Heatmap: Cluster_232 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002020 (GRMZM2G059740)
0.03 0.0 0.11 0.03 0.42 0.2 0.09 0.07 0.03 0.02 0.26 0.37 0.0 0.05 0.3 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.77 0.12 0.07 0.07 0.02 0.02 0.01 0.0 0.04 0.3 0.21 0.14
Zm00001d002085 (GRMZM2G023163)
0.12 0.17 0.24 0.41 0.51 0.15 0.13 0.15 0.11 0.12 0.24 0.21 0.15 0.21 0.24 0.18 0.21 0.46 0.37 0.08 0.13 0.13 1.0 0.22 0.15 0.4 0.17 0.13 0.1 0.18 0.29 0.01 0.03 0.18 0.71 0.26 0.22
Zm00001d002168 (GRMZM2G115705)
0.0 0.02 0.0 0.36 0.28 0.12 0.13 0.05 0.03 0.06 0.18 0.17 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02
Zm00001d003365 (GRMZM2G022699)
0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.12 0.19 0.0 0.06 0.09 0.8 0.27 0.01 0.01 0.2 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.02 0.02 0.01 0.05 0.05 0.31 0.03 0.0 0.13 0.0 0.02 0.03 0.12 0.11
Zm00001d003434 (GRMZM2G041356)
0.51 0.07 0.07 0.21 0.26 0.12 0.08 0.13 0.03 0.03 0.1 0.13 0.01 0.01 0.07 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 1.0 0.01 0.03 0.04 0.09 0.04 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.1 0.05 0.07
Zm00001d004072 (GRMZM2G052386)
0.12 0.0 0.04 0.08 0.23 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
Zm00001d006531 (GRMZM2G365282)
0.0 0.0 0.0 0.17 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.01 0.03 0.07 0.28 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.24 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01
Zm00001d006755 (GRMZM2G079082)
0.03 0.0 0.01 0.52 0.41 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.19 0.08 0.0 0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.0 0.12 0.28 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.08 0.06
Zm00001d008201 (GRMZM5G853479)
0.01 0.01 0.05 0.0 0.52 0.18 0.04 0.17 0.05 0.06 0.05 0.26 0.01 0.0 0.05 0.1 0.0 0.11 0.01 0.0 0.02 0.01 1.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.06 0.01 0.03 0.21 0.1 0.32
Zm00001d008457 (GRMZM2G079219)
0.01 0.03 0.22 0.23 0.35 0.09 0.06 0.08 0.04 0.02 0.45 0.38 0.02 0.13 0.2 0.13 0.02 0.03 0.03 0.0 0.03 0.07 0.51 0.01 0.17 0.27 0.38 0.06 0.04 0.07 0.01 0.15 0.01 0.05 1.0 0.2 0.36
Zm00001d010463 (GRMZM2G029756)
0.15 0.05 0.04 0.67 0.46 0.12 0.1 0.03 0.03 0.05 0.08 0.25 0.02 0.1 0.12 0.07 0.02 0.02 0.01 0.0 0.03 0.03 1.0 0.12 0.04 0.47 0.17 0.02 0.05 0.04 0.1 0.1 0.0 0.03 0.03 0.13 0.21
Zm00001d011157 (GRMZM2G338161)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.85 0.12 0.03 0.0 0.01 0.0 0.11 0.17 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.04
Zm00001d014056 (GRMZM2G386952)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.5 0.13 0.07 0.01 0.0 0.0 0.14 0.23 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.67 1.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.0 0.06 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.23 0.31 0.11
Zm00001d016219 (GRMZM2G135862)
0.01 0.01 0.18 0.52 0.41 0.24 0.25 0.07 0.04 0.07 0.26 0.32 0.07 0.2 0.17 0.09 0.01 0.04 0.06 0.0 0.04 0.06 1.0 0.14 0.18 0.5 0.09 0.04 0.0 0.17 0.04 0.0 0.0 0.03 0.33 0.25 0.11
