06	0.03	0.16	0.26	0.11	0.82	0.24	0.35
Pp3c18_15660V3.1 (Pp3c18_15660)	0.68	0.6	0.96	0.42	0.07	0.24	0.37	0.27	0.64	0.48	0.24	0.25	0.76	0.69	0.39	0.55	0.36	0.79	0.41	0.31	0.26	0.36	0.15	0.32	0.36	0.44	0.28	0.62	0.55	0.69	0.48	0.39	0.43	0.61	0.61	0.42	0.49	0.95	0.51	0.5	0.38	0.46	0.57	0.49	0.44	1.0	0.46	0.54
Pp3c18_19690V3.1 (EXPA6)	0.02	0.18	0.15	0.02	0.26	0.29	0.2	0.36	0.12	0.07	0.0	0.0	0.03	0.08	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.08	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.14	0.76	0.36	0.06	0.57	0.16	0.01	0.65	0.12	0.15	0.05	0.29	0.0	0.01	0.07	0.09	0.13	0.18	1.0	0.02
Pp3c19_7670V3.1 (Pp3c19_7670)	0.45	0.65	0.78	0.76	0.29	0.37	0.42	0.38	0.62	0.61	0.46	0.46	0.91	0.76	0.44	0.61	0.83	0.74	0.4	0.37	0.37	0.53	0.07	0.56	0.76	0.9	0.83	0.56	1.0	0.58	0.76	0.42	0.57	0.65	0.67	0.36	0.79	0.67	0.5	0.56	0.61	0.59	0.55	0.49	0.46	0.69	0.55	0.5
Pp3c1_10719V3.1 (Pp3c1_10719)	0.0	0.08	0.17	0.01	0.03	0.19	0.01	0.29	0.58	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.17	0.02	0.0	0.03	0.0	0.01	0.11	0.16	0.0	0.15	0.02	1.0	0.0	0.64	0.16	0.0	0.06	0.08	0.0	0.0	0.14	0.01	0.0	0.1	0.25	0.51	0.03	0.13	0.0	0.02	0.0	0.76
Pp3c1_15380V3.1 (Pp3c1_15380)	0.57	0.83	1.0	0.45	0.28	0.54	0.48	0.46	0.91	0.69	0.52	0.49	0.71	0.48	0.61	0.47	0.94	0.72	0.84	0.83	0.7	0.63	0.36	0.15	0.42	0.46	0.35	0.72	0.68	0.69	0.55	0.8	0.65	0.83	0.62	0.64	0.64	0.84	0.47	0.66	0.49	0.55	0.6	0.76	0.54	0.85	0.81	0.58
Pp3c20_210V3.1 (Pp3c20_210)	0.01	0.07	0.13	0.12	0.0	0.11	0.06	0.02	0.05	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.03	0.32	0.12	0.25	0.02	0.0	0.0	0.0	0.17	0.51	0.01	0.11	0.02	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.14
Pp3c20_449V3.1 (Pp3c20_449)	0.08	0.16	0.22	0.07	0.01	0.32	0.16	0.13	0.06	0.02	0.13	0.12	0.03	0.09	0.03	0.14	0.2	0.81	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.4	0.13	0.31	0.09	0.02	0.22	0.4	0.02	0.01	0.02	0.04	1.0	0.09	0.02	0.02	0.09	0.02	0.09	0.1	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.19
Pp3c20_481V3.1 (Pp3c20_481)	0.08	0.16	0.22	0.07	0.01	0.32	0.16	0.13	0.06	0.02	0.13	0.12	0.03	0.09	0.03	0.14	0.2	0.81	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.4	0.13	0.31	0.09	0.02	0.22	0.4	0.02	0.01	0.02	0.04	1.0	0.09	0.02	0.02	0.09	0.02	0.09	0.1	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.19