Zm00001d017365 (GRMZM2G139773)
0.06 0.02 0.35 0.25 0.86 0.02 0.02 0.01 0.04 0.01 0.49 0.16 0.03 0.07 0.08 0.05 0.01 0.53 0.52 0.02 0.01 0.01 1.0 0.05 0.12 0.26 0.07 0.18 0.0 0.12 0.01 0.14 0.03 0.09 0.13 0.09 0.09
Zm00001d017671 (GRMZM2G168980)
0.66 0.12 0.06 0.26 0.36 1.0 0.24 0.15 0.07 0.04 0.57 0.14 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.67 0.01 0.02 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.19 0.24
Zm00001d019256 (GRMZM2G117878)
0.1 0.13 0.18 0.1 0.21 0.03 0.22 0.01 0.03 0.03 0.18 0.15 0.02 0.37 0.08 0.04 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.35 0.04 0.04 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.13 0.06 0.12
Zm00001d020057 (GRMZM2G473001)
0.22 0.47 1.0 0.61 0.8 0.42 0.54 0.21 0.53 0.3 0.23 0.47 0.33 0.39 0.33 0.43 0.31 0.36 0.33 0.0 0.34 0.39 0.16 0.32 0.34 0.63 0.63 0.4 0.28 0.38 0.29 0.06 0.14 0.32 0.21 0.4 0.32
Zm00001d021737 (GRMZM2G309025)
0.25 0.05 0.59 0.49 0.43 0.24 0.22 0.14 0.09 0.13 0.59 0.36 0.21 0.33 0.22 0.38 0.23 0.28 0.16 0.01 0.09 0.11 1.0 0.15 0.19 0.85 0.38 0.18 0.38 0.26 0.13 0.08 0.06 0.21 0.31 0.35 0.24
Zm00001d023843 (GRMZM2G176472)
0.44 0.15 0.06 0.34 0.8 0.18 0.08 0.05 0.01 0.02 0.81 0.39 0.01 0.1 0.12 0.08 0.03 0.03 0.1 0.01 0.03 0.01 1.0 0.04 0.12 0.01 0.21 0.4 0.27 0.89 0.03 0.14 0.01 0.21 0.21 0.3 0.15
Zm00001d024200 (GRMZM2G092363)
0.1 0.04 0.18 0.31 0.24 0.56 0.54 0.26 0.06 0.06 0.13 0.16 0.01 0.13 0.1 0.1 0.0 0.02 0.01 0.0 0.09 0.02 1.0 0.0 0.05 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.16 0.33
Zm00001d024352 (GRMZM2G481531)
0.0 0.0 0.03 0.04 0.36 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06
Zm00001d024412 (GRMZM2G144407)
0.0 0.0 0.02 0.37 0.28 0.07 0.03 0.01 0.05 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.03 0.02 0.06 0.03 0.14 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.02 0.0 0.18 0.01 0.0 0.22 0.01 0.0 0.0 0.02 0.1 0.09 0.09
Zm00001d024866 (GRMZM2G089721)
0.51 0.01 0.13 0.9 0.32 0.55 0.6 0.09 0.17 0.19 0.39 0.29 0.05 0.14 0.3 0.16 0.0 0.23 0.31 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.02 0.14 0.01 0.13 0.33 0.0 0.0 0.16 0.13 0.07 0.06 0.28 0.31
Zm00001d024961 (GRMZM2G436448)
0.0 0.0 0.27 0.0 0.81 0.16 0.36 0.0 0.11 0.19 0.9 0.53 0.01 0.03 0.36 0.16 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.02 0.75 0.0 0.18 0.0 0.87 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.85 0.22 0.12
Zm00001d025035 (GRMZM2G017164)
0.03 0.08 0.14 0.34 0.46 0.16 0.1 0.11 0.07 0.11 0.32 0.35 0.17 0.24 0.24 0.2 0.21 0.13 0.18 0.0 0.07 0.13 1.0 0.18 0.19 0.59 0.07 0.2 0.09 0.46 0.03 0.0 0.05 0.16 0.36 0.23 0.16
0.01 0.17 0.01 0.37 0.32 0.06 0.02 0.03 0.0 0.0 0.15 0.15 0.0 0.0 0.04 0.01 0.04 0.04 0.03 0.0 0.02 0.01 1.0 0.05 0.05 0.01 0.27 0.04 0.04 0.25 0.11 0.0 0.01 0.1 0.05 0.07 0.05