Pp3c21_18410V3.1 (EDR2)	0.07	0.01	0.77	0.11	0.07	0.07	0.06	0.09	0.03	0.13	0.02	0.01	0.13	0.1	0.05	0.2	0.06	0.27	0.2	0.03	0.03	0.05	0.08	0.95	0.28	0.08	0.02	0.54	0.52	0.34	0.56	0.2	0.45	0.43	0.18	0.26	0.61	0.94	0.16	0.29	0.25	0.25	0.27	0.26	0.2	1.0	0.36	0.35
Pp3c22_18210V3.1 (Pp3c22_18210)	0.49	0.4	0.76	0.45	0.11	0.48	0.46	0.62	0.52	0.56	0.1	0.11	0.36	0.34	0.24	1.0	0.77	0.48	0.7	0.62	0.59	0.46	0.23	0.07	0.19	0.35	0.2	0.34	0.22	0.41	0.26	0.41	0.29	0.3	0.21	0.26	0.29	0.81	0.21	0.26	0.18	0.17	0.25	0.37	0.22	0.74	0.22	0.27
Pp3c22_2990V3.1 (Pp3c22_2990)	0.65	0.34	0.8	0.74	0.17	0.39	0.61	0.55	0.87	0.33	0.22	0.24	0.39	0.39	0.21	0.58	1.0	0.46	0.66	0.59	0.59	0.49	0.84	0.34	0.33	0.32	0.25	0.48	0.67	0.77	0.31	0.45	0.55	0.97	0.76	0.38	0.32	0.58	0.39	0.51	0.3	0.39	0.51	0.51	0.48	0.58	0.5	0.63
Pp3c24_19780V3.1 (MTM1)	0.31	0.14	0.45	0.31	0.34	0.28	0.38	0.35	0.46	0.39	0.22	0.22	0.13	0.06	0.06	0.24	0.57	0.47	0.79	0.65	0.31	0.39	0.07	0.44	0.43	0.33	0.11	0.12	0.16	0.26	0.13	0.33	0.14	0.13	0.08	0.05	0.1	1.0	0.06	0.09	0.1	0.09	0.08	0.2	0.07	0.96	0.08	0.09
Pp3c26_10001V3.1 (Pp3c26_10001)	0.0	0.0	0.04	0.11	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.03	0.12	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.02	0.0	0.0	0.15	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0
Pp3c26_6890V3.1 (ACA4)	0.0	0.0	0.03	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.01	0.0	0.0	0.12	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.08	0.06	0.06	0.04	1.0	0.02	0.11	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.02	0.18
Pp3c26_6930V3.1 (ACA4)	0.0	0.0	0.03	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.01	0.0	0.0	0.12	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.08	0.06	0.06	0.04	1.0	0.02	0.11	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.02	0.18
Pp3c27_2400V3.1 (Pp3c27_2400)	0.49	0.72	0.9	0.39	0.15	0.32	0.42	0.35	0.59	0.49	0.08	0.1	0.37	0.33	0.33	0.62	0.9	0.61	0.65	0.68	0.54	0.48	0.14	0.33	0.29	0.33	0.2	0.46	0.36	0.71	0.39	0.67	0.56	0.65	0.37	0.49	0.38	1.0	0.35	0.48	0.2	0.27	0.44	0.71	0.39	0.97	0.47	0.36
Pp3c27_6380V3.1 (Pp3c27_6380)	0.03	0.29	1.0	0.1	0.07	0.33	0.4	0.45	0.18	0.34	0.02	0.02	0.34	0.3	0.2	0.12	0.33	0.34	0.19	0.23	0.29	0.16	0.06	0.73	0.27	0.25	0.07	0.61	0.26	0.45	0.72	0.4	0.31	0.49	0.27	0.17	0.41	0.72	0.28	0.38	0.49	0.54	0.29	0.44	0.27	0.63	0.54	0.59
Pp3c2_11490V3.1 (Pp3c2_11490)	0.56	0.89	1.0	0.24	0.3	0.65	0.82	0.64	0.58	0.38	0.31	0.34	0.39	0.75	0.38	0.6	0.38	0.36	0.39	0.69	0.45	0.38	1.0	0.32	0.26	0.37	0.3	0.4	0.35	0.43	0.25	0.26	0.29	0.36	0.52	0.37	0.23	0.37	0.33	0.37	0.32	0.33	0.45	0.39	0.34	0.35	0.29	0.71
Pp3c3_3475V3.1 (Pp3c3_3475)	0.19	0.06	1.0	0.07	0.12	0.26	0.19	0.17	0.17	0.11	0.03	0.05	0.11	0.06	0.03	0.27	0.56	0.31	0.14	0.14	0.09	0.1	0.07	0.06	0.16	0.08	0.25	0.67	0.25	0.36	0.53	0.37	0.22	0.34	0.24	0.2	0.36	0.25	0.14	0.21	0.16	0.11	0.17	0.14	0.14	0.26	0.52	0.35
Pp3c3_4090V3.1 (Pp3c3_4090)	0.19	0.4	0.38	0.02	0.55	0.37	0.39	0.49	0.26	0.67	0.03	0.02	0.41	0.36	0.24	0.1	0.56	0.49	0.32	0.57	0.35	0.41	0.38	0.2	0.23	0.09	0.09	0.39	0.19	0.51	0.39	0.55	0.53	0.54	0.11	0.33	0.23	0.83	0.32	0.43	0.08	0.11	0.5	1.0	0.42	0.83	0.54	0.19
Pp3c3_4150V3.1 (Pp3c3_4150)	0.47	0.39	0.5	0.33	0.12	0.25	0.22	0.24	0.46	0.57	0.46	0.53	0.5	0.69	0.19	0.47	0.77	0.77	0.26	0.43	0.27	0.36	0.15	0.27	0.58	0.5	0.47	0.2	0.4	0.37	0.32	0.56	0.34	0.29	0.22	0.1	0.26	0.99	0.27	0.36	0.39	0.47	0.41	0.55	0.32	1.0	0.26	0.28
Pp3c3_6870V3.1 (Pp3c3_6870)	0.0	0.25	0.6	0.13	0.06	0.48	0.44	0.4	0.04	0.23	0.07	0.06	0.07	0.18	0.04	0.19	0.09	0.27	0.1	0.17	0.07	0.31	0.11	0.5	0.04	0.0	0.0	0.17	0.06	0.31	0.07	0.0	0.12	0.0	0.02	0.06	0.05	0.83	0.01	0.29	0.02	0.34	0.24	0.16	0.07	1.0	0.31	0.12
Pp3c4_15580V3.1 (Pp3c4_15580)	0.59	0.73	1.0	0.25	0.1	0.3	0.3	0.34	0.33	0.62	0.21	0.2	0.77	0.65	0.43	0.39	0.91	0.85	0.7	0.74	0.65	0.62	0.84	0.51	0.35	0.65	0.29	0.15	0.15	0.39	0.28	0.53	0.28	0.26	0.14	0.13	0.18	0.77	0.14	0.39	0.33	0.4	0.41	0.38	0.31	0.76	0.15	0.24
Pp3c4_20623V3.1 (ARFA1E)	0.36	0.53	0.82	0.07	0.14	0.18	0.15	0.16	0.41	0.69	0.19	0.21	0.57	0.53	0.31	0.51	0.76	0.54	0.55	0.61	0.48	0.53	0.28	0.18	0.2	0.25	0.11	0.17	0.19	0.44	0.31	0.3	0.4	0.29	0.17	0.15	0.21	0.99	0.16	0.36	0.35	0.46	0.44	0.4	0.31	1.0	0.22	0.25