Zm00001d025390 (GRMZM2G042811)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Zm00001d025401 (GRMZM2G052100)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.14 0.06 0.12 0.02 0.02 0.02 0.15 0.12 0.0 0.02 0.09 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.07 0.03 0.02 0.01 0.0 0.03 0.03 0.05 0.04
Zm00001d027921 (GRMZM2G115105)
0.22 0.21 0.11 0.53 0.39 0.39 0.25 0.25 0.14 0.31 0.71 0.32 0.0 0.01 0.15 0.08 0.02 0.26 0.78 0.01 0.02 0.0 0.29 0.01 0.07 0.08 0.07 0.02 1.0 0.05 0.04 0.34 0.04 0.03 0.03 0.21 0.16
Zm00001d027995 (GRMZM2G397055)
0.2 0.03 0.01 0.07 0.43 0.27 0.53 0.08 0.11 0.21 0.22 0.27 0.0 0.0 0.1 0.01 0.01 0.22 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.16 0.21
0.05 0.1 0.12 0.12 0.33 0.24 0.16 0.08 0.05 0.06 0.82 0.5 0.13 0.0 0.24 0.15 0.07 0.27 0.16 0.01 0.06 0.05 1.0 0.1 0.25 0.01 0.09 0.07 0.34 0.62 0.13 0.12 0.04 0.07 0.04 0.3 0.28
Zm00001d029590 (GRMZM2G074138)
1.0 0.13 0.86 0.7 0.95 0.68 0.49 0.26 0.22 0.27 0.36 0.77 0.08 0.27 0.57 0.26 0.28 0.27 0.26 0.0 0.45 0.33 0.35 0.23 0.27 0.2 0.51 0.18 0.55 0.27 0.09 0.02 0.03 0.1 0.14 0.6 0.68
Zm00001d030555 (GRMZM2G303909)
0.0 0.0 0.0 0.24 0.23 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.03
Zm00001d031345 (GRMZM2G017629)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
Zm00001d037949 (GRMZM2G069713)
0.68 0.22 0.52 0.26 0.87 0.67 1.0 0.52 0.47 0.29 0.73 0.68 0.21 0.02 0.48 0.35 0.28 0.23 0.32 0.0 0.3 0.1 0.85 0.41 0.27 0.04 0.5 0.33 0.81 0.38 0.44 0.35 0.05 0.1 0.06 0.48 0.3
Zm00001d038115 (GRMZM2G332107)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.07 0.01 0.01 0.04 0.03 0.09 0.23 0.0 0.01 0.25 0.01 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.1 0.09
Zm00001d038494 (GRMZM2G089461)
0.69 0.06 1.0 0.28 0.52 0.2 0.13 0.04 0.31 0.36 0.31 0.42 0.05 0.12 0.15 0.24 0.09 0.11 0.15 0.0 0.03 0.01 0.55 0.06 0.18 0.34 0.25 0.16 0.14 0.25 0.05 0.0 0.04 0.16 0.07 0.42 0.25
Zm00001d038548 (GRMZM2G116335)
0.02 0.01 0.3 0.72 0.68 0.23 0.06 0.01 0.03 0.03 0.47 0.15 0.0 0.0 0.06 0.13 0.3 0.08 0.14 0.0 0.01 0.0 1.0 0.09 0.07 0.02 0.29 0.05 0.0 0.05 0.14 0.0 0.02 0.16 0.08 0.14 0.11
Zm00001d039527 (GRMZM2G308910)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.13 0.17 0.24 0.08 0.07 0.04 0.14 0.0 0.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.14 0.04
Zm00001d039822 (GRMZM2G463574)
0.07 0.11 0.16 0.51 0.26 0.07 0.31 0.17 0.09 0.17 0.59 0.46 0.15 0.02 0.2 0.19 0.13 0.18 0.27 0.02 0.23 0.3 1.0 0.15 0.26 0.26 0.33 0.2 0.09 0.3 0.14 0.0 0.08 0.31 0.25 0.42 0.12
Zm00001d041476 (GRMZM2G412885)
0.11 0.05 0.66 0.26 1.0 0.55 0.77 0.2 0.2 0.21 0.48 0.63 0.01 0.0 0.77 0.07 0.32 0.11 0.05 0.01 0.25 0.16 0.83 0.15 0.12 0.01 0.23 0.13 0.06 0.0 0.1 0.0 0.01 0.2 0.37 0.47 0.51
Zm00001d041772 (GRMZM2G019090)
0.0 0.0 0.14 0.25 0.58 0.17 0.17 0.01 0.0 0.0 0.67 0.13 0.0 0.14 0.05 0.08 0.24 0.0 0.09 0.0 0.05 0.16 1.0 0.0 0.17 0.45 0.79 0.11 0.01 0.56 0.08 0.0 0.01 0.02 0.02 0.28 0.13
Zm00001d042135 (GRMZM2G116554)
0.0 0.01 0.01 0.07 1.0 0.27 0.02 0.1 0.01 0.0 0.73 0.34 0.0 0.03 0.18 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.09 0.0 0.41 0.69 0.12 0.0 0.31 0.0 0.04 0.02 0.0 0.15 0.33