Pp3c5_4790V3.1 (Pp3c5_4790)	0.51	0.49	0.88	0.62	0.05	0.2	0.33	0.34	0.3	0.58	0.15	0.15	0.98	0.96	0.34	0.66	0.62	0.89	0.28	0.32	0.31	0.4	0.07	0.4	0.51	0.73	0.42	0.53	0.59	0.68	0.54	0.61	0.61	0.67	0.64	0.61	0.65	0.96	0.51	0.59	0.68	0.66	0.5	0.47	0.49	1.0	0.61	0.65
Pp3c6_18880V3.1 (Pp3c6_18880)	0.85	0.52	0.84	0.23	0.12	0.18	0.15	0.21	1.0	0.51	0.07	0.08	0.56	0.5	0.48	0.82	0.81	0.27	0.74	0.44	0.46	0.34	0.15	0.15	0.15	0.31	0.1	0.6	0.33	0.64	0.48	0.44	0.47	0.64	0.54	0.42	0.57	0.9	0.29	0.63	0.33	0.43	0.53	0.61	0.33	0.87	0.54	0.4
Pp3c7_1450V3.1 (ATSMO2)	0.37	0.48	0.73	0.17	0.45	0.31	0.24	0.33	0.54	0.47	0.14	0.14	0.17	0.08	0.15	0.13	0.64	0.61	0.63	0.59	0.67	0.65	0.09	0.81	0.39	0.17	0.24	0.54	0.33	0.45	0.4	0.43	0.37	0.36	0.37	0.25	0.31	0.97	0.15	0.23	0.07	0.08	0.24	0.37	0.17	1.0	0.3	0.16
Pp3c7_17943V3.1 (Pp3c7_17943)	0.14	0.2	1.0	0.11	0.07	0.36	0.61	0.52	0.26	0.08	0.0	0.0	0.18	0.22	0.07	0.06	0.12	0.15	0.26	0.19	0.11	0.07	0.17	0.02	0.05	0.06	0.01	0.01	0.0	0.08	0.05	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.08	0.01	0.05	0.45	0.4	0.09	0.06	0.01	0.08	0.06	0.33
Pp3c7_6250V3.1 (Pp3c7_6250)	0.62	0.31	0.82	0.26	0.09	0.29	0.36	0.47	1.0	0.75	0.23	0.31	0.69	0.5	0.58	0.79	0.99	0.52	0.46	0.42	0.45	0.36	0.23	0.11	0.41	0.73	0.39	0.67	0.43	0.71	0.85	0.84	0.53	0.65	0.8	0.59	0.6	0.97	0.29	0.43	0.21	0.27	0.41	0.44	0.32	1.0	0.65	0.65
Pp3c7_670V3.1 (Pp3c7_670)	0.11	0.29	1.0	0.28	0.06	0.23	0.16	0.16	0.05	0.18	0.06	0.02	0.28	0.28	0.09	0.0	0.35	0.13	0.12	0.12	0.01	0.04	0.25	0.15	0.11	0.36	0.33	0.07	0.05	0.24	0.22	0.43	0.15	0.13	0.02	0.09	0.17	0.25	0.07	0.29	0.48	0.5	0.25	0.26	0.19	0.32	0.17	0.7
Pp3c8_11280V3.1 (Pp3c8_11280)	0.12	0.7	1.0	0.11	0.06	0.22	0.17	0.38	0.39	0.11	0.03	0.05	0.11	0.08	0.08	0.14	0.36	0.34	0.41	0.16	0.13	0.13	0.28	0.11	0.07	0.17	0.07	0.18	0.11	0.4	0.14	0.22	0.23	0.31	0.29	0.1	0.12	0.35	0.24	0.34	0.1	0.14	0.19	0.24	0.33	0.32	0.28	0.42
Pp3c9_19570V3.1 (Pp3c9_19570)	0.07	0.38	0.2	0.08	0.41	0.3	0.37	0.32	0.15	0.55	0.03	0.02	0.25	0.09	0.36	0.13	0.26	0.34	0.54	0.32	0.5	0.53	0.05	0.05	0.18	0.03	0.06	1.0	0.25	0.56	0.73	0.68	0.61	0.56	0.09	0.73	0.67	0.84	0.37	0.26	0.1	0.11	0.37	0.57	0.46	0.85	0.84	0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)