Zm00001d042731 (GRMZM2G053284)
0.0 0.03 0.01 0.16 1.0 0.08 0.33 0.03 0.02 0.04 0.51 0.31 0.01 0.07 0.13 0.01 0.02 0.03 0.08 0.0 0.02 0.03 0.56 0.01 0.13 0.11 0.08 0.02 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.02 0.19 0.39
Zm00001d043199 (GRMZM2G178704)
0.01 0.0 0.12 0.21 0.48 0.41 0.09 0.33 0.18 0.18 0.58 0.68 0.0 0.06 0.29 0.15 0.07 0.04 0.04 0.0 0.05 0.04 1.0 0.0 0.07 0.02 0.27 0.09 0.13 0.09 0.04 0.0 0.01 0.07 0.25 0.59 0.18
0.02 0.01 0.11 0.33 0.29 0.36 0.24 0.03 0.12 0.19 0.08 0.38 0.0 0.07 0.26 0.16 0.19 0.09 0.06 0.0 0.03 0.03 1.0 0.05 0.05 0.02 0.09 0.05 0.0 0.03 0.02 0.04 0.0 0.07 0.23 0.23 0.31
0.17 0.18 0.06 0.43 0.68 0.19 0.06 0.09 0.02 0.04 0.14 0.28 0.03 0.13 0.08 0.06 0.12 0.37 0.17 0.87 0.14 0.06 0.94 0.09 0.17 0.06 0.33 0.07 0.47 0.31 1.0 0.06 0.02 0.1 0.08 0.14 0.13
Zm00001d044654 (GRMZM2G079303)
0.2 0.33 0.38 0.76 0.68 0.21 0.2 0.13 0.01 0.01 0.5 0.53 0.04 0.12 0.17 0.18 0.23 0.55 0.83 0.08 0.22 0.33 0.55 0.99 0.4 0.12 0.38 0.1 0.0 0.0 0.26 0.12 0.17 0.7 1.0 0.4 0.1
Zm00001d045845 (GRMZM2G070603)
1.0 0.21 0.0 0.52 0.4 0.47 0.19 0.15 0.07 0.06 0.12 0.43 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.74 0.0 0.05 0.1 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.1
Zm00001d046801 (GRMZM2G452896)
0.17 0.12 0.07 0.38 0.69 0.23 0.14 0.11 0.06 0.06 0.42 0.32 0.02 0.22 0.14 0.14 0.0 0.03 0.03 0.0 0.02 0.01 1.0 0.01 0.09 0.02 0.1 0.05 0.28 0.04 0.01 0.03 0.01 0.03 0.15 0.21 0.29
Zm00001d046919 (GRMZM2G057616)
0.65 0.11 0.1 0.58 0.5 0.75 0.69 0.25 0.33 0.36 0.28 0.6 0.13 0.6 0.63 0.15 0.01 0.06 0.04 0.0 0.01 0.01 0.25 0.02 0.13 0.22 0.14 0.0 0.01 0.12 0.07 0.01 0.0 0.01 0.29 0.38 1.0
Zm00001d047358 (GRMZM2G149273)
0.38 0.0 0.0 0.09 0.19 0.19 0.04 0.0 0.09 0.06 0.17 0.22 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06
Zm00001d047952 (GRMZM2G081458)
0.03 0.0 0.05 0.0 1.0 0.11 0.03 0.01 0.01 0.01 0.27 0.35 0.01 0.0 0.2 0.12 0.0 0.01 0.07 0.0 0.01 0.0 0.88 0.0 0.16 0.3 0.51 0.17 0.14 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13 0.22 0.27 0.24
Zm00001d050803 (GRMZM2G107021)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.23 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.58 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.31
Zm00001d050834 (GRMZM2G047715)
0.01 0.03 0.02 0.72 0.25 0.0 0.01 0.04 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.03 0.01 0.05 0.02 0.04 0.01 0.04 0.03 1.0 0.05 0.06 0.0 0.03 0.03 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.03 0.09 0.11 0.07
Zm00001d051015 (GRMZM2G138624)
0.07 0.27 0.38 0.28 0.7 0.16 0.22 0.44 0.15 0.14 0.37 0.57 0.24 0.51 0.16 0.38 0.49 0.57 0.58 1.0 0.35 0.68 0.85 0.3 0.62 0.22 0.61 0.49 0.53 0.9 0.88 0.47 0.24 0.49 0.63 0.36 0.2
Zm00001d051799 (GRMZM2G063276)
0.28 0.01 0.01 0.31 0.39 0.36 0.35 0.23 0.21 0.2 0.29 0.29 0.22 0.1 0.24 0.13 0.04 0.1 0.02 0.0 0.16 0.06 1.0 0.12 0.19 0.39 0.04 0.05 0.0 0.08 0.07 0.04 0.01 0.04 0.03 0.25 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